In vitro исследование противовирусных свойств соединений на основе тетрагидропиранового производного клозо-декаборатного аниона с остатками эфиров аминокислот в отношении вируса гриппа A/IIV-Orenburg/83/2012(H1N1)pdm09

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Исходя из замещенного производного декагидро-клозо-декаборатного аниона (Ph4P)2[B10H9O(CH2)6COOH], полученного при раскрытии тетрагидропиранового заместителя в анионе [B10H9O(CH2)5] под действием малонового эфира, синтезирован ряд соединений Na2[B10H9O(CH2)6C(O)X], где X = Trp-OMe (1), His-OMe (2), Met-OMe (3), Ala(2-оксопирролидин-3-ил)-OMe (Pld-OMe) (4), содержащих различные аминокислотные заместители, присоединенные по пендантной карбоксильной группе. Соединения были выделены в виде натриевых солей. Остатки L-триптофана (Trp-OMe в Na21) и L-гистидина (His-OMe в Na22) содержали в качестве боковой группы ароматические гетероциклические группы индол и имидазол соответственно. Соединения Na23 и Na24 содержали в качестве боковой группы замещенные алканы: L-метионин (Met-OMe в Na23) содержал метилэтилсульфидную группу, а соединение Na24 содержало остаток алифатической синтетической аминокислоты, в которой боковая группа представлена γ-бутиролактамом (2-оксопирролидин-3-ил) (Pld-OMe). Обнаружено, что соединения Na21 и Na22 проявляли дозозависимую противовирусную активность в отношении штамма вируса гриппа A/IIV-Orenburg/83/2012(H1N1)pdm09 in vitro. IC50 для соединения Na21 составила 5.0 мкг/мл, а для соединения Na22 – 10.0 мкг/мл. Проведено молекулярное моделирование стыковки поры белка М2 и соединений Na21 и Na22. Обнаружено, что наиболее вероятное расположение молекул в поре канала М2 связано с нахождением гетероцикла внутри поры канала М2 в районе остатков His37-Trp41, причем для соединения Na21 такое расположение более выгодно, чем для соединения Na22, что объясняет некоторое различие в концентрациях подавления вирусной репродукции для Na21 и Na22. Для соединений Na23 и Na24 противовирусная активность не выявлена.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Т. М. Гараев

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

И. И. Юдин

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

Н. В. Бреслав

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

Т. В. Гребенникова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

Е. И. Бурцева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 123098, Москва, ул. Гамалеи, 18

Е. Ю. Матвеев

МИРЭА – Российский технологический университет; Институт общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова РАН

Email: avdeeva.varvara@mail.ru

Институт тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова

Россия, 119571, Москва, пр-т Вернадского, 86; 119991, Москва, Ленинский пр-т, 31

Е. А. Ештукова-Щеглова

МИРЭА – Российский технологический университет

Email: avdeeva.varvara@mail.ru

Институт тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова

Россия, 119571, Москва, пр-т Вернадского, 86

И. Е. Соколов

МИРЭА – Российский технологический университет

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 119571, Москва, пр-т Вернадского, 86

В. В. Авдеева

Институт общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 119991, Москва, Ленинский пр-т, 31

К. Ю. Жижин

МИРЭА – Российский технологический университет; Институт общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова РАН

