Полногеномный анализ ассоциации риска развития параноидной шизофрении у русских: поиск генетических маркеров в хромосомной области 1q43

Обложка
  • Авторы: Гареева А.Э.1,2,3
  • Учреждения:
    1. Институт биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
    2. Кемеровский государственный университет Минобранауки России
    3. Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России
  • Выпуск: Том 60, № 1 (2024)
  • Страницы: 100-105
  • Раздел: КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ
  • URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/255588
  • DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675824010085
  • ID: 255588

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Шизофрения является высоконаследуемым заболеванием. Генетический риск связан с большим количеством аллелей, включая распространенные аллели с малым эффектом, которые могут быть обнаружены в ходе полногеномных ассоциативных исследованиий. Цель настоящего исследования ‒ изучение генетических факторов риска развития шизофрении при проведении полногеномного анализ ассоциации (GWAS) у русских из Республики Башкортостан. Исследованная выборка состояла из 320 больных параноидной шизофренией и 402 здоровых индивидов. Полногеномное генотипирование образцов ДНК было проведено на биочипе PsychChip, включавшим 610000 однонуклеотидных полиморфных вариантов (ОНП).

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. Э. Гареева

Институт биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук; Кемеровский государственный университет Минобранауки России; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: annagareeva@yandex.ru
Россия, Уфа; Кемерово; Москва

Список литературы

  1. Mehta N. , Jena I. , Ray S. et al. Plasma homocysteine, serum vitamin B12 and folic acid status in newly detected schizophrenic patients of Еastern India // Biomedicine. 2023. V. 43. № 2. P. 587–589. https://doi.org/10.51248/.v43i02.2370
  2. Purcell S., Neale B., Todd-Brown K. et al. PLINK: А toolset for whole-genome association and population-based linkage analysis // Am. J. Hum. Genet. 2007. V. 81. № 3. P. 559–575. https://doi.org/10.1086/519795
  3. Гареева А.Э. Полногеномное ассоциативное исследование риска развития шизофрении в Республике Башкортостан // Генетика. 2023. Т. 59. № 8. С. 954–963. https://doi.org/10.31857/S0016675823080076
  4. Benjamini Y., Drai D., Elmer G. et al. Controlling the false discovery rate in behavior genetics research // Behav. Brain Res. 2001. V. 125. № 1-2. P. 279–284. https://doi.org/10.1016/s0166-4328(01)00297-2
  5. Yu J., Xue R., Wang Q. et al. The effects of plasma homocysteine level on the risk of three major psychiatric disorders: A mendelian randomization study // Front. Psychiatry. 2022. V. 13. https://doi.org/10.3389/fpsyt.2022.841429
  6. Jia R., Yuan X., Zhang X. et al. Oxidative stress impairs cognitive function by affecting hippocampal fimbria volume in drug-naïve, first-episode schizophrenia // Front. Neurosci. 2023 V. 17. P. 1153439. https://doi.org/10.3389/fnins.2023.1153439
  7. Hasnat F., Dewan Z. F., Misbahuddin M. et al. Folic acid, vitamin B12 and homocysteine levels following olanzapine administration in schizophrenia patients // Bangabandhu Sheikh Mujib Med. Univ. J. 2018. V. 11. № 1. P. 11–16. https://doi.org/10.3329/bsmmuj.v11i1.34950
  8. D’Souza S.W., Glazier J.D. Homocysteine metabolism in pregnancy and developmental impacts // Front. Cell Dev. Biol. 2022 V. 10. P. 802285. https://doi.org/10.3389/fcell.2022.802285
  9. Kempisty B., Sikora J., Lianeri M. et al. MTHFD 1958G>A and MTR 2756A>G polymorphisms are associated with bipolar disorder and schizophrenia // Psychiatr. Genet. 2007. V. 17. P. 3. P. 177–181. https://doi.org/10.1097/YPG.0b013e328029826f
  10. Roffman J.L., Brohawn D.G., Nitenson A.Z. et al. Genetic variation throughout the folate metabolic pathway influences negative symptom severity in schizophrenia // Schizophr. Bull. 2013. V. 39. № 2. P. 330–338. https://doi.org/10.1093/schbul/sbr150
  11. Dahal S., Longkumer I., Bhattacharjee D., Devi N.K. Association of CBS 844ins68, MTR A2756G and MTRR A66G gene polymorphisms with depression: A population-based study from North India // Gene Reports. 2023. V. 30. https://doi.org/10.1016/j.genrep.2022.101714
  12. Chatterjee M., Saha T., Maitra S. et al. Folate system gene gariant rs1801394 66A>G may have a causal role in down syndrome in the Eastern Indian population // Int. J. Mol. Cell. Med. 2020. V. 9. № 3. P. 215–224. https://doi.org/10.22088/IJMCM.BUMS.9.3.215
  13. Djurovic S., Gustafsson O., Mattingsdal M. et al. A genome-wide association study of bipolar disorder in Norwegian individuals, followed by replication in Icelandic sample // J. Affect. Disord. 2010. V. 126. № 1-2. P. 312–316. https://doi.org/10.1016/j.jad.2010.04.007
  14. Hamshere M.L., Walters J.T., Smith R., et al. Genome-wide significant associations in schizophrenia to ITIH3/4, CACNA1C and SDCCAG8, and extensive replication of associations reported by the Schizophrenia PGC // Mol. Psychiatry. 2013. V. 6. P. 708–712. https://doi.org/10.1038/mp.2012.67
  15. Ripke S., O’Dushlaine C., Chambert K. et al. Genome-wide association analysis identifies 13 new risk loci for schizophrenia // Nat. Genet. 2013. V. 45. № 10. P. 1150–1159. https://doi.org/10.1038/ng.2742
  16. Bergen S.E., Petryshen T.L. Genome-wide association studies of schizophrenia: Does bigger lead to better results // Curr. Opin. Psychiatry. 2012. V. 25. № 2. P. 76–82. https://doi.org/10.1097/YCO.0b013e32835035dd
  17. McCauley J.L., Zuvich R.L., Bradford Y., et al. Follow-up examination of linkage and association to chromosome 1q43 in multiple sclerosis // Genes Immun. 2009. V. 10. № 7. P. 624–630. https://doi.org/10.1038/gene.2009.53

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Графическое изображение результатов полногеномного анализа ассоциации 395832 ОНП с параноидной шизофренией у русских (Manhattan plot). На оси X указана хромосомная локализация ОНП, на оси Y – значения отрицательного десятичного логарифма уровня значимости p-value.

Скачать (1MB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах