Создание продуцента рекомбинантной универсальной пероксидазы VP2 Trametes hirsuta в Penicillium canescens

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Интерес к пероксидазам секретируемого ферментного комплекса базидиальных грибов обусловлен их широкой субстратной специфичностью и способностью участвовать в процессе биодеградации таких трудно деградируемых биополимеров, как лигнин. Однако из-за сложности выделения этих ферментов из нативных источников, их изучение затруднено. В работе были получены экспрессионные вектора, несущие последовательность, кодирующую универсальную пероксидазу VP2 T. hirsuta LE-BIN072, которые были трансформированы в геном штамма P. canescens. Скрининг трансформантов показал наличие пероксидазной активности до 1 ед./мл. Целевой белок идентифицирован в культуральной жидкости отобранных трансформантов методом масс-спектрометрического анализа. Впервые получен новый штамм P. canescens pVP2D-6 – продуцент рекомбинантной универсальной пероксидазы VP2 T. hirsuta LE-BIN072 и показана способность секретируемого им ферментного комплекса к модификации щелочного лигнина.

Об авторах

О. С. Савинова

Институт биохимии им. А.Н. Баха, Федеральный исследовательский центр
“Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: savinova_os@rambler.ru
Россия, 119071, Москва

А. М. Чулкин

Институт биохимии им. А.Н. Баха, Федеральный исследовательский центр
“Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: savinova_os@rambler.ru
Россия, 119071, Москва

К. В. Моисеенко

Институт биохимии им. А.Н. Баха, Федеральный исследовательский центр
“Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: savinova_os@rambler.ru
Россия, 119071, Москва

Т. В. Федорова

Институт биохимии им. А.Н. Баха, Федеральный исследовательский центр
“Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: savinova_os@rambler.ru
Россия, 119071, Москва

