Relationship of microRNAs with transposons in osteoarthritis development

Мұқаба

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Аннотация

Conducted GWAS identified the association of osteoarthritis with more than 100 different SNPs, most of which are located in intronic and intergenic regions where genes encoding transposable elements and non-coding RNAs derived from them are located. A number of studies have also determined the activation of retroelements in joint tissues and in peripheral blood of patients with osteoarthritis. An assumption has been made that activated transposons, which cause aging and associated inflammation, influence the etiopathogenesis of osteoarthritis. To confirm this hypothesis, a search was conducted for data on changes in the expression of specific microRNAs derived from transposons during aging and osteoarthritis. As a result, 23 such microRNAs were found, the participation of which in the development of the disease is associated with an impact on genes and signaling pathways regulating cell proliferation and apoptosis, inflammatory and metabolic processes, and mechanisms of cartilage degradation. Changes in expression of these microRNAs indicate that the epigenetic mechanisms of aging are involved in osteoarthritis etiopathogenesis due to pathological activation of transposable elements complementary to the sequences of non-coding RNAs derived from them in evolution.

Толық мәтін

Остеоартрит (ОА) является самым распространенным типом артрита [1] и представляет собой гетерогенное многофакторное заболевание, характеризующееся ассоциацией более чем со 100 различными однонуклеотидными полиморфизмами (SNP – single nucleotide polymorphism), большинство из которых расположены в интронах генов и в межгенных областях [2, 3]. Болезнь характеризуется развитием воспаления в синовиальной оболочке сустава с деградацией хряща [4]. Помимо генетических факторов, на риск ОА влияют возраст, женский пол, семейный анамнез, курение, профессиональное воздействие избыточных нагрузок и ожирение, в большей степени остеоартриту подвержены женщины [5]. Глобальная распространенность ОА в мире, согласно статистическим данным за 2020-й год, составляет 7.6% всего населения, возрастая до 14.8% для людей старше 30 лет. Отмечена выраженная ассоциация ОА со старением [1]. Так, частота встречаемости ОА у людей старше 50 лет составляет уже 29.3% [6], а старше 70 лет – 40% [7]. Поскольку старение характеризуется развитием аутоиммунного асептического воспаления и гиперпродукцией интерферона в ответ на прогрессирующую гиперактивацию мобильных генетических элементов (МГЭ) [8, 9], можно сделать предположение о влиянии этих механизмов и на этиопатогенез ОА. Действительно, в тканях пораженных ОА суставов определяются транскрипты эндогенных ретровирусов HERV-E2 и HERV-WE1 [10], а в лейкоцитах крови больных ОА выявлено значительное снижение метилирования ретроэлементов (РЭ) LINE1 по сравнению со здоровым контролем, что свидетельствует об их активации [11].

МГЭ занимают не менее 45% генома человека и представляют собой генетические элементы, которые перемещаются внутри генома и подразделяются на РЭ (класс I) и ДНК-транспозоны (класс II). К РЭ относятся содержащие длинные концевые повторы (LTR – long terminal repeats) и не содержащие их элементы (включают автономные LINE и неавтономные SINE и SVA) [12]. О вероятной роли МГЭ в развитии ОА свидетельствует расположение ассоциированных с болезнью SNP главным образом в интронных и межгенных областях [2, 3], где находятся большинство МГЭ, а также произошедшие от них в эволюции гены микроРНК [13–15]. Кроме того, в опытах на мышах было показано, что при синовиальном воспалении суставов, пораженных ОА, выявляется снижение концентрации деацетилазы гистонов SIRT6. В результате индуцируется поляризация М1-макрофагов с высвобождением в них провоспалительных цитокинов [16]. Истощение SIRT6 наблюдается при старении и считается одним из эпигенетических драйверов данного процесса в связи со снижением сайленсинга МГЭ [17], продукты экспрессии которых стимулируют интерфероновый ответ [8]. Последний в свою очередь активирует М1-макрофаги, вызывая продукцию ими интерлейкинов IL-1β, IL-6, IL-12, фактора некроза опухоли-α (TNF-α), активных форм кислорода и индуцибельной синтетазы оксида азота (iNOS) [18]. В плазме крови и в синовиальной жидкости больных ОА определено также достоверное повышение концентрации CXCL10 (C-X-C motif chemokine ligand 10) – индуцибельного интерфероном-γ белка (Interferon gamma-induced protein 10, IP-10) по сравнению со здоровым контролем [19]. Перечисленные факты свидетельствуют о вероятной роли патологической экспрессии МГЭ при старении как драйверного процесса для развития ОА. Поскольку МГЭ являются регуляторами эпигенетических факторов [20], следует рассмотреть особенности их изменений при ОА.

Проведенный в 2021 г. GWAS с использованием образцов ДНК от 826 690 больных с различными типами ОА позволил определить независимую ассоциацию 100 различных SNP [2]. GWAS отдельных типов ОА также идентифицировали множество различных SNP, ассоциированных с болезнью. Например, с ОА тазобедренного сустава, согласно проведенному GWAS в 2023 г., ассоциированы 42 SNP [3]. Объяснить влияние такого количества генетических вариантов даже при помощи современных биоинформационных технологий очень сложно. В то же время результаты проведенных мета-анализов показывают достоверную ассоциацию ОА с аллельными вариантами лишь нескольких генов иммунной системы: IL17A [21], IL1RN [22], IL6 [23] и компонента соединительной ткани COL11A1 [24]. Данные ассоциации не могут объяснить сложную гетерогенную природу ОА. Однако расположение большинства ассоциированных с болезнью SNP в интронах и некодирующих частях генома [2, 3] подтверждает предположение о роли МГЭ в этиопатогенезе ОА, поскольку МГЭ находятся главным образом в интронах и межгенных областях [13–15]. На рис. 1 представлена схема вероятных путей влияния МГЭ на развитие ассоциированного со старением ОА.

 

Рис. 1. Схема вероятных путей влияния активированных при старении мобильных генетических элементов (МГЭ) на эпигенетические механизмы развития остеоартрита.

 

Представляют интерес результаты исследования нарушений экспрессии генов в тканях пораженных ОА суставов, поскольку это отражает влияние изменений эпигенетических факторов. Причиной таких изменений могут быть воздействия микроРНК, регулирующих экспрессию генов, кодирующих участвующие в воспалении факторы, стимуляция которых характерна также для старения под влиянием активированных МГЭ, вызывающих иммунный ответ. Согласно результатам ряда исследований, при ОА под влиянием микроРНК повышается экспрессия генов различных провоспалительных белков (табл. 1) [25–30], таргетное ингибирование которых с помощью регуляции эпигенетических факторов перспективно в лечении ОА [31]. Кроме того, согласно результатам анализа экспрессии генов в тканях пораженных ОА суставов, при болезни снижается экспрессия участвующих в иммунных реакциях генов KLF2, KLF4 [32], KLF9 [33], белковые продукты которых, круппель-подобные транскрипционные факторы, ингибируют воспаление, JUN, кодирующего транскрипционный фактор, который стимулирует апоптоз иммуноцитов. При ОА определена также низкая экспрессия MYC, подавляющего пролиферацию клеток, стимулирующего их апоптоз и ингибирующего IL-1β, TNF-α, IL-6, MMP-13. У больных ОА в тканях суставов выявлено снижение экспрессии генов: NFKBIA, ингибитора NFKB, предотвращающего образование комплексов NFKB/REL, связанных с воспалением [34]; TFNAIP3, кодирующего индуцируемый фактором некроза опухолей белок цинковых пальцев, редактирующего убиквитин и участвующего в иммунных и воспалительных реакциях [35]; MCL1, регулятора апоптоза, необходимого для выживания фибробластов, макрофагов и лимфоцитов [36]; CEACAM-1, иммунного регулятора Т-лимфоцитов, подавляющего воспаление; TNFRSF18, кодирующего белок GITRL, индуцированного глюкокортикоидами лиганда рецептора TNF, регулирующего воспаление и оказывающего противовоспалительный эффект [26]. Причиной нарушения экспрессии этих генов может служить эпигенетическая дисрегуляция, обусловленная воздействием микроРНК вследствие патологической активации МГЭ.

