Characteristics by str Markers of gray Ukrainian Cattle Breed in the Russian Federation
- 作者: Mokeev A.S.1, Fursa N.N.1, Beketov S.V.2, Svishcheva G.R.2, Onokhov A.A.2, Stolpovsky Y.A.2
-
隶属关系:
- Ivanov Institute of Livestock Husbandry of Steppe Regions “Askania-Nova” – National Scientific Selection and Genetic Center for Sheep Breeding of the National Academy of Agrarian Sciences
- Vavilov Institute of General Genetics of Russian Academy of Sciences
- 期: 卷 60, 编号 12 (2024)
- 页面: 75–82
- 栏目: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
- URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/277598
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675824120081
- EDN: https://elibrary.ru/waagjv
- ID: 277598
如何引用文章
全文:
详细
Using 14 microsatellite markers (BM1824, BM2113, CSRM60, CSSM66, ETH3, ETH10, ETH225, ILSTS006, INRA023, SPS115, TGLA53, TGLA122, TGLA126, TGLA227), samples of Ukrainian Grey cattle herds of the M.F. Ivanov Institute “Askania-Nova” (Kherson region) (n = 101) and experimental farm of Cherga (Altai Republic) (n = 41). When considering Wright's F-statistics for the studied loci, the value FIS = –0.0285 indicates an excess of heterozygous genotypes in the population of Ukrainian Grey cattle, with a low probability of encountering alleles of the common ancestor FIT = 0.1161, and the level FST = 0.1394 indicates an average divergence of subpopulations, the largest contribution to which is contributed by the Eth3 locus. At the same time, the number of detected polymorphic loci – 95.64%, the level of allelic diversity – AR = 7.66 and genetic diversity – HE = 0.76 were higher in the Altai subpopulation than in the Kherson subpopulation – 58.13%, 4.41, 0.61, respectively. At the same time, the Kherson herd was characterized by better evenness, homogeneity and consolidation, which allows us to consider it as a source of valuable breeding material for breeding the Ukrainian Grey breed.
全文:
Серая украинская порода, прежние названия: серый степной, южно-русский, малороссийский, черкасский, черноморский и кубано-черноморский скот, является одной из древнейших пород, которая ведет свое происхождение от серого степного скота, включающего подольскую и романскую породы, в прошлом широко распространенных в южной части Европы, преимущественно в степной зоне Средиземноморья и Причерноморья. В настоящее время это одна из немногих реликтовых аборигенных пород, сохранившихся до наших дней. До начала двадцатого века серый украинский скот являлся основной рабочей и тягловой породой в Малороссии, а также ценился за мясные качества. Молочная продуктивность коров серой украинской породы небольшая и в среднем составляет 2950 кг, содержание жира в молоке – около 4.5% и белка – 3.45%. С конца XIX в. в связи с освоением степных целинных земель Северного Причерноморья и Приазовья отмечалось постепенное снижение численности серого украинского скота, которое усилилось в начале XX в. на фоне коллективизации и механизации сельского хозяйства [1].
Однако уже в 1960-х гг. в Советском Союзе была принята государственная программа по сохранению серой украинской породы, в частности были сформированы два генофондных стада: первое в ОПХ “Поливановка” Украинского НИИ разведения и искусственного осеменения КРС (Днепропетровская обл.) (680 голов) и второе в опытном хозяйстве Украинского НИИ животноводства степных районов им. М. Ф. Иванова “Аскания-Нова” (Херсонская обл.) (около 2000 голов). В 1982 г. небольшая группа животных (34 особи) была перевезена из Аскании-Нова в с. Черга (Республика Алтай) в экспериментальное хозяйство Института цитологии и генетики СО АН СССР [1, 2].
Тем не менее, несмотря на проводимые охранные мероприятия, общая численность серого украинского скота к 1980 г. снизилась до 1000 животных, а в 2007 г. – до 962 особей. В этом же году статус породы был оценен ФАО как критический [3] и к 2022 г. насчитывалось уже 738 особей [4].
