Structure of subopopulations of Aireshire, Holstin and Jersey cattle in the Southern Regions of Russia by CSN2 (rs43703011), CSN3 (rs43703016) and microsatellite locuses (BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53)

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

During studies using molecular biological methods, the following loci were genotyped: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53, CSN2 (rs43703011) and CSN3 (rs43703 016) 3000 cow blood samples Ayrshire, Holstein and Jersey breeds from the herds of the Krasnodar and Stavropol territories. On average, the frequency of occurrence of homozygous genotypes for 12 microsatellite loci in Jersey cattle was 0.38, in Holstein and Ayrshire cattle – 0.30 and 0.27, respectively; the highest allelic diversity was found in Holstein cattle (9.0 ± 1.7 alleles per locus). It should be noted that there are significant differences in the genetic profile of Ayrshire cattle. For Ayrshire animals, the following alleles turned out to be typical (but rare in Jersey and Holstein cattle): 270 locus BM1818, 137 locus BM2113, 213 locus ETH10, 119 locus ETH3, 142 locus ETH225, 87 locus TGLA227, 166 locus TGLA53. In the studied subpopulation of Jersey cattle, the frequency of occurrence of the A2A2 genotype of the CSN2 locus (rs43703011) (beta casein) was 0.68, and in the Ayrshire and Holstein groups it was only 0.25 and 0.31, respectively. The BB genotype of the CSN3 locus (rs43703016) (casein kappa) was found in the Jersey group of animals with a frequency of 0.76, and in Ayrshires and Holsteins – 0.04 and 0.15, respectively. The genotyped groups of Jersey, Ayrshire and Holstein animals are significant in volume; we assume that the identified patterns are typical for cattle of these breeds in the south of Russia. We believe that the data obtained can be used in the future in practical work on classifying certain groups of livestock as typical Holstein, Ayrshire or Jersey and when creating herds that produce milk of a certain type (for example, type A2 milk).

Full Text

Restricted Access

About the authors

N. V. Kovalyuk

Krasnodar Scientific Center for Animal Science and Veterinary Medicine

Author for correspondence.
Email: NVK1972@yandex.ru
Russian Federation, Krasnodar, 350055

A. E. Volchenko

Krasnodar Scientific Center for Animal Science and Veterinary Medicine

Email: NVK1972@yandex.ru
Russian Federation, Krasnodar, 350055

E. V. Shiryaeva

Krasnodar Scientific Center for Animal Science and Veterinary Medicine

Email: NVK1972@yandex.ru
Russian Federation, Krasnodar, 350055

L. I. Yakusheva

Krasnodar Scientific Center for Animal Science and Veterinary Medicine

Email: NVK1972@yandex.ru
Russian Federation, Krasnodar, 350055

Yu. Yu. Shakhnazarova

Krasnodar Scientific Center for Animal Science and Veterinary Medicine

Email: NVK1972@yandex.ru
Russian Federation, Krasnodar, 350055

References

  1. Волкова В.В., Денискова Т.Е., Костюнина О.В. и др. Характеристика аллелофонда локальных пород крупного рогатого скота России по микросателлитным маркерам // Генетика и разведение животных. 2018. № 1. С. 3–10. https://doi.org/10.31043/2410-2733-2018-1-3-10
  2. Киселева Т.Ю., Kantanen J., Воробьев Н.И. и др. Неравновесие по сцеплению микросателлитных локусов у шести локальных популяций крупного рогатого скота // Генетика. 2014. Т. 50. № 4. С. 464–473. https://doi.org/10.1134/S1022795414040048
  3. Кольцов Д.Н., Волкова В.В., Гладырь Е.А. и др. Характеристика аллелофонда сычевской породы крупного рогатого скота по ДНК микросателлитам // Достижения науки и техники АПК. 2012. № 8. С. 56–57
  4. Стрекозов Н.И., Зиновьева Н.А., Горелов П.В. и др. Генетическая характеристика созданных типов скота бурой швицкой и сычевской пород с использованием полиморфизма микросателлитных локусов // С.-х. биология. 2009. Т. 44. № 2. С. 10–15.
  5. Li Y., Liu L., Zunongjiang А. et al. Analysis of the relationship between short tandem repeats and lactation performance of Xinjiang Holstein cows // Trop. Anim. Health Prod. 2023. V. 55(4). P. 238. https://doi.org/10.1007/s11250-023-03651-y
  6. Prinzenberg E.M., Jianlin H., Erhardt G. Genetic variation in kappa-casein gene (CSN3) of Chinese yak (Bos grunniens) and phylogenetic analysis of CSN3 seguences in the genus Bos // J. Dairy Sci. 2008. V. 91(3). P. 1198–1203. https://doi.org/10.3168/jds.2007-0746
  7. Heck J.M., Schennink A., Van Valenberg H.J. et al. Effects of milk protein variants on the protein composition of bovine milk // J. Dairy Sci. 2009. № 92. Р. 1192–1202. https://doi.org/10.3168/jds.2008-1208
  8. Kruchinin A.G., Illarionova E.E., Galstyan A.G. et al. Effect of CSN3 gene polymorphism on the formation of milk gels induced by physical, chemical, and biotechnological factors // Foods. 2023. V. 12(9). https://doi.org/10.3390/foods12091767
  9. Demirel A.F. Discussions of effect A1 and A2 milk beta-casein gene on health // Appr. in Poultry, Dairy & Veterinary Sci. 2018. V. 3. https://doi.org/10.31031/APDV.2018.03.000556
  10. Jaiswal K.P., De S., Sarsavan A. Review on bovine beta-casein (A1,A2) gene polymorphism and their potentially hazardous on human health // Int. J. Environment & Animal Conservation. 2014. V. 3(1). Р. 1–12. https://doi.org/10.31031/APDV.2018.03.000556
  11. Ковалюк Н.В., Сацук В.Ф., Ковалюк М.А., Мачульская Е.В. Селекция крупного рогатого скота по гену бета-казеина в Краснодарском крае // Генетика и разведение животных. 2019. № 1. С. 22–27. https://doi.org/10.31043/2410-2733-2019-1-22-26
  12. Barroso A., Dunner S., Canon J. Technical note: Detection of bovine kappa-casein variants A, B, C, and E by means of polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) // J. Anim. Sci. 1998. № 76. Р. 1535–1538. https://doi.org/10.2527/1998.7661535x
  13. Ковалюк Н.В., Сацук В.Ф., Волченко А.Е. Изменчивость гена BoLADRB3 у крупного рогатого скота молочного направления продуктивности и его влияние на параметры жизнеспособности // Генетика. 2012. Т. 48. № 8. С. 962–965. https://doi.org/10.1134/S1022795412070083
  14. Ковалюк Н.В., Сацук В.Ф., Мачульская Е.В., Шахназарова Ю.Ю. Возможные причины и последствия распространения отдельных аллельных вариантов локуса LEP в группах айрширского и голштинского скота // Генетика. 2018. № 12. С.1–6. https://doi.org/10.1134/S0016675818120068
  15. Шаталина О.С., Ткаченко И.В., Ярышкин А.А. Генетическая структура популяции голштинизированного черно-пестрого скота по микросателлитным локусам // Генетика. 2021, T. 57. № 2. C. 205–213. https://doi.org/10.31857/S0016675821020090

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Рис. 1. Аллельные варианты микросателлитных локусов (ось Х) и их количество (ось Y) в выборках крупного рогатого скота

Download (128KB)
3. Fig. 1. (End) Allelic variants of microsatellite loci (X-axis) and their number (Y-axis) in cattle samples

Download (127KB)

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».