The BAIAP2L1 gene variant as a risk factor for the development of genital endometriosis in combination with endometrial hyperplasia

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Objective: To investigate the association between single nucleotide variants (SNVs) and the occurrence of genital endometriosis combined with endometrial hyperplasia in the Russian population in the following genes: NC_000017.11 (SHBG): g.7618597G>T (rs12150660), NC_000001.11 (PRMT6):g.107003753A>G (rs17496332), NC_000007.14 (BAIAP2L1):g.98364050T>A (rs3779195), NC_000012.12 (SLCO1B1):g.21178615T>C (rs4149056) and NC_000015.10 (NR2F2):g.96165062T>C (rs8023580).

Materials and methods: GWAS-significant single nucleotide variants (SNVs) associated with sex hormone-binding globulin (SHBG) levels were genotyped in 286 patients with genital endometriosis, including 183 patients with both genital endometriosis and endometrial hyperplasia and 103 patients with isolated genital endometriosis (control group). Logistic regression was used to assess the association between GWAS-significant SNVs linked to SHBG levels and the development of genital endometriosis in combination with endometrial hyperplasia. Allelic, additive, recessive, and dominant models were applied using the gPLINK software.

Results: The A allele of the BAIAP2L1 (rs3779195) gene was identified as a risk factor for the development of endometriosis in combination with endometrial hyperplasia (OR = 2.85; 95% CI 1.36–5.97; рperm = 0.006 for the additive model; OR = 1.91; 95% CI 1.15–3.17; рperm = 0.014 for the allelic model; OR = 2.72; 95% CI 1.26–5.88; рperm = 0.012 for the dominant model). The rs3779195 locus is located in the intronic region of the BAIAP2L1 gene, characterizes DNA interaction with the Foxp1 transcription factor, and is in linkage disequilibrium with 20 SNV, four of which (rs6950023, rs6967728, rs77032872, and rs3779196) exhibit significant regulatory potential.

Conclusion: The A allele of BAIAP2L1 (rs3779195) is associated with an increased risk of genital endometriosis in combination with endometrial hyperplasia.

About the authors

Tatyana A. Ponomareva

Belgorod State National Research University; Saint Ioasaph Belgorod Regional Clinical Hospital

Author for correspondence.
Email: rybaarbusova@icloud.com
ORCID iD: 0009-0007-8533-9319

PhD Student at the Department of Medical and Biological Disciplines; Obstetrician-Gynecologist

Russian Federation, 85, Pobeda St., Belgorod, 308015; 8/9, Nekrasov St., Belgorod, 308007

Oksana B. Altukhova

Belgorod State National Research University; Saint Ioasaph Belgorod Regional Clinical Hospital

Email: altuhova_o@bsuedu.ru
ORCID iD: 0000-0003-4674-8797

Dr. Med. Sci., Associate Professor, Head of the Department of Obstetrics and Gynecology; Head of the Gynecological Department

Russian Federation, 85, Pobeda St., Belgorod, 308015; 8/9, Nekrasov St., Belgorod, 308007

Irina V. Ponomarenko

Belgorod State National Research University

Email: ponomarenko_i@bsuedu.ru
ORCID iD: 0000-0002-5652-0166

Dr. Med. Sci., Associate Professor at the Department of Medical and Biological Disciplines

Russian Federation, 85, Pobeda St., Belgorod, 308015

Mikhail I. Churnosov

Belgorod State National Research University

Email: churnosov@bsuedu.ru
ORCID iD: 0000-0003-1254-6134

Dr. Med. Sci., Professor, Head of the Department of Medical and Biological Disciplines

Russian Federation, 85, Pobeda St., Belgorod, 308015

References

  1. Crump J., Suker A., White L. Endometriosis: a review of recent evidence and guidelines. Aust. J. Gen. Pract. 2024; 53(1-2): 11-8. https:// dx.doi.org/10.31128/AJGP/04-23-6805
  2. Wang P.H., Yang S.T., Chang W.H., Liu C.H., Lee F.K., Lee W.L. Endometriosis: part I. Basic concept. Taiwan. J. Obstet. Gynecol. 2022; 61(6): 927-34. https://dx.doi.org/10.1016/j.tjog.2022.08.002
  3. Smolarz B., Szyłło K., Romanowicz H. Endometriosis: epidemiology, classification, pathogenesis, treatment and genetics (review of Literature). Int. J. Mol. Sci. 2021; 22(19): 10554. https://dx.doi.org/10.3390/ijms221910554
  4. Koninckx P.R., Fernandes R., Ussia A., Schindler L., Wattiez A., Al-Suwaidi S. et al. Pathogenesis based diagnosis and treatment of endometriosis. Front. Endocrinol. (Lausanne). 2021; 12: 745548. https://dx.doi.org/10.3389/fendo.2021.745548
  5. Zondervan K.T., Becker C.M., Missmer S.A. Endometriosis. N. Engl. J. Med. 2020; 382(13): 1244-56. https://dx.doi.org/10.1056/NEJMra1810764
  6. Ponomarenko M.S., Reshetnikov E.A., Churnosova M.M., Reshetnikova Y.N., Churnosov V.I., Ponomarenko I.V. Comorbidity and syntropy of benign proliferative diseases of the female reproductive system: non-genetic, genetic, and epigenetic factors (review). Research Results in Biomedicine. 2023; 9(4): 544-56. https://dx.doi.org/10.18413/2658-6533-2023-9-4-0-9
  7. Пономарева Т.А., Алтухова О.Б., Пономаренко И.В., Чурносов М.И. Современные представления о механизмах развития и факторах риска эндометриоза. Акушерство и гинекология. 2024; 7: 12-20. [Ponomareva T.A., Altukhova O.B., Ponomarenko I.V., Churnosov M.I. Novel concepts in the pathogenesis and risk factors of endometriosis. Obstetrics and Gynecology. 2024; (7): 12-20 (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2024.110
  8. Пономаренко И.В., Полоников А.В., Верзилина И.Н., Чурносов М.И. Молекулярно-генетические детерминанты развития эндометриоза. Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. 2019; 18(1): 82-6 [Ponomarenko I.V., Polonikov A.V., Verzilina I.N., Churnosov M.I. Molecular-genetic determinants of the development of endometriosis. Gynecology, Obstetrics, and Perinatology. 2019; 18(1): 82-6 (in Russian)]. https:// dx.doi.org/10.20953/1726-1678-2019-1-82-86
  9. Signorile P.G., Baldi A., Viceconte R., Ronchi A., Montella M. Pathogenesis of endometriosis: focus on adenogenesis-related factors. In Vivo. 2023; 37(5): 1922-30. https://dx.doi.org/10.21873/invivo.13288
  10. Adilbayeva A., Kunz J. Pathogenesis of endometriosis and endometriosis-associated cancers. Int. J. Mol. Sci. 2024; 25(14): 7624. https:// dx.doi.org/10.3390/ijms25147624
  11. Kim H., Kim H.J., Ahn H.S. Does endometriosis increase the risks of endometrial hyperplasia and endometrial cancer? Gynecol. Oncol. 2023; 169: 147-53. https://dx.doi.org/10.1016/j.ygyno.2022.06.021
  12. Пономаренко И.В., Полоников А.В., Чурносов М.И. Молекулярные механизмы и факторы риска развития эндометриоза. Акушерство и гинекология. 2019; 3: 26-31. [Ponomarenko I.V., Polonikov A.V., Churnosov M.I. Molecular mechanisms of and risk factors for endometriosis. Obstetrics and Gynecology. 2019; (3): 26-31 (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18565/aig.2019.3.26-31
  13. Радзинский В.Е., Алтухова О.Б. Молекулярно-генетические детерминанты бесплодия при генитальном эндометриозе. Научные результаты биомедицинских исследований. 2018; 4(3): 28-37. [Radzinsky V.E., Altukhova O.B. Molecular-genetic determinants of infertility in genital endometriosis. Research Results in Biomedicine. 2018; 4(3): 28-37 (in Russian)]. https:// dx.doi.org/10.18413/2313-8955-2018-4-3-0-3
  14. Андреев А.Е., Клейменова Т.С., Дробинцева А.О., Полякова В.О., Кветной И.М. Сигнальные молекулы, вовлеченные в образование новых нервных окончаний при эндометриозе (обзор). Научные результаты биомедицинских исследований. 2019; 5(1): 94-107. [Andreev A.E., Kleimenova T.S., Drobintseva A.O., Polyakova V.O., Kvetnoy I.M. Signal molecules involved in formation of new nerve endings in endometriosis (review). Research Results in Biomedicine. 2019; 5(1): 94-107 (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18413/2313-8955-2019-5-1-0-7
  15. Narinx N., David K., Walravens J., Vermeersch P., Claessens F., Fiers T. et al. Role of sex hormone-binding globulin in the free hormone hypothesis and the relevance of free testosterone in androgen physiology. Cell. Mol. Life Sci. 2022; 79(11): 543. https://dx.doi.org/10.1007/s00018-022-04562-1
  16. Simons P.I.H.G., Valkenburg O., Stehouwer C.D.A., Brouwers M.C.G.J. Sex hormone-binding globulin: biomarker and hepatokine? Trends Endocrinol. Metab. 2021; 32(8): 544-53. https://dx.doi.org/10.1016/ j.tem.2021.05.002
  17. Coviello A.D., Haring R., Wellons M., Vaidya D., Lehtimäki T., Keildson S. et al. A genome-wide association meta-analysis of circulating sex hormone-binding globulin reveals multiple loci implicated in sex steroid hormone regulation. PLOS Genet. 2012; 8(7): e1002805. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1002805
  18. Harrison S., Davies N. M., Howe L. D., Hughes A. Testosterone and socioeconomic position: mendelian randomization in 306,248 men and women in UK Biobank. Sci. Adv. 2021; 7(31): eabf8257. https://dx.doi.org/10.1126/ sciadv.abf8257
  19. Пономарева Т.А., Алтухова О.Б., Пономаренко И.В., Чурносов М.И. Роль генетических факторов в формировании эндометриоидных поражений. Акушерство, гинекология и репродукция. 2023; 17(4): 443-54 [Ponomareva T.A., Altukhova O.B., Ponomarenko I.V., Churnosov M.I. The role of genetic factors in developing endometrioid lesions. Obstetrics, Gynecology and Reproduction. 2023; 17(4): 443-54 (in Russian)]. https://dx.doi.org/110.17749/2313-7347/ob.gyn.rep.2023.434
  20. Golovchenko I., Aizikovich B., Golovchenko O., Reshetnikov E., Churnosova M., Aristova I. et al. Sex hormone candidate gene polymorphisms are associated with endometriosis. Int. J. Mol. Sci. 2022; 23(22): 13691. https://dx.doi.org/10.3390/ijms232213691
  21. HaploReg v4.2. https://pubs.broadinstitute.org/mammals/haploreg/ haploreg.php (accessed 02.04.2025).
  22. GTExPortal. https://gtexportal.org/home (accessed 24.06.2025).
  23. PLINK v1.07. https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/ (accessed 02.04.2025).
  24. Ruth K.S., Day F.R., Tyrrell J., Thompson D.J., Wood A.R., Mahajan A. et al. Using human genetics to understand the disease impacts of testosterone in men and women. Nat. Med. 2020; 26(2): 252-8. https://dx.doi.org/10.1038/ s41591-020-0751-5
  25. Пасенов К.Н. Особенности ассоциаций SHBG-связанных генов с раком молочной железы у женщин в зависимости от наличия наследственной отягощенности и мутаций в генах BRCA1/CHEK2. Научные результаты биомедицинских исследований. 2024; 10(1): 69-88. [Pasenov K.N. Features of associations of SHBG-related genes with breast cancer in women, depending on hereditary burden and mutations in BRCA1/CHEK2 genes. Research Results in Biomedicine. 2024; 10(1): 69-88 (in Russian)]. https:// dx.doi.org/10.18413/2658-6533-2024-10-1-0-4
  26. Головченко И.О. Генетические детерминанты уровня половых гормонов у больных эндометриозом. Научные результаты биомедицинских исследований. 2023; 9(1): 5-21. [Golovchenko I.O. Genetic determinants of sex hormone levels in endometriosis patients. Research Results in Biomedicine. 2023; 9(1): 5-21 (in Russian)]. https://dx.doi.org/10.18413/ 2658-6533-2023-9-1-0-1
  27. Yuan S., Wang L., Sun J., Yu L., Zhou X., Yang J. et al. Genetically predicted sex hormone levels and health outcomes: phenome-wide Mendelian randomization investigation. Int. J. Epidemiol. 2022; 51(6): 1931-42. https:// dx.doi.org/10.1093/ije/dyac036
  28. Пономарева Т.А. Генетические варианты глобулина, связывающего половые гормоны, и гормональный профиль больных генитальным эндометриозом. Научные результаты биомедицинских исследований. 2025; 11(1): 75-90. [Ponomareva T.A. Genetic variants of sex hormone-binding globulin and hormonal profile in patients with genital endometriosis. Research Results in Biomedicine. 2025; 11(1): 75-90 (in Russian)]. https:// dx.doi.org/10.18413/2658-6533-2025-11-1-0-4
  29. Nees L.K., Heublein S., Steinmacher S., Juhasz-Böss I., Brucker S., Tempfer C.B. et al. Endometrial hyperplasia as a risk factor of endometrial cancer. Arch. Gynecol. Obstet. 2022; 306(2): 407-21. https://dx.doi.org/10.1007/ s00404-021-06380-5

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».