Что касается непосредственно Российской Федерации, то серый украинский скот представлен здесь двумя субпопуляциями: около 260 животных содержится в Аскания-Нова и около 100 – в Алтайском экспериментальном племенном центре в с. Черга (Республика Алтай). Учитывая небольшую общую численность серого украинского скота, а также то, что генетическая структура этой породы в сравнительном аспекте мало изучена, цель настоящей работы заключается в том, чтобы с использованием STR-маркеров дать характеристику состояния генофондов двух локальных географически удаленных субпопуляций серого украинского скота, разводимых на территории Российской Федерации. При этом важно отметить, что STR-маркирование до настоящего времени остается наиболее доступным, достаточно информативным и востребованным методом при проведении популяционно-генетических исследований [5, 6].
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Материалом для исследований являлись образцы биоматериала (ушные выщипы) отдельных особей серого украинского скота ИЖСР им. М. Ф. Иванова (Херсонская обл.) (Askan, n = 101), включая 97 коров и 4 быка (рис. 1, 2), полученные с использованием технологии FlexoPlusGeno (Сaisley, Германия) [7]. Также исследовались пробы ДНК серого украинского скота экспериментального хозяйства c. Черга (Республика Алтай, Шебалинский р-н) (Altai, n = 41) из коллекции лаборатории сравнительной генетики животных ИОГен РАН им. Н.И. Вавилова (Москва). ДНК из образцов хрящевой ткани наружного уха выделяли с помощью набора реагентов “ДНК-Экстран-2” (ООО “Синтол”, Россия). Животные обеих рассматриваемых субпопуляций были прогенотипированы по 14 STR-маркерам (BM1824, BM2113, CSRM60, CSSM66, ETH3, ETH10, ETH225, ILSTS006, INRA023, SPS115, TGLA53, TGLA122, TGLA126, TGLA227).
Рис. 1. Серый украинский скот (коровы).
Рис. 2. Серый украинский скот (бык).
Мультиплексный ПЦР-анализ микросателлитных локусов, содержащих короткие тандемные повторы, проводили с использованием набора COrDIS Cattle (ООО “Гордиз”, Россия) согласно инструкции производителя. После начальной денатурации (94°C, 3 мин) амплификацию фрагментов осуществляли в следующем температурно-временном режиме: 4 цикла при 98°C 30 с, 59°C 120 с, 72°C 90 с, 6 – при 94°C 30 с, 59°C 120 с, 72°C 90 с, 18 – при 90°C 30 с, 59°C 120 с, 72°C 75 с и окончательным удлинением при 68°C 15 мин. Полимеразную цепную реакцию выполняли на термоциклере Veriti (Thermo Fisher Scientific, США). Капиллярный электрофорез продуктов ПЦР-реакции осуществляли на генетическом анализаторе ABI 3130XL (Applied Biosystems, США) с последующим определением длин аллелей микросателлитов в программном обеспечении GeneMapper v. 4.0. (Applied Biosystems, CША).
Основные популяционно-генетические характеристики для каждой выборки были рассчитаны в R-пакете degenet [8]. Частоты аллелей, аллельное богатство и количество частных аллелей оценивали с помощью R-пакета PopGenReport. Для каждой пары “локус–популяция” индекс фиксации, а также наблюдаемую и ожидаемую гетерозиготности оценивали с помощью функции divBasic из R-пакета divRsity [9]. F-cтатистики (FIT, FST и FIS) для каждого локуса рассчитывали с помощью функции FST из R-пакета pegas. Дендрограмма, основанная на генетических расстояниях Нея, была построена с помощью алгоритма объединения соседей (NJ), реализованного в R-пакете poppr, анализ главных компонент по исследованным локусам (PCA – Principal Component Analysis) проводили с помощью программного обеспечения PopGenReport [10, 11].
РЕЗУЛЬТАТЫ
В ходе сравнительного анализа двух географически удаленных популяций серого украинского скота было установлено, что количество полиморфных локусов – 95.64%, и уровень аллельного разнообразия – 7.66, были больше в алтайской субпопуляции, по сравнению с асканийской: 58.13 и 4.41% соответственно (табл. 1).
В то же время значения наблюдаемой (HO) и ожидаемой (HE) гетерозиготностей оказались одинаковыми в алтайской субпопуляции (HO = 0.76, HE = 0.76) и достаточно близкими между собой в асканийской (HO = 0.64, HE = 0.61). При этом в последней при избытке гетерозигот уровень генетической изменчивости был несколько меньше – HE = 0.61, по сравнению с алтайской – HE = 0.76. На этом фоне рассчитанный коэффициент инбридинга FIS алтайской популяции был равен 0, в то время как у асканийского скота отмечали незначительный избыток гетерозигот – FIS = –0.05 (табл. 1).
Таблица 1. Параметры аллельного и генетического разнообразия субпопуляций серого украинского скота
Локус | Субпопуляция | ||||||||||
асканийская (Askan) | алтайская (Altai) | ||||||||||
Р, % | AR | HO | HE | FIS | Р, % | AR | HO | HE | FIS | ||
ETH3 | 66.67 | 3.7 | 0.3 | 0.31 | 0.03 | 83.33 | 5 | 0.83 | 0.74 | –0.12 | |
CSSM66 | 60 | 4.5 | 0.69 | 0.58 | –0.19 | 90 | 8.59 | 0.88 | 0.82 | –0.07 | |
INRA23 | 60 | 5.86 | 0.83 | 0.76 | –0.09 | 90 | 8.24 | 0.8 | 0.83 | 0.04 | |
ILSTS6 | 75 | 5.63 | 0.66 | 0.64 | –0.03 | 100 | 6.96 | 0.76 | 0.79 | 0.04 | |
TGLA227 | 60 | 5.71 | 0.77 | 0.77 | 0 | 100 | 9.75 | 0.73 | 0.82 | 0.11 | |
TGLA126 | 83.33 | 4.53 | 0.73 | 0.64 | –0.14 | 100 | 5.69 | 0.73 | 0.61 | –0.20 | |
TGLA122 | 33.33 | 4.42 | 0.53 | 0.58 | 0.09 | 86.67 | 11.9 | 0.83 | 0.83 | 0 | |
SPS115 | 50 | 3.02 | 0.54 | 0.5 | –0.08 | 100 | 6.6 | 0.54 | 0.61 | 0.11 | |
ETH225 | 55.56 | 4.57 | 0.73 | 0.66 | –0.11 | 88.89 | 7.22 | 0.71 | 0.78 | 0.09 | |
TGLA53 | 46.15 | 4.88 | 0.64 | 0.64 | 0 | 100 | 11.76 | 0.76 | 0.84 | 0.10 | |
CSRM60 | 66.67 | 3.95 | 0.59 | 0.61 | 0.03 | 100 | 5.96 | 0.83 | 0.79 | –0.05 | |
BM2113 | 57.14 | 3.94 | 0.6 | 0.59 | –0.02 | 100 | 6.99 | 0.83 | 0.83 | 0 | |
BM1824 | 57.14 | 4.00 | 0.69 | 0.62 | –0.11 | 100 | 6.22 | 0.68 | 0.71 | 0.04 | |
ETH10 | 42.86 | 3.00 | 0.64 | 0.63 | –0.02 | 100 | 6.43 | 0.68 | 0.66 | –0.03 | |
Средняя | 58.13 | 4.41 | 0.64 | 0.61 | –0.05 | 95.64 | 7.66 | 0.76 | 0.76 | 0 | |
Примечание. Р – доля полиморфных локусов; AR – аллельное разнообразие; HO – наблюдаемая гетерозиготность; HE – ожидаемая гетерозиготность; FIS – коэффициент инбридинга.