 

Таблица 1. Гены, повышение экспрессии которых вовлечено в иммунные реакции при остеоартрите

Название гена

Название белка – продукта экспрессии гена

Функция белка [автор]

С5AR1

рецептор анафилотоксина С5а, экспрессируемый иммунными клетками

химический аттрактант и медиатор воспаления [25]

CTLA4

клеточный рецептор иммуноглобулинов

стимулирует иммунный ответ [26]

EDNRB

рецептор эндотелина типа В, связанный с G-белком

активирует фосфатидилинозитол-кальциевую систему [27]

FSH

фолликуло-стимулирующий гормон

стимулирует воспаление в суставе [26]

HLA-DMB

белки главного комплекса гистосовместимости класса II, DM beta

участвуют в иммунных реакциях [28]

IL1B

интерлейкин-1-бета

провоспалительный цитокин, вырабатываемый иммунными клетками [25]

IL1R1

рецептор интерлейкина 1

передача провоспалительных сигналов [27]

IL4R

рецептор интерлейкина 4

передача иммунных сигналов [29]

IL6R

рецептор интерлейкина 6

передача противовоспалительных сигналов [29]

IL10

интерлейкин 10

противовоспалительный цитокин, вырабатываемый иммунными клетками [25]

IRAK3

ассоциированная с рецептором интерлейкина-1 киназа

способствует передаче провоспалительных сигналов [30]

RHOB

малая везикулярная ГТФаза RhoB

активирует провоспалительные IL-1β, LPS, TNFα [30]

SOX13

транскрипционный фактор SRY-related HMG-box

аутоиммунный антиген, модулирующий воспалительный ответ [30]

TNFSF11

член семейства факторов некроза опухолей

стимулирует активацию В- и Т-лимфоцитов и их инфильтрацию тканей сустава [27]

 

Взаиморегуляция транспозонов и микроРНК

Патологическая активация МГЭ при старении, отражающаяся на развитии ОА, может быть обусловлена различными механизмами воздействия транспозонов на эпигенетическую регуляцию (рис. 2). Данные механизмы обусловлены наличием комплементарных последовательностей между МГЭ и микроРНК в связи с возникновением микроРНК от МГЭ в эволюции или непосредственным образованием микроРНК из транскриптов МГЭ [15]. Еще в 2016 г. G. Wei и соавт. была создана база данных о происхождении микроРНК от специфических МГЭ, названная MDTE DB (miRNAs derived from transposable elements database), в которую вошли 661 микроРНК человека [15]. Активированные МГЭ могут оказывать влияние на произошедшие от них микроРНК за счет связывания с ними продуктов транскрипции МГЭ, действующих как “губки” для микроРНК путем комплементарного связывания с нуклеотидными последовательностями по причине их эволюционного родства. Так блокируется влияние РНК-интерференции на мРНК генов-мишеней этих микроРНК [37]. Такой принцип регуляции определен не только у животных, но и у растений. Например, транскрипт LTR-содержащего ретроэлемента MIKKI (переводится с корейского языка как “приманка”), экспрессируемый в корнях риса, является имитатором для miR-171, которая дестабилизирует мРНК транскрипционных факторов корня, подобных SCARECROW. Процессированные транскрипты MIKKI действуют как ловушки для miR-171, запуская их деградацию и обеспечивая накопление специфичных для корня мРНК транскрипционных факторов [38]. Транскрипты LTR-содержащих РЭ [39] и LINE1 функционируют в качестве молекул длинных некодирующих РНК, взаимодействуя со специфическими участками хроматина и регулируя экспрессию генов (в том числе контролируемых микроРНК) [40].

 

Рис. 2. Механизмы влияния транспозонов на эпигенетическую регуляцию микроРНК с участием малых интерферирующих РНК (миРНК).

 

Некоторые микроРНК образуются непосредственно из генов МГЭ, которые являются основой для шпилечных структур пре-микроРНК. В результате формируются различные микроРНК, образующие регуляторную сеть управления экспрессией генов, меняющейся в ходе онтогенеза в тканях и органах человека. (Для анализа таких процессов было создано веб-приложение Brain miRTExplorer [41]). Поэтому патологическая активация МГЭ приводит к образованию различных микроРНК из их транскриптов, влияющих на регуляторные сети других микроРНК в организме. МГЭ оказывают регуляторное воздействие на микроРНК за счет образования малых интерферирующих РНК (миРНК, siRNA – small interfering RNA) из транскриптов МГЭ. При этом миРНК являются конкурентными молекулами для связывания с мРНК-мишенями для микроРНК, нивелируя их воздействие на экспрессию генов. Этот эффект связан с защитными системами клеток-хозяев против активированных МГЭ в их геномах, запуская деградацию транскриптов МГЭ рибонуклеазами до миРНК. Последние оказывают посттранскрипционное ингибирование мРНК генов, которые не содержат фрагментов МГЭ в своем составе за счет частичной комплементарности последовательностей нуклеотидов [42].

Одним из путей взаимодействий микроРНК с МГЭ в регуляции активности генов является также подавление их экспрессии при связывании микроРНК со специфическими структурами ДНК, образованными благодаря встроенным в эти области МГЭ. В геноме человека Z-форма ДНК образуется эндогенными ретровирусами, которые обеспечивают функциональные гены альтернативными промоторами [43]. Так, Z-форма ДНК, расположенная в промоторной области гена простагландинредуктазы (PTGR1), образована MER4 ретроэлементом. С последовательностями 5’-CACACACA-3’ данной области связывается miR-6867-5p (содержащая комплементарные повторы 5’-GUGUGUG-3’), подавляя экспрессию гена PTGR1 за счет ингибирования образования Z-формы (которая предполагает активацию экспрессии) [12]. Кроме того, у человека описан феномен РНК-направленного метилирования ДНК (RdDM – RNA-dependent DNA methylation), при помощи которого образованные из транскриптов МГЭ микроРНК [41] и миРНК [42] могут воздействовать на экспрессию произошедших от них в эволюции микроРНК за счет наличия комплементарных последовательностей в структуре генома [44]. В то же время сами МГЭ являются мишенями для эпигенетической регуляции как произошедшими от них микроРНК [15], так и не имеющими с ними эволюционного родства за счет частичной комплементарности последовательностей. Например, микроРНК let-7 ингибирует экспрессию различных LINE1 за счет связывания с продуктом транскрипции ORF2p их генов, подавляя трансляцию на рибосомах [45].

