Анализ носительства клинически значимых аллельных вариантов генов TPMT и DPYD, ассоциированных с ответом на лекарственную терапию в онкогематологической практике, среди 9 этнических групп Российской Федерации
- Авторы: Мирзаев К.Б.1, Федоринов Д.С.1, Акмалова К.А.1, Абдуллаев Ш.П.1, Качанова А.А.1, Созаева Ж.А.1, Гришина Е.А.1, Шуев Г.Н.1, Китаева Е.Ю.2, Шпрах В.В.2, Сулейманов С.Ш.3, Болиева Л.З.4, Созаева М.С.5, Жучкова С.М.6, Гималдинова Н.Е.7, Сидукова Е.Э.8, Бурашникова И.С.9, Шикалева А.А.9, Забудская К.Г.10, Сычев Д.А.1
-
Учреждения:
- ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
- Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
- ООО «Саико»
- ФГБОУ ВО «Северо-Осетинская государственная медицинская академия» Минздрава России
- ГБУЗ «Республиканская клиническая больница» Минздрава Кабардино-Балкарской Республики
- АУ «Республиканский клинический онкологический диспансер» Минздрава Чувашии
- ФГБОУ ВО «Чувашский государственный университет им. И.Н. Ульянова»
- ГБУ РМЭ «Козьмодемьянская межрайонная больница»
- Казанская государственная медицинская академия – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
- ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
- Выпуск: Том 92, № 8 (2020)
- Страницы: 43-51
- Раздел: Оригинальные статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/0040-3660/article/view/43540
- DOI: https://doi.org/10.26442/00403660.2020.08.000719
- ID: 43540
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Изучить особенности носительства клинически значимых аллельных вариантов генов TPMT и DPYD, ассоциированных с ответом на лекарственную терапию гемобластозов, среди 9 этнических групп Российской Федерации.
Материалы и методы. В исследование включены 1446 условно здоровых добровольцев 9 этнических групп. Носительство полиморфных маркеров генов TPMT и DPYD выявлялось методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.
Результаты. Во всех этнических группах распределение генотипов и аллелей соответствовало равновесию Харди–Вайнберга. TPMT*3A (rs1800460) и TPMT*3C (rs1142345) наблюдались во всех исследуемых этнических группах в гетерозиготном состоянии. В группе кабардинцев (n=204) частота встречаемости минорного аллеля TPMT*3A (MAF, %) составила 2,94%; балкарцев (n=200) – 1,25%; осетин (n=239) – 1,67%; чувашей (n=238) – 1,89%; марийцев (n=206) – 1,21%; татар (n=141) – 1,77%; русских (n=134) – 4,85%. Частота встречаемости минорного аллеля TPMT*3С (MAF, %) в группе кабардинцев (n=204) составила 4,90%; балкарцев (n=200) – 1,75%; бурятов (n=114) – 0,44%; осетин (n=239) – 1,88%; чувашей (n=238) – 1,68%; марийцев (n=206) – 1,21%; татар (n=141) – 1,42%; русских (n=134) – 4,48%. Результаты анализа полиморфизм DPYD*2A (rs3918290) продемонстрировали важные этнические особенности распределения. В гетерозиготном состоянии он выявлен лишь в группах кабардинцев (n=204, MAF 1,22%), балкарцев (n=200, MAF 2,00%), осетин (n=239, MAF 0,63%).
Заключение. Полученные в исследовании результаты будут полезны для разработки персонализированных алгоритмов противоопухолевой терапии в онкологической практике, в том числе направленных на повышение безопасности химиотерапевтического лечения гемобластозов.
Ключевые слова
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Карин Бадавиевичр Мирзаев
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Автор, ответственный за переписку.