В ходе дальнейшего анализа на уникальность выявляемых аллелей было обнаружено 50 приват-аллелей в алтайской субпопуляции и 6 – в асканийской (табл. 2). В то же время в алтайской субпопуляции серого скота – только 10 уникальных аллелей (20% от их общего числа) превышали вероятность обнаружения (равную 0.05); в асканийской субпопуляции число таких аллелей составило 3 или 50%. Причем, если в алтайской субпопуляции приватные аллели выявлялись преимущественно с низкой частотой и в узких пределах обнаружения – 0.06–0.14, то у асканийского скота, несмотря на их немногочисленность, приват аллели встречались чаще и с более широким диапазоном варьирования – 0.16–0.39 (табл. 2).
Таблица 2. Приват-аллели в локусах и субпопуляциях серого украинского скота
Локус | Субпопуляция | Aллель | Частота, % | Локус | Субпопуляция | Aллель | Частота, % | |
ETH3 | Askan | 115 | 26 | TGLA122 | Altai | 175 | 4 | |
ETH3 | Altai | 121 | 9 | TGLA122 | Askan | 179 | 3 | |
ETH3 | Altai | 127 | 13 | TGLA122 | Altai | 183 | 1 | |
CSSM66 | Altai | 181 | 1 | TGLA122 | Altai | 185 | 4 | |
CSSM66 | Altai | 187 | 3 | SPS115 | Altai | 246 | 1 | |
CSSM66 | Altai | 195 | 5 | SPS115 | Altai | 252 | 4 | |
CSSM66 | Altai | 197 | 6 | SPS115 | Altai | 258 | 1 | |
CSSM66 | Askan | 199 | 1 | SPS115 | Altai | 262 | 1 | |
INRA23 | Altai | 196 | 5 | ETH225 | Altai | 142 | 5 | |
INRA23 | Altai | 200 | 13 | ETH225 | Askan | 146 | 16 | |
INRA23 | Askan | 202 | 39 | ETH225 | Altai | 152 | 3 | |
INRA23 | Altai | 210 | 4 | ETH225 | Altai | 154 | 1 | |
INRA23 | Altai | 216 | 1 | ETH225 | Altai | 156 | 1 | |
ILSTS6 | Altai | 282 | 1 | TGLA53 | Altai | 154 | 4 | |
ILSTS6 | Altai | 300 | 1 | TGLA53 | Altai | 162 | 2 | |
TGLA227 | Altai | 079 | 3 | TGLA53 | Altai | 164 | 4 | |
TGLA227 | Altai | 091 | 5 | TGLA53 | Altai | 176 | 3 | |
TGLA227 | Altai | 097 | 14 | TGLA53 | Altai | 178 | 4 | |
TGLA227 | Altai | 101 | 3 | TGLA53 | Altai | 182 | 2 | |
TGLA126 | Altai | 123 | 2 | TGLA53 | Altai | 186 | 1 | |
TGLA122 | Altai | 139 | 1 | CSRM60 | Altai | 096 | 7 | |
TGLA122 | Altai | 141 | 10 | CSRM60 | Altai | 104 | 3 | |
TGLA122 | Altai | 145 | 2 | BM2113 | Altai | 125 | 4 | |
TGLA122 | Altai | 153 | 2 | BM2113 | Altai | 131 | 14 | |
TGLA122 | Altai | 161 | 5 | BM2113 | Altai | 135 | 12 | |
TGLA122 | Altai | 163 | 4 | BM1824 | Altai | 176 | 1 | |
TGLA122 | Askan | 169 | 3 | BM1824 | Altai | 184 | 1 | |
TGLA122 | Altai | 173 | 3 | BM1824 | Altai | 186 | 7 |
При рассмотрении F-cтатистик по исследованным локусам обеих субпопуляций значение FIS = –0.0285 указывает на избыток гетерозиготных генотипов с малой вероятностью встречи аллелей общего предка в рассматриваемых популяциях FIT = 0.1161, а уровень FST = 0.1394 свидетельствует об их средней дивергенции, наибольший вклад в которую вносит локус Eth3 (табл. 3).
Таблица 3. F-cтатистики по исследованным локусам субпопуляций серого украинского скота
Локус | FIT | FST | FIS |
ETH3 | 0.20948280 | 0.23848947 | –0.038090963 |
CSSM66 | 0.08202644 | 0.19849845 | –0.145317266 |
INRA23 | 0.07071799 | 0.11239222 | –0.046951181 |
ILSTS6 | 0.17892123 | 0.18257128 | –0.004465281 |
TGLA227 | 0.11005591 | 0.07895635 | 0.033765563 |
TGLA126 | 0.08620622 | 0.21275222 | –0.160744810 |
TGLA122 | 0.23889019 | 0.19515622 | 0.054338459 |
SPS115 | 0.01416733 | 0.02679428 | –0.012974590 |
ETH225 | 0.07487413 | 0.10363076 | –0.032081235 |
TGLA53 | 0.18498442 | 0.15169638 | 0.039240709 |
CSRM60 | 0.13075568 | 0.12568836 | 0.005795789 |
BM2113 | 0.12618519 | 0.13532227 | –0.010567033 |
BM1824 | 0.08929996 | 0.14285507 | –0.062480814 |
ETH10 | 0.02944797 | 0.04738194 | –0.018825989 |
Cредняя | 0.116143961 | 0.139441805 | –0.028525617 |
Согласно дендрограмме Neighbor-Joining взаимоотношений можно видеть два больших кластера, сформированных алтайской и асканийской субпопуляциями (рис. 3). При этом серый украинский скот из Черги делится еще на два достаточно удаленных подкластера (или две линии разведения), в один из которых попадают пять особей асканийской субпопуляции, что подтверждает их отдаленные родственные связи [12]. Что же касается асканийской субпопуляции, то она образует куст из нескольких сближенных подкластеров (всего восемь родственных групп), отражающих ее множественную линейную структуру.
Рис. 3. NJ-дендрограмма взаимоотношений исследуемых субпопуляций серого украинского скота, построенная на основе попарных генетических дистанций DA Нея. Синим цветом обозначена асканийская субпопуляция, красным – алтайская.
Рис. 4. Проекция особей исследуемых субпопуляций серого украинского скота на плоскости двух координат по данным PCA-анализа.
При последующем рассмотрении тех же самых субпопуляций с использованием метода главных компонент (PCA) (рис. 4) наблюдается их четкое разграничение с выраженной неоднородностью особей в алтайской и консолидацией животных в асканийской субпопуляции.
ОБСУЖДЕНИЕ
Можно видеть, что при общем рассмотрении популяций серого украинского скота с использованием F-статистик Райта отмечается незначительный избыток гетерозигот c отсутствием инбридинга FIT = 0.116 < FST (табл. 1), причем в большей степени это относится к херсонской популяции. Все это указывает на то, что в обоих стадах серого украинского скота ведется работа по сохранению генетического разнообразия с той лишь разницей, что более низкий уровень аллельного разнообразия (АR) при большей генетической изменчивости (HE), обнаруживаемый в асканийской субпопуляции, свидетельствует о более интенсивном в ней фенотипическом отборе. Об этом же свидетельствует и бόльшая консолидированность асканийской субпопуляции по данным PCA-анализа.
В связи с вышесказанным интересно отметить, что в ранее проведенных исследованиях при оценке аллельного полиморфизма по гену BoLA-DRB3 с применением индекса Шеннона – Винера (Н`) самые высокие его значения (3.77 и 3.4) были выявлены у красно-пестрой и голштинских пород КРС и самое низкое – у якутской породы (1.74). Для серого украинского скота асканийской субпопуляции аллельный полиморфизм BoLA-DRB3 составил 3.26, что сближает его по этому показателю со специализированными молочными породами [13].
В свою очередь, расчет значения FST (табл. 3), отражающего степень подразделенности субпопуляций, показал, что 86.1% выявленной у серого украинского скота изменчивости реализуется внутри популяции, включающей асканийскую и алтайскую субпопуляции, и 13.4% (FST = 0.134) приходится на долю межпопуляционной составляющей. В связи с этим интерес представляет оценка величины М [14], характеризующей интенсивность потока генов между субпопуляциями. В нашем случае М = 1.61 и 2М > 1, что свидетельствует об отсутствии тенденции к дивергенции рассматриваемых субпопуляций по аллельным частотам [15].
