Interaction of Cobalt Tetrasulfophthalocyanine with ORF8 Accessory Protein of SARS-CoV-2

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The interaction of cobalt(II) tetrasulfophthalocyanine (CoPc) with the ORF8 accessory protein of SARS-CoV-2 was studied by spectroscopy and calorimetry. The protein was found to shift the aggregation equilibrium in cobalt tetrasulfophthalocyanine solutions towards dimerization. Most probably, the CoPc dimer binds to ORF8 on the greater β-sheet side, thus causing fluorescence quenching. The protein affinity constant to CoPc dimer is 1.5 × 105. Differential scanning calorimetry data indicate that ORF8 undergoes thermally induced denaturation in the temperature range of 38–67°C. Melting of ORF8 includes two stages, which partly overlap. The complex formation of ORF8 with CoPc leads to thermal stabilization of the protein, thus preventing the second stage of protein unfolding. Denaturation of the complex proceeds between 40 and 77°C as two temperature-separated stages. According to gel electrophoresis and immunoblotting data, visible light photoirradiation of the ORF8 complex with CoPc does not induce photooxidation of the protein. It was shown that water-soluble cobalt sulfo-substituted phthalocyanine can be considered as a potential drug inhibiting the ORF8 accessory protein.

About the authors

O. I. Koifman

G.A. Krestov Institute of Solution Chemistry of the Russian Academy of Sciences, Ivanovo, Russia; Ivanovo State University of Chemical Technology, Ivanovo, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново; Россия, Иваново

V. E. Maizlish

Ivanovo State University of Chemical Technology, Ivanovo, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново

N. Sh. Lebedeva

G.A. Krestov Institute of Solution Chemistry of the Russian Academy of Sciences, Ivanovo, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново

E. S. Yurina

G.A. Krestov Institute of Solution Chemistry of the Russian Academy of Sciences, Ivanovo, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново

S. S. Guseinov

G.A. Krestov Institute of Solution Chemistry of the Russian Academy of Sciences, Ivanovo, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново

E. L. Guriev

Lobachevsky State University of Nizhny Novgorod, Nizhny Novgorod, Russia

Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Нижний Новгород

Yu. A. Gubarev

G.A. Krestov Institute of Solution Chemistry of the Russian Academy of Sciences, Ivanovo, Russia

Author for correspondence.
Email: gua@isc-ras.ru
Россия, Иваново

References

  1. Garcia-Vidal C., Meira F., Cózar-Llistó A. et al. // Revista Española de Quimioterapia. 2021. V. 34. P. 136. https://doi.org/10.37201/req/018.2021
  2. Benfield T., Bodilsen J., Brieghel C. et al. // Clin. Infect. Dis. 2021. V. 73. P. 2031. https://doi.org/10.1093/cid/ciab536
  3. Koifman O., Ageeva T., Kuzmina N.S. // Macroheterocycles. 2022. V. 15. P. 207. https://doi.org/10.6060/mhc224870k
  4. Lebedeva N.S., Gubarev Y.A., Koifman M.O. et al. // Molecules. 2020. V. 25. P. 4368. https://doi.org/10.3390/molecules25194368
  5. Gubarev Y.A., Lebedeva N.S., Yurina E.S. et al. // J. Biomol. Struct. Dyn. 2022. P. 1. https://doi.org/10.1080/07391102.2022.2079562
  6. Lebedeva N.S., Gubarev Y.A., Mamardashvili G.M. et al. // Sci. Reports. 2021. V. 11. P. 1. https://doi.org/10.1038/s41598-021-99072-8
  7. Koifman O.I., Lebedeva N.S., Gubarev Y.A. et al. // Chem. Heterocycl. Compd. 2021. V. 57. P. 423. https://doi.org/10.1007/s10593-021-02920-8
  8. Koifman M.O., Malyasova A.S., Romanenko Y.V. et al. // Spectrochim. Acta. A. 2022. V. 279. P. 121403. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.saa.2022.121403
  9. Koifman O.I., Ageeva T.A., Beletskaya I.P. et al. // Macroheterocycles. 2020. V. 13. https://doi.org/10.6060/mhc200814k
  10. Weber J.H., Busch D.H. // Inorg. Chem. 1965. V. 4. P. 469. https://doi.org/10.1021/ic50026a007
  11. Шапошников Г., Кулинич В., Майзлиш В. Модифицированные фталоцианины и их структурные аналоги. М.: Красанд, 2012.
  12. Майзлиш В., Мочалова Н., Снегирева Ф. и др. // Изв. вузов. Хим. и хим. технол. 1986. Т. 29. P. 3.
  13. Trott O., Olson A.J. // J. Comput. Chem. 2010. V. 31. P. 455. https://doi.org/10.1002/jcc.21334
  14. Zhang C., Zheng W., Huang X. et al. // J. Proteome Res. 2020. V. 19. P. 1351. https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.0c00129
  15. Zheng W., Zhang C., Li Y. et al. // Cell Reports Methods. 2021. P. 100014. https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2021.100014
  16. Neese F. // Wiley Interdiscip. Rev. Comput. Mol. Sci. 2022. V. 12. Art. e1606. https://doi.org/10.1002/wcms.1606
  17. Baker N.A., Sept D., Joseph S. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001. V. 98. P. 10037. https://doi.org/10.1073/pnas.181342398
  18. Zhang Y., Chen Y., Li Y. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2021. V. 118. Art. e2024202118. https://doi.org/10.1073/pnas.2024202118
  19. Li J.-Y., Liao C.-H., Wang Q. et al. // Virus Res. 2020. V. 286. P. 198074. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2020.198074
  20. Lebedeva N.S., Yurina E.S., Gubarev Y.A. et al. // J. Photochem. Photobiol. A. 2018. V. 353. P. 299. https://doi.org/10.1016/j.jphotochem.2017.11.037
  21. Lebedeva N.S., Popova T., Mal’kova E. et al. // Russ. J. Phys. Chem. A. 2013. V. 87. P. 2030. https://doi.org/10.1134/S0036024413120133
  22. Flower T.G., Buffalo C.Z., Hooy R.M. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2021. V. 118. Art. e2021785118. https://doi.org/10.1073/pnas.2021785118

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2.

Download (478KB)
3.

Download (181KB)
4.

Download (114KB)
5.

Download (52KB)
6.

Download (676KB)

Copyright (c) 2023 О.И. Койфман, В.Е. Майзлиш, Н.Ш. Лебедева, Е.С. Юрина, С.С. Гусейнов, Е.Л. Гурьев, Ю.А. Губарев

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».