Влияние произошедших от транспозонов микроРНК, ассоциированных с механизмами старения, на развитие остеоартрита

Вышеописанные механизмы воздействия активированных МГЭ на регуляторные эффекты произошедших от них микроРНК позволяют предположить, что дисрегуляция МГЭ при старении оказывает влияние на такие микроРНК, вовлеченные в патогенез ОА. Согласно данным научной литературы, 23 произошедшие от МГЭ микроРНК из базы данных MDTE DB [15] вовлечены в механизмы старения и ОА (табл. 2). Действительно, у пациентов с ОА в макрофагах синовиальной жидкости пораженных суставов определена повышенная экспрессия miR-1246, произошедшей от LTR-ERVL [15]. Данная микроРНК подавляет экспрессию генов GSK3β, киназы гликогенсинтазы-3β и Axin2, Axis inhibition protein 2, белка ингибирования оси 2 у человека, способствуя активации путей Wnt/β-катенина и обусловленному этим воспалению [46]. Увеличение уровней miR-1246 выявлено также при старении фибробластов человека [47]. В суставах при ОА повышенная экспрессия miR-1271 [48], произошедшая от LINE2 [15], вызывает апоптоз хондроцитов за счет ингибирования митоген-активируемой протеинкиназы MAPK [49]. В экзосомах пациентов с ОА определена повышенная экспрессия miR-1290 [50], которая ингибирует ген CCNG2, кодирующий циклин, регулирующий клеточный цикл [51]. Высокий уровень miR-1271 и miR-1290 определен также при старении фибробластов человека [47].

 

Таблица 2. Особенности экспрессии микроРНК, произошедших от транспозонов, при старении и ОА

МикроРНК (транспозон-источник)

Механизм действия микроРНК при остеоартрите

Изменение экспрессии при старении (повышение – ↑; снижение – ↓) [автор]

Изменение экспрессии при остеоартрите (повышение – ↑; снижение – ↓) [автор]

miR-1246 (LTR-ERVL)

подавляет экспрессию GSK3β и Axin2, способствуя активации путей Wnt/β-катенина и воспалению [46]

↑ [47]

↑ [46]

miR-1271 (LINE2)

ингибирует MAPK [49]

↑ [47]

↑ [48, 49]

miR-1290 (SINE/MIR)

подавляет CCNG2 [51]

↑ [47]

↑ [50]

miR-151a (LINE2)

ингибирует экспрессию агматиназы, нарушая метаболизм полиаминов [49]

↓ [52]

↓ [5]

miR-192 (LINE2)

повреждает хондроциты в ответ на липополисахариды, вызывая воспаление [54]

↑ [55]

↑ [54]

miR-211 (LINE2)

подавляет экспрессию фибулина-4 и провоспалительных цитокинов [57]

↓ [56]

↓ [57]

miR-224 (MER-135)

ингибирует экспрессию провоспалительного хемокина CCL1 [58]

↓ [60]

↓ [58]

miR-28 (LINE2)

ингибирует экспрессию IL-34 [63]

↓ [62]

↓ [61]

miR-31 (LINE2)

подавляет мРНК генов PAPOLG, SP1, SRC, ZC3H12C [64]

↑ [65]

↑ [64]

miR-320b (LINE2)

участвует в генных сетях регуляции апоптоза с участием YWHAZ, YWHAQ, YWHAH, YWAHE, YWHAB, YWHAG, SFN [66]

↑ [67]

↑ [66]

miR-326

(hAT-Tip100)

ингибирует SIRT1 с активацией воспаления и ангиогенеза [68]

↑ [70]

↑ [68]

miR-335 (SINE/MIR)

ингибирует экспрессию генов MMP13, VCAM1 [71], подавляет энхондральную оссификацию хряща [72]

↑ [73]

↑ [71, 72]

miR-340

(DNA-TE/TcMar)

воздействует на мРНК генов YTHDF3, IGF2BP3, ингибирует сигналинг ERK посредством подавления FMOD [74]

↓ [75]

↓ [74]

miR-374 (LINE2)

препятствует индуцированному липополисахаридами разрушению хряща за счет ингибирования Wnt5b [77]

↓ [76]

↓ [77]

МикроРНК (транспозон-источник)

Механизм действия микроРНК при остеоартрите

Изменение экспрессии при старении (повышение – ↑; снижение – ↓) [автор]

Изменение экспрессии при остеоартрите (повышение – ↑; снижение – ↓) [автор]

miR-378a (SINE/MIR)

ингибирует мРНК генов Sox6 и Atg2a [78]

↑ [79]

↑ [78]

miR-384 (LINE-Dong-R4)

подавляет экспрессию SOX9 и сигналинг NF-kB, препятствуя пролиферации хрящевых клеток [80]

↑ [81]

↑ [80]

miR-421 (LINE2)

препятствует вызванному IL-1β апоптозу и воспалению [82]

↓ [83]

↓ [82]

miR-450b (LINE1)

регулирует экспрессию гена SKAP2 в макрофагах [84]

↓ [85]

↓ [84]

miR-487b (SINE/MIR)

целевое ингибирование Wnt5a-пути [92]

↑ [92]

↓ [93, 94]

miR-495 (ERV-L/MaLR)

ингибирует мРНК гена AKT1, с подавлением p-S6, p-mTOR и пролиферации хондроцитов [86]

↑ [87]

↑ [86]

miR-576 (LINE1)

целевое ингибирование Wnt5a-пути [97]

↑ [96]

↓ [95]

miR-708 (LINE2)

связывается с мРНК гена SATB2, ингибируя регенерацию хряща [88]

↑ [89]

↑ [88]

miR-885 (SINE/MIR)

подавляет экспрессию генов IGF1R, CTNNB1, OXR1 [90]

↑ [91]

↑ [90]

 

Проведенный в 2021 г. комплексный анализ регуляторной сети развития ОА показал снижение экспрессии miR-151a [5], которая произошла от LINE2 [15]. Уровень данной микроРНК в сыворотке крови значительно выше у пожилых людей по сравнению с молодыми [52]. Прямой мишенью miR-151a является мРНК гена AGMAT, кодирующего агматиназу – ключевой фермент метаболизма агматина, который выполняет роль нейротрансмиттера. Соответственно, подавление экспрессии агматиназы под влиянием miR-151a может стать причиной нарушений иннервации тканей и органов при старении, в том числе и суставов при ОА [53]. Уровень miR-192, возникшей от LINE2 [15], повышается при ОА и оказывает повреждающее действие на хондроциты за счет ингибирования экспрессии гена GDF11, кодирующего секретируемый лиганд суперсемейства трансформирующих факторов роста бета, рекрутирующего транскрипционные факторы SMAD, необходимые для роста и размножения клеток [54]. При старении в тканях почек также повышается уровень miR-192 [55]. Низкая экспрессия miR-211, произошедшей от LINE2 [15], ассоциирована с короткой продолжительностью жизни, что свидетельствует о ее протективном действии в отношении старения [56]. При ОА уровень miR-211 также снижен. MiR-211 способствует дифференцировке хондроцитов путем подавления экспрессии гена EFEMP2, EGF containing fibulin extracellular matrix protein 2, который кодирует фибулин-4, препятствующий выработке провоспалительных цитокинов и разрушающих хрящ протеиназ [57].

MiR-224, произошедшая от ДНК-транспозона MER-135 [15], ингибирует экспрессию провоспалительного хемокина CCL1, препятствуя также деградации хряща [58]. Были разработаны наночастицы с miR-224 в качестве перспективного метода лечения ОА [59]. MiR-224 ассоциирована со старением головного мозга. Ее мишенью является ген CHOP, C/EBP homologous protein, который участвует в регуляции митохондриальных белков [60]. В сыворотке крови больных ОА определен сниженный уровень miR-28 [61]. При физиологическом старении также уменьшена экспрессия miR-28 [62]. Мишенью miR-28 является мРНК гена IL-34, интерлейкина-34. Соответственно низкий уровень miR-28 при старении и ОА способствует воспалению в связи с усилением выработки IL-34 [63].

