Mitochondrial Genetic Diversity of Eurasian Otter ( Lutra lutra ) from European Part of Russia and Transcaucasian Countries

N. A. Sokolova; Соколова Н. А.; N. P. Korablev; Кораблев Н. П.; P. N. Korablev; Кораблев П. Н.; J. A. Hernandez-Blanco; Эрнандес-Бланко Х. А.; G. A. Kaloyan; Калоян Г. А.; A. A. Gyonjyan; Гёнджян А. А.; A. H. Malkhasyan; Малхасян А. Г.; P. A. Sorokin; Сорокин П. А.

doi:10.31857/S0016675823070111

Генетическое разнообразие речной выдры (Lutra lutra) европейской части России и стран Закавказья (по данным полиморфизма фрагмента мтДНК)

Авторы: Соколова Н.А.¹, Кораблев Н.П.², Кораблев П.Н.³, Эрнандес-Бланко Х.А.¹, Калоян Г.А.⁴, Гёнджян А.А.⁴, Малхасян А.Г.⁵, Сорокин П.А.¹
Учреждения:
1. Институт проблем экологии и эволюции им А.Н. Северцова Российской академии наук
2. Государственный природный заповедник “Полистовский”
3. Центрально-Лесной государственный природный биосферный заповедник
4. Научный центр зоологии и гидроэкологии Национальной академии наук Республики Армения
5. Армянский филиал Всемирного фонда дикой природы
Выпуск: Том 59, № 7 (2023)
Страницы: 804-812
Раздел: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/134619
DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675823070111
EDN: https://elibrary.ru/QQMBRV
ID: 134619

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Проведен анализ генетической структуры группировок выдры европейской части России (ЕЧР) и ее сравнение с известной по литературным данным генетической структурой выдры в Европе. Проанализированы данные на основе гаплотипов фрагмента контрольного региона мтДНК (255 пн), в том числе представленных в NCBI. Для выборки (N = 75) из европейской части России описано шесть гаплотипов мтДНК. 62.1% животных принадлежат общему европейскому гаплотипу, 17.6% – гаплотипу, отмеченному в Великобритании и Финляндии, остальные четыре гаплотипа описаны впервые. Гаплотипическое разнообразие для выборки по России и Закавказью составило h = 0.56 ± 0.054, нуклеотидное разнообразие π = 0.0016 ± 0.002. При увеличении длины фрагмента мтДНК до 820 пн у выдр из ЕЧР наблюдается увеличение как гаплотипического разнообразия h до 0.85 ± 0.03, так и нуклеотидного π = 0.002 ± 0.001, число гаплотипов увеличилось до 14. Географическое распределение гаплотипов не зависит ни от региона, ни от системы рек. Имеется как центральный гаплотип, распространенный по всей ЕЧР, так и второстепенные, объединяющие меньшее число регионов. Таким образом, генетическое разнообразие выдры ЕЧР выше, чем в Европе, при этом структура популяций повторяет общеевропейский паттерн, но с региональными особенностями.

Ключевые слова

Lutra lutra, митохондриальная ДНК, контрольный регион, генетическое разнообразие, европейская часть России.

