Сравнительный анализ мутаций генов гиногенеза кукурузы

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В статье приведен анализ полиморфизма нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих гиногенез (Zm_Pla1, Zm_CenH3, Zm_Dmp7) у гаплоиндуцирующих (ЗМС-8, ЗМС-П) и контрольных (КМ, ГПЛ-1) линий кукурузы саратовской селекции. С помощью секвенирования и последующего множественного выравнивания транскриптов целевых генов исследуемых в работе линий и референсной линии кукурузы B73 определено наличие однонуклеотидных замен (ОНЗ), делеций и вставок, построены филогенетические деревья по изучаемым генам. Установлено наличие 4-нуклеотидной вставки в гене Zm_Pla1, которая обусловливает гаплоиндуцирующую способность у предковой линии Stock 6 и гаплоиндуцирующих линий ЗМС-8 и ЗМС-П, а также 15 идентичных ОНЗ. Но элементы партеногенеза, демонстрируемые линиями АТ-1, АТ-3 и АТ-4, у которых отсутствуют вставки из четырех нуклеотидов в гене Zm_Pla1, имеют иную генетическую основу. Филогенетический анализ гена Zm_Pla1 подтвердил родство гаплоиндуцирующих линий Stock6, ЗМС-П и ЗМС-8. В гене Zm_Dmp7 зафиксировано наличие пяти ОНЗ у линии ЗМС-8 и трех ОНЗ у линий ЗМС-П и КМ. Одна из ОНЗ (в положении 131 от стартового кодона) в гене Zm_Dmp7 является причиной повышенной гаплоиндуцирующей способности линии CAU5, но не ЗМС-П. Помимо этого, в гене Zm_Dmp7 обнаружены 3-нуклеотидная делеция у линии ЗМС-П и 9-нуклеотидная делеция у линии КМ.

Полный текст

Одной из важнейших мировых сельскохозяйственных культур является кукуруза (Zea mays L.). В современных сельскохозяйственных биотехнологиях для ускоренного получения гомозиготных линий применяют такую особенность систем размножения растений, как гиногенез (образование гаплоидных растений при нарушениях оплодотворения яйцеклетки). У современных сортов кукурузы независимое от оплодотворения развитие зародыша (гиногенез, или матроклинный партеногенез, как частный случай) встречается крайне редко (0,01–0,1%). Однако более 60 лет назад в результате скрещиваний и селекции была получена линия кукурузы Stock 6, при использовании которой в качестве опылителя в потомстве индуцируется образование до 2–3% матроклинных гаплоидов [1].

В 2017 г. впервые установлено, что в результате скрещиваний у линии кукурузы Stock 6, полученной более 60 лет назад [1], возникла случайная мутация – в четвертом экзоне гена Zm_Pla1, кодирующего белок фосфолипазу А, произошла вставка четырех нуклеотидов, что привело к сдвигу рамки считывания, замене 20 аминокислот, появлению стоп-кодона и укорочению белка [2]. В ходе последующей селекции у линий саратовской селекции на базе линии Stock 6 эффективность гаплоиндукции (ГИ) была повышена с 2 до 8–10% [3–6]. Однако пока неясно, какие мутации обусловливают повышенную ГИ-способность у линий саратовской селекции.

В 2018 г. впервые было установлено, что ген Dmp9 регулирует слияние мембран женской и мужской гамет растений и экспрессируется специфически как в генеративных клетках, так и в спермиях [7]. Годом позже было показано, что нокаут гена Dmp9 арабидопсиса приводит к нарушению оплодотворения в большей степени яйцеклетки, чем центральной клетки [8]. В 2019 г. было показано, что ген Dmp7, расположенный в локусе qhir8 (789 тпн) у кукурузы, является ортологом гена Dmp9 арабидопсиса и контролирует гаплоиндукцию [9]. Ген Dmp7 экспрессируется на поздней стадии развития пыльцы кукурузы, а кодируемый им белок локализуется в плазматической мембране спермия и участвует в прикреплении спермия к поверхности яйцеклетки или центральной клетки. Роль гена Dmp7 в гаплоиндукции кукурузы была доказана в экспериментах по нокауту гена с помощью геномного редактирования (CRISPR/Cas9) [9]. Одна однонуклеотидная замена (ОНЗ) (в положении 131 от стартового кодона) последовательности гена Dmp7 у линии кукурузы CAU5 приводит к аминокислотной замене (метионин на треонин), что повышает гаплоиндукцию в 2–3 раза в присутствии мутантного гена Pla1 [9].

В 2003 г. Чалык (Chalyk) с соавт. впервые была выдвинута гипотеза, что возможной причиной появления гаплоидов в потомстве линий-гаплоиндукторов кукурузы является анеуплоидия (элиминация хромосом) у части популяции мужских половых клеток, которая вызывает стимуляцию деления яйцеклетки без оплодотворения [10]. Элиминация хромосом подтвердилась у линий-гаплоиндукторов кукурузы, созданных на основе линии Stock 6 [11, 12]. Согласно [13], для CENH3-мутантов кукурузы содержание гаплоидов в потомстве может достигать 3.6%.

Элиминация хромосом и появление гаплоидов в потомстве арабидопсиса наблюдались при мутации в гене, кодирующем центромер-специфичный гистоновый белок CENH3, необходимый для прикрепления веретена в процессе митоза и мейоза. Изменения в нуклеотидной последовательности гена приводят к несовместимости и потере хромосом в первых зиготических делениях [14].

Исследования механизма анеуплоидии у кукурузы показали, что гаплоиндукция возникает при модификации N-концевого фрагмента или C-концевого складчатого гистонового домена белка CENH3 [13]. В работе [15] показано, что при ко-экспрессии гена CenH3 дикого и мутантного типов способность к гаплоиндукции пропадает.

Цель статьи – сравнительный анализ полиморфизма нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих гиногенез (наследуемый и индуцируемый) у гаплоиндуцирующих и контрольных линий кукурузы саратовской селекции.

Материалы и методы

Растения

Линия кукурузы ЗМС-8 (частота ГИ − 8%) [4], производная от линии ЗМС, получена на кафедре генетики ФГБУ ВО Саратовского национального исследовательского государственного университета им. Н.Г. Чернышевского (СГУ). Линия ЗМС-П (частота ГИ − 10%) была получена из потомства самоопыленных гибридов линии ЗМС-8 (материнский родитель) и формы кукурузы с пурпурной окраской стеблей, листьев и метелок [6]. В скрещиваниях при получении линий ЗМС-8 и ЗМС-П использована линия Stock 6 [16].

Партеногенетическая линия кукурузы АТ-1 была выделена в самоопыленном потомстве гибрида линии-гаплоиндуктора Stock 6 (США, [1]) и линии Коричневый тестер (США) [см. 17]. При экспериментальной задержке опыления в зародышевых мешках у линии кукурузы AT-1 был обнаружен высокий процент начала развития зародышей и эндосперма [17]. Однако линия АТ-1 плохо вызревала в условиях Саратовской области и поэтому была скрещена со скороспелой линией саратовской селекции ГПЛ-1 (дигаплоидизированный гаплоид, Саратов), в результате чего получена линия АТ-3 [18]. Партеногенетическая линия кукурузы АТ-4 была получена путем скрещивания линии АТ-1 с тетраплоидной линией Кр-1 (Краснодар) и последующим отбором диплоидной формы гибрида [19, 20]. Для линий АТ характерны такие элементы апомиксиса, как независимое от опыления развитие зародыша до стадии глобулы, начало эндоспермогенеза, полиэмбриония, а также псевдогамия [17, 21–23].

Линия КМ саратовской селекции без ГИ-способности имеет пурпурную окраску корней и побегов, что позволяет выявлять гаплоиды на стадии проростков [3].

Определение нуклеотидной последовательности транскриптов генов

Для выявления мутаций были секвенированы транскрипты целевых генов у исследуемых линий кукурузы. РНК выделяли из замороженных тканей (пыльца, завязи) [24, 25], получали кДНК согласно инструкции производителя ревертазы (“Евроген”, Россия). Участки кДНК исследуемых генов амплифицировали с использованием специфических праймеров (подобраны с помощью ресурса Primer-Blast для перекрывающихся фрагментов последовательностей) и набора реактивов Tersus Plus PCR kit (Кат. № PK121, “Евроген”). Затем ПЦР-продукты очищали при помощи набора Cleanup Mini (Кат. № BC023S, Евроген) и секвенировали в компаниях “Евроген” и “Синтол”.

Методы биоинформатики

Нуклеотидные последовательности генов гаплоиндуцирующих и партеногенетических линий кукурузы сравнивали между собой, с линиями, не обладающими данными признаками, и референсной линией B73 методом множественного выравнивания с использованием программы BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ Blast.cgi).

Результаты и обсуждение

Zm_Pla1

Множественное выравнивание нуклеотидных последовательностей транскриптов гена Zm_Pla1 исследованных нами линий ЗМС-П и ЗМС-8, а также предковой линии Stock 6 показало присутствие вставки из четырех нуклеотидов и 15 ОНЗ (рис. 1), что свидетельствует о наследовании саратовскими линиями нуклеотидной последовательности гена Zm_Pla1 от линии Stock 6. Филогенетический анализ и множественное выравнивание гена Zm_Pla1 у исследуемых линий и линий из базы данных (https://www.gramene.org, https://www.maizegdb.org) показали наличие тех же 15 ОНЗ в генах Zm_Pla1 у линий, ни одна из которых не является гаплоиндуктором. Поэтому можно предположить, что наличие 15 ОНЗ не связано с повышенной ГИ-способностью линий ЗМС-П и ЗМС-8.

 

Рис. 1. Множественное выравнивание нуклеотидных последовательностей гена Zm_Pla1 у линий кукурузы саратовской селекции КМ, ЗМС-8, ЗМС-П, ГПЛ-1, а также линий Stock 6 и B73, выполненное с использованием программы BLAST. Точками показано нуклеотидное сходство у линий кукурузы, буквами обозначены однонуклеотидные замены, дефисом – отсутствие нуклеотида.

 

Последовательности гена Zm_Pla1 линий КМ и ГПЛ-1, которые использовались при получении линий ЗМС-8 и ЗМС-П, также не содержали 4-нуклеотидной вставки. У линии КМ обнаружен вариант нуклеотидной последовательности гена Zm_Pla1, содержащий семь ОНЗ. Последовательность гена Zm_Pla1 линии ГПЛ-1 полностью совпадает с последовательностью гена Zm_Pla1 референсной линии В73.

Мы секвенировали транскрипт гена Zm_Pla1 партеногенетической линии АТ-1, которая была выделена среди самоопыленного потомства Stock 6 и Коричневый тестер [17] и ее производных ‒ АТ-3, АТ-4. Вопреки нашему ожиданию последовательности Zm_Pla1 этих линий полностью совпадают с последовательностью Zm_Pla1 референсной линии и не имеют вставки четырех нуклеотидов и 15 ОНЗ (данные не показаны). Эти линии характеризуются наличием элементов наследуемого партеногенеза, но не обладают гаплоиндуцирующей способностью. Таким образом, ген Zm_Pla1, мутировавший у линии Stock 6, не был унаследован линией АТ-1 и ее производными, а наследуемый партеногенез линий АТ связан с другими генетическими детерминантами.

Вставка четырех нуклеотидов в гене Zm_Pla1 нарушает функцию кодируемого им фермента фосфолипазы А, который осуществляет гидролиз фосфолипидов до жирных кислот. Связь этого процесса с гаплоиндукцией не вполне ясна, но предположительно дефектная фосфолипаза влияет на состав фосфолипидов мембраны и, как следствие, способность мембран спермия и яйцеклетки к слиянию [26]. В результате спермий не может слиться с яйцеклеткой и произвести диплоидный зародыш. Вставка четырех нуклеотидов в ген Zm_Pla1 приводит к фенотипу, как у линии Stock 6, и служит причиной образования до 2% гаплоидов в потомстве у линии-негаплоиндуктора [27]. Какие дополнительные мутации и в каких генах дают увеличение ГИ-способности линий ЗМС-П и ЗМС-8 до 8‒10%, еще предстоит выяснить.

Zm_CenH3

Нуклеотидная последовательность гена Zm_CenH3 у линий КМ и ЗМС-8 полностью совпадает с последовательностью гена референсной линии В73, а у линии ЗМС-П несет одну ОНЗ.

Zm_Dmp7

Линии ЗМС-8 и ЗМС-П обладают высокой гаплоиндуцирующей способностью ‒ 8‒10 % [3‒6]. Количество ОНЗ на 1000 нуклеотидов у гена Zm_Dmp7 исследованных линий составляет от 6,4 до 10,4. Анализ белок-кодирующей последовательности гена Zm_Dmp7 показал наличие пяти ОНЗ у линии ЗМС-8, а также трех ОНЗ и одной делеции из трех нуклеотидов у линии ЗМС-П по сравнению с контрольной линией B73 (рис. 2). Линия КМ несет три ОНЗ и делецию из девяти нуклеотидов в белок-кодирующей части гена Zm_Dmp7, последовательность гена Zm_Dmp7 линии ГПЛ-1 совпадает с референсной последовательностью гена Zm_Dmp7 линии В73 (данные не показаны). У линий ЗМС-8 и ЗМС-П одинаковые ОНЗ С>G в положении 431, линии КМ, ЗМС-8 и ЗМС-П несут идентичные ОНЗ в положении 457 (см. рис. 2).

 

Рис. 2. Множественное выравнивание нуклеотидных последовательностей гена Zm_Dmp7 у линий кукурузы саратовской селекции КМ, ЗМС-8, ЗМС-П и референсной линии B73, выполненное с использованием программы BLAST. Точками показано нуклеотидное сходство последовательностей гена Zm_Dmp7 исследуемых линий с последовательностью гена Zm_Dmp7 референсной линии В73; ОНЗ у линий КМ, ЗМС-8 и ЗМС-П обозначены буквами; дефис означает отсутствие нуклеотида. ОНЗ линии ЗМС-8, совпадающая с ОНЗ линии CAU5, подчеркнута.

 

Интересно отметить, что ген Zm_Dmp7 у линии ЗМС-8 несет ту же ОНЗ (в положении 131 от стартового кодона, рис. 2), что и гаплоиндуцирующая линия кукурузы CAU5 [9], которая, как считают авторы, увеличивает гаплоиндукцию у линии кукурузы CAU5 в 2‒3 раза в присутствии мутантного гена Zm_Pla1 [9]. Однако линия ЗМС-П (ГИ ‒ 10%), полученная при скрещивании ЗМС-8 (ГИ ‒ 8%) с негаплоиндуцирующими линиями, не несет ОНЗ в положении 131. Таким образом, ОНЗ в положении 131 от стартового кодона в гене Zm_Dmp7 не является причиной повышенной гаплоиндуцирующей способности линии ЗМС-П.

 

Рис. 3. Филограмма линий кукурузы по гену Zm_Pla1, построенная в программе MEGA 11 [по 16] (обозначения линий даны согласно авторскому оригиналу). Вариант представления с данными эволюционного расстояния для каждой из ветвей; рамками выделены изучаемые линии саратовской селекции.

 

Для выявления филогенетического родства изучаемых линий кукурузы были построены филограммы с использованием последовательностей транскриптов генов Zm_Pla1 (рис. 3), Zm_Dmp7 (рис. 4).

 

Рис. 4. Филограмма линий кукурузы по гену Zm_DMP7, построенная в программе MEGA 11 [по 16] (обозначения линий даны согласно авторскому оригиналу). Вариант представления с данными эволюционного расстояния для каждой из ветвей; рамками выделены изучаемые линии саратовской селекции.

 

Эволюционный анализ генов был проведен в программе MEGA 11 [28]. Эволюционные расстояния были вычислены с использованием метода максимального составного правдоподобия [29].

Из филограммы, построенной по гену Zm_Pla1, видно, что линии саратовской селекции распределились по родственным группам линий из баз данных. Линии по данному гену разделились на два больших кластера или на 12 отдельных групп, у всех линий в дендрограмме р-расстояния ветвей не превышают 0,007 (см. рис. 3). Линии АТ-1, АТ-3 и АТ-4 входят в одну группу с референсной линией В73. Несмотря на то что линия Stock 6 аннотирована как одна из предковых для линии АТ-1 [17], ген Zm_Pla1 не был унаследован этой линией.

Филогенетический анализ гена Zm_Pla1 демонстрирует родство гаплоиндуцирующих линий Stock 6, ЗМС-П и ЗМС-8 и приобретение линиями ЗМС-П и ЗМС-8 способности к гаплоиндукции за счет мутации в гене Zm_Pla1 у Stock 6 укладывается в эту концепцию. Однако линии-гаплоиндукторы ЗМС-П и ЗМС-8 объединены в группу не только с линией Stock 6, но и с негаплоиндуцирующими линиями EP1, CML277, CML69, TX303, CML103, NC358, M162W, KY21, CML247 (см. рис. 3).

На основании выявленного нами полиморфизма гена Zm_Dmp7 построена филограмма с использованием последовательностей гена Zm_Dmp7 линий-негаплоиндукторов, найденных в базах данных и исследуемых нами, линий ГПЛ-1 и КМ, а также линий-гаплоиндукторов ‒ ЗМС-П и ЗМС-8 (см. рис. 4). По характеру нуклеотидных последовательностей линии кукурузы распределились в два кластера с низким значением p-расстояния (эволюционное расстояние) между линиями внутри кластера. Как видно из дендрограммы, один из кластеров включает линии-гаплоиндукторы ЗМС-П, ЗМС-8 и контрольную линию ГПЛ-1 саратовской селекции.

Линия Stock 6, несущая мутацию в гене Zm_Pla1, являлась предковой для линий с наследуемым (АТ-1, АТ-3, АТ-4) и индуцированным (ЗМС-П, ЗМС-8) партеногенезом. Нами показано, что высокая гаплоиндуцирующая способность саратовских линий ЗМС-П и ЗМС-8 частично обусловлена наличием дефектного гена Zm_Pla1, унаследованного от Stock 6. Партеногенетические линии АТ несут ген Zm_Pla1, полностью идентичный гену Zm_Pla1 референсной непартеногенетической линии В73, что указывает на то, что элементы апомиксиса, демонстрируемые этими линиями, обусловлены иными генетическими детерминантами.

В процессе многолетней селекционной работы нескольких групп по всему миру частоту гаплоиндукции у современных линий-гаплоиндукторов кукурузы удалось повысить с 2 до 8–15 % по сравнению с предковой линией Stock 6 [6, 16]. Ген Zm_Pla1 определен как первый детерминирующий гаплоиндукцию с частотой 2% [27], и ведутся поиски генов повышенной гаплоиндуцирующей способности. Например, в работе [30] идентифицировали девять ОНЗ, которые были достоверно связаны с гаплоиндукцией. В работе [9] одна из ОНЗ (в положении 131) в гене Zm_Dmp7 была определена как причина повышенной частоты гаплоиндукции в присутствии мутантного гена Zm_Pla1. В наших исследованиях связь этой мутации гена Zm_Dmp7 с повышенной способностью линий саратовской селекции к гаплоиндукции не установлена.

 

Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда (проект № 23-26-00101). Авторы признательны Ю.В. Смолькиной, О.В. Гуторовой, А.Ю. Колесовой за предоставленные образцы кукурузы.

Настоящая статья не содержит каких-либо исследований с использованием в качестве объекта людей и животных.

Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.

×

Об авторах

Е. М. Моисеева

Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов, Федеральный исследовательский центр «Саратовский научный центр Российской академии наук»

Email: chumakov_m@ibppm.ru
Россия, Саратов, 410049

В. В. Фадеев

Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов, Федеральный исследовательский центр «Саратовский научный центр Российской академии наук»

Email: chumakov_m@ibppm.ru
Россия, Саратов, 410049

Ю. В. Фадеева

Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов, Федеральный исследовательский центр «Саратовский научный центр Российской академии наук»

Email: chumakov_m@ibppm.ru
Россия, Саратов, 410049

С. И. Мазилов

Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов, Федеральный исследовательский центр «Саратовский научный центр Российской академии наук»

Email: chumakov_m@ibppm.ru
Россия, Саратов, 410049

М. И. Чумаков

Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов, Федеральный исследовательский центр «Саратовский научный центр Российской академии наук»

Автор, ответственный за переписку.
Email: chumakov_m@ibppm.ru
Россия, Саратов, 410049

Список литературы

  1. Coe E.H. A line of maize with high haploid frequency // Am. Naturalist. 1959. V. 59. P. 381–382. doi: 10.1086/282098
  2. Gilles L.M., Khaled A., Laffaire J.B. et al. Loss of pollen-specific phospholipase NOT LIKE DAD triggers gynogenesis in maize // EMBO J. 2017. doi: 10.15252/embj.201796603
  3. Тырнов В.С., Завалишина А.Н. Индукция высокой частоты возникновения матроклинных гаплоидов кукурузы // Докл. АН СССР. 1984. Т. 276. С. 735–738.
  4. Zavalishina A.N., Tyrnov V.S. Induction of matroclinical haploidy in maize in vivo // Reproductive biology and plant breeding: XIII EUCARPIA Сongr. L. 1992. P. 221–222.
  5. Еналеева Н.Х., Тырнов В.С., Селиванова Л.П., Завалишина А.Н. Одинарное оплодотворение и проблема гаплоиндукции у кукурузы // ДАН. 1997. Т. 353. C. 405–407.
  6. Гуторова О.В., Апанасова Н.В., Юдакова О.И. Создание генетически маркированных линий кукурузы с наследуемым и индуцированным типами партеногенеза // Изв. Самар. науч. центра Росс. академии наук. 2016. T. 18. № 2. C. 341–344.
  7. Takahashi T., Mori T., Ueda K. et al. The male gamete membrane protein DMP9/DAU2 is required for double fertilization in flowering plants // Development. 2018. V. 45. Iss. 23. doi: 10.1242/dev.170076
  8. Cyprys P., Lindemeier M., Sprunck S. Gamete fusion is facilitated by two sperm cell-expressed DUF679 membrane proteins // Nat. Plants. 2019. V. 5. P. 253–257. doi: 10.1038/s41477-019-0382-3
  9. Zhong Y., Liu C., Qi X. et al. Mutation of ZmDMP enhances haploid induction in maize // Nat. Plants. 2019. V. 5. P. 575–580. doi: 10.1038/s41477-019-0443-7
  10. Chalyk S., Baumann A., Daniel G. et al. Aneuploidy as a possible cause of haploid-induction in maize // Maize Genet. Coop. Newsletter. 2003. V. 77. P. 29–30.
  11. Zhang Z.L., Qiu F.Z., Liu Y.Z. et al. Chromosome elimination and in vivo haploid production induced by Stock 6-derived inducer line in maize (Zea mays L.) // Plant Cell Rep. 2008. V. 27. P. 1851–1860. doi: 10.1007/s00299-008-0601-2
  12. Qiu F., Liang Y., Li Y. et al. Morphological, cellular and molecular evidences of chromosome random elimination in vivo upon haploid induction in maize // Curr. Plant Biol. 2014. V. 1. P. 83–90. doi: 10.1016/j.cpb.2014.04.001
  13. Kelliher T., Starr D., Wang W. et al. Maternal haploids are preferentially induced by CENH3-tailswap transgenic complementation in maize // Front. Plant Sci. 2016. V. 7. P. 1–11. doi: 10.3389/fpls.2016.00414
  14. Ravi M., Chan S.W.L. Haploid plants produced by centromere-mediated genome elimination // Nature. 2010. V. 464. P. 615–619. doi: 10.1038/nature08842
  15. Wang S., Jin W., Wang K. Centromere histone H3- and phospholipase-mediated haploid induction in plants // Plant Methods. 2019. V. 15. Article 42. doi: 10.1186/s13007-019-0429-5
  16. Hu H., Schrag T.A., Peis R. et al. The genetic basis of haploid induction in maize identified with a novel genome-wide association method // Genetics. 2016. V. 202. P. 1267–1276. doi: 10.1534/genetics.115.184234
  17. Тырнов B.C., Еналеева Н.Х. Автономное развитие зародыша и эндосперма у кукурузы // Докл. АН СССР. 1983. Т. 272. № 3. С. 722–725.
  18. Апанасова Н.В., Павлов Н.А. Новые партеногенетические линии кукурузы // Сб. ст. Межд. науч.-практ. конф., посвящ. 135-й годовщине со дня рождения акад. Н.И. Вавилова. ВАВИЛОВСКИЕ ЧТЕНИЯ. Саратов, 2022. С. 49–52. https://www.vavilovsar.ru/files/ckeditor/uploads/22-12-26/1672047844/ VCh2022%20SBORNIK.pdf
  19. Kolesova A.Y., Tyrnov V.S. Embryological peculiarities of tetraploid parthenogenetic maize forms // Maize Genet. Coop. Newsletter. 2012. V. 85. P. 65–66.
  20. Volokhina I., Gusev Y., Moiseeva Ye. et al. Gene expression in parthenogenic maize proembryos // Plants. 2021. V. 10 (5). doi: 10.3390/plants10050964
  21. Апанасова Н.В., Титовец В.В. Цитоэмбриологическое изучение проявления апомиксиса у кукурузы линии АТ-3 после опыления // Бюлл. Бот. сада Саратовского гос. ун-та. 2003. № 2. С. 194–197.
  22. Tyrnov V.S. Producing of parthenogenetic forms of maize // Maize Genet. Coop. Newsletter. 1997. V. 71. P. 73–74.
  23. Tyrnov V.S., Smolkina Y.V., Titovets V.V. Estimation of parthenogenesis frequency on the grounds of genetical and embryological data // Maize Genet. Coop. Newsletter. 2001. V. 75. P. 56–57.
  24. Моисеева E.М., Гусев Ю.С., Гуторова О.В., Чумаков М.И. Сравнительный анализ экспрессии генов HAP2/GCS1, GEX2 у линий кукурузы саратовской селекции // Генетика. 2023. Т. 59. № 3. С. 327–335. doi: 10.31857/S0016675823030098.
  25. Моисеева Е.М., Фадеев В.В., Красова Ю.В., Чумаков М.И. Анализ мутаций генов автономного эмбрио- и эндоспермогенеза кукурузы // Генетика. 2023. Т. 59. № 9. С. 1090–1093. doi: 10.31857/S0016675823090084.
  26. Чумаков М.И. Матроклинная гаплоидия и взаимодействие гамет у кукурузы (обзор) // Генетика. 2018. Т. 54. № 10. С. 1120–1124. doi: 10.1134/S1022795418100058
  27. Liu C., Li X., Meng D. et al. A 4-bp insertion at ZmPLA1 encoding a putative phospholipase a generates haploid induction in maize // Mol. Plant. 2017. V. 10. P. 520–522. doi: 10.1016/j.molp.2017.01.011
  28. Tamura K., Nei M., Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2004. V. 101 (30). P. 11030–11035.
  29. Tamura K., Stecher G., Kumar S. MEGA 11: Molecular evolutionary genetics analysis version 11 // Mol. Biol. Evol. 2021. V. 38. P. 3022–3027. doi: 10.1093/molbev/msab120
  30. Trentin H.U., Frei U.K., Lübberstedt T. Breeding maize maternal haploid inducers // Plants. 2020. V. 9 (5). P. 614. doi.: 10.3390/plants90506

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Множественное выравнивание нуклеотидных последовательностей гена Zm_Pla1 у линий кукурузы саратовской селекции КМ, ЗМС-8, ЗМС-П, ГПЛ-1, а также линий Stock 6 и B73, выполненное с использованием программы BLAST. Точками показано нуклеотидное сходство у линий кукурузы, буквами обозначены однонуклеотидные замены, дефисом – отсутствие нуклеотида.

Скачать (1MB)
Метаданные
3. Рис. 2. Множественное выравнивание нуклеотидных последовательностей гена Zm_Dmp7 у линий кукурузы саратовской селекции КМ, ЗМС-8, ЗМС-П и референсной линии B73, выполненное с использованием программы BLAST. Точками показано нуклеотидное сходство последовательностей гена Zm_Dmp7 исследуемых линий с последовательностью гена Zm_Dmp7 референсной линии В73; ОНЗ у линий КМ, ЗМС-8 и ЗМС-П обозначены буквами; дефис означает отсутствие нуклеотида. ОНЗ линии ЗМС-8, совпадающая с ОНЗ линии CAU5, подчеркнута.

Скачать (404KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Филограмма линий кукурузы по гену Zm_Pla1, построенная в программе MEGA 11 [по 16] (обозначения линий даны согласно авторскому оригиналу). Вариант представления с данными эволюционного расстояния для каждой из ветвей; рамками выделены изучаемые линии саратовской селекции.

Скачать (164KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Филограмма линий кукурузы по гену Zm_DMP7, построенная в программе MEGA 11 [по 16] (обозначения линий даны согласно авторскому оригиналу). Вариант представления с данными эволюционного расстояния для каждой из ветвей; рамками выделены изучаемые линии саратовской селекции.

Скачать (166KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».