При тяжелом ОА определена повышенная экспрессия miR-31, мишенями которой являются мРНК генов: PAPOLG, кодирующего полиадениловую полимеразу; SP1, specificity protein 1, кодирующего транскрипционный фактор цинкового пальца; SRC, кодирующего протоонкоген нерецепторной тирозинкиназы; ZC3H12C, кодирующего эндорибонуклеазу. Продуктом гена SP1 является транскрипционный фактор, играющий важную роль в дифференцировке костей и хондроцитов, регуляции роста клеток [64]. Повышенный уровень miR-31 определен при старении эндотелиальных клеток человека [65]. Произошедшая от LINE2 miR-320b [15] ассоциирована с быстрым прогрессированием ОА и была предложена в качестве прогностического биомаркера болезни [66]. Данная микроРНК вовлечена в генные сети с участием генов – регуляторов апоптоза. К ним относятся гены путей сигнальной трансдукции: YWHAZ, 14-3-3 protein zeta/delta; YWHAQ, 14-3-3 protein theta; YWHAH, 14-3-3 protein eta; YWAHE, 14-3-3 protein epsilon; YWHAB, 14-3-3 protein beta/alpha; YWHAG, 14-3-3 protein gamma и SFN, супрессора опухоли стратифина [66]. Повышенная экспрессия miR-320b ассоциирована со старением фибробластов человека [67]. Возникшая от ДНК-транспозона hAT-Tip100 miR-326 [15] способствует развитию ОА путем ингибирования экспрессии гена SIRT1, сиртуина-1, НАД-зависимой деацетилазы и стимуляции VEGF, сосудистого эндотелиального фактора роста с активацией воспаления и ангиогенеза [68]. Уровень miR-326 значительно повышен у больных ревматоидным артритом с положительным ревматоидным фактором [69]. Экспрессия miR-326 повышена в фибробластах кожи при старении [70].

При ОА определен повышенный уровень miR-335 [71], которая подавляет энхондральную оссификацию суставного хряща [72] путем ингибирования генов: MMP13, matrix metallopeptidase 13, кодирующего матриксную металлопепитидазу, участвующую в деградации хряща; VCAM1, vascular cell adhesion molecule 1, кодирующего белок суперсемейства иммуноглобулинов, участвующий в регуляции адгезии лейкоцитов [71]. Высокий уровень miR-335 определен при старении в целом, а также при старении культуры астроцитов человека и гиппокампа головного мозга мышей по сравнению с молодыми клетками и гиппокампом молодых мышей и ведет к нарушению консолидации памяти в гиппокампе головного мозга за счет ингибирования мРНК гена PSD95, который кодирует белок постсинаптической плотности [73]. При ОА снижение экспрессии произошедшей от ДНК-транспозона TcMar miR-340 [15] активирует гены YTHDF3 (кодирует РНК-связывающийся белок), IGF2BP3 (ген мРНК-связывающего белка инсулиноподобного фактора роста), FMOD (ген интерстициального протеогликана фибромодулина) и сигналинг ERK, extracellular signal-regulated kinase, способствующий пролиферации, подвижности и выживанию клеток [74]. При старении уровень miR-340 в сыворотке крови снижается [75].

Уровень miR-374, произошедшей от LINE2 [15], снижен при старении [76], а также в хрящевой ткани пораженных суставов при ОА [77]. МiR-374 препятствует индуцированному липополисахаридами разрушению хряща за счет ингибирования Wnt5b. Название гена образовано из слов Wingless и Int-1. Ген Wnt5b кодирует белки семейства сигнальных белков WNT, передающих сигналы в клетку через рецепторы клеточной поверхности, стимулируя пролиферацию и дифференцировку клеток, в том числе физиологическую регенерацию хондроцитов. Соответственно, ингибирование Wnt5b ведет к деградации хряща [77]. У пациентов с ОА в синовиальной оболочке пораженных суставов экспрессируется на высоком уровне miR-378, особенно на поздней стадии заболевания. Мишенями miR-378 являются мРНК генов Sox6, sex determining region Y-box 6, кодирующего регулятор хондрогенеза, и Atg2a, autophagy related 2A, кодирующего связанный с аутофагией белок [78]. На моделях мышей внутрисуставные инъекции анти-miR-378 лентивируса замедляли прогрессирование ОА, способствуя регенерации и подавлению патологической гипертрофии [78]. При старении тимуса также выявлено повышение уровней miR-378 [79]. MiR-384, возникшая в эволюции от LINE-DONG-R4 [15], подавляет экспрессию генов SOX9, SRY-box transcription factor 9, и сигналинг NF-kB, nuclear factor kappa B, препятствуя пролиферации хрящевых клеток. Белок SOX9 регулирует транскрипцию гена антимюллерова гормона во время дифференцировки хондроцитов. NF-kB является регулятором транскрипции, стимулирующим экспрессию генов, участвующих в иммунных реакциях, в том числе регуляцию воспаления [80]. MiR-384 негативно регулирует возрастную остеогенную дифференцировку мезенхимальных стволовых клеток костного мозга, способствуя старению [81].

Экспрессия произошедшей от LINE2 miR-421 [15] в хондроцитах пораженных ОА суставов снижена. Данная микроРНК препятствует вызванному IL-1β апоптозу и воспалению [82]. Старение также ассоциировано с уменьшением уровней miR-421 [83]. В фибробластоподобных клетках при ОА снижена экспрессия miR-450b, мишенью которой является мРНК гена SKAP2, кодирующий с Src-киназой фосфопротеин 2, который играет важную роль в сигнальных путях киназы в макрофагах [84]. Поскольку активация макрофагов при ОА [16] способствует прогрессированию заболевания за счет продукции ими интерлейкинов IL-1β, IL-6, IL-12, TNF-α, активных форм кислорода и iNOS [18], нарушение сигнальных путей киназы в данных клетках имеет значение в патогенезе ОА [84]. В экспериментах снижение miR-450b выявлено при старении фибробластов мышей. Фибробласты являются необходимыми клеточными компонентами суставов, поэтому их старение способствует дегенеративным процессам и прогрессированию ОА [85]. У больных ОА определен повышенный уровень miR-495 в хрящевой ткани пораженных суставов [86]. MiR-495 ингибирует мРНК гена AKT1, RAC-alpha serine/threonine-protein kinase, кодирующего протеинкиназу регуляции роста и пролиферации клеток с опосредованным подавлением p-S6, ribosomal protein S6, p-mTOR, phosphorylated mammalian target of rapamycin и пролиферации клеток [86]. Данная микроРНК произошла от ERV-L/MaLR [15]. MiR-495 блокирует клеточный цикл в S-фазе и способствует апоптозу клеток, индуцируя старение мезенхимальных стволовых клеток человека [87].

При остеоартрите повышение уровня miR-708 вызывает ингибирование гена SATB2, special AT-rich sequence-binding protein 2, белковый продукт которого способствует регенерации хряща при ОА. Поэтому снижение экспрессии SATB2 под влиянием miR-708 вызывает нарушение регенерации и как результат – деградацию хряща [88]. Усиленная экспрессия miR-708 ассоциирована также со старением [89]. Эволюционным источником гена miR-708 является LINE2 [15]. Повышенная экспрессия miR-885, произошедшей от SINE/MIR [15], ассоциирована с ОА [90] и старением. Мишенью miR-885 является мРНК гена IGF1R, insulin-like growth factor 1 receptor, вовлеченного в клеточную интернализацию IGF-1 и активацию сигнальных каскадов PI3K/Akt/GSK-3β, phosphoinositide 3-kinases/ AKT serine/threonine kinase/ glycogen synthase kinase-3 beta. MiR-885 нацелена также на мРНК генов: CTNNB1, catenin beta-1, регулятор канонической передачи сигналов Wnt; MAN1C1, mannosidase alpha class 1C member 1, белковый продукт которого участвует в N-гликозилировании белков; OXR1, oxidation resistance 1, кодирующего белок регуляции чувствительности к окислительному стрессу [91].

Для некоторых произошедших от МГЭ микроРНК определено противоположное изменение экспрессии идентичных микроРНК при старении и ОА, что свидетельствует о том, что не все механизмы старения пересекаются с этиопатогенезом ОА, но изменение МГЭ влияет на нарушение экспрессии микроРНК, содержащих идентичные последовательности. Так, произошедшая от SINE/MIR miR-487b [15], являющаяся прямой мишенью длинной нкРНК MAR1 (muscle anabolic regulator 1), оказывает целевое ингибирование мРНК гена Wnt5a, что ведет к подавлению путей регуляции миогенеза, способствуя старению мышечной ткани [92]. Активация путей Wnt5a при ОА способствует прогрессированию заболевания в связи с низкой экспрессией miR-487b [93], которая способствует хондрогенной дифференцировке мезенхимальных стволовых клеток [94]. Сходные изменения определены в отношении экспрессии произошедшей от LINE1 [15] miR-576, уровень которой снижен в хондроцитах при ОА по сравнению с нормой [95]. У пожилых людей определена ассоциация повышенной экспрессии miR-576 с гериатрическим синдромом дряхлости (прогрессирующее ухудшение физического здоровья) [96]. Мишенью miR-576 также является Wnt5a [97]. Таким образом, анализ научной литературы позволил выявить 23 микроРНК, произошедших от МГЭ и участвующих в патогенезе ОА (см. табл. 2).

Заключение

Предложена гипотеза, согласно которой патологическая активация МГЭ при старении способствует развитию ОА при наличии индивидуальных особенностей SNP в межгенных и интронных областях, где расположены гены МГЭ. Этим можно объяснить значительную распространенность ОА, увеличивающуюся с возрастом, а также влияние факторов внешней среды на развитие заболевания, поскольку МГЭ являются высокочувствительными сенсорами генома к стрессовым воздействиям. При старении в организме происходят воспалительно-дегенеративные процессы, обусловленные активацией интерферонового ответа на продукты экспрессии МГЭ. Сходные механизмы описаны в патогенезе ОА. Кроме того, произошедшие от МГЭ микроРНК, характеризующиеся взаиморегуляцией со своими эволюционными источниками за счет комплементарности нуклеотидных последовательностей, оказались вовлеченными в развитие ОА. Было выявлено 23 таких микроРНК, участие которых в патогенезе ОА обусловлено ингибированием экспрессии генов, вовлеченных в иммунные, воспалительные и дегенеративные процессы. В перспективе возможно использование таких микроРНК для таргетной терапии ОА.

Исследование проведено без внешнего финансирования.

Настоящая статья не содержит каких-либо исследований с использованием в качестве объекта людей и животных.

Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.

×

Авторлар туралы

R. Mustafin

Bashkir State Medical University

Хат алмасуға жауапты Автор.
Email: ruji79@mail.ru
Ресей, Ufa

Е. Khusnutdinova

Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Federal Research Centre, Russian Academy of Sciences

Email: ruji79@mail.ru
Ресей, Ufa

Әдебиет тізімі

  1. GBD 2021 Osteoarthritis Collaborators. Global, regional, and national burden of osteoarthritis, 1990–2020 and projections to 2050: A systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2021 // Lancet Rheumatol. 2023. V. 5. e508–e522. https://doi.org/10.1016/S2665-9913(23)00163-7
  2. Boer C.G., Hatzikotoulas K., Southam L. et al. Deciphering osteoarthritis genetics across 826,690 individuals from 9 populations // Cell. 2021. V. 184. P. 4784–4818.e17. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.038
  3. Faber B.G., Frysz M., Boer C.G. et al. The identification of distinct protective and susceptibility mechanisms for hip osteoarthritis: Findings from a genome-wide association study meta-analysis of minimum joint space width and Mendelian randomisation cluster analyses // EBioMedicine. 2023. V. 95. https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2023.104759
  4. Chen X., Wu Q., Cao X. et al. Menthone inhibits type-I interferon signaling by promoting Tyk2 ubiquitination to relieve local inflammation of rheumatoid arthritis // Int. Immunopharmacol. 2022. V. 112. https://doi.org/10.1016/j.intimp.2022.109228
  5. Jiang Y., Shen Y., Ding L. et al. Identification of transcription factors and construction of a novel miRNA regulatory network in primary osteoarthritis by integrated analysis // BMC Musculoskelet. Disord. 2021. V. 22. P. 1008. https://doi.org/10.1186/s12891-021-04894-2
  6. Allen K.D., Thoma L.M., Golightly Y.M. Epidemiology of osteoarthritis // Osteoarthritis Cartilage. 2022. V. 30. P. 184–195. https://doi.org/10.1016/j.joca.2021.04.020
  7. Vos T., Flaxman A.D., Naghavi M. et al. Years lived with disability (YLDs) for 1160 sequelae of 289 diseases and injuries 1990–2010: A systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010 // Lancet. 2012. V. 380. P. 2163–2196. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(12)61729-2
  8. De Cecco M., Ito T., Petrashen A.P. et al. L1 drives IFN in senescent cells and promotes age-associated inflammation // Nature. 2019. V. 566. P. 73–78.
  9. Gorbunova V., Seluanov A., Mita P. et al. The role of retrotransposable elements in ageing and age-associated diseases // Nature. 2021. V. 596. P. 43–53. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03542-y
  10. Bendiksen S., Martinez-Zubiavrra I., Tümmler C. et al. Human endogenous retrovirus W activity in cartilage of osteoarthritis patients // Biomed. Res. Int. 2014. V. 2014. https://doi.org/10.1155/2014/698609
  11. Teerawattanapong N., Udomsinprasert W., Ngarmukos S. et al. Blood leukocyte LINE-1 hypomethylation and oxidative stress in knee osteoarthritis // Heliyon. 2019. V. 5. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2019.e01774
  12. Lee D.H., Bae W.H., Ha H. et al. The human PTGR1 gene expression is controlled by TE-derived Z-DNA forming sequence cooperating with miR-6867-5p // Sci. Rep. 2024. V. 14. P. 4723. https://doi.org/10.1038/s41598-024-55332-x
  13. Conley A.B., Jordan I.K. Cell type-specific termination of transcription by transposable element sequences // Mob. DNA. 2012. V. 3. P. 15. https://doi.org/10.1186/1759-8753-3-15
  14. Daniel C., Behm M., Öhman M. The role of Alu elements in the cis-regulation of RNA processing // Cell. Mol. Life Sci. 2015. V. 72. P. 4063–4076. https://doi.org/10.1007/s00018-015-1990-3
  15. Wei G., Qin S., Li W. et al. MDTE DB: A database for microRNAs derived from Transposable element // IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinform. 2016. V. 13. P. 1155–1160. https://doi.org/10.1109/TCBB.2015.2511767
  16. Chen J., Chen S., Cai D. et al. The role of Sirt6 in osteoarthritis and its effect on macrophage polarization // Bioengineered. 2022. V. 13. P. 9677–9689. https://doi.org/10.1080/21655979.2022.2059610
  17. Van Meter M., Kashyap M., Rezazadeh S. et al. SIRT6 represses LINE1 retrotransposons by ribosylating KAP1 but this repression fails with stress and age // Nat. Commun. 2014. V. 5. P. 5011. https://doi.org/10.1038/ncomms6011
  18. Zhou F., Mei J., Han X. et al. Kinsenoside attenuates osteoarthritis by repolarizing macrophages through inactivating NF-κ B/MAPK signaling and protecting chondrocytes // Acta. Pharm. Sin. B. 2019. V. 9. P. 973–985. https://doi.org/10.1016/j.apsb.2019.01.015
  19. Saetan N., Honsawek S., Tanavalee S. et al. Association of plasma and synovial fluid interferon-γ inducible protein-10 with radiographic severity in knee osteoarthritis // Clin. Biochem. 2011. V. 44. P. 1218–1222. https://doi.org/10.1016/j.clinbiochem.2011.07.010
  20. Мустафин Р.Н., Хуснутдинова Э.К. Некодирующие части генома как основа эпигенетической наследственности // Вавил. журн. генетики и селекции. 2017. V. 21. P. 742–749.
  21. Lu F., Liu P., Zhang Q. et al. Association between the polymorphism of IL-17A and IL-17F gene with knee osteoarthritis risk: A meta-analysis based on case-control studies // J. Orthop. Surg. Res. 2019. V. 14. P. 445. https://doi.org/10.1186/s13018-019-1495-0
  22. Budhiparama N.C., Lumban-Gaol I., Sudoyo H. Interleukin-1 genetic polymorphisms in knee osteoarthritis: What do we know? A meta-analysis and systematic review // J. Orthop. Surg. (Hong Kong). 2022. V. 30. https://doi.org/10.1177/23094990221076652
  23. Deng X., Ye K., Tang J., Huang Y. Association of rs1800795 and rs1800796 polymorphisms in interleukin-6 gene and osteoarthritis risk: Evidence from a meta-analysis // Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2023. V. 42. P. 328–342. https://doi.org/10.1080/15257770.2022.2147541
  24. Rodriguez-Fontenla C., Calaza M., Evangelou E. et al. Assessment of osteoarthritis candidate genes in a meta-analysis of nine genome-wide association studies // Arthritis Rheumatol. 2014. V. 66. P. 940–949. https://doi.org/10.1002/art.38300
  25. Liu Y., Lu T., Liu Z. et al. Six macrophage-associated genes in synovium constitute a novel diagnostic signature for osteoarthritis // Front. Immunol. 2022. V. 13. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.936606
  26. Yang L., Chen Z., Guo H. et al. Extensive cytokine analysis in synovial fluid of osteoarthritis patients // Cytokine. 2021. V. 143. https://doi.org/10.1016/j.cyto.2021.155546
  27. Pan L., Yang F., Cao X. et al. Identification of five hub immune genes and characterization of two immune subtypes of osteoarthritis // Front. Endocrinol (Lausanne). 2023. V. 14. https://doi.org/10.3389/fendo.2023.1144258
  28. Xu J., Chen K., Yu Y. et al. Identification of immune-related risk genes in osteoarthritis based on bioinformatics analysis and machine learning // J. Pers. Med. 2023. V. 13. P. 367. https://doi.org/10.3390/jpm13020367
  29. Cheng P., Gong S., Guo C. et al. Exploration of effective biomarkers and infiltrating Immune cells in Osteoarthritis based on bioinformatics analysis // Artif. Cells. Nanomed. Biotechnol. 2023. V. 51. P. 242–254. https://doi.org/10.1080/21691401.2023.2185627
  30. Li J., Wang G., Xv X. et al. Identification of immune-associated genes in diagnosing osteoarthritis with metabolic syndrome by integrated bioinformatics analysis and machine learning // Front. Immunol. 2023. V. 14. https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1134412
  31. Grandi F.C., Bhutani N. Epigenetic therapies for osteoarthritis // Trends. Pharmacol. Sci. 2020. V. 41. P. 557–569. https://doi.org/10.1016/j.tips.2020.05.008
  32. Knights A.J., Redding S.J., Maerz T. Inflammation in osteoarthritis: The latest progress and ongoing challenges // Curr. Opin. Rheumatol. 2023. V. 35. P. 128–134.
  33. Zhang J., Zhang S., Zhou Y. et al. KLF9 and EPYC acting as feature genes for osteoarthritis and their association with immune infiltration // J. Orthop. Surg. Res. 2022. V. 17. P. 365. https://doi.org/10.1186/s13018-022-03247-6
