Polymorphism and Differentiation of the Evoron Vole Three Populations according to the mtDNA Control Region Variability
- Authors: Sheremetyeva I.N.1, Kartavtseva I.V.1, Frisman L.V.2
-
Affiliations:
- Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity Far East Branch, Russian Academy of Sciences
- Institute for Complex Analysis of Regional Problems Far East Branch, Russian Academy of Sciences
- Issue: Vol 59, No 2 (2023)
- Pages: 157-169
- Section: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
- URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/134553
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675823010101
- EDN: https://elibrary.ru/EGKVYG
- ID: 134553
Cite item
Abstract
As a result of the control region mtl DNA analysis for the Evoron vole, a high haplotype (97%) and nucleotide (1.53%) diversity was found. The data obtained indicate a low level of genetic differentiation populations. At the same time, populations geographically located closer are subdivided more strongly than remote ones. In general, there is agreement between the data on the variability of the mitochondrial DNA control region and chromosome races. However, if the data of chromosomal analysis indicate the preservation of the karyotype more ancient variants in the Evoron-Chukchagir lowland (“evoron” chromosomal race), then the data of molecular genetic analysis testify in favor of the preservation of the most ancient mt haplotype (106-19) in the upper Bureya depression population (“argi” chromosomal race).
About the authors
I. N. Sheremetyeva
Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity Far East Branch,Russian Academy of Sciences
Author for correspondence.
Email: sheremet76@yandex.ru
Russia, 690022, Vladivostok
I. V. Kartavtseva
Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity Far East Branch,Russian Academy of Sciences
Email: sheremet76@yandex.ru
Russia, 690022, Vladivostok
L. V. Frisman
Institute for Complex Analysis of Regional Problems Far East Branch,Russian Academy of Sciences
Email: sheremet76@yandex.ru
Russia, 679016, Birobidzhan
References
- Gerrie R., Kennerley R. Microtus evoronensis (errata version published in 2017) // The IUCN Red List of Threatened Species. 2016. e.T13429A115112487. https://doi.org/10.2305/IUCN.UK.2016-3.RLTS.T1-3429A22350421
- Shenbrot G.I., Krasnov B.R. An Atlas of the Geographic Distribution of the Arvicoline Rodents of the World (Rodentia, Muridae: Arvicolinae). Sofia: Pensoft, 2005. 336 p.
- Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: Изд. Зоол. ин-та РАН, 1995. 520 с.
- Костенко В.А. Грызуны (Rodentia) Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2000. 209 с.
- Абрамсон Н.А., Лисовский А.А. Род Alexandromys Ognev, 1914 // Млекопитающие России: ситематико-географический справочник (Сб. трудов Зоологического музея МГУ. Т. 52) / Под ред. Павлинова И.Я., Лисовского А.А. М.: Т-во науч. изд. КМК, 2012. С. 258–365.
- Мейер М.Н., Голенищев Ф.Н., Раджабли С.И., Саблина О.Л. Серые полевки фауны России и сопредельных территорий СПб.: Зоол. ин-т РАН, 1996. 320 с.
- Bannikova A.A., Lebedev V.S., Lissovsky A.A. et al. Molecular phylogeny and evolution of the Asian lineage of vole genus Microtus (Arvicolinae, Rodentia) inferred from mitochondrial cytochrome b sequence // Biological J. Linnean Society. 2010. V. 99. P. 595–613. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2009.01378.x
- Haring E., Sheremetyeva I., Kryukov A. Phylogeny of Palearctic vole species (genus Microtus, Rodentia) based on mitochondrial sequences // Mammalian Biology. 2011. V. 76. P. 258–267. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2010.04.006
- Лисовский А.А., Оболенская Е.В. Структура краниометрического разнообразия серых полевок Microtus подрода Alexandromys // Тр. Зоол. ин-та РАН. 2011. Т. 315. № 4. С. 461–477. https://www.zin.ru/journals/trudyzin/doc/vol_315_4/ tz_315_4_lisovsky.pdf
- Фрисман Л.В., Картавцева И.В., Шереметьева И.Н. и др. Аллозимная дифференциация и кариотипические особенности восточноазиатских полевок Дальнего Востока России // Вecтник СВНЦ ДВО РАН. 2016. № 3. С. 93–103.
