Proteomic Profile of the Bacterium Sinorhizobium meliloti Depends on Its Life Form and Host Plant Species


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Abstract—The importance of root nodule bacteria in biotechnology is determined by their distinctive feature: symbiotic nitrogen fixation resulting in the production of organic nitrogen-containing compounds. While interacting with host legume plants, the cells of these bacteria undergo global changes at all levels of expression of genetic information leading to the formation in root nodules of so-called bacteroids functioning as nitrogen fixation factories. The molecular mechanisms underlying plant-microbial symbiosis are actively investigated, and one of the most interesting and poorly studied aspects of this problem is the species-specificity of interaction between root nodule bacteria and host plants. In this work we have performed the proteomic analysis of the Sinorhizobium meliloti bacteroids isolated from two legume species: alfalfa (Medicago sativa L.) and yellow sweet clover (Melilotus officinalis L.). It has been shown that the S. meliloti bacteroids produce a lot of proteins (many of them associated with symbiosis) in a host-specific manner, i.e., only in certain host plant species. It has been demonstrated for the first time that the levels of expression in bacteroids of the genes encoding the ExoZ and MscL proteins responsible for the synthesis of surface lipopolysaccharides and formation of a large conductance mechanosensitive channel, respectively, depend on a host plant species that confirms the results of proteomic analysis. Overall, our data show that the regulation of bacteroid development by the host plant has species-specific features.

Об авторах

K. Antonets

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology; St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608; St. Petersburg, 199034

O. Onishchuk

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608

O. Kurchak

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608

K. Volkov

St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Lykholay

St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034

E. Andreeva

St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034

E. Andronov

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology; St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608; St. Petersburg, 199034

A. Pinaev

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608

N. Provorov

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608

A. Nizhnikov

All-Russia Research Institute of Agricultural Microbiology; St. Petersburg State University

Автор, ответственный за переписку.
Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, Pushkin, St. Petersburg, 196608; St. Petersburg, 199034

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».