  34. Zhang Q., Sun C., Liu X. et al. Mechanism of immune infiltration in synovial tissue of osteoarthritis: A gene expression-based study // J. Orthop. Surg. Res. 2023. V. 18. P. 58. https://doi.org/10.1186/s13018-023-03541-x
  35. Xia D., Wang J., Yang S. et al. Identification of key genes and their correlation with immune infiltration in osteoarthritis using integrative bioinformatics approaches and machine-learning strategies // Medicine (Baltimore). 2023. V. 102. https://doi.org/10.1097/MD.0000000000035355
  36. Xu L., Wang Z., Wang G. Screening of biomarkers associated with osteoarthritis aging genes and immune correlation studies // Int. J. Gen. Med. 2024. V. 17. P. 205–224. https://doi.org/10.2147/IJGM.S447035
  37. Cornec A., Poirier E.Z. Interplay between RNA interference and transposable elements in mammals // Front. Immunol. 2023. V. 14. https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1212086
  38. Cho J., Paszkowski J. Regulation of rice root development by a retrotransposon acting as a microRNA sponge // eLife. 2017. V. 6. https://doi.org/10.7554/eLife.30038
  39. Lu X., Sachs F., Ramsay L. et al. The retrovirus HERVH is a long noncoding RNA required for human embryonic stem cell identity // Nat. Struct. Mol. Biol. 2014. V. 21. P. 423–425. https://doi.org/https://doi.org/ 10.1038/nsmb.2799
  40. Honson D.D., Macfarlan T.S. A lncRNA-like role for LINE1s in development // Dev. Cell. 2018. V. 46. P. 132–134. https://doi.org/https://doi.org/ 10.1016/j.devcel.2018.06.022
  41. Playfoot C.J., Sheppard S., Planet E., Trono D. Transposable elements contribute to the spatiotemporal microRNA landscape in human brain development // RNA. 2022. V. 28. P. 1157–1171. https://doi.org/10.1261/rna.079100.122
  42. McCue A.D., Nuthikattu S., Slotkin R.K. Genome-wide identification of genes regulated in trans by transposable element small interfering RNAs // RNA Biol. 2013. V. 10. P. 1379–1395. https://doi.org/10.4161/rna.25555
  43. Lee D.H., Bae W.H., Ha H. et al. Z-DNA-containing long terminal repeats of human endogenous retrovirus families provide alternative promoters for human functional genes // Mol. Cells. 2022. V. 45. P. 522–530. https://doi.org/10.14348/molcells.2022.0060
  44. Chalertpet K., Pin-On P., Aporntewan C. et al. Argonaute 4 as a effector protein in RNA-directed DNA methylation in human cells // Front. Genet. 2019. V. 10. P. 645. https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00645
  45. Tristán-Ramos P., Rubio-Roldan A., Peris G. et al. The tumor suppressor microRNA let-7 inhibits human LINE-1 retrotransposition // Nat. Commun. 2020. V. 11. P. 5712. https://doi.org/10.1038/s41467-020-19430-4
  46. Peng S., Yan Y., Li R. et al. Extracellular vesicles from M1-polarized macrophages promote inflammation in the temporomandibular joint via miR-1246 activation of the Wnt/β-catenin pathway // Ann. N. Y. Acad. Sci. 2021. V. 1503. P. 48–59. https://doi.org/10.1111/nyas.14590
  47. Dhahbi J.M., Atamna H., Boffelli D. et al. Deep sequencing reveals novel microRNAs and regulation of microRNA expression during cell senescence // PLoS One. 2011. V. 6. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0020509
  48. Lu M.Y., Yang Y.H., Wu X. et al. Effect of needle-knife on chondrocyte apoptosis of knee joint in rabbits with knee osteoarthritis based on CircSERPINE2-miR-1271-5P-ERG axis // Zhongguo Zhen Jiu. 2023. V. 43. P. 447–453. https://doi.org/10.13703/j.0255-2930.20220411-k0001
  49. Xie W.P., Ma T., Liang Y.C. et al. Cangxi Tongbi Capsules promote chondrocyte autophagy by regulating circRNA_0008365/miR-1271/p38 MAPK pathway to inhibit development of knee osteoarthritis // Zhongguo Zhong Yao Za Zhi. 2023. V. 48. P. 4843–4851. https://doi.org/10.19540/j.cnki.cjcmm.20230510.708
  50. Ju C., Liu R., Zhang Y. et al. Exosomes may be the potential new direction of research in osteoarthritis management // Biomed. Res. Int. 2019. V. 3. https://doi.org/10.1155/2019/7695768
  51. Qin W.J., Wang W.P., Wang X.B. et al. MiR-1290 targets CCNG2 to promote the metastasis of oral squamous cell carcinoma // Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci. 2019. V. 23. P. 10332–10342. https://doi.org/10.26355/eurrev_201912_19671
  52. Noren Hooten N., Fitzpatrick M., Wood W.H 3rd et al. Age-related changes in microRNA levels in serum // Aging (Albany NY). 2013. V. 5. P. 725–740. https://doi.org/10.18632/aging.100603
  53. Xie Y., Zhang Y., Liu X. et al. miR-151-5p promotes the proliferation and metastasis of colorectal carcinoma cells by targeting AGMAT // Oncol. Rep. 2023. V. 49. P. 50. https://doi.org/10.3892/or.2023.8487
  54. Wang Y., Yu C., Zhang H. Lipopolysaccharides-mediated injury to chondrogenic ATDC5 cells can be relieved by Sinomenine via downregulating microRNA-192 // Phytother. Res. 2019. V. 33. P. 1827–1836. https://doi.org/10.1002/ptr.6372
  55. Sataranatarajan K., Feliers D., Mariappan M.M. et al. Molecular events in matrix protein metabolism in the aging kidney // Aging Cell. 2012. V. 11. P. 1065–1073. https://doi.org/10.1111/acel.12008
  56. Smith-Vikos T., Liu Z., Parsons C. A serum miRNA profile of human longevity: Findings from the Baltimore Longitudinal Study of Aging (BLSA) // Aging (Albany NY). 2016. V. 8. P. 2971–2987. https://doi.org/10.18632/aging.101106
  57. Liu H., Luo J. miR-211-5p contributes to chondrocyte differentiation by suppressing Fibulin-4 expression to play a role in osteoarthritis // J. Biochem. 2019. V. 166. P. 495–502. https://doi.org/10.1093/jb/mvz065
  58. Liu Y., Zhang Y. Hsa_circ_0134111 promotes osteoarthritis progression by regulating miR-224-5p/CCL1 interaction // Aging (Albany NY). 2021. V. 13. P. 20383–20394. https://doi.org/10.18632/aging.203420
  59. Chen H., Chen F., Hu F. et al. MicroRNA-224-5p nanoparticles balance homeostasis via inhibiting cartilage degeneration and synovial inflammation for synergistic alleviation of osteoarthritis // Acta Biomater. 2023. V. 167. P. 401–415. https://doi.org/10.1016/j.actbio.2023.06.010
  60. Francisco S., Martinho V., Ferreira M. et al. The role of microRNAs in proteostasis decline and protein aggregation during brain and skeletal muscle aging // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 3232. https://doi.org/10.3390/ijms23063232
  61. Beyer C., Zampetaki A., Lin N.Y. et al. Signature of circulating microRNAs in osteoarthritis // Ann. Rheum. Dis. 2015. V. 74. e18. https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2013-204698
  62. Morsiani C., Bacalini M.G., Collura S. et al. Blood circulating miR-28-5p and let-7d-5p associate with premature ageing in Down syndrome // Mech. Ageing Dev. 2022. V. 206. https://doi.org/10.1016/j.mad.2022.111691
  63. Zhou S.L., Hu Z.Q., Zhou Z.J. et al. miR-28-5p-IL-34-macrophage feedback loop modulates hepatocellular carcinoma metastasis // Hepatology. 2016. V. 63. P. 1560–1575. https://doi.org/10.1002/hep.28445
  64. Costa V., De Fine M., Carina V. et al. How miR-31-5p and miR-33a-5p regulates SP1/CX43 expression in osteoarthritis disease: preliminary insights // Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. P. 2471. https://doi.org/10.3390/ijms22052471
  65. Dellago H., Preschitz-Kammerhofer B., Terlecki-Zaniewicz L. et al. High levels of oncomiR-21 contribute to the senescence-induced growth arrest in normal human cells and its knock-down increases the replicative lifespan // Aging Cell. 2013. V. 12. P. 446–458. https://doi.org/10.1111/acel.12069
  66. Ali S.A., Espin-Garcia O., Wong A.K. et al. Circulating microRNAs differentiate fast-progressing from slow-progressing and non-progressing knee osteoarthritis in the Osteoarthritis Initiative cohort // Ther. Adv. Musculoskelet. Dis. 2022. V. 14. https://doi.org/10.1177/1759720X221082917
  67. Dalmasso B., Hatse S., Brouwers B. et al. Age-related microRNAs in older breast cancer patients: biomarker potential and evolution during adjuvant chemotherapy // BMC Cancer. 2018. V. 18. P. 1014. https://doi.org/10.1186/s12885-018-4920-6
