Preparation, Crystallization, and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of Recombinant House Dust Mite Allergen Der p 3 from Dermatophagoides pteronyssinus

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The high-producing strain С3029/pGro7/pERDerp3 for the house dust mite allergen Der p 3 from Dermatophagoides pteronyssinus, expressing the recombinant protein in Escherichia coli in the soluble form, was constructed. A procedure was developed for the purification of the recombinant allergen. Crystals of the recombinant protein Der p 3 suitable for X-ray diffraction analysis were grown by the vapor-diffusion method. The X-ray diffraction data set was collected to 2.25 Å resolution at the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF, France, ID23-1 beamline) at 100 K. The crystals belong to sp. gr. С121 and contain two enzyme molecules per asymmetric unit.

About the authors

V. I. Timofeev

Shubnikov Institute of Crystallography of Federal Scientific Research Centre “Crystallography and Photonics,” Russian Academy of Sciences, 119333, Moscow, Russia; National Research Centre “Kurchatov Institute,”, 123098, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва; Россия, Москва

Yu. A. Abramchik

Shubnikov Institute of Crystallography of Federal Scientific Research Centre “Crystallography and Photonics,” Russian Academy of Sciences, 119333, Moscow, Russia; Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва; Россия, Москва

N. E. Zhukhlistova

Shubnikov Institute of Crystallography of Federal Scientific Research Centre “Crystallography and Photonics,” Russian Academy of Sciences, 119333, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

O. O. Mikheeva

Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

M. B. Shevtsov

Moscow Institute of Physics and Technology, 141701, Dolgoprudny, Moscow oblast, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Долгопрудный

E. A. Zayats

Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

D. D. Lykoshin

Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

M. A. Kostromina

Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

R. S. Esipov

Shemyakin−Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, 117997, Moscow, Russia

Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва

I. P. Kuranova

Shubnikov Institute of Crystallography of Federal Scientific Research Centre “Crystallography and Photonics,” Russian Academy of Sciences, 119333, Moscow, Russia; National Research Centre “Kurchatov Institute,”, 123098, Moscow, Russia

Author for correspondence.
Email: inna@crys.ras.ru
Россия, Москва; Россия, Москва

References

  1. Murphy K., Weaver C. // Janeway’s Immunobiology. 2017. 9th Edition. Garland Science, Taylor & Francis Group. 927 p.
  2. Bousquet P.-J., Chinn S., Janson C. et al. // European Community Respiratory Health Survey I. Allergy. 2007. V. 62. P. 301. https://doi.org/10.1111/j.1398-9995.2006.01293.x
  3. Gaffin J.M., Phipatanakul W. // Curr. Opin. Allergy Clin. Immunol. 2009. V. 9. P. 128. https://doi.org/10.1097/aci.0b013e32832678b0
  4. Gaffin J.M., Spergel J.M., Boguniewicz M. et al. // Allergy Asthma Proc. 2012. V. 33. P. 282. https://doi.org/10.2500/aap.2012.33.3572
  5. Cox L., Nelson H., Lockey R. et al. // J. Allergy Clin. Immunol. 2011. V. 127 (1 Suppl.). P. S1–55.
  6. Thomas W.R. // J. Allergy Clin. Immunol. 2011. V. 127. P. 855. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2010.12.1084
  7. Pauli G., Malling H.J. // Curr. Top Microbiol. Immunol. 2011. V. 352. P. 43. https://doi.org/10.1007/82_2011_125
  8. Gregory L.G., Lloyd C.M. // Trends Immunol. 2011. V. 32. P. 402. https://doi.org/10.1016/j.it.2011.06.006
  9. Hales B.J., Martin A.C., Pearce L.J. et al. // J. Allergy Clin. Immunol. 2006. V. 118. P. 361. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2006.04.001
  10. Weghofer M., Thomas W.R., Kronqvist M. et al. // Eur. J. Clin. Invest. 2008. V. 38. P. 959. https://doi.org/10.1111/j.1365-2362.2008.02048.x
  11. King C., Brennan S., Thompson P.J., Stewart G.A. // J. Immunol. 1998. V. 161. P. 3645.
  12. Sun G., Stacey M.A., Schmidt M. et al. // J. Immunol. 2001. V. 167. P. 1014. https://doi.org/10.4049/jimmunol.167.2.1014
  13. Lin Y.-P., Nelson C., Kramer H., Parekh A.B. // Mol. Cell. 2018. V. 70 (2). P. 228. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2018.03.025
  14. Ivanciuc O., Schein C.H., Braun W. // Bioinformatics. 2002. V. 18. № 10. P. 1358. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.10.1358
  15. Battye T.G., Kontogiannis L., Johnson O. et al. // Acta Cryst. D. 2011. V. 67. P. 271. https://doi.org/10.1107/S0907444910048675
  16. Smith W.A., Thomas W.R. // Clin. Exp. Allergy. 1996. V. 26. P. 571.
  17. Bouaziz A., Walgraffe D., Bouillot C. et al. // Clin. Exp. Allergy. 2015. V. 45. P. 823. https://doi.org/10.1111/cea.12452

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2.

Download (193KB)
3.

Download (343KB)
4.

Download (711KB)

Copyright (c) 2023 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».