Популяции тувинских короткожирнохвостых овец в структуре генофонда пород овец российской федерации

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

С использованием 11 микросателлитных маркеров (ОarCP49, INRA063, HSC, OarAE129, MAF214, OarFCB11, INRA005, SPS113, INRA23, MAF65, McM527) получены данные об уровнях изменчивости и степени дифференциации 24 популяций (1140 образцов) тувинской грубошерстной короткожирнохвостой овцы разных районов Республики Тыва и 24 пород овец (721 образец) различного происхождения, охватывающих основные овцеводческие районы Российской Федерации. В ходе анализа обнаружен высокий уровень генетической изоляции и изменчивости тувинских овец, а в общей структуре российских пород овец выявлена выраженная генетическая дивергенция на две большие группы, одна из которых объединяет тонкорунных и полутонкорунных овец, а другая – аборигенные грубошерстные породы северокавказского и азиатского происхождения.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

С. В. Бекетов

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Москва

Т. Е. Денискова

Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Московская область, пос. Дубровицы

А. В. Доцев

Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Московская область, пос. Дубровицы

Э. А. Николаева

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Москва

Н. А. Зиновьева

Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Московская область, пос. Дубровицы

М. И. Селионова

Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Москва

Ю. А. Столповский

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: svbeketov@gmail.com
Россия, Москва