  68. Lin Z., Ma Y., Zhu X. et al. Potential predictive and therapeutic applications of small extracellular vesicles-derived circPARD3B in osteoarthritis // Front. Pharmacol. 2022. V. 13. https://doi.org/10.3389/fphar.2022.968776
  69. Paradowska-Gorycka A., Wajda A., Rzeszotarska E. et al. miR-10 and Its negative correlation with serum IL-35 concentration and positive correlation with STAT5a expression in patients with rheumatoid arthritis // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 7925. https://doi.org/10.3390/ijms23147925
  70. Yang X., Tan J., Shen J. et al. Endothelial cell-derived extracellular vesicles target TLR4 via miRNA-326-3p to regulate skin fibroblasts senescence // J. Immunol. Res. 2022. V. 2022. P. 3371982. https://doi.org/10.1155/2022/3371982
  71. Wilson T.G., Baghel M., Kaur N. et al. Characterization of miR-335-5p and miR-335-3p in human osteoarthritic tissues // Arthritis Res. Ther. 2023. V. 25. P. 105. https://doi.org/10.1186/s13075-023-03088-6
  72. Xia S., Zhao J., Zhang D. et al. MiR-335-5p inhibits endochondral ossification by directly targeting SP1 in TMJ OA // Oral Dis. 2023. V. 20. https://doi.org/10.1111/odi.14736
  73. Raihan O., Brishti A., Molla M.R. et al. The age-dependent elevation of miR-335-3p leads to reduced cholesterol and impaired memory in brain // Neuroscience. 2018. V. 390. P. 160–173. https://doi.org/10.1016/j.neuroscience.2018.08.003
  74. Duan Y., Yu C., Yan M. et al. m6A regulator-mediated RNA methylation modification patterns regulate the immune microenvironment in osteoarthritis // Front. Genet. 2022. V. 13. https://doi.org/fgene.2022.921256
  75. Zhang H., Yang H., Zhang C. et al. Investigation of microRNA expression in human serum during the aging process // J. Gerontol. A. Biol. Sci. Med. Sci. 2015. V. 70. P. 102–109. https://doi.org/10.1093/gerona/glu145
  76. ElSharawy A., Keller A., Flachsbart F. et al. Genome-wide miRNA signatures of human longevity // Aging Cell. 2012. V. 11. P. 607–616. https://doi.org/10.1111/j.1474-9726.2012.00824.x
  77. Shi F.L., Ren L.X. Up-regulated miR-374a-3p relieves lipopolysaccharides induced injury in CHON-001 cells via regulating Wingless-type MMTV integration site family member 5B // Mol. Cell. Probes. 2020. V. 51. https://doi.org/10.1016/j.mcp.2020.101541
  78. Feng L., Yang Z., Li Y. et al. MicroRNA-378 contributes to osteoarthritis by regulating chondrocyte autophagy and bone marrow mesenchymal stem cell chondrogenesis // Mol. Ther. Nucleic Acids. 2022. V. 28. P. 328–341. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2022.03.016
  79. Guo D., Ye Y., Qi J. et al. Age and sex differences in microRNAs expression during the process of thymus aging // Acta Biochim. Biophys. Sin. (Shanghai). 2017. V. 49. P. 409–419. https://doi.org/10.1093/abbs/gmx029
  80. Zhang W., Cheng P., Hu W. et al. Inhibition of microRNA-384-5p alleviates osteoarthritis through its effects on inhibiting apoptosis of cartilage cells via the NF-κB signaling pathway by targeting SOX9 // Cancer Gene Ther. 2018. V. 25. P. 326–338. https://doi.org/10.1038/s41417-018-0029-y
  81. Li X., Wu J., Zhang K. et al. MiR-384-5p targets Gli2 and negatively regulates age-related osteogenic differentiation of rat bone marrow mesenchymal stem cells // Stem. Cells Dev. 2019. V. 28. P. 791–798. https://doi.org/10.1089/scd.2019.0044
  82. Zhang H., Xiang X., Zhou B. et al. Circular RNA SLTM as a miR-421-competing endogenous RNA to mediate HMGB2 expression stimulates apoptosis and inflammation in arthritic chondrocytes // J. Biochem. Mol. Toxicol. 2023. V. 37. https://doi.org/10.1002/jbt.23306
  83. Li G., Song H., Chen L. et al. TUG1 promotes lens epithelial cell apoptosis by regulating miR-421/caspase-3 axis in age-related cataract // Exp. Cell. Res. 2017. V. 356. P. 20–27. https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2017.04.002
  84. Chen Y.J., Chang W.A., Wu L.Y. et al. Identification of novel genes in osteoarthritic fibroblast-like synoviocytes using next-generation sequencing and bioinformatics approaches // Int. J. Med. Sci. 2019. V. 16. P. 1057–1071. https://doi.org/10.7150/ijms.35611
  85. Nidadavolu L.S., Niedernhofer L.J., Khan S.A. Identification of microRNAs dysregulated in cellular senescence driven by endogenous genotoxic stress // Aging (Albany NY). 2013. V. 5. P. 460–473. https://doi.org/10.18632/aging.100571
  86. Zhao X., Wang T., Cai B. et al. MicroRNA-495 enhances chondrocyte apoptosis, senescence and promotes the progression of osteoarthritis by targeting AKT1 // Am. J. Transl. Res. 2019. V. 11. P. 2232–2244.
  87. Li X., Song Y., Liu D. et al. MiR-495 promotes senescence of mesenchymal stem cells by targeting Bmi-1 // Cell Physiol. Biochem. 2017. V. 42. P. 780–796. https://doi.org/10.1159/000478069
  88. Wang Y., Su Q., Tang H. et al. Microfracture technique combined with mesenchymal stem cells inducer represses miR-708-5p to target special at-rich sequence-binding protein 2 to drive cartilage repair and regeneration in rabbit knee osteoarthritis // Growth Factors. 2023. V. 41. P. 115–129. https://doi.org/10.1080/08977194.2023.2227269
  89. Lee B.P., Buric I., George-Pandeth A. et al. MicroRNAs miR-203-3p, miR-664-3p and miR-708-5p are associated with median strain lifespan in mice // Sci. Rep. 2017. V. 7. https://doi.org/10.1038/srep44620
  90. Kwak Y.H., Kwak D.K., Moon H.S. et al. Significant changes in serum microRNAs after high tibial osteotomy in medial compartmental knee osteoarthritis: potential prognostic biomarkers // Diagnostics (Basel.). 2021. V. 11. P. 258. https://doi.org/10.3390/diagnostics11020258
  91. Behbahanipour M., Peymani M., Salari M. et al. Expression profiling of blood microRNAs 885, 361, and 17 in the Patients with the Parkinson’s disease: Integrating interatction data to uncover the possible triggering age-related mechanisms // Sci. Rep. 2019. V. 9. P. 13759. https://doi.org/10.1038/s41598-019-50256-3
  92. Zhang Z.K., Li J., Guan D. et al. A newly identified lncRNA MaR1 acts as a miR-487b sponge to promote skeletal muscle differentiation and regeneration // J. Cachexia Sarcopenia Muscle. 2018. V. 9. P. 613–626. https://doi.org/10.1002/jcsm.12281
  93. Chang L., Yao H., Yao Z. et al. Comprehensive analysis of key genes, signaling pathways and miRNAs in human knee osteoarthritis: based on bioinformatics // Front. Pharmacol. 2021. V. 12. https://doi.org/10.3389/fphar.2021.730587
  94. Alizadeh A.H., Lively S., Lepage S. et al. MicroRNAs as prognostic markers for chondrogenic differentiation potential of equine mesenchymal stromal cells // Stem Cells Dev. 2023. V. 32. P. 693–702. https://doi.org/10.1089/scd.2022.0295
  95. Díaz-Prado S., Cicione C., Muiños-López E. et al. Characterization of microRNA expression profiles in normal and osteoarthritic human chondrocytes // BMC Musculoskelet. Disord. 2012. V. 13. P. 144. https://doi.org/10.1186/1471-2474-13-144
  96. Ipson B.R., Fletcher M.B., Espinoza S.E., Fisher A.L. Identifying exosome-derived microRNAs as candidate biomarkers of frailty // J. Frailty Aging. 2018. V. 7. P. 100–103. https://doi.org/10.14283/jfa.2017.45
  97. Luo J., Liu L., Shen J. et al. MiR-576-5p promotes epithelial-to-mesenchymal transition in colorectal cancer by targeting the Wnt5a-mediated Wnt/β-catenin signaling pathway // Mol. Med. Rep. 2021. V. 23. P. 94. https://doi.org/10.3892/mmr.2020.11733

Қосымша файлдар

Қосымша файлдар
Әрекет
1. JATS XML
2. Fig. 1. Diagram of the probable ways in which mobile genetic elements (MGE) activated during aging affect the epigenetic mechanisms of osteoarthritis development.

Жүктеу (531KB)
3. 2. The mechanisms of the effect of transposons on the epigenetic regulation of microRNAs with the participation of small interfering RNAs (miRNAs).

Жүктеу (490KB)

© Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).