Email: avdeeva.varvara@mail.ru

Институт тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова

Россия, 119571, Москва, пр-т Вернадского, 86; 119991, Москва, Ленинский пр-т, 31

Н. Т. Кузнецов

Институт общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова РАН

Email: avdeeva.varvara@mail.ru
Россия, 119991, Москва, Ленинский пр-т, 31

Список литературы

  1. Reid A.H., Taubenberger J.K., Fanning T.G. // Microbes Infect. 2001. V. 3. P. 81. https://doi.org/10.1016/s1286-4579(00)01351-4
  2. Garten R.J., Davis C.T., Russell C.A., Shu B. // Science. 2009. V. 325. P. 197. https://doi.org/10.1126/science.1176225
  3. WHO. Avian influenza in humans. 2012. http://www.who.int/csr/disease/avian_influenza/
  4. Imai M., Watanabe T., Hatta M. et al. // Nature. 2012. V. 486. P. 420. https://doi.org/10.1038/nature10831
  5. Herfst S., Schrauwen E.J.A., Linster M. et al. // Science. 2012. V. 336. P. 1534. https://doi.org/10.1126/science.1213362
  6. WHO. Global Influenza Programme. 2012. Available: http://www.who.int/influenza/en/
  7. Mohanty P., Panda P., Acharya R.K. et al. // World J. Virol. 2023. V. 12. P. 242. https://doi.org/10.5501/wjv.v12.i5.242
  8. Batool S., Chokkakula S., Song M.S. // Microorganisms. 2023. V. 11. P. 183. https://doi.org/10.3390/microorganisms11010183
  9. Toots M., Plemper R.K. // Transl Res. 2020. V. 220. P. 33. https://doi.org/10.1016/j.trsl.2020.01.005
  10. Нелюбин А.В., Клюкин И.Н., Жданов А.П. и др. // Журн. неорган. химии. 2021. Т. 66. № 2. С. 134. https://doi.org/10.31857/S0044457X21020136
  11. Nelyubin A.V., Klyukin I.N., Zhdanov A.P. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2019. V. 64. № 14. P. 1750. https://doi.org/10.1134/S0036023619140043
  12. Zhizhin K.Y., Zhdanov A.P., Kuznetsov N.T. // Russ. J. Inorg. Chem. 2010. V. 55. № 14. P. 2089. https://doi.org/10.1134/S0036023610140019
  13. Акимов С.С., Матвеев Е.Ю., Разгоняева Г.А. и др. // Изв. АН. Сер. хим. 2010. № 2. С. 364.
  14. Klyukin I.N., Zhdanov A.P., Matveev E.Yu. et al. // Inorg. Chem. Commun. 2014. V. 50. P. 28. https://doi.org/10.1016/j.inoche.2014.10.008
  15. Klyukin I.N., Kubasov A.S., Limarev I.P. et al. // Polyhedron. 2015. V. 101. P. 215. https://doi.org/10.1016/j.poly.2015.09.025
  16. Клюкин И.Н., Воинова В.В., Селиванов Н.А. и др. // Журн. неорган. химии. 2018. Т. 63. № 12. С. 1536.
  17. Матвеев Е.Ю., Кубасов А.С., Разгоняева Г.А. и др. // Журн. неорган. химии. 2015. Т. 60. № 7. С. 858.
  18. Retivov V.M., Matveev E.Yu., Lisovskiy M.V. et al. // Russ. Chem. Bull. 2010. V. 59. P. 550. https://doi.org/10.1007/s11172-010-0123-2
  19. Al-Joumhawy M., Cendoya P., Shmalko A. et al. // J. Organomet. Chem. 2021. V. 949. P. 121967. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2021.121967
  20. Laila Z., Ghaida F., Anwar S. et al. // Main Group Chem. 2015. V. 14. P. 301. https://doi.org/10.3233/MGC-150173
  21. Hawthorne M.F., Mavunkal I.J., Knobler C.B. // J. Am. Chem. Soc. 1992. V. 114. P. 4427. https://doi.org/10.1021/ja00037a074
  22. Laila Z., Yazbeck O., Ghaida F. et al. // J. Organomet. Chem. 2020. V. 910. P. 121132. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2020.121132
  23. Norman A.H., Kaczmarczyk A. // Inorg. Chem. 1974. V. 13. P. 2316. https://doi.org/10.1021/ic50140a005
  24. Peymann T., Hawthorne M.F. // Inorg. Chem. 2000. V. 39. P.1163.
  25. Hall H.D., Ulrich B.D., Kultyshev R.G. et al. // Collect. Czech. Chem. Commun. 2002. V. 67. P. 1007. https://doi.org/10.1135/cccc20021007
  26. Sivaev I.B., Prikaznov A.V., Naoufal D. // Collect. Czech. Chem. Commun. 2010. V. 75. P. 1149. https://doi.org/10.1135/cccc2010054
  27. Sivaev I.B., Bregadze V.I., Sjöberg S. // Collect. Czech. Chem. Commun. 2002. V. 67. P. 679. https://doi.org/10.1135/cccc20020679
  28. Peymann T., Gabel D. // Inorg. Chem. 1997. V. 36. P. 5138. https://doi.org/10.1021/ic970647t
  29. Prikaznov A.V., Semioshkin A.A., Sivaev I.B. et al. // Russ. Chem. Bull. 2011. V. 60. P. 2550. https://doi.org/10.1007/s11172-011-0392
  30. Justus E., Izteleuova D.T., Kasantsev A.V. et al. // Collect. Czech. Chem. Commun. 2007. V. 72. P. 1740. https://doi.org/10.1135/cccc200071740
  31. Serdyukov A., Kosenko I., Druzina A. et al. // J. Organomet. Chem. 2021. V. 946. P. 121905. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2021.121905
