Herbaria of Russia: The role in the study of biodiversity of the country, the problems of conservation and management
- Authors: Garin E.V.1, Garina D.V.1
-
Affiliations:
- Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS
- Issue: Vol 84, No 2 (2023)
- Pages: 144-154
- Section: Articles
- URL: https://journals.rcsi.science/0044-4596/article/view/136441
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0044459623020033
- EDN: https://elibrary.ru/RAHAMT
- ID: 136441
Cite item
Abstract
In order to preserve biodiversity on Earth, it is necessary to carry out an inventory of all forms of life as soon as possible, and this task is especially relevant for little-studied territories, including Russia. The terrestrial and aquatic ecosystems of Russia represent the largest array of natural extratropical ecosystems in Eurasia. To solve the problem of inventorying flora and fauna, biological collections are of particular importance; in a number of reviews by scientists (mainly foreign ones) the attention of the scientific and civil community is drawn to the problem of preserving and increasing the use of collections. The article examines the role of herbaria in the study of biodiversity in Russia based on a quantitative analysis of collections, their representation in various regions of the country, the degree of their digitalization and integration into the global world network of biological collections. It is concluded that the herbarium fund of Russia is insufficient in terms of the number of specimens and unevenly distributed across the regions, the smallest number of plant specimens is available for a number of regions of the north-east of Russia. About half of all Russian herbaria are not registered in Index Herbariorum, although the pace of digitalization of botanical collections in Russia has somewhat accelerated in recent decades. It also highlights the problem of the preservation of herbarium collections, outlines ways to solve it and prospects for the use of herbaria in the future. The authors believe that the priority measures should be: 1) the formation of a regulatory framework for working with biocollections, which, in particular, will make it possible to recognize herbarium collections as objects of cultural and scientific heritage, and provide special funding for collections; 2) introduction into the practice of centralized accounting of Russian herbaria and their inclusion in the international database; 3) a ban on writing off herbarium collections by organizations; 4) increasing the pace of digitalization of botanical collections; 5) staffing of herbaria by professional researchers; introducing of a herbarium course in specialized universities; 6) the allocation of separate rooms for herbariums, equipped with specialized cabinets and ventilation.
About the authors
E. V. Garin
Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS
Author for correspondence.
Email: garinev@ibiw.ru
Russia, 152742, Yaroslavskaya Region, Nekouz, Borok, 109
D. V. Garina
Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS
Email: garinev@ibiw.ru
Russia, 152742, Yaroslavskaya Region, Nekouz, Borok, 109
References
- Алимов А.Ф., Алтухов Ю.П., Амирханов А.М., Бобылев С.Н., Боголюбов С.А. и др., 2001. Национальная стратегия сохранения биоразнообразия России. М.: Проект ГЭФ “Сохранение биоразнообразия”. 76 с.
- Ботанические коллекции – национальное достояние России, 2015. Сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества (г. Пенза, 17–19 февраля 2015 г.) / Под ред. Новиковой Л.А. Пенза: Изд-во ПГУ. 408 с.
- Гарин Э.В., 2015а. Гербарий ИБВВ РАН на современном этапе // Ботанические коллекции – национальное достояние России: сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества. Пенза: Изд-во ПГУ. С. 28–30.
- Гарин Э.В., 2015б. К вопросу о частных гербариях // Ботанические коллекции – национальное достояние России: сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества. Пенза: Изд-во ПГУ. С. 31–33.
- Гарин Э.В., 2015в. Манжетка Литвинова в Тверской и Ярославской областях по фондам Гербария ИБВВ РАН (IBIW) // Междунар. журн. прикл. и фунд. исследований. № 6–3. С. 514.
- Грубов В.И., Сергиенко Л.А., 1988. О состоянии гербариев в СССР // Бот. журн. Т. 73. № 10. С. 1507–1511.
- Гуреева И.И., 2010. Мировой гербарный фонд и его распределение // Бот. журн. Т. 95. № 11. С. 1658–1667.
- Гуреева И.И., 2013. Гербарное дело: Руководство по организации Гербария и работе с гербарными коллекциями. 2-е изд., испр. и доп. Томск: Изд-во Томск. ун-та. 194 с.
- Казанцев М.Ф., 2018. Правовое регулирование в сфере биологических коллекций: система, состояние, развитие // Науч. ежегодник ИФиП УрО РАН. Т. 18. № 1. С. 94–143. https://doi.org/10.17506/ryipl.2016.18.1.94143
- Камелин Р.В., Буданцев А.Л., Павлов В.Н., 2019. Растительный мир России // Большая российская энциклопедия. https://old.bigenc.ru/text/v/3038905
- Каменский П.А., Сазонов А.Э., Федянин А.А., Садовничий В.А., 2016. Биологические коллекции: стремление к идеалу // Acta Naturae. Т. 8. № 2. С. 6–10.
- Конституция Российской Федерации с поправками от 30.12.2008 № 6-ФКЗ, от 30.12.2008 № 7-ФКЗ, от 05.02.2014 № 2-ФКЗ, от 21.07.2014 № 11-ФКЗ, от 14.03.2020 № 1-ФКЗ, от 04.10.2022 № 5-ФКЗ, 6‑ФКЗ, 7-ФКЗ, 8-ФКЗ.
