Genetic Diversity of the European Perch ( Perca fluviatilis  Linnaeus, 1758) from Some Rivers of Russia

L. T. Bachevskaya; Бачевская Л. Т.; V. V. Pereverzeva; Переверзева В. В.; G. A. Agapova; Агапова Г. А.; A. A. Primak; Примак А. А.

doi:10.31857/S0042132423030031

Genetic Diversity of the European Perch (Perca fluviatilis Linnaeus, 1758) from Some Rivers of Russia

Авторлар: Bachevskaya L.¹, Pereverzeva V.¹, Agapova G.¹, Primak A.¹
Мекемелер:
1. Institute of Biological Problems of the North, Far Eastern Branch of the Russian Academy of Sciences
Шығарылым: Том 143, № 3 (2023)
Беттер: 261-269
Бөлім: Articles
URL: https://journals.rcsi.science/0042-1324/article/view/138957
DOI: https://doi.org/10.31857/S0042132423030031
EDN: https://elibrary.ru/QPUAQW
ID: 138957

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Ашық рұқсат
Рұқсат жабық

Рұқсат берілді
Рұқсат жабық

Тек жазылушылар үшін

Аннотация
Авторлар туралы
Әдебиет тізімі
Қосымша файлдар
Статистика

Аннотация

Data on the nucleotide sequence variability of the mtDNA cytochrome b gene of the European perch (Perca fluviatilis Linnaeus, 1758) from the rivers of the Volga and the Kolyma basins were obtained. An assessment of the genetic diversity of the European perch from the studied populations was carried out. A high level of divergence was noted between the perch samples from the rivers of different regions. At the same time, it was shown that, according to the genetic parameters, the samples of the European perch from the rivers of the same water basin had statistically significant differences. Phylogenetic analysis based on the found haplotypes of the mtDNA cytochrome b gene led to the conclusion that the Kolyma perch cannot claim the status of a subspecies of P. fluviatilis.

Негізгі сөздер

mtDNA cytochrome b gene polymorphism (cytb), genetic diversity of European perch (Perca fluviatilis), intraspecific divergence