  32. Matveev E.Y., Kubasov A.S., Nichugovskii A.I. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2023. V. 68. P. 644. https://doi.org/10.1134/S0036023623600545
  33. Imperio D., Muz B., Azab A.K. et al. // Eur. J. Org. Chem. 2019. V. 2019. P. 7228. https://doi.org/10.1002/ejoc.201901412
  34. Matveev E.Y., Razgonyaeva G.A., Mustyatsa V.N. et al. // Russ. Chem. Bull. 2010. V. 59. P. 556. https://doi.org/10.3390/inorganics10120238
  35. Semioshkin A., Laskova J., Ilinova A. et al. // J. Organomet. Chem. 2011. V. 696. P. 539.
  36. Matveev E.Y., Retivov V.M., Razgonyaeva G.A. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2011. V. 56. P. 1549. https://doi.org/10.1134/S0036023611100160
  37. Матвеев Е.Ю., Лимарев И.П., Ничуговский А.И. и др. // Журн. неорган. химии. 2019. Т. 64. № 8. С. 811. https://doi.org/10.1134/S0044457X19080087
  38. Матвеев Е.Ю., Левицкая В.Я., Новиков С.С. и др. // Журн. неорган. химии. 2022. Т. 67. С. 1717. https://doi.org/10.31857/S0044457X22601031
  39. Orlova A.V., Kondakov N.N., Kimel B.G. et al. // Appl. Organomet. Chem. 2007. V. 21. P. 98. https://doi.org/10.1002/aoc.1151
  40. Druzina A.A., Zhidkova O.B., Kosenko I.D. // Russ. Chem. Bull. 2020. V. 69. P. 1080. https://doi.org/10.1007/s11172-020-2870-z
  41. Meschaninova M.I., Novopashina D.S., Semikolenova O.A. et al. // Molecules. 2019. V. 24. № 23. P. 4266. https://doi.org/10.3390/molecules24234266
  42. Druzina A.A., Grammatikova N.E., Zhidkova O.B. et al. // Molecules. 2022. V. 27. P. 2920. https://doi.org/10.3390/molecules27092920
  43. Semioshkin A., Laskova J., Wojtczak B. et al. // J. Organomet. Chem. 2009. V. 694. P. 1375. https://doi.org/10.1016/j.jorganchem.2008.12.024
  44. Shibnev V.A., Deryabin P.G., Garaev T.M. et al. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2017. V. 43. P. 517. https://doi.org/10.1134/S1068162017050132
  45. Avdeeva V.V., Garaev T.M., Breslav N.V. et al. // J. Biol. Inorg. Chem. 2022. V. 27. P. 421. https://doi.org/10.1007/s00775-022-01937-4
  46. Garaev T.M., Grebennikova T.V., Avdeeva V.V. et al. // Probl. Virol. (Vopr. Virusol.). 2023. V. 68. P. 18. https://doi.org/10.36233/0507-4088-147
  47. Жижин К.Ю., Мустяца В.Н., Малинина Е.А. и др. // Журн. неорган. химии. 2004. Т. 49. № 2. С. 221.
  48. Shibnev V.A., Garaev T.M., Finogenova M.P. et al. // Bull. Exp. Biol. Med. 2012. V. 153. P. 233. https://doi.org/10.1007/s10517-012-1684-x
  49. Corso G., Jing H., Barzilay B., Jaakkola R. // DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking. 2022. https://doi.org/10.48550/arXiv.2210.01776
  50. Eberhardt J., Santos-Martins D., Tillack A.F., Forli S. // J. Chem. Inf. Model. 2021. V. 23. P. 3891. https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00203
  51. Ryabchikova M.N., Nelyubin A.V., Klyukin I.N. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2024. https://doi.org/10.1134/S0036023624601892
  52. Ryabchikova M.N., Nelyubin A.V., Smirnova A.V. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2024. https://doi.org/10.1134/S003602362460093X
  53. Сиваев И.Б. Дис. … докт. хим. наук. М., 2014.
  54. Avdeeva V.V., Garaev T.M., Malinina E.A. et al. // Russ. J. Inorg. Chem. 2022. V. 67. P. 28. https://doi.org/10.1134/S0036023622010028
  55. Fu R., Miao Y., Qin H. // J. Am. Chem. Soc. 2020. V. 142. P. 2115. https://doi.org/10.1021/jacs.9b09985

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Приложение 1.
Скачать (17KB)
3. Приложение 2.

Скачать (585KB)
4. Схема 1. Синтез аминокислотных производных клозо-декабораного аниона 12––42– с эфирами аминокислот, отстоящих от борного кластера на величину линкера (раскрытого цикла молекулы тетрагидропирана).

Скачать (103KB)
5. Рис. 1. a) Комплекс 12− и трансмембранного домена протон-проводящего канала М2 вируса гриппа А. б) Комплекс 22− и трансмембранного домена протон-проводящего канала М2 вируса гриппа А. Отмечены важные аминокислотные остатки внутри поры канала. Зеленым отмечены валин, лейцин, изолейцин; белым – глицин, аланин; голубым – аспарагин (Asn31); фиолетовым – гистидин (His37); лиловым – триптофан (Trp41).

Скачать (314KB)

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».