Что же касается величины ожидаемой генетической гетерозиготности (НE), то характерная гетерогенность генетического разнообразия, обнаруживаемая у серого украинского скота, свойственна и для других пород КРС, в том числе региональных и трансграничных. Например, по черно-пестрой породе в разных субпопуляциях величина ожидаемой гетерозиготности HE варьировала от минимальной 0.417 до максимальной 0.751 (коэффициент вариации Cv = 19.7%) при среднем значении 0.608 ± 0.042 и 95% доверительном интервале (ДИ) = 0.526÷0.690. По голштинской породе значения HE изменялись от 0.430 до 0.891 (коэффициент вариации 19.4%) при среднем – 0.639 ± 0.026 (95% ДИ, 0.588÷0.690) [16].
Причем одни авторы подобный внутрипородный разброс значений НЕ связывают с использованием в вычислениях малочисленных нерепрезентативных выборок, в то время как другие склонны объяснять его характером динамики происходящих во времени внутрипопуляционных процессов [12, 17]. Принимая во внимание данные точки зрения и с учетом объема выборочных данных, использованных в настоящем исследовании, можно было бы говорить об асканийской субпопуляции как наиболее объективно отражающей фактическую генетическую изменчивость серого украинского скота. Наблюдаемые различия НЕ в двух рассматриваемых субпопуляциях также можно объяснить уменьшением поголовья в асканийском стаде и его увеличением в алтайском. Причем сходная картина наблюдалась ранее на Украине в отдельных субпопуляциях серого украинского скота (ООО “Голосеево” и КСП “Вороньков”), где с ростом численности животных увеличивался показатель генотипической изменчивости (HE) до 0.80 и 0.81 соответственно [18].
Таким образом, по результатам сравнительного анализа асканийского и алтайского серого украинского скота в настоящей работе установлено, что рассматриваемые популяции по изучаемым микросателлитным локусам характеризуются отсутствием инбридинга, отдаленными родственными связями и различались между собой показателями аллельного и генетического разнообразия: бóльшим для алтайской микропопуляции и меньшим для херсонской. Эти данные свидетельствуют о том, что алтайская популяция по своим генетическим характеристикам была менее подвержена селекционному давлению. В то же время асканийское стадо серого украинского скота при большем линейном разнообразии и избыточной гетерозиготности отличается выравненностью, однородностью и консолидированностью, что позволяет рассматривать его в качестве источника ценного племенного материала при разведении этой породы.
Исследования выполнены при финансовой поддержке РНФ – проект № 23-16-00059 и Государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ “Оценка генетического потенциала национальных пород крупного рогатого скота” № 122020800034-4.
Исследование одобрено Этическим комитетом Института общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН 17 июня 2024 г., протокол № 3.
Все применимые международные, национальные и/или институциональные принципы ухода и использования животных были соблюдены.
Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.
作者简介
A. Mokeev
Ivanov Institute of Livestock Husbandry of Steppe Regions “Askania-Nova” – National Scientific Selection and Genetic Center for Sheep Breeding of the National Academy of Agrarian Sciences
编辑信件的主要联系方式.
Email: mokeev.as@mail.ru
俄罗斯联邦, Askania-Nova, 275230
N. Fursa
Ivanov Institute of Livestock Husbandry of Steppe Regions “Askania-Nova” – National Scientific Selection and Genetic Center for Sheep Breeding of the National Academy of Agrarian Sciences
Email: mokeev.as@mail.ru
俄罗斯联邦, Askania-Nova, 275230
S. Beketov
Vavilov Institute of General Genetics of Russian Academy of Sciences
Email: svbeketov@gmail.com
俄罗斯联邦, Moscow, 119991
G. Svishcheva
Vavilov Institute of General Genetics of Russian Academy of Sciences
Email: svbeketov@gmail.com
俄罗斯联邦, Moscow, 119991
A. Onokhov
Vavilov Institute of General Genetics of Russian Academy of Sciences
Email: svbeketov@gmail.com
俄罗斯联邦, Moscow, 119991
Yu. Stolpovsky
Vavilov Institute of General Genetics of Russian Academy of Sciences
Email: svbeketov@gmail.com
俄罗斯联邦, Moscow, 119991
参考
- Столповский Ю.А. Серая украинская порода // Генетические ресурсы крупного рогатого скота: редкие и исчезающие отечественные породы. М.: Наука, 1993. С. 94–111.