Список литературы

  1. Дмитриева Т.О. Мясная порода овец – катумская // Аграрная наука. 2018. № 6. С. 25–27.
  2. Цырендондоков Н.Д. Основы овцеводства: биологические особенности овец. Технология производства. М.: Росагропромиздат. 1989. 175 с.
  3. Столповский Ю.А., Шимиит Л.В., Кол Н.В., и др. Анализ генетической изменчивости и филогенетических связей у популяций тувинской короткожирнохвостой овцы с использованием ISSR-маркеров // С.-х. биология. 2009. № 6. С. 34–43.
  4. Бекетов С.В., Коноров E.А., Пискунов А.К. и др. Популяционно-генетическая характеристика тувинских короткожирнохвостых овец // Генетика. 2022. T. 58. № 3. С. 332–342.
  5. Государственный племенной регистр, 2023 http://opendata.mcx.ru/opendata/7708075454-plemennoyregistr.
  6. Нестерук Л.В. Генетический полиморфизм романовской породы овец: Автореф. Дис. … канд. биол. наук. М.: ИОГен РАН, 2016. 22 с.
  7. Zinovieva N.A., Selionova M.I., Gladyr E.A. et al. Investigation of gene pool and genealogical links between sheep breeds of southern Russia by blood groups and DNA microsatellites // Genetika. 2015. V. 47. P. 395–404.
  8. Денискова Т.Е., Селионова М.И., Гладырь Е.А. и др. Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России // С.-х. биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 801–810. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2016.6.801rus
  9. Deniskova Т.E., Dotsev A.V., Selionova M.I. et al. Population structure and genetic diversity of 25 Russian sheep breeds based on whole-genome genotyping // Genet. Sel. Evol. 2018. V. 50. №. 29. https://doi.org/10.1186/s12711-018-0399-5
  10. Денискова Т.Е., Доцев А.В., Зиновьева Н.А. Характеристика современного генофонда российских пород овец на основе применения ДНК-чипов высокой плотности // Материалы науч. конф. с междун. участием “Генетические процессы в популяциях”. М.: ИОГен РАН, 2022. С. 24.
  11. Deniskova Т., Esmailizadeh A., Dotsev A. et al. A search for Eurasian sheep relationships: Genomic assessment of the autochthonous sheep breeds in Russia and the Persian plateau // Diversity. 2022. V. 14. № 6. P. 445. https://doi.org/10.3390/d14060445
  12. Кошкина О.А., Денискова Т.Е., Доцев А.В., Зиновьева Н.А. Гаплотипическое разнообразие российских пород овец // Сборник научных трудов КНЦЗВ. 2022. Т. 11. № 1. https://doi.org/10.48612/sbornik-2022-1-74
  13. Olschewsky А., Hinrichs D. An оverview of the use of genotyping techniques for assessing genetic diversity in local farm animal breeds // Animals. 2021. V. 11. № 7. https://doi.org/10.3390/ani11072016.
  14. Кузнецов В.М. Сравнение методов оценки генетической дифференциации популяций по микросателлитным маркерам // Зоотехния. 2020. С. 169–182. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2020.21.2.169-182.
  15. Huson D.H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Mol. Biol. Evol. 2006. V. 23. № 2. Р. 254–267. https://doi.org/10.1093/molbev/msj030
  16. R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna. 2018. https://www.R-project.org.
  17. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update // Bioinformatics. 2012. V. 28. № 19. P. 2537–2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460
  18. Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. 2000. V. 155. № 2. Р. 945–959.
  19. Keenan K., McGinnity P., Cross T.F. et al. DiveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors // Methods Ecol. Evol. 2013. № 4. Р. 782–788. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12067
  20. Абонеев В.В., Селькин И.И., Кулаков Б.С. О породной структуре тонкорунного и полутонкорунного овцеводства // Сб. науч. трудов Ставропольского н.-и. ин-та животноводства и кормопроизводства, 2005. Т. 1. № 1. С. 16–20.
  21. Марзанов Н.С., Амерханов Х.А., Фокеев В.С. и др. Генетические особенности овец отечественных и зарубежных тонкорунных пород // С.-х. биология. 2012. № 2. С. 14–26.
  22. Монгуш С.С. Продуктивные качества тувинско-сараджинских полугрубошерстных овец // Материалы межд. научно-практ. конф. “Состояние, проблемы и перспективы развития овцеводства и козоводства в Российской Федерации”. Чита, 2018. С. 29–33.
  23. Иванов М.Ф. Овцеводство. М.: Сельхозгиз, 1935. 816 с.
  24. Остапчук П.С. Породы овец в контексте исторического развития отрасли на Крымском полуострове // Аграрный вестник Урала. 2021. Т. 210. № 7. С. 75–86. https://doi.org/10.32417/1997-4868-2021-210-07-75-86
  25. Akış I., Esen Gürsel F., Hacıhasanoğlu Çakmak N. et al. Polymorphisms of Cyp19 and Myostatin Genes in Turkish Indigenous Sheep Breeds // J. Hellenic Veterinary Med. Society. 2017. V. 68. P. 313–318.