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9307-4994
к.м.н., с.н.с., зав. отд. персонализированной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваДенис Сергеевич Федоринов
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5516-7367
ординатор каф. онкологии и паллиативной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваКристина Анатольевна Акмалова
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3505-8520
м.н.с. отд. молекулярной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваШерзод Пардабоевич Абдуллаев
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-9001-1499
м.н.с. отд. молекулярной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваАнастасия Алексеевна Качанова
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3194-4410
м.н.с. отд. молекулярной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваЖаннет Алимовна Созаева
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5166-7903
м.н.с. отд. молекулярной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваЕлена Анатольевна Гришина
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5621-8266
д.б.н., в.н.с. отд. молекулярной медицины НИИ молекулярной и персонализированной медицины ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваГригорий Николаевич Шуев
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5031-0088
аспирант каф. клинической фармакологии и терапии им. акад. Б.Е. Вотчала ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваЕлена Юрьевна Китаева
Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-9498-4503
ассистент каф. геронтологии, гериатрии и клинической фармакологии ИГМАПО – филиала ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, ИркутскВладимир Викторович Шпрах
Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1650-1275
дир. ИГМАПО – филиала ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, ИркутскСалават Шейхович Сулейманов
ООО «Саико»
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9236-7525
д.м.н., проф., ген. дир. ООО «Саико»
Россия, ХабаровскЛаура Зелимхановна Болиева
ФГБОУ ВО «Северо-Осетинская государственная медицинская академия» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1820-7726
д.м.н., проф., зав. каф. фармакологии с клинической фармакологией ФГБОУ ВО СОГМА
Россия, ВладикавказМариям Султан-Хамитовна Созаева
ГБУЗ «Республиканская клиническая больница» Минздрава Кабардино-Балкарской Республики
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5616-8836
зав. КДЛ ГБУЗ РКБ
Россия, НальчикСветлана Михайловна Жучкова
АУ «Республиканский клинический онкологический диспансер» Минздрава Чувашии
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2503-1271
к.м.н., клин. фармаколог АУ РКОД
Россия, ЧебоксарыНаталья Евгеньевна Гималдинова
ФГБОУ ВО «Чувашский государственный университет им. И.Н. Ульянова»
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8488-308X
к.м.н., ассистент каф. общей и клинической морфологии и судебной медицины ФГБОУ ВО «ЧГУ им. И.Н. Ульянова»
Россия, ЧебоксарыЕлена Эдуардовна Сидукова
ГБУ РМЭ «Козьмодемьянская межрайонная больница»
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5083-6223
зам. глав. врача ГБУ РМЭ «Козьмодемьянская МБ»
Россия, КозьмодемьянскИрина Сергеевна Бурашникова
Казанская государственная медицинская академия – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-8511-5696
к.м.н., ассистент каф. клинической фармакологии и фармакотерапии КГМА – филиала ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, КазаньАнастасия Алексеевна Шикалева
Казанская государственная медицинская академия – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1798-0490
председатель Совета обучающихся и молодых ученых КГМА – филиала ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, КазаньКсения Геннадьевна Забудская
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1290-574X
ординатор по специальности «Генетика» ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Россия, МоскваДмитрий Алексеевич Сычев
ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России
Email: karin05doc@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-4496-3680
чл.-кор. РАН, проф. РАН, д.м.н., проф., проректор по развитию и инновациям ФГБОУ ДПО РМАНПО
Россия, МоскваСписок литературы
- Available from: http://canceratlas.cancer.org/the-burden/the-burden-of-cancer/
- Wei M. Dentification of pharmacogenetic markers in cancer supportive care. J Clin Oncol. 2018;36:34(Suppl.):109. doi: 10.1200/JCO.2018.36.34_suppl.109