Әдебиет тізімі

Баранова Ю.П., Бискэ С.Ф. Северо-Восток СССР. М.: Наука, 1964. 350 с.
Бачевская Л.Т., Переверзева В.В., Примак А.А., Агапова Г.А. Нуклеотидная изменчивость гена цитохрома b мтДНК сибирского чукучана Catostomus catostomus rostratus из рек Колымо-Индигирской низменности // Вестн. СВНЦ ДВО РАН. 2019. № 3. С. 109–116.
Берг Л.С. Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран. Ч. 3. М., Л.: Изд-во АН СССР, 1949. С. 929–1372.
Жигилева О.Н., Егорова А.Г., Хохлов Д.А. Особенности генетики популяций некоторых видов хищных рыб Обь-Иртышского бассейна // Пробл. популяционной биологии / Мат. ХII всерос. популяционного семинара. 2017. С. 91–93.
Жигилева О.Н., Егорова А.Г., Сарьянова А.В. Морфология и генетическая изменчивость речного окуня Perca fluviatilis (Percidae) речных и озерных экосистем Западной Сибири // Вестн. рыбохоз. науки. 2019. Т. 6. № 3 (23). С. 4–16.
Кириллов Ф.Н. Рыбы Якутии. М.: Наука, 1972. 359 с.
Кириллов А.Ф. Промысловые рыбы Якутии. М.: Научный мир, 2002. 194 с.
Козырева А.А., Злотина А.М., Головкин А.С. и др. Конструирование праймеров для ПЦР в программе Primer-BLAST // Трансляц. медицина. 2021. Т. 8 (3). С. 37–52.
Лебедев В.Д. Остатки окуня Perca fluviatilis L. в четвертичных отложениях северо-востока Сибири // Вопр. ихтиол. 1960. Вып. 14. С. 63–65.
Мамилов Н.Ш., Митрофанов И.В., Кириллов А.Ф. Морфологическая и генетическая дивергенция обыкновенного окуня Perca fluviatilis L. (Perciformes; Perciformes) из реки Колымы // Вестн. КазГУ. Сер. биол. 1998. № 5. С. 57–64.
Новиков А.С. Рыбы реки Колымы. М.: Наука, 1966. 135 с.
Решетников Ю.С., Попова О.А., Соколов Л.И. и др. Атлас пресноводных рыб России. М.: Наука, 2002. Т. 2. 253 с.
Романов В.И. Рыбы России в системе мировой ихтиофауны. Томск: Дельтаплан, 2010. 276 с.
Световидов А.Н., Дорофеева Е.А. Систематические отношения, происхождение и история расселения европейско-азиатских и североамериканских окуней и судаков (роды Реrса, Lucioperca и Stizostedion) // Вопр. ихтиол. 1963. Вып. 4. С. 625–651.
Черешнев И.А. Происхождение пресноводной ихтиофауны районов Берингии // Биогеография Берингийского сектора Субарктики. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1986. С. 122–145.
Черешнев И.А. Биогеография пресноводных рыб Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 1998. 130 с.
Черешнев И.А. Пресноводные рыбы Чукотки. Магадан: СВНЦ ДВО РАН, 2008. 324 с.
Черешнев И.А., Шестаков А.В., Скопец М.Б. Определитель пресноводных рыб Северо-Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2001. 197 с.
Шедько С.В. Обзор пресноводной ихтиофауны // Растительный и животный мир Курильских островов. Владивосток: Дальнаука, 2002. С. 118–134.
Avise J.C. Molecular markers, natural history and evolution. N. Y.; L.: Chapman and Hall, 1994. 511 p.
Behrmann-Godel J., Gerlach G. First evidence for postzygotic reproductive isolation between two populations of Eurasian perch (Perca fluviatilis L.) within Lake Constance // Front. Zool. 2008. V. 5 (3). P. 1–7.
Bergek S., Björklund M. Cryptic barriers to dispersal within a lake allow genetic differentiation of Eurasian perch // Evolution. 2007. V. 61 (8). P. 2035–2041.
Bergek S., Björklund M. Genetic and morphological divergence reveals local subdivision of perch (Perca fluviatilis L.) // Biol. J. Linn. Soc. Lond. 2009. V. 96. P. 746–758.
Bergek S., Sundblad G., Björklund M. Population differentiation in perch Perca fluviatilis: environmental effects on gene flow // Fish Biol. 2010. V. 76. P. 1159–1172.
Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: an integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinform. Online. 2005. V. 1. P. 47–50.
Faulks L., Svanbäck R., Eklöv P., Östman Ö. Genetic and morphological divergence along the littoral-pelagic axis in two common and sympatric fishes: perch, Perca fluviatilis (Percidae) and roach, Rutilus rutilus (Cyprinidae) // Biol. J. Linn. Soc. Lond. 2015. V. 114 (4). P. 929–940.
Fokina O., Grauda D., Rashal I. Genetic diversity of two perch Perca fluviatilis populations of the Latgale region // Environ. Technol. Res. 2015. V. 11. P. 96–98.
Fu Y.X. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth, hitchhiking and background selection // Genetics. 1997. V. 147. P. 915–925.
Fu Y., Li W. Statistic test of neutrality of mutations // Genetics. 1993. V. 133. P. 693–709.
Gerlach G., Schardt U., Eckmann R., Meyer A. Kin-structured subpopulations in Eurasian perch (Perca fluviatilis L.) // Heredity. 2001. V. 86 (2). P. 213–221.
Gharibkhani M. The genetic structure and phylogenetics of pikeperch (Sander lucioperca) Anzali and Amirkolaye wetlands and perch (Perca fluviatilis) populations in Aras Dam and south-west of the Caspian Sea: PhD Thesis. Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran. 2009. 195 p.
Gyllensten U., Ryman N., Stahl G. Monomorphism of allozymes in perch (Perca fluviatilis L.) // Hereditas. 1985. V. 102. P. 57–61.
Heldstab H., Katoh M. Low genetic variation in perch (Perca fluviatilis L.) from three major European drainage systems in Switzerland // Aqua. Sci. 1995. V. 57 (1). P. 14–19.
Kohlmann K., Louati M., Kersten P. et al. Detection of two major cytochrome b lineages in pike-perch, Sander lucioperca, and first data on their distribution in European populations // Environ. Biotechnol. 2013. № 9. P. 1–5.
Miller S., Underwood T., Spearman W.J. Genetic assessment of inconnu (Stenodus leucichthys) from the Selawik and Kobuk rivers, Alaska, using PCR and RFLP analyses // Alaska Fish. Techn. Rep. 1998. № 48. P. 1–13.
Nesbo C., Fossheim T., Vollestad L., Jakobsen K. Genetic divergence and phylogeographic relationships among European perch (Perca fluviatilis) populations reflect glacial refugia and postglacial colonization // Mol. Ecol. 1999. V. 8. P. 1387–1404.
Nesbo C., Mohammed O., Jakobsen K. Genetic differentiation among stationary and anadromous perch (Perca ftuviatilis) in the Baltic Sea // Hereditas. 1998. V. 129. P. 241–249.
Sloss B.L., Billington N., Burr B.M. A molecular phylogeny of the Percidae (Teleostei, Perciformes) based on mitochondrial DNA sequence // J. Mol. Phylogen. Evol. 2004. V. 32 (2). P. 545–562.
Sruoga A., Rashal I., Butkauskas D., Ložys L. Variety of mtDNA haplotypes in the populations of the European perch (Perca fluviatilis) of the Curonian Lagoon, the coastal zone of the Baltic Sea and the Gulf of Rīga // Proc. Latvian Acad. Sci. 2007. V. 61 (3–4). P. 20–30.
Stepien C.A., Behrmann-Godel J., Bernatchez L. Population genetics, and ecological and genomic adaptations of perch (Perca) // Biology of Perch / Eds P. Couture, G. Pyle. Boca Raton: CRC Press, 2015. P. 7–46.
Tajima F. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism // Gen. Soc. Am. 1989. V. 123. P. 585–595.
Tamura K., Stecher G., Peterson D. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0 // Mol. Bio.l Evol. 2013. V. 30 (12). P. 2725–2729.
Zhigileva O.N., Egorova A.G. The genetic variability and phenotypic diversity in populations of the Eurasian perch, Perca fluviatilis (Actinopterygii, Percidae) // Acta Biol. Sibirica. 2022. V. 8. P. 237–252.
Yang X.X., Wang C.H., Wang J. et al. Isolation and characterization of 12 polymorphic microsatellite loci in Eurasian perch (Perca fluviatilus L.) // Conser. Gen. Res. 2009. V. 1. P. 229–231.
Yang R., Ma Z., Beliczky G., Havasi M., Bercsenyi M. The complete mitochondrial genome of perch Perca fluviatilis (Perciformes: Percidae) // Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq. Anal. 2016. V. 27 (3). P. 1953–1954.