- Glazko V.I. Podolic сattle in the Ukraine and eastern territories // Stočarstvo: Časopis za unapređenje stočarstva. 2001. V. 55. № 1. Р. 33–60.
- The state of the world’s animal genetic resources for food and agriculture. Rome, FAO, 2007. 511 р.
- Ukrainian grey/Ukraine (cattle). Domestic animal diversity information system of the food and agriculture organization of the United Nations. Accessed April 2023. https://www.fao.org/dad-is/browse-by-country-and-species/en/
- Dakin E.E., Avise J.C. Microsatellite null alleles in parentage analysis // Heredity. 2004. V. 93. P. 504–509. doi: 10.1038/sj.hdy.6800545
- Olschewsky А., Hinrichs D. An overview of the use of genotyping techniques for assessing genetic diversity in local farm animal breeds // Animals. 2021. V. 11. № 7. P. 2016. https://www.mdpi.com. doi: 10.3390/ani11072016
- Бекетов С.В., Семина М.Т., Мокеев А.С. и др. Перспективы применения технологии “генетического биркования” в животноводстве // Главный зоотехник. 2024. № 5. С. 3–15.
- Jombart T. Adegenet: A R package for the multivariate analysis of genetic markers // Bioinformatics. 2008. V. 24. P. 1403–1405. doi: 10.1093/bioinformatics/btn129
- Keenan K., McGinnity P., Cross T.F. et al. diveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors // Methods Ecol. and Evol. 2013. № 4. P. 782–788. doi: 10.1111/2041-210X.12067
- Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: Simplifying basic population genetic analyses in R. Methods // Ecology and Evolution. 2014. № 5. P. 384–387. doi: 10.1111/2041-210X.12158
- Gruber B., Adamack A.T. landgenreport: A new R function to simplify landscape genetic analysis using resistance surface layers // Mol. Ecol. Resources. 2015. V. 15. P. 1172–1178. doi: 10.1111/1755-0998.12381
- Кушнир А.В., Глазко В.И. Серый украинский скот и его близкородственные формы // Сиб. экол. журнал. 2009. Т. 16. № 3. С. 495–506.
- Копылов К.В., Стародуб Л.Ф., Мохначева Н.Б., Супрович Н.П. Особенности изменчивости генома крупного рогатого скота серой украинской породы по цито- и ДНК-маркерам // Акт. пробл. интенсивного развития животноводства. 2019. Вып. 1. С. 60–69.
- Holsinger K.E. Lecture notes in population genetics. Stanford: University of Connecticut, 2010. 275 p. doi: 10.6084/M9.FIGSHARE.100687
- Кузнецов В.М. F-статистики Райта: оценка и интерпретация // Пробл. биол. продуктивных животных. 2014. № 4. С. 80–104.
- Кузнецов В.М. Снижает ли кроссбридинг генетическое разнообразие? Разведение и сохранение пород молочного скота в России. Киров: НИИСХ Северо-Востока, 2017. 104 с.
- Кузнецов В.М. Сравнение методов оценки генетической дифференциации популяций по микросателлитным маркерам // Зоотехния. 2020. Т. 21. № 2. С. 169–182. doi: 10.30766/2072-9081.2020.21.2.169-182
- Гузеев Ю.В., Мельник О.В., Спиридонов В.Г., Мельничук С.Д. Сравнительный анализ генетической структуры микропопуляции серой украинской породы крупного рогатого скота по ДНК-маркерам // Науковий вісник ЛНУВМБТ імені С. З. Ґжицького. 2015. Т. 17. № 3(63). С. 166–171.
补充文件





