Геномные изменения вируса африканской чумы свиней (Asfarviridae: Asfivirus: African swine fever virus), связанные с адаптацией к размножению в перевиваемой культуре клеток
- Авторы: Мазлум А.А.1, Иголкин А.С.1, Зиняков Н.Г.1, ван Шалквик А.2, Власова Н.Н.1
-
Учреждения:
- ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ВНИИЗЖ)
- Ветеринарный институт Ондерстепорта
- Выпуск: Том 66, № 3 (2021)
- Страницы: 211-216
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- URL: https://journals.rcsi.science/0507-4088/article/view/118221
- DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-50
- ID: 118221
Цитировать
Аннотация
Введение. Возбудитель африканской чумы свиней (Suidae) (АЧС) – крупный (175–215 нм) двухцепочечный ДНК-вирус, относящийся к семейству Asfarviridae. К настоящему времени секвенирован и подробно проанализирован только геном штамма BA71V, адаптированного к клеточной культуре Vero.
Целью данной работы явился сравнительный анализ полногеномного сиквенса исходного изолята вируса АЧС Odintsovo 02/14 и 2 штаммов, полученных на уровне 30 и 50 пассажей и адаптированных к росту в клеточной культуре CV-1.
Материал и методы. В работе использованы различные варианты вируса АЧС: исходный изолят Odintsovo 02/14 и 2 штамма адаптированного вируса: ASFV/ARRIAH/CV-1/30 и ASFV/ARRIAH/CV-1/50. Библиотеку последовательностей конструировали с использованием набора «Nextera XT DNA library preparation kit» («Illumina», США).
Результаты. Длина геномов штаммов ASFV/ARRIAH/CV-1/30 и ASFV/ARRIAH/CV-1/50 составила 186 529 и 186 525 п.н. соответственно. Всего между исходным и адаптированными вариантами обнаружены 78 однонуклеотидных полиморфизмов (single nucleotide polymorphisms, SNP); кроме того, установлено наличие крупноразмерной делеции величиной 2947 п.н. в правом (3’-концевом) вариабельном регионе у обоих адаптированных штаммов.
Обсуждение. Возбудитель АЧС как ДНК-содержащий вирус может не иметь высокого мутационного статуса. Однако в данном исследовании повторно установлено, что адаптация этого инфекционного агента к росту в перевиваемой культуре клеток (КК) приводит к появлению крупноразмерной делеции в 3’-вариабельной области генома.
Заключение. В связи с недостаточной изученностью данной проблемы необходимо проведение дополнительных исследований, что позволит подтвердить имеющиеся данные относительно влияния каждой из описанных мутаций на характер размножения вируса и степень его вирулентности.
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
А. А. Мазлум
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ВНИИЗЖ)
Автор, ответственный за переписку.
Email: ali.mazloum6@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5982-8393
Мазлум Али, канд. биол. наук, ведущий ветеринар
600901, Владимирская обл., Владимир, мкр. Юрьевец
РоссияА. С. Иголкин
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ВНИИЗЖ)
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-5438-8026
600901, Владимирская обл., Владимир, мкр. Юрьевец
РоссияН. Г. Зиняков
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ВНИИЗЖ)
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-3015-5594
600901, Владимирская обл., Владимир, мкр. Юрьевец
РоссияА. ван Шалквик
Ветеринарный институт Ондерстепорта
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-4761-8767
100 Олд Саутпен Роад, Ондерстепорт 0110
ЮАРН. Н. Власова
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ВНИИЗЖ)
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8707-7710
600901, Владимирская обл., Владимир, мкр. Юрьевец
РоссияСписок литературы
- Krug P.W., Holinka L.G., O’Donnell V., Reese B., Sanford B., Fernandez-Sainz I., et al. The progressive adaptation of a Georgian isolate of African swine fever virus to Vero cells leads to a gradual attenuation of virulence in swine corresponding to major modifications of the viral genome. J. Virol. 2015; 89(4): 2324–32. https://doi.org/10.1128/jvi.03250-14
- Rodríguez J.M., Moreno L.T., Alejo A., Lacasta A., Rodríguez F., Salas M.L. Genome sequence of african swine fever virus BA71, the virulent parental strain of the nonpathogenic and tissue-culture adapted BA71V. PLoS One. 2015; 10(11): e0142889. https://doi. org/10.1371/journal.pone.0142889
- Мазлум А., Зиняков Н.Г., Першин А.С., Шевченко И.В., Жуков И.Ю., Федосеева Д.Н., и др. Анализ изменений генетической структуры и биологических свойств вируса африканской чумы свиней при адаптации к перевиваемой культуре клеток. Ветеринария сегодня. 2018; (4): 21–5. https://doi.org/10.29326/2304- 196X-2018-4-27-21-25
- Мазлум А., Шарипова Д.В., Гаврилова В.Л. Методические рекомендации по выделению и титрованию вируса африканской чумы свиней в культуре клеток селезенки свиней. Владимир; 2019.
- Szpara M.L., Tafuri Y.R., Enquist L.W. Preparation of viral DNA from nucleocapsids. J. Vis. Exp. 2011; (54): 3151. https://doi. org/10.3791/3151
- Elsukova A.A., Shevchenko I.V., Varentsova A.A., Puzankova O.S., Zhukov I.Y., Pershina A.S., et al. Biological properties of African swine fever virus Odintsovo 02/14 isolate and its genome analysis. Int. J. Env. Agricult. Res. 2017; 3(10): 26–37. https://doi. org/10.25125/agriculture-journal-IJOEAR-OCT-2017-15
- Tabares E., Olivares I., Santurde G., Garcia M.J., Martin E., Carnero M.E. African swine fever virus DNA: deletions and additions during adaptation to growth in monkey kidney cells. Arch. Virol. 1987; 97(3): 333–46. https://doi.org/10.1007/bf01314431