- Лавренко Е.М., Скворцов А.К., Тахтаджян А.Л., Тихомиров В.Н., Юрцев Б.А., 1973. Гербарии: значение для общества, современное состояние, перспективы // Изв. АН СССР. Сер. биол. № 1. С. 5–12.
- Серёгин А.П., 2002. География гербарного дела в России // География и регион. V. Биогеография и биоразнообразие Прикамья: мат-лы Междунар. науч.-практ. конф. Пермь. С. 224–226. https://doi.org/10.13140/2.1.4993.7609
- Серёгин А.П., 2003. Регистрация Гербариев в Index Herbariorum: российский пример // Вісн. Луганського нац. пед. ун-ту ім. Т.Г. Шевченка. Біол. науки. № 11. С. 69–72. https://doi.org/10.13140/2.1.1948.3840
- Скворцов А.К., 1973. Гербарий – основа систематической и географической ботаники // Природа. № 9. С. 2–9.
- Скворцов А.К., 1977. Гербарий. Руководство по методике и технике. М.: Наука. 199 с.
- Скворцов А.К., Проскурякова Г.М., 1973. Гербарий Главного ботанического сада АН СССР // Бот. журн. Т. 58. № 1. С. 155–161.
- Фомина Н.А., Антонова О.Ю., Чухина И.Г., Гавриленко Т.А., 2019. Гербарные коллекции в молекулярно-генетических исследованиях // Turczaninowia. Т. 22. № 4. C. 104–118. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.22.4.12
- Хлёсткина Е.К., Захарова М.В., Нижников А.А., Гельтман Д.В., Чернецов Н.С. и др., 2022. Первый научный форум “Генетические ресурсы России” – о правовом регулировании в сфере биоресурсов и биологических коллекций // Биотехнология и селекция растений. Т. 5. № 2. С. 48–54. https://doi.org/10.30901/2658-6266-2022-2-o2
- Чеченкина Т.В., Сотникова М.В., 2019. Можно ли оценить бесценное? К вопросу о сравнении стоимости научных коллекций // Управление наукой и наукометрия. Т. 14. № 4. С. 567–583. https://doi.org/10.33873/2686-6706.2019.14-4.567-583
- Шиян Н.М., 2011. Гербарії України. Index Herbariorum Ucrainicum. Київ: “Альтерпрес”. 442 с.
- Юрцев Б.А., Тихомиров В.Н., Скворцов А.К., 1991. Гербарии взывают о помощи // Вестн. АН СССР. № 2. С. 131–135.
- Bakker F.T., 2019. Herbarium genomics: Plant archival DNA explored // Paleogenomics, Population Genomics / Eds Lindqvist C., Rajora O.P. Switzerland: Springer Nature. P. 205–224. https://doi.org/10.1007/978-3-030-04753-5
- Bakker F.T., Bieker V.C., Martin M.D., 2020. Editorial: Herbarium collection-based plant evolutionary genetics and genomics // Front. Ecol. Evol. V. 8. Art. 603948. https://doi.org/10.3389/fevo.2020.603948
- Bakker F.T., Lei D., Yu J., Mohammadin S., Wei Z. et al., 2016. Herbarium genomics: Plastome sequence assembly from a range of herbarium specimens using an iterative organelle genome assembly pipeline // Biol. J. Linn. Soc. V. 117. P. 33–43. https://doi.org/10.1111/bij.12642
- Bertuol-Garcia D., Morsello C., El-Hani C.N., Pardini R., 2018. A conceptual framework for understandingthe perspectives on the causes of the science – practice gap in ecology and conservation // Biol. Rev. Camb. Philos. Soc. V. 93. № 2. P. 1032–1055. https://doi.org/10.1111/brv.12385
- Buerki S., Baker W.J., 2016. Collections-based research in the genomic era // Biol. J. Linn. Soc. V. 117. № 1. P. 5–10. https://doi.org/10.1111/bij.12721
- Crisci J.V., Katinas L., Apodaca M.J., Hoch P.C., 2020. The end of botany // Trends Plant Sci. V. 25. № 16. P. 1173–1176. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2020.09.012
- Feeley K., 2012. Distributional migrations, expansions, and contractions of tropical plant species as revealed in dated herbarium records // Glob. Change Biol. V. 18. № 4. P. 1335–1341. https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02602.x
- Funk V.A., 2003. 100 uses for an herbarium: Well at least 72 // Am. Soc. Pl. Taxon. Newsl. V. 17. P. 17–19.
