Konformatsionnoe raznoobrazie lipidov

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

В работе исследуется конформационное разнообразие гидрофобных цепей липидов. Даются ответы на вопросы: сколько всего возможно конформаций липидной цепи и сколько из них может реализоваться в реальной системе. Предлагается подход к анализу конформаций липидных молекул, основанный на теории множеств, и вводится равенство, связывающее наборы реализованных в липидной системе конформаций с энергией системы. С помощью теории множеств рассматривается вопрос о том, какие конформации гидрофобных цепей липидов могут быть реализованы в реальной системе. Сформулировано понятие ключевой конформации, позволяющее оценивать зависимость между структурными характеристиками липидов и энергетическими характеристиками мембран.

About the authors

I. A Boldyrev

Email: i_boldyrev@mail.ru

References

  1. T. Harayama and H. Riezman, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 19(5), 281 (2018).
  2. H. Sunshine and M. L. Iruela-Arispe, Current Opinion in Lipidology 28(5), 408 (2017).
  3. X. Wang, Current opinion in plant biology 7(3), 329 (20040.
  4. D. Casares, P. V. Escribá, and C. A. Rosselló, Int. J. Mol. Sci. 20(9), 2167 (2019).
  5. B. de Kruijff, Current Opinion in Chemical Biology 1(4), 564 (1997).
  6. V. A. Frolov, A. V. Shnyrova, and J. Zimmerberg, Cold Spring Harbor Persp ectives in Biology 3(11), a004747 (2011).
  7. J. Seeling, Q. Rev. Biophys. 10, 353 (1977).
  8. J. H. Davis, BBA Reviews on Biomembranes 737(1), 117 (1983).
  9. T. Molugu, S. Lee, and M. Brown, Chem. Rev. 117(19), 12087 (2017).
  10. A. Leftin and M. Brown, Biochimica et Biophysica Acta Biomembranes 1808(3), 818 (2011).
  11. S. Marčelja, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) -Biomembranes 367(2), 165 (1974).
  12. P. De Gennes, Phys. Lett. A 47(2), 123 (1974).
  13. W. Helfrich, Z. Naturforsch. 28(11-12), 693 (1973).
  14. Z. Tu and Z. Ou-Yang, Adv. Colloid Interface Sci. 208, 66 (2014).
  15. S. May, ‘Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 5(3-4), 244 (2000).
  16. J. F. Nagle, J. Chem. Phys. 58(1), 252 (1973).
  17. H. Scott and W.-H. Cheng, Biophysical Journal 28(1), 117 (1979).
  18. A. Caille, A. Rapini, M. Zuckermann, A. Cros, and S. Doniach, Can. J. Phys. 56(3), 348 (1978).
  19. M. Hamm and M. Kozlov, Eur. Phys. J. E3, 323 (2000).
  20. S. I. Mukhin and S. Baoukina, Physical. Rev. E 71(6), 061918 (2005).
  21. S. I. Mukhin and B. B. Kheyfets, Phys. Rev. E 82(5), 051901 (2010).
  22. B. Kheyfets, T. Galimzyanov, and S. Mukhin, JETP Lett. 107, 718 (2018).
  23. A. Drozdova and S. Mukhin, JETP 125, 357 (2017).
  24. S. A. Akimov, P. E. Volynsky, T. R. Galimzyanov, P. I. Kuzmin, K. V. Pavlov, and O. V. Batishchev, Sci. Rep. 7(1), 12152 (2017).
  25. S. Akimov, P. Volynsky, T. Galimzyanov, P. Kuzmin, K. Pavlov, and O. Batishchev, Sci. Rep. 7(1), 12509 (2017).
  26. O. G. Mouritsen and M. Bloom, Annual Review of Biophysics and Biomolecular structure 22(1), 145 (1993).
  27. M. F. Brown, Biochemistry 51(49), 9782 (2012).
  28. S. A. Akimov, P. I. Kuzmin, J. Zimmerberg, and F. S. Cohen, Phys. Rev. E 75(1), 011919 (2007).
  29. T. R. Galimzyanov, R. J. Molotkovsky, M. E. Bozdaganyan, F. S. Cohen, P. Pohl, and S. A. Akimov, Phys. Rev. Lett. 115(8), 088101 (2015).
  30. S. E. Feller, Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 5(3-4), 217 (2000).
  31. R. M. Venable, F. L. Brown, and R. W. Pastor, Chemistry and Physics of Lipids 192, 60 (2015).
  32. R. M. Venable, A. Kramer, and R. W. Pastor, Chem. Rev. 119(9), 5954 (2019).
  33. L. S. Vermeer, B. L. De Groot, V. Réat, A. Milon, and J. Czaplicki, Eur. Biophys. J. 36(8), 919 (2007).
  34. K. V. Pinigin, Membranes 12(11), 1149 (2022).
  35. A. Semenova, A. Chugunov, P. Dubovskii, V. Chupin, P. Volynsky, and I. Boldyrev, Chemistry and Physics of Lipids 165(4), 382 (2012).
  36. O. Batishchev, A. Alekseeva, D. Tretiakova, T. Galimzyanov, A. Chernyadyev, N. Onishchenko, P. Volynsky, and I. Boldyrev, Soft Matter 16(13), 3216 (2020).
  37. S. E. Feller, K. Gawrisch, and A. D. MacKerell, J. Am. Chem. Soc. 124(2), 318 (2002).
  38. T. Gocen, S. H. Bayari, and M. H. Guven, J. Mol. Struct. 1150, 68 (2017).
  39. M. R. Rich, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research 1178(1), 87 (1993).
  40. I. Kanesaka, R. G. Snyder, and H. L. Strauss, J. Chem. Phys. 84(1), 395 (1986).

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2024 Российская академия наук

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».