Микробиота кишечника. Исторический очерк и роль в нефрологии

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В статье освещены основные этапы исследования микробиоты (МБ) кишечника начиная с Древних времен до настоящего времени, рассматриваются особенности взаимодействия между кишечной МБ и почечными заболеваниями – ось «кишечник – почки». Считается, что впервые МБ упоминается в одном из трактатов Аюрведы «Чарака-Самхита» (700–100 лет до н.э.), а первое использование пробиотиков упоминается в Древнем Китае (1000 лет до н.э.). В 1670-х годах Антони ван Левенгук с помощью усовершенствованного микроскопа описал простейших и бактерии, в том числе и кишечную МБ. В дальнейшем, параллельно с открытиями Луи Пастера и Роберта Коха, шло изучение МБ кишечника, в котором важную роль играют исследования Теодора Эшериха, Анри Тиссье и наших соотечественников С.Н. Виноградского и И.И. Мечникова. Следующий этап в изучении МБ кишечника относится к 1994 г. – началу использования секвенирования 16s рРНК, метаисследований и организации глобальных проектов по изучению МБ – Human Microbiome Project и METAgenomics of the Human Intestinal Tract, целью которых является изучение ее состава и взаимодействия с организмом. Пример такого взаимодействия – ось «кишечник – почки», которая отражает метаболическую связь почек и МБ кишечника. В рамках данной оси в настоящее время исследуются потенциальные терапевтические возможности про-, пребиотиков и синбиотиков при заболеваниях почек. Однако, несмотря на успехи в данной области, требуются дальнейшие исследования для разработки оптимальной стратегии по коррекции нарушений микробиоты, в том числе и при хронических заболеваниях почек.

Об авторах

Кирилл Сергеевич Нежданов

ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова»

Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9558-363X

аспирант каф. внутренних болезней фак-та фундаментальной медицины 

Россия, Москва

Людмила Юрьевна Милованова

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет)

Автор, ответственный за переписку.
Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5599-0350

д-р мед. наук, проф. каф. внутренних, профессиональных болезней и ревматологии 

Россия, Москва

Светлана Юрьевна Милованова

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет)

Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-2687-6161

д-р мед. наук, проф. каф. внутренних, профессиональных болезней и ревматологии 

Россия, Москва

Марина Владимировна Таранова

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет)

Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-7363-6195

канд. мед. наук, доц. каф. внутренних, профессиональных болезней и ревматологии 

Россия, Москва

Алексей Владимирович Волков

ФГБОУ ВО «Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова»

Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-1873-0189

ординатор каф. внутренних, болезней фак-та фундаментальной медицины 

Россия, Москва

Татьяна Витальевна Андросова

ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет)

Email: Ludm.milovanova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9951-126X