- Funk V.A., 2018. Collections-based science in the 21st Century // J. Sist. Evol. V. 56. № 3. P. 175–193. https://doi.org/10.1111/jse.12315
- Garin E.V., 2023. List of herbariums of Russia // Mendeley Data. Ver. 1. https://doi.org/10.17632/wc9j7xr772.1
- Heberlink J.M., Isaak B.L., 2017. Herbarium specimens as exaptations: New uses for old collections // Am. J. Bot. V. 104. P. 963–965. https://doi.org/10.3732/ajb.1700125
- Holmes M.W., Hammond T.T., Wogan G.O.U., Walsh R.E., LaBarbera K. et al., 2016. Natural history collections as windows on evolutionary processes // Mol. Ecol. V. 25. P. 864–881. https://doi.org/10.1111/mec.13529
- Ivanova N.V., Shashkov M.P., 2016. Biodiversity databases in Russia: Towards a national portal // Arctic Sci. V. 3. № 3. P. 560–576. https://doi.org/10.1139/as-2016-0050
- Jarvis R.M., Borrelle S.B., Forsdick N.J., Pérez-Hämmerle K.-V., Dubois N.S. et al., 2020. Navigating spaces between conservation research and practice: Are we making progress? // Ecol. Solut. Evid. V. 1. Art. e12028. https://doi.org/10.1002/2688-8319.12028
- Kemp C., 2015. Museums: The endangered dead // Nature. V. 518. P. 292–294. https://doi.org/10.1038/518292a
- Knight A.T., Cowling R.M., Rouget M., Balmford A., Lombard A.T., Campbell B.M., 2008. Knowing but not doing: selecting priority conservation areas and the research-implementation gap // Conserv. Biol. V. 22. № 3. P. 610–617. https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2008.00914.x
- Lavoie C., 2013. Biological collections in an everchanging world: Herbaria as tools for biogeographical and environmental studies // Perspect. Plant Ecol. Evol. Syst. V. 15. № 1. P. 68–76. https://doi.org/10.1016/j.ppees.2012.10.002
- McLean B.S., Bell K.C., Dunnum J.L., Abrahamson B., Colella J.P. et al., 2016. Natural history collections-based research: progress, promise, and best practices // J. Mammal. V. 97. № 1. P. 287–297. https://doi.org/10.1093/jmammal/gyv178
- Meineke E.K., Davies T.J., Daru B.H., Davis C.C., 2018. Biological collections for understanding biodiversity in the Anthropocene // Phil. Trans. R. Soc. B. V. 374. Art. 20170386. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0386
- Natural-history collections face fight for survival, 2017 // Nature. V. 544. P. 137–138. https://doi.org/10.1038/544137b
- Nelson G., Ellis S., 2018. The history and impact of digitization and digital data mobilization on biodiversity research // Phil. Trans. R. Soc. B. V. 374. Art. 20170391. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0391
- Nevill P.G., Zhong X., Tonti‑Filippini J., Byrne M., Hislop M. et al., 2020. Large scale genome skimming from herbarium material for accurate plant identification and phylogenomics // Plant Methods. V. 16. Art. 1. https://doi.org/10.1186/s13007-019-0534-5
- Nualart N., Ibáñez N., Soriano I., López-Pujol J., 2017. Assessing the relevance of herbarium collections as tools for conservation biology // Bot. Rev. V. 83. P. 303–325. https://doi.org/10.1007/s12229-017-9188-z
- Parnell J., 1996. The monetary value of herbarium collections // Systematics and Biological Collections. Abstracts of Papers and Posters / Ed. Rushton B.S. Belfast: Ulster Museum. P. 33–34.
- Parnell J., 2001. The monetary value of herbarium collections // Biological Collections & Biodiversity / Eds Rushton B.S., Hackney P., Tyrie C.R. Otley: Linnean Society of London. P. 271–286.
- Ronsted N., Grace O.M., Carine M.A., 2020. Editorial: Integrative and translational uses of herbarium collections across time, space, and species // Front. Plant Sci. V. 11. Art. 1319. https://doi.org/10.3389/fpls.2020.01319
- Seregin A.P., 2016. Making the Russian flora visible: Fast digitisation of the Moscow University herbarium (MW) in 2015 // Taxon. V. 65. № 1. P. 205–207. https://doi.org/10.12705/651.29
- Seregin A.P., 2018. The largest digital herbarium in Russia is now available online! // Taxon. V. 67. № 2. P. 463–467. https://doi.org/10.12705/672.34
- Seregin A.P., 2020. Moscow Digital Herbarium: A consortium since 2019. https://www.researchgate.net/publication/339052464_Moscow_Digital_Herbarium_a_consortium_since_2019. https://doi.org/10.13140/RG.2.2.17337.93283
- Shenzhen Declaration Drafting Committee, 2017. The Shenzhen Declaration on Plant Sciences – Uniting plant sciences and society to build a green, sustainable Earth // PhytoKeys. V. 86. P. 3–7. https://doi.org/10.3897/phytokeys.86.20859
- Vere N., de, Rich T.C.G., Trinder S.A., Long C., 2015. DNA barcoding for plants // Methods Mol. Biol. V. 1245. P. 101–118. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1966-6_8
- Zeng C.-X., Hollingsworth P.M., Yang J., He Z.-S., Zhang Z.-R. et al., 2018. Genome skimming herbarium specimens for DNA barcoding and phylogenomics // Plant Methods. V. 14. Art. 43. https://doi.org/10.1186/s13007-018-0300-0