Список литературы

Гимранов Д.О., Косинцев П.А. Географическое распределение морфотипов зубов речной выдры (Carnivora, Mustelidae, Lutra lutra L., 1758) в Северной Евразии // ДАН. 2012. Т. 443. № 1. С. 130–139. https://doi.org/10.1134/S0012496612020019
http://www.ohotcontrol.ru/resource/number/
Красная книга Российской Федерации. Животные. 2-е изд. М.: ВНИИ Экологии, 2021. 1128 с.
Туманов И.Л. Редкие хищные млекопитающие России (мелкие и средние виды). СПб.: Бранко, 448 с.
Mucci N., Pertoldi C., Madsen A.B. et al. Extremely low mitochondrial DNA control region sequence variation in the otter Lutra lutra population of Denmark // Heredity. 1999. V. 130. № 3. P. 331–336.
Ferrando A., Ponsà M., Marmi J., Domingo-Roura X. Eurasian otters, Lutra lutra, have a dominant mtDNA haplotype from the Iberian Peninsula to Scandinavia // J. Heredity. 2004. V. 95. № 5. P. 430–435. https://doi.org/10.1093/jhered/esh066
Kalz B., Jewgenow K., Fickel J. Structure of an otter (Lutra lutra) population in Germany-results of DNA and hormone analyses from faecal samples // Mamm. Biol. 2006. V. 71. № 6. P. 321–335. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2006.02.010
Finnegan L.A., Néill L.Ó. Mitochondrial DNA diversity of the Irish otter, Lutra lutra, population // Conserv. Gen. 2010. V. 11. № 4. P. 1573–1577. https://doi.org/10.1007/s10592-009-9955-4
Lanszki J., Hidas A., Szentes K. et al. Genetic structure of otter (Lutra lutra) populations from two fishpond systems in Hungary // Mamm. Biol. 2010. V. 75. № 5. P. 447–450. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2009.09.006
Stanton D.W.G., Hobbs G.I., Chadwick E.A. et al. Mitochondrial genetic diversity and structure of the European otter (Lutra lutra) in Britain // Conserv. Gen. 2009. V. 10. № 3. P. 733–737. https://doi.org/10.1007/s10592-008-9633-y
Mucci N., Arrendal J., Ansorge H. et al. Genetic diversity and landscape genetic structure of otter (Lutra lutra) populations in Europe // Conserv. Gen. 2010. V. 11. № 2. P. 583–599. https://doi.org/10.1007/s10592-010-0054-3
Geboes A.L., Rosoux R., Lemarchand C. et al. Genetic diversity and population structure of the Eurasian otter (Lutra lutra) in France // Mamm. Res. 2016. V. 61. № 2. P. 121–129. https://doi.org/10.1007/s13364-015-0258-5
Honnen A.C., Roos A., Stjernberg T., Zachos F.E. Genetic analysis of Eurasian otters (Lutra lutra) reveals high admixture in Finland and pronounced differentiation in Sweden // Mamm. Biol. 2015. V. 80. № 1. P. 47–53. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2014.09.005
Jo Y.S., Won C.M., Jung J. Testing microsatellite loci and preliminary genetic study for Eurasian otter in South Korea // J. Spec. Research. 2012. V. 1. № 2. P. 240–248. https://doi.org/10.12651/JSR.2012.1.2.240
Cassens I., Tiedeman R., Suchentrunk F., Hartle G.B. Brief communication. mitochondrial DNA variation in the European otter (Lutra lutra) and the use of spatial autocorrelation analysis in conservation // J. Hered. 2000. V. 91. № 1. P. 31–35. https://doi.org/10.1093/jhered/91.1.31
Рожнов В.В., Ячменникова А.А., Найденко С.В. и др. Мониторинг переднеазиатского леопарда и других крупных кошек. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2018. 121 с.
Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. № 1. P. 37–48. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036
Leigh J.W., Bryant D. PopART: Full-feature software for haplotype network construction // Methods Ecol. Evol. 2015. V. 6. № 9. P. 1110–1116 https://doi.org/10.1111/2041-210X.12410
Excoffier L., Lischer H.E.L. Arlequin suite ver. 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Res. 2010. V. 10. P. 564–567.
Pérez-Haro M., Vinas J., Manas F. et al. Genetic variability in the complete mitochondrial control region of the Eurasian otter (Lutra lutra) in the Iberian Peninsula // Biol. J. Linnean Soc. 2005. V. 86. № 4. P. 397–403.
Sommer R., Benecke N. Late and post glacial history of the Mustelidae in Europe // Mamm. Rev. 2004. V. 34. № 4. P. 249–284.
Данилов П.И., Туманов И.Л. Куньи Северо-Запада СССР. Л.: Наука, 1976. 256 с.
Гептнер В.Г., Наумов Н.П., Юргенсон П.Б. Млекопитающие СССР. Т. 2. Морские коровы и хищные. М.: Высш. шк., 1967. С. 553–584.
Барышников Г.Ф., Пузаченко А.Ю. Краниометрическая изменчивость речной выдры (Lutra lutra: Carnivora: Mustelidae) в Cеверной Евразии // Тр. ЗИН РАН. 2012. Т. 316. № 3. С. 203–222. https://doi.org/10.31610/trudyzin/2012.316.3.203