- Lissovsky A.A., Petrova T.V., Yatsentyuk S.P. et al. Multilocus phylogeny and taxonomy of East Asian voles Alexandromys (Rodentia, Arvicolinae) // Zool. Scripta. 2018. V. 47. № 1. P. 9–20. https://doi.org/10.1111/zsc.12261
- Лисовский А.А., Кадетова А.А., Оболенская Е.В. Морфологическое определение видов восточноазиатских серых полевок Alexandromys (Rodentia, Cricetidae) России и сопредельных территорий // Зоол. журн. 2018. Т. 97. № 1. С. 101–113. https://doi.org/10.7868/S0044513418010099
- Ковальская Ю.М., Соколов В.Е. Новый вид полевок (Rodentia, Cricetidae, Microtus) из нижнего Приамурья // Зоол. журн. 1980. Т. 59. № 9. С. 1409–1416.
- Голенищев Ф.Н., Раджабли С.И. Новый вид серой полевки с берегов озера Эворон // Докл. Акад. наук СССР. 1981. Т. 257. № 1. С. 248–250.
- Kartavtseva I.V., Sheremetyeva I.N., Pavlenko M.V. Intraspecific multiple chromosomal variations including rare tandem fusion in the russian far eastern endemic evoron vole Alexandromys evoronensis (Rodentia, Arvicolinae) // Comparative Cytogenetics. 2021. V. 15. № 4. P. 393–411. https://doi.org/10.3897/compcytogen.v15.i4.67112
- Картавцева И.В., Шереметьева И.Н., Павленко М.В. Множественный хромосомный полиморфизм, хромосомной расы “эворон” эворонской полевки (Rodentia, Arvicolinae) // Генетика. 2021. Т. 57. № 1. С. 82–94. https://doi.org/10.31857/S0016675821010082
- Картавцева И.В., Шереметьева И.Н., Немкова Г.А., Лазурченко Е.В. Хромосомные исследования полевки Максимовича Microtus maximowiczii Schrenk, 1858 в Норском заповеднике Амурской области и эворонской Microtus evoronensis Kovalsk. et Socolov, 1980 окрестностей озера Эворон Хабаровского края // Териофауна России и сопредельных территорий. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2007. С. 188.
- Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Войта Л.Л., Тиунов M.П. Новые данные по распространению серых полевок рода Microtus (Rodentia: Cricetidae) на Дальнем Востоке России // Зоол. журн. 2010. Т. 89. № 10. С. 1273–1276.
- Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Васильева Т.В., Фрисман Л.В. Серые полевки рода Alexandromys из Верхнебуреинской впадины // Зоол. журн. 2016. Т. 95. № 5. С. 597–603. https://doi.org/10.7868/S0044513416050111
- Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Васильева Т.В. Обитает ли эворонская полевка (Alexandromys evoronensis) на северо-востоке Верхнезейской равнины? // Зоол. журн. 2017. Т. 96. № 4. С. 477–474. https://doi.org/10.7868/S0044513417020076
- Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques // Nucl. Acids Res. 1997. V. 25. № 22. P. 4692–4693. https://doi.org/10.1093/nar/25.22.4692
- Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Фрисман Л.В. и др. Полиморфизм и генетическая структура полевки Максимовича Microtus maximowiczii (Schrenck, 1858) (Rodentia, Cricetidae) Среднего Приамурья по данным секвенирования контрольного региона мтДНК // Генетика. 2015. Т. 51. № 10. С. 1154–1162. https://doi.org/10.7868/S0016675815100161
- Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98 // Nucl. Acids Symposium Series. 1999. V. 41. № 41. P. 95–98. https://doi.org/10.1021/bk-1999-0734.ch008
- Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. № 6. P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
- Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. № 1. P. 37–48. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036
- Rozas J., Ferrer-Mata A., Sánchez-DelBarrio J.C. et al. DnaSP 6: DNA sequence polymorphism Analysis of large datasets // Mol. Biol. Evol. 2017. V. 34. P. 3299–3302. https://doi.org/10.1093/molbev/msx248
- Excoffier L., Lischer H.E.L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Resources. 2010. № 10. P. 564–567. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x
- Tamura K., Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biology and Evolution. 1993. V. 10. P. 512–526. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023
- Картавцева И.В., Васильева Т.В., Шереметьева И.Н. и др. Генетическая изменчивость трех изолированных популяций муйской полевки Alexandromys mujanensis Orlov et Kovalskaja, 1978 (Rodentia, Arvicolinae) // Генетика. 2019. Т. 55. № 8. С. 920–935. https://doi.org/10.1134/S0016675819080071
- Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Павленко М.В. и др. Формирование генетической структуры популяций дальневосточной полевки Alexandromys fortis (Rodentia, Arvicolinae) северной периферии ареала // Зоол. журн. 2022. Т. 101. № 10. С. 1173–1189.