  26. Мурзина Т.В., Вершинин А.С., Дамдинова Л.Г. Генетический потенциал забайкальской тонкорунной породы овец // Овцы, козы, шерстяное дело. 2016. № 1. С. 8–11.
  27. Максимов Г.В., Иванова Н.В., Максимов А.Г. Породы овец и коз. Персиановский: Донской ГАУ, 2018. 182 с.
  28. Словарь-справочник по животноводству. М.–Л.: Сельхозгиз, 1935. 612 с.
  29. Мороз В.А., Исмаилов И.С. К вопросу селекции овец грозненской породы // Вестник АПК Ставрополья. 2013. Т. 10. № 2. С. 72–75.
  30. Колосов Ю.А., Засемчук И.В., Широкова Н.В, Бакоев Н.Ф. Сальская порода овец – история развития и совершенствования // Сб. науч. трудов Ставропольского н.-и. ин-та животноводства и кормопроизводства. 2014. Т. 3. № 7. С. 84–87.
  31. Владимиров Н.И., Старожук С.И., Владимирова Н.Ю. Некоторые экстерьерно-конституциональные особенности овец кулундинской породы // Вестник Алтайского гос. аграрного ун-та. 2003. № 2. С. 259–261.
  32. Эрнст Л.К., Дмитриев Н.Г., Паронян И.А. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах. Санкт-Петербург: ВНИИГРЖ, 1994. 469 с.
  33. Цырендондоков Н.Д. Создание новой породы волгоградских тонкорунных мясо-шерстных овец // Вопросы совершенствования племенной работы и технологий в животноводстве. М.: Московская ветеринарная академия, 1979. Т.104. С. 31–41.
  34. Подкорытов А.Т. Горное овцеводство: разведение, селекция, кормление, содержание, переработка, технология, экономика. Барнаул: Азбука, 2019. 818 с.
  35. Гаджиев З.К., Бобрышова Г.Т. Грубошерстные овцы Дагестана // Сб. науч. трудов Всеросс. н.-и. ин-та овцеводства и козоводства. 2017. Т. 2. № 10. С. 3–10.
  36. Юлдашбаев Ю.А., Арилов А.Н., Зулаев М.С., Гаряев Б.Е. Новая порода овец – калмыцкая курдючная // Изв. ТСХА. 2013. Вып. 3. С. 109–113.
  37. Очир А., Бакаева Э.П., Орлова К. В. Монгольские этнонимы: вопросы происхождения и этнического состава монгольских народов. Элиста: КИГИ РАН, 2016. 286 с.
  38. Васин Б. Н. Цветной каракуль. М.: Колос, 1968. 105 с.
  39. Митыпова Е.Н., Цыбикова Р.Н. Совершенствование овец аборигенной бурятской грубошерстной породы в направлении повышения продуктивности // Вестник Алтайского гос. аграрного ун-та. Т. 147. № 1. 2017. С. 104–110.
  40. Маннай-оол М.Х. Тувинцы. Происхождение и формирование этноса. Новосибирск: Наука, 2004. 164 с.
  41. Попков Ю.В., Тюгашев Е.А. “Затерянный мир”: тувинская культура в центр-периферийной интерпретации геокультурного и социокультурного пространства // Новые исследования Тувы. 2022. № 1. С. 225–236. https://doi.org/10.25178/nit.2022.1.15
  42. Прокофьева Е.Д. Процесс национальной консолидации тувинцев. СПб.: Наука, 2011. 538 с.
  43. Дубровский Н.Г. Степные и залежные фитосистемы Тувы: Автореф. Дис. … докт. биол. наук. Улан-Удэ: Бурятский гос. ун-т, 2007. 48 с.
  44. Потанина А.В. Овцеводство Дагестана и пути его дальнейшего улучшения. Махачкала.1968. 468 с.
  45. Тамбиев Х.М. История и пути развития карачаевской породы овец. Черкесск: Изд. КНИИ, 2007. 222 с.
  46. Гаджиев З.К., Османова О.Р. Продуктивность овец карачаевской породы разных генотипов // Сб. науч. трудов Краснодарского науч. центра по зоотехнии и ветеринарии. 2014. С. 1–4.
  47. Елемесов К.Е. Руководство по каракулеводству. Алма-Ата: Кайнар, 1986. 219 с.
  48. Марзанов Н.С., Петров С.Н., Марзанова Л.К. и др. Генетические особенности и происхождение каракульской породы овец // Овцы, козы, шерстяное дело. 2014. № 4. С. 15–17.
  49. Лобков В.Ю., Белоногова А.Н., Арсеньев Д.Д. Биологические особенности овец романовской породы. Ярославль: Изд-во ФГБОУ ВПО “Ярославская ГСХА”, 2012. 162 с.
  50. Шайдуллин И.Н., Фейзуллаев Ф.Р., Кириллова Е.К. и др. Продуктивные качества овец волгоградской породы разных конституциональных типов // Сб. науч. трудов Ставропольского н.-и. ин-та животноводства и кормопроизводства. 2012. Т. 2. № 1. С. 102–107.
  51. Столповский Ю.А., Кузнецов С.Б., Солоднева Е.В., Шумов И.Д. Новая система генотипирования крупного рогатого скота на основе технологии ДНК-микрочипов // Генетика. 2022. Т. 58. № 8. С. 857–871.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Neighbour-Net дендрограмма взаимоотношений исследуемых популяций и пород овец, построенная на основе матрицы попарных генетических дистанций FST.

Скачать (949KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Neighbor-Net дендрограмма взаимоотношений исследуемых популяций и пород овец, построенная на основе матрицы попарных генетических дистанций Jost’sD.

Скачать (1MB)
Метаданные
4. Рис. 3. Популяционно-генетическая структура пород и популяций овец.

Скачать (3MB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах