Applying Space-Variant Point Spread Function to Three-Dimensional Reconstruction of Fluorescence Microscopic Images


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Three-dimensional (3D) reconstruction of fluorescence microscopic images is a challenging topic in the image processing, because the imaging system is very complex, and the point spread function (PSF) continuously varies along the optical axis. Generally, the more exact the PSF is, the higher the reconstruction accuracy is. An image reconstruction method is proposed for fluorescence microscopic sample based on space-variant PSF (SV-PSF) which is generated by cubic spline theory in this paper. Firstly, key PSFs are estimated by blind deconvolution algorithm at several depths of fluorescence microscopic image stack along the optical axis. Then, other PSFs are interpolated using cubic spline theory. Finally, a 3D microscopic specimen model is reconstructed by this group of SV-PSFs. The experimental results show that the proposed method is obviously superior to the method in which space-invariant (SI) PSF is used to reconstruct the simulated and real fluorescence microscopic images.

Об авторах

Yu Wang

Beijing Key Laboratory of Big Data Technology for Food Safety School of Computer and Information Engineering Beijing Technology and Business University

Автор, ответственный за переписку.
Email: wangyu@btbu.edu.cn
Китай, Beijing, 100048

Xiaomeng Chen

Beijing Key Laboratory of Big Data Technology for Food Safety School of Computer and Information Engineering Beijing Technology and Business University

Email: wangyu@btbu.edu.cn
Китай, Beijing, 100048

Huan Jiang

Beijing Key Laboratory of Big Data Technology for Food Safety School of Computer and Information Engineering Beijing Technology and Business University

Email: wangyu@btbu.edu.cn
Китай, Beijing, 100048

Qian Cao

Beijing Key Laboratory of Big Data Technology for Food Safety School of Computer and Information Engineering Beijing Technology and Business University

Email: wangyu@btbu.edu.cn
Китай, Beijing, 100048

Xiuxin Chen

Beijing Key Laboratory of Big Data Technology for Food Safety School of Computer and Information Engineering Beijing Technology and Business University

Email: wangyu@btbu.edu.cn
Китай, Beijing, 100048

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Allerton Press, Inc., 2019

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».