Effect of Reversion Back to Cys11 on the Structure and Function of S11C Cys-free Nt.BspD6I

R. I. Artyukh; Артюх Р. И.; B. F. Fatkhullin; Фатхуллин Б. Ф.; V. N. Antipova; Антипова В. Н.; T. A. Perevyazova; Перевязова Т. А.; G. S. Kachalova; Качалова Г. С.; A. K. Yunusova; Юнусова А. К.

doi:10.31857/S0023476123600702

Влияние возвращения CyS11 на структуру и функцию S11C CyS-free Nt.BspD6I

Авторы: Артюх Р.И.¹, Фатхуллин Б.Ф.², Антипова В.Н.¹, Перевязова Т.А.¹, Качалова Г.С.¹, Юнусова А.К.¹
Учреждения:
1. Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
2. Институт белка РАН
Выпуск: Том 68, № 6 (2023)
Страницы: 859-865
Раздел: СТРУКТУРА МАКРОМОЛЕКУЛЯРНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
URL: https://journals.rcsi.science/0023-4761/article/view/231802
DOI: https://doi.org/10.31857/S0023476123600702
EDN: https://elibrary.ru/YEJZJU
ID: 231802

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Пространственная структура рекомбинантной никующей эндонуклеазы S11C Cys-free Nt.BspD6I определена с разрешением 1.85 Å. Никаза S11C Cys-free Nt.BspD6I получена в результате возвращения Cys11 в Cys-free Nt.BspD6I методом сайт-направленного мутагенеза. Анализ кристаллической структуры никазы S11C Cys-free Nt.BspD6I показал, что возвращение Cys11 индуцирует заметные конформационные изменения в узнающем домене никазы, которые сопровождаются изменениями в ее функции: уменьшением сродства к ДНК, потерей образования олигомерных форм и высокой активностью эндонуклеазы рестрикции S11C Cys-free R.BspD6I.

Список литературы

Wang W-C., Mao H., Ma D.-D., Yang W-X. // Front. Mar. Sci. 2014. V. 1. https://doi.org/10.3389/fmars.2014.00034
Holliday G.L., Mitchell J.B., Thornton J.M. // J. Mol. Biol. 2009. V. 390. P. 560. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2009.05.015
Ribeiro A.J.M., Tyzack J.D., Borkakoti N. et al. // J. Biol. Chem. 2020. V. 295. P. 314. https://doi.org/10.1074/jbcREV 119.006289
Leichert L.I., Jakob U. // Antioxid. Redox Signal. 2006. V. 8 (5–6). P. 763. https://doi.org/10.1089/ars.2006.8.763
Kachalova G.S., Rogulin E.A., Yunusova A.K. et al. // J. Mol. Biol. 2008. V. 384 (2). P. 489. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2008.09.033
Artyukh R.I., Fatkhullin B.F., Kachalova G.S. et al. // Biochim. Biophys. Acta – Proteins Proteom. 2022. V. 1870 (3). P. 140756. https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2022.140756
Zheleznaya L.A., Perevyazova T.A., Alzhanova D.V., Matvienko N.I. // Biochemistry. 2001. V. 66. P. 989.
Yunusova A.K., Rogulin E.A., Artyukh R.I. et al. // Biochemistry. 2006. V. 71. P. 815.
Rogulin E.A., Perevyazova T.A., Zheleznaya L.A., Matvienko N.I. // Biochemistry. 2004. V. 69 (10). P. 1123. https://doi.org/10.1023/b:biry.0000046886.19428.d5
Laemmli U.K. // Nature. 1970. V. 227 (5259). P. 680. https://doi.org/10.1038/227680a0
Hellman L.M., Fried M.G. // Nat. Protoc. 2007. V. 2 (8). P. 1849. https://doi.org/10.1038/nprot.2007.249
Kabsch W. // Acta Cryst. D. 2010. V. 66. Pt. 2. P. 125. https://doi.org/10.1107/S0907444909047337
Kabsch W. // Acta Cryst. D. 2010. V. 66. Pt. 2. P. 133. https://doi.org/10.1107/S0907444909047374
Battye T.G., Kontogiannis L., Johnson O. et al. // Acta Cryst. D. 2011. V. 67. Pt. 4. P. 271. https://doi.org/10.1107/S0907444910048675
Evans P. // Acta Cryst. D. 2006. V. 62. Pt. 1. P. 72. https://doi.org/10.1107/S0907444905036693
Murshudov G.N., Vagin A.A., Dodson E.J. // Acta Cryst. D. 1997. V. 53. Pt. 3. P. 240. https://doi.org/10.1107/S0907444996012255
Abrosimova L.A., Samsonova A.R., Perevyazova T.A. // Mol. Biol. (Rus). 2020. V. 54. (4). P. 667. https://doi.org/10.31857/S0026898420040023
Goodsell D.S., Olson A.J. // Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2020.V. 29. P. 105. https://doi.org/10.1146/annurev.biophys.29.1.105
Santos J., Pujols J., Pallarès I. et al. // Comput. Struct. Biotechnol. J. 2020. V. 18. P. 1403. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2020.05.026
Sekerina S.A., Grishin A.V., Riazanova A.I. et al. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2012. V. 38 (4). P. 431. https://doi.org/10.1134/s1068162012040127