- Ingelman-Sundberg M, Oscarson M, McLellan RA. Polymorphic human cytochrome P450 enzymes: an opportunity for individualized drug treatment. Trends Pharmacol Sci. 1999;20(8):342-9. doi: 10.1016/s0165-6147(99)01363-2
- Monte AA, Heard KJ, Vasiliou V. Prediction of drug response and safety in clinical practice. J Med Toxicol. 2012;8:43-51. doi: 10.1007/s13181-011-0198-7
- Biomarkers Definitions Working Group. Biomarkers and surrogate endpoints: preferred definitions and conceptual framework. Clin Pharmacol Ther. 2001;69(3):89-95. doi: 10.1067/mcp.2001.113989
- Patel JN. Application of genotype-guided cancer therapy in solid tumors. Pharmacogenomics. 2014;15(1):79-93. doi: 10.2217/pgs.13.227
- Tang H, Quertermous T, Rodriguez B, et al. Genetic structure, self-identified race/ethnicity, and confounding in case-control association studies. Am J Human Genet. 2005;76(2):268-75. doi: 10.1086/427888
- Schärfe CP, Tremmel R, Schwab M, et al. Genetic variation in human drug-related genes. Genome Med. 2017;9(1):117. doi: 10.1186/s13073-017-0502-5
- Saadeh C, Bright D, Rustem D. Precision Medicine in Oncology Pharmacy Practice. Acta Medica Academica. 2019;48(1):90-104. doi: 10.5644/ama2006-124.246
- National Center for Biotechnology Information. ClinVar. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/VCV000012722.2
- Available from: http://gnomad.broadinstitute.org/variant/6-18139228-C-T
- Available from: https://www.pagestudy.org/index.php/mega
- Samochatova EV, Chupova NV, Rudneva A, et al. TPMT genetic variations in populations of the Russian Federation. Pediatr Blood Cancer. 2009;52(2):203-8. doi: 10.1002/pbc.21837
- Карнюшка А.А., Субботина Т.Н., Шайхутдинова Р.В. и др. Анализ полиморфизмов в гене ТРМТ у детей с острым лейкозом на территории Красноярского края. Рос. журн. детской гематологии и онкологии. 2018;5(3):56-9 [Karnyushka AA, Subbotina TN, Shaikhutdinova RV, et al. Analysis of polymorphisms in the TPMT gene in children with acute leukemia in the Krasnoyarsk Territory. Russian Journal of Pediatric Hematology and Oncology. 2018;5(3):56-9 (In Russ.)]. doi: 10.17650/2311-1267-2018-5-3-56-59
- Nasedkina TV, Fedorova OE, Glotov AS, et al. Rapid genotyping of common deficient thiopurine S-methyltransferase alleles using the DNA-microchip technique. Eur J Hum Genet. 2006;14(9):991-8. doi: 10.1038/sj.ejhg.5201647
- Palmirotta R, Lovero D, Delacour H, et al. Rare Dihydropyrimidine Dehydrogenase Variants and Toxicity by Floropyrimidines: A Case Report. Front Oncol. 2019;9:139. doi: 10.3389/fonc.2019.00139
- Meulendijks D, Cats A, Beijnen JH, Schellens JH. Improving safety of fluoropyrimidine chemotherapy by individualizing treatment based on dihydropyrimidine dehydrogenase activity – Ready for clinical practice? Cancer Treat Rev. 2016;50:23-34. doi: 10.1016/j.ctrv.2016.08.002
- Patel JN, Fuchs CS, Owzar K, et al. Gastric cancer pharmacogenetics: progress or old tripe? Pharmacogenomics. 2013;14(9):1053-64. doi: 10.2217/pgs.13.88
- Van Kuilenburg AB, Meinsma R, Zoetekouw L, Van Gennip AH. High prevalence of the IVS14 + 1G>A mutation in the dihydropyrimidine dehydrogenase gene of patients with severe 5-fluorouracil-associated toxicity. Pharmacogenetics. 2002;12(7):555-8. doi: 10.1097/00008571-200210000-00007
- Amstutz U, Henricks LM, Offer SM, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for Dihydropyrimidine Dehydrogenase Genotype and Fluoropyrimidine Dosing: 2017 Update. Clin Pharmacol Ther. 2018;103(2):210-6. doi: 10.1002/cpt.911
- Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs3918290
- Митрофанов Д.В., Часовникова О.Б., Королёва Л.С. и др. Оценка частоты встречаемости мутации 735G → А в сайте сплайсинга интрона 14 гена дигидропиримидиндегидрогеназы (DPYD) с помощью флюоресцентно-меченых олигонуклеотидов среди жителей Новосибирской области. Генетика. 2008;44(12):1684-92 [Mitrofa- nov DV, Chasovnikova OB, Koroleva LS et al. Frequency of the 735G → A mutation of the 5′-splice donor site of intron 14 of the dihydropyrimidine dehydrogenase gene (DPYD) in residents of Novosibirsk region (Russia) as revealed with fluorescent oligonucleotides. Russ J Genet. 2008;44(12):1684‐92 (In Russ.)]. doi: 10.1134/S1022795408120119
- Тимошкина Н.Н., Богомолова О.А., Жужеленко И.А. и др. Исследование полиморфизмов генов UGT1A1 и DPYD у пациентов с колоректальным раком. Сиб. онкол. журн. 2018;17(6):49-56. [Timoshkina NN, Bogomolova OA, Zhuzhelenko IA, et al. Study of polymorphisms of UGT1A1 and DPYD genes in chemotherapy for colorectal cancer. Siberian Journal of Oncology. 2018;17(6):49-56 (In Russ.)]. doi: 10.21294/1814-4861-2018-17-6-49-56