канд. мед. наук., доц. каф. внутренних, профессиональных болезней и ревматологии 

Россия, Москва

Список литературы

  1. Lederberg J, McCray AT. ’Ome Sweet’omics – A genealogical treasury of words. Scientist. 2001;15(7):8.
  2. Fan Y, Pedersen O. Gut microbiota in human metabolic health and disease. Nat Rev Microbiol. 2021;19(1):55-71. doi: 10.1038/s41579-020-0433-9
  3. Saini S, Porte MS. Ayurvedic aspect of bacteria and bacterial food poisoning. Int J Pharm Sci Res. 2015;6(6):2281-90. doi: 10.13040/IJPSR.0975-8232.6(6).2281-90
  4. Kuhad U, Goel G, Maurya PK, Kuhad RC. Sukshmjeevanu in Vedas: The forgotten past of microbiology in Indian Vedic knowledge. Indian J Microbiol. 2021;61:108-10. doi: 10.1007/s12088-020-00911-5
  5. Zhang F, Luo W, Shi Y, et al. Should we standardize the 1,700-year-old fecal microbiota transplantation? Am J Gastroenterol. 2012;107(11):1755. doi: 10.1038/ajg.2012.251
  6. Leung PC, Cheng KF. Fecal microbiota transplantation: Historical review and current perspective. World J Meta-Anal. 2019;7(9):423-7. doi: 10.13105/wjma.v7.i9.423
  7. Ottogalli G, Testolin G. Dairy products. In: Spiller GA, ed. The mediterranean diets in health and disease. Boston, MA: Springer, 1991.
  8. Cruchet S, Furnes R, Maruy A, et al. The use of probiotics in pediatric gastroenterology: A review of the literature and recommendations by Latin-American experts. Pediatr Drugs. 2015;17(3):199-216. doi: 10.1007/s40272-015-0124-6
  9. Prioreschi P. A history of medicine / Plinio Prioreschi. Lewiston, N.Y.: Edwin Mellen Press, 1991.
  10. Robertson LA. Antoni van Leeuwenhoek 1723–2023: A review to commemorate Van Leeuwenhoek’s death, 300 years ago: For submission to Antonie van Leeuwenhoek journal of microbiology. Antonie Van Leeuwenhoek. 2023;116(10):919-35. doi: 10.1007/s10482-023-01859-4
  11. Goodsir J, Wilson G. History of a case in which a fluid periodically ejected from the stomach contained vegetable organisms of an undescribed form. Edinb Med Surg J. 1842;57(151):430-43. PMID: 30330668
  12. Leidy J. A flora and fauna within living animals (excerpt), Smithsonian Contributions to Knowledge (1853). In: Resetarits CR, ed. An anthology of nineteenth-century American science writing. London: Anthem Press, 2012.
  13. Berche P. Louis Pasteur, from crystals of life to vaccination. Clin Microbiol Infect. 2012;18(Suppl. 5):1-6. doi: 10.1111/j.1469-0691.2012.03945.x
  14. Blevins SM, Bronze MS. Robert Koch and the ‘golden age’ of bacteriology. Int J Infect Dis. 2010;14(9):e744-51. doi: 10.1016/j.ijid.2009.12.003
  15. Lionel S. The microscope, in its application to practical medicine. N Am Medchir Rev. 1859;3(4):611-5. PMCID:PMC10340930
  16. Hallier E. Die Parasiten Der Infektionskrankheiten Bei Menschen, Thieren Und Pflanzen: Für Naturforscher, Mediciner, Land-u. Forstwirthe Und Gärtner Geschildert von Ernst Hallier. Verlag, 1878. Vol. 1.
  17. Shulman ST, Friedmann HC, Sims RH. Theodor Escherich: The first pediatric infectious diseases physician? Clin Infect Dis. 2007;45(8):1025-9. doi: 10.1086/521946
  18. Dworkin M. Sergei Winogradsky: A founder of modern microbiology and the first microbial ecologist. FEMS Microbiol Rev. 2012;36(2):364-79. doi: 10.1111/j.1574-6976.2011.00299.x
  19. Tissier MH. La reaction chromophile d’Escherich et le Bacterium coli. CR Soc Biol. 1899;51:943-5.
  20. Бордин Д.С., Шенгелия М.И., Иванова В.А., Войнован И.Н. История открытия бактерии Helicobacter pylori. Терапевтический архив. 2022;94(2):283-8 [Bordin DS, Shengelia MI, Ivanova VA, Voynovan IN. The history of the discovery of the Helicobacter pylori. Terapevticheskii Arkhiv (Ter. Arkh.). 2022;94(2):283-8 (in Russian)]. doi: 10.26442/00403660.2022.02.201377
  21. Underhill DM, Gordon S, Imhof BA, et al. Élie Metchnikoff (1845–1916): Celebrating 100 years of cellular immunology and beyond. Nat Rev Immunol. 2016;16(10):651-6. doi: 10.1038/nri.2016.89
  22. Sonnenborn U. Escherichia coli strain Nissle 1917 – From bench to bedside and back: History of a special Escherichia coli strain with probiotic properties. FEMS Microbiol. Lett. 2016;363(19):fnw212. doi: 10.1093/femsle/fnw212
  23. Senator H. Über ein Fall von Hydrothionamie und über Selbstinfektion durch abnorme Verdauungsvorgänge. Berl Klin Wochenschr. 1868;5:254-6.
  24. Dubos R, Schaedler RW, Costello R, Hoet P. Indigenous, normal, and autochthonous flora of the gastrointestinal tract. J Exp Med. 1965;122(1):67-76. PMID: 14325474
