ТРАНСКРИПТОМНЫЙ АНАЛИЗ ВЛИЯНИЯ УРОВНЯ ЦИТОСКЕЛЕТНОГО БЕЛКА ЗИКСИНА НА ПРОЦЕССЫ МЕТАБОЛИЗМА И СИГНАЛЬНЫЕ ПУТИ НА МОДЕЛИ ЭМБРИОНОВ ШПОРЦЕВОЙ ЛЯГУШКИ

Зиксин – белок цитоскелета, регулирующий сборку и восстановление активовых филаментов. Исследования, проведенные в нашей лаборатории на модели эмбрионов шпорцевой лягушки Xenopus laevis, показали, что зиксин играет важную роль в регуляции экспрессии генов и клеточной дифференцировке. В работах последних лет мы получили интересные данные, указывающие на способность этого механочувствительного белка участвовать в механизмах, связывающих морфогенетические движения с экспрессией генов, ответственных за формирование осевых структур и стволового статуса клеток в самом сложном процессе в жизни любого организма – эмбриогенезе. В этой статье мы представляем последние полученные результаты по поиску генов, сигнальных путей и биологических процессов, которые регулируются с участием зиксина. Для исследования было использовано высокопроизводительное секвенирование пулов мРНК из клеток эмбрионов X. laevis на стадии нейрулы с нормальной, повышенной и подавленной при помощи морфолиновых олигонуклеотидов функцией зиксина. Использование биоинформатического анализа позволило выделить из большого числа генов зиксин-зависимые сигнальные пути и биологические процессы, важные для эмбриогенеза. Показано, что подавление зиксина приводит к изменению в экспрессии генов-участников более 16 сигнальных каскадов и влияет на 27 биологических процессов, из которых наиболее выраженные связаны с морфогенезом и генной экспрессией. Результаты работы имеют прежде всего фундаментальное значение. Изучение роли зиксина в передаче сигналов от механических стимулов к аппарату генной экспрессии важно для изучения координации биомеханики и дифференцировки в ходе эмбриогенеза, а в перспективе предоставляет возможность использования зиксина в качестве потенциального диагностического маркера для ряда заболеваний.

сигнальные пути, секвенирование, генная онтология, биологические процессы, зиксин