Список литературы

  1. Ponnusamy V.K., Nguyen D.D., Dharmaraja J., Shobana S., Banu J.R., Saratale R.G. et al. // Bioresour. Technol. 2019. V. 271. P. 462–472. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2018.09.070
  2. Biko O. D.V., Viljoen-Bloom M., van Zyl W. H. // Enzyme Microb. 2021. V. 141, 109669. https://doi.org/10.1016/j.enzmictec.2020.109669
  3. Kainthola J., Podder A., Fechner M., Goel R. // Bioresour. Technol. 2021. V. 321. 124397. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2020.124397
  4. Abbas A., Koc H., Liu F., Tien M. // Curr Genet. 2005. V. 47. P. 49–56. https://doi.org/10.1007/s00294-004-0550-4
  5. Dashtban M., Schraft H., Syed T.A., Qin W. // Int. J. Biochem. Mol. Biol. 2010. V. 1. P. 36–50.
  6. Zhang S., Xiao J., Wanga G., Chen G. // Bioresour. Technol. 2020. V. 304. 122975. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2020.122975
  7. Liers C., Aranda E., Strittmatter E., Piontek K., Plattner D.A., Zorn H. et al. // J. Mol. Catal. B Enzym. 2014. V. 103. P. 41–46. https://doi.org/10.1016/j.molcatb.2013.09.025
  8. Moiseenko K.V., Glazunova O.A., Savinova O.S., Vasina D.V., Zherebker A.Ya., Kulikova N.A. et al. // Bioresour. Technol. 2021. V. 335. 125229. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2021.125229
  9. Vasina D.V., Moiseenko K.V., Fedorova T.V., Tyazhelova T.V. // PLoS ONE. 2017. V. 12. № 3. e0173813. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0173813
  10. Savinova O.S., Shabaev A.V., Glazunova O.A., Moiseenko K.V., Fedorova T.V. // Appl. Biochem. Microbiol. 2022. V. 58. Suppl. 1. P. S113–S125.
  11. Fernández-Fueyo E., Ruiz-Dueñas F.J., Martínez M.J., Romero A., Hammel K.E., Medrano F.J., Martínez A.T. // Biotechnol. Biofuels. 2014. V. 7. № 2. https://doi.org/10.1186/1754-6834-7-2
  12. Ruiz-Duenas F.J., Morales M., Garcia E., Miki Y., Martinez M.J., Martinez A.T. // J. Exp. Bot. 2009. V. 60. № 2. P. 441–452. https://doi.org/10.1093/jxb/ern261
  13. Rodakiewicz-Nowak J., Jarosz-Wilkolazka A., Luterek J. // Applied Catalysis A: General. 2006. V. 308. P. 56–61.
  14. Perez-Boada M., Doyle W.A., Ruiz-Duenas F.J., Martinez M.J., Martinez A.T. // Enzyme Microb. Technol. 2002. V. 30. P. 518–524.
  15. Majekea B.M., García-Aparicioa M., Biko O.D, Viljoen-Bloom M., van Zyl W.H., Görgensa J.F. // Enzyme Microb. 2020. V. 139. 109593.https://doi.org/10.1016/j.enzmictec.2020.109593
  16. Stewart P., Whitwam R. E., Kersten P. J., Cullen D., Tien M. // Appl. Environ. Microbiol. 1996. V. 62. № 3. P. 860–864. https://doi.org/10.1128/aem.62.3.860-864.1996
  17. Sugano Y., Nakano R., Sasaki K., Shoda M. // Physiology and Biotechnology. 2000. V. 66. № 4. https://doi.org/10.1128/AEM.66.4.1754-1758.2000
  18. Chekushina A.V., Dotsenko G.S., Sinitsyn A.P. // Catalysis in Industry. 2013. V. 5 № 1. P. 98–104. https://doi.org/10.1134/S2070050413010042
  19. Savinova O.S., Moiseenko K.V., Vavilova E.A., Tyazhelova T.V., Vasina D.V. // Biochimie. 2017. V. 142. P. 183–190. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2017.09.013
  20. Savinova O.S., Moiseenko K.V., Vavilova E.A., Chulkin A.M., Fedorova T.V., Tyazhelova T.V., Vasina D.V. // Front. Microbiol. 2019. V. 10. 152. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00152
  21. Abyanova A.R., Chulkin A.M., Vavilova E.A., Fedorova T.V., Loginov D.S., Koroleva O.V., Benevolensky S.V. // Appl. Biochem. Microbiol. 2010. V. 46. № 3. P. 313–317.
  22. Aleksenko A.Y., Makarova N.A., Nikolaev I.V., Clutterbuck A.J. // Curr. Genet. 1995. V. 28. P. 474–478.
  23. Чулкин А.М., Логинов Д.С., Вавилова Е.А., Абянова А.Р., Зоров И.Н., Курзеев С.А., Королева О.В., Беневоленский С.В. // Прикл. биохимия и микробиология. 2009. Т. 45. № 2. С. 163–170.
  24. Fraczek M.G., Zhao C., Dineen L., Lebedinec R., Bowyer P., Bromley D., Delneri M. Current Protocols in Microbiology. 2019. V. 54. e89. https://doi.org/10.1002/cpmc.89
  25. Unkles S.E., Campbell E.I., Punt P.J., Hawker K.L., Contreras R., Hawkins A.R. et al. // Gene. 1992. V. 111. № 2. P. 149–155.
  26. Shabaev A.V., Moiseenko K.V., Glazunova O.A., Savinova O.S., Fedorova T.V. // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. № 10322. https://doi.org/10.3390/ ijms231810322
  27. Лисов А.В., Заварзина А.Г., Белова О.В., Леонтьевский А.А. // Микробиология. 2020. Т. 89. № 3. С. 300–307. https://doi.org/10.31857/S0026365620030118
  28. Sinitsyn A.P., Rozhkova A.M. Microorganisms in Biorefineries. Penicillium canescens Host as the Platform for Development of a New Recombinant Strain Producers of Carbohydrases. / Ed. B. Kamm Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 2015. V. 26. P. 1–19.
  29. Королева О.В., Федорова Т.В., Беневоленский С.В., Вавилова Е.А., Чулкин А.М. // Патент РФ. 2015. № 2538149.
  30. Айзенштадт М.А., Боголицын К.Г. // Химия растительного сырья. 2009. № 2. С. 5–18.
  31. Ruwoldt J., Tanase-Opedal M., Syverud K. // ACS Omega. 2022. V. 7. P. 46371–46383.https://doi.org/10.1021/acsomega.2c04982
  32. Sadeghifar H., Ragauskas A. // Polymers. 2020. V. 12. № 5. P. 1134. https://doi.org/10.3390/polym12051134
  33. Lara M.A., Rodriguez-Malaver A.J., Rojas O.J., Holmquist O., Gonzalez A.M., Bullon J., Penaloza N., Araujo E. // International Biodeterioration & Biodegradation. 2003. V. 52. P. 167–173. https://doi.org/10.1016/S0964-8305(03)00055-6
  34. Amara S., Perrot T., Navarro D., Deroy A., Benkhelfallah A., Chalak A. et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2018. V. 84. e02826-17. https://doi.org/10.1128/AEM.02826-17
  35. Sáez-Jiménez V., Rencoret J., Rodríguez-Carvajal M.A., Gutiérrez A., Ruiz-Dueñas F.J., Martínez A.T. // Biotechnol Biofuels. 2016. V. 9. P. 198. doi.org/https://doi.org/10.1186/s13068-016-0615-x
  36. Silva D., Sousa A.C., Robalo M.P., Martins L.O. // New Biotechnology. 2022. https://doi.org/10.1016/j.nbt.2022.12.003
  37. Moiseenko K.V., Glazunova O.A., Savinova O.S., Vasina D.V., Zherebker A.Ya., Kulikova N.A., Nikolaev E.N., Fedorova T.V. // Bioresour. Technol. 2021. V. 335. 125229. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2021.125229

Дополнительные файлы


© О.С. Савинова, А.М. Чулкин, К.В. Моисеенко, Т.В. Федорова, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».