  25. Schaedler RW, Dubs R, Costello R. Association of germfree mice with bacteria isolated from normal mice. J Exp Med. 1965;122(1):77-82. PMID: 14325475
  26. Goldman P, Peppercorn MA, Goldin BR. Metabolism of drugs by microorganisms in the intestine. Am J Clin Nutr. 1974;27(11):1348-55. PMID: 4155602
  27. Wilson KH, Blitchington RB. Human colonic biota studied by ribosomal DNA sequence analysis. Appl Environ Microbiol. 1996;62(7):2273-8. PMID: 8779565
  28. Zoetendal EG, Akkermans AD, De Vos WM. Temperature gradient gel electrophoresis analysis of 16S rRNA from human fecal samples reveals stable and host-specific communities of active bacteria. Appl Environ Microbiol. 1998;64(10):3854-9. PMID: 9758810
  29. NIH Human Microbiome Portfolio Analysis Team. A review of 10 years of human microbiome research activities at the US National Institutes of Health, fiscal years 2007–2016. Microbiome. 2019;7(1):31. doi: 10.1186/s40168-019-0620-y
  30. Ehrlich SD. MetaHIT: The European Union Project on metagenomics of the human intestinal tract. In: Nelson KE, ed. Metagenomics of the human body. New York, NY: Springer New York, 2011. doi: 10.1007/978-1-4419-7089-3_15
  31. Klaassens ES, de Vos WM, Vaughan EE. Metaproteomics approach to study the functionality of the microbiota in the human infant gastrointestinal tract. Appl Environ Microbiol. 2007;73(4):1388-92. doi: 10.1128/AEM.01921-06
  32. Perez-Carrasco V, Soriano-Lerma A, Soriano M, et al. Urinary microbiome: Yin and yang of the urinary tract. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:617002. doi: 10.3389/fcimb.2021.617002
  33. Tang Z, Yu S, Pan Y. The gut microbiome tango in the progression of chronic kidney disease and potential therapeutic strategies. J Transl Med. 2023;21(1):689. doi: 10.1186/s12967-023-04455-2
  34. El Chamieh C, Liabeuf S, Massy Z. Uremic toxins and cardiovascular risk in chronic kidney disease: What have we learned recently beyond the past findings? Toxins (Basel). 2022;14(4):280. doi: 10.3390/toxins14040280
  35. Aragón IM, Herrera-Imbroda B, Queipo-Ortuño MI, et al. The urinary tract microbiome in health and disease. Eur Urol Focus. 2018;4(1):128-38. doi: 10.1016/j.euf.2016.11.001
  36. Stavropoulou E, Kantartzi K, Tsigalou C, et al. Focus on the gut-kidney axis in health and disease. Front Med (Lausanne). 2021;7:620102. doi: 10.3389/fmed.2020.620102
  37. Castillo-Rodriguez E, Fernandez-Prado R, Esteras R, et al. Impact of altered intestinal microbiota on chronic kidney disease progression. Toxins (Basel). 2018;10(7):300. doi: 10.3390/toxins10070300
  38. Liu W, Huang J, Liu T, et al. Changes in gut microbial community upon chronic kidney disease. PloS One. 2023;18(3):e0283389. doi: 10.1371/journal.pone.0283389
  39. Poulakou-Rebelakou E, Marketos SG. Kidney disease in byzantine medical texts. Am J Nephrol. 1999;19(2):172-6. doi: 10.1159/000013446
  40. Loying R, Kalita J, Manna P. Rice-based alcoholic fermented beverages of North-East India: Insight into ethnic preparation, microbial intervention, ethnobotany, and health benefits. J Food Biochem. 2024;260:1-23. doi: 10.1155/2024/7769743
  41. Fagundes RAB, Soder TF, Grokoski KC, et al. Probiotics in the treatment of chronic kidney disease: A systematic review. J Bras Nefrol. 2018;40(3):278-86. doi: 10.1590/2175-8239-jbn-3931
  42. Sumida K, Pierre JF, Yuzefpolskaya M, et al. Gut microbiota-targeted interventions in the management of chronic kidney disease. Semin Nephrol. 2023;43(2):151408. doi: 10.1016/j.semnephrol.2023.151408

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Фотография отрывка из аюрведического трактата «Чарака-Самхита» (Caraka-Samhitā). https://wellcomecollection.org/works/f2kqft8j.

Скачать (287KB)
3. Рис. 2. Точная репродукция Генри Бейкера (1742 г.) зарисовок А. Левенгука (1676 г.): представлены бактерии на рис. IV (Fig. IV) и простейшие.

Скачать (150KB)
4. Рис. 3. Портрет С.Н. Виноградского. Музей портрета «Национальная портретная галерея», коллекция музея, раздел «История – глазами потомков» (слева) и колонна Виноградского (справа).

Скачать (184KB)
5. Рис. 4. Илья Ильич Мечников, 1910–1915 гг. Издательство Bain News Service. Изображение из Библиотеки Конгресса США, отдел эстампов и фотографий, Вашингтон, 20540 США.

Скачать (233KB)

© ООО "Консилиум Медикум", 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
 
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».