Genetic Differentiation and Relationships  Cottus kolymensis  Sideleva et Goto, 2012 (Cottidae)

O. A. Radchenko; Радченко О. А.; I. N. Moreva; Морева И. Н.; A. V. Petrovskaya; Петровская А. В.

doi:10.31857/S0016675823030104

Генетическая дифференциация и родственные связи Cottus kolymensis Sideleva et Goto, 2012 (Cottidae)

Авторы: Радченко О.А.¹, Морева И.Н.¹^,2, Петровская А.В.¹
Учреждения:
1. Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук
2. Национальный научный центр морской биологии им. А.В. Жирмунского Дальневосточного отделения Российской академии наук
Выпуск: Том 59, № 4 (2023)
Страницы: 425-436
Раздел: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/134577
DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675823030104
EDN: https://elibrary.ru/IQJEIM
ID: 134577

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Впервые проведено кариологическое и молекулярно-генетическое (гены COI, цитохрома b, 16S рРНК) изучение пресноводного вида рыб Cottus kolymensis, описанного недавно из рек Дукча и Колыма на северо-востоке Азии. Определен комплекс кариологических и молекулярно-генетических маркерных признаков, позволяющих идентифицировать вид. Обнаружены генетические различия популяций C. kolymensis, населяющих водоемы бассейнов р. Колымы и северной части Охотского моря, на основании которых вид разделяется на группы в соответствии с местом обитания. Подтверждено существование в пределах рода Cottus отдельной группы “Cottus poecilopus”, в которую входят таксоны видового ранга, в том числе и C. kolymensis.

Ключевые слова

рогатковые рыбы, кариотип, маркерные хромосомы, митохондриальная ДНК (мтДНК), гены COI, цитохрома b, 16S рРНК, молекулярная филогения, перицентрические инверсии.

Список литературы

Сиделева В.Г., Гото А. Новый вид подкаменщика Cottus kolymensis sp. nova (Scorpaeniformes: Cottidae) из рек Колымского края // Вопр. ихтиологии. 2012. Т. 52. № 3. С. 288–294. https://doi.org/10.1134/S0032945212020130
Черешнев И.А. Подкаменщик рода Cottus (Cottidae) из бассейна реки Чаун (арктическая Чукотка) // Вопр. ихтиологии. 1982. Т. 22. № 1. С. 15–26.
Сиделева В.Г., Гото А. Видовой статус и переописание трех видов группы Cottus poecilopus (Cottidae) Евразии // Вопр. ихтиологии. 2009. Т. 49. № 5. С. 617–631.
Парин Н.В., Евсеенко С.А., Васильева Е.Д. Рыбы морей России: аннотированный каталог. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2014. 733 с.
Токранов А.М., Липнягов С.В., Ким О.О. Подкаменщик рода Cottus Linnaeus (Cottidae) из бассейна р. Ука (Северо-Восток Камчатки) // Чтения памяти Владимира Яковлевича Леванидова. Вып. 8. Владивосток: Дальнаука, 2019. С. 166–174. https://doi.org/10.25221/levanidov.08.17
Богданов Б.Э., Свердлова Т.В., Книжин И.Б. Изменчивость и таксономический статус сибирских популяций пестроногого подкаменщика Cottus poecilopus complex (Scorpaeniformes: Cottidae) // Журн. Сиб. федерального ун-та. Биология. 2013. Т. 6. № 1. С. 18–31.
Кириллов А.Ф., Апсолихова О.Д., Жирков Ф.Н. и др. Аннотированный список рыбообразных и рыб бассейна Восточно-Сибирского моря // Исследования водных биологических ресурсов Камчатки и Северо-Западной части Тихого океана. 2016. Вып. 42. С. 78–87. https://doi.org/10.15853/2072-8212.2016.42.78-87
Yokoyama R., Sideleva V.G., Shedko S.V., Goto A. Broad-scale phylogeography of the Palearctic freshwater fish Cottus poecilopus complex (Pisces: Cottidae) // J. Mol. Phylogen. Evol. 2008. V. 48. P. 1244–1251. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2008.02.002
Radchenko O.A., Moreva I.N., Petrovskaya A.V. The subfamily Myoxocephalinae of cottid fishes (Cottidae): Genetic divergence and phylogenetic relationships // J. Fish Biol. 2021. V. 99. P. 1857–1868. https://doi.org/10.1111/jfb.14886
Черешнев И.А., Шестаков А.В., Скопец М.Б. Определитель пресноводных рыб Северо-Востока России. В.: Дальнаука, 2001. 129 с.
Maniatis T., Fritsch E.F., Sambrook J. Molecular Cloning, A Laboratory Manual. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab., 1982. 480 p.
Moreva I.N., Radchenko O.A., Petrovskaya A.V. Differentiation of the frog sculpin Myoxocephalus stelleri Tilesius, 1811 (Actinopterygii, Cottidae) based on mtDNA and karyotype analyses // Comp. Cytogenet. 2021. V. 15. № 2. P. 179–197. https://doi.org/10.3897/CompCytogen.v15.i2.63207
Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. P. 1547–1549.
Ronquist F., Teslenko M., Van Der Mark P. et al. MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space // Syst. Biol. 2012. V. 61. P. 539–542.
Rambaut A., Drummond A.J., Xie D. et al. Posterior summarisation in Bayesian phylogenetics using tracer 1.7 // Syst. Biol. 2018. V. 67. P. 901–904.
Leache A.D., Reeder T.W. Molecular systematics of the eastern fence lizard (Sceloporus undulatus): A comparison of parsimony, likelihood, and Bayesian approaches // Syst. Biol. 2002. V. 51. P. 44–68.
Kligerman A.D., Bloom S.E. Rapid chromosome preparations from solid tissues of fishes // J. Fish. Res. Board Can. 1977. V. 34. P. 266–269.
Levan A., Fredga K., Sandberg A.A. Nomenclature for centromeric position on chromosomes // Hereditas. 1964. V. 52. P. 201–220.
Starmach J. Die Cromosomen von Cottus poecilopus Heckel und Cottus gobio L. // Acta Hydrobiol. 1967. V. 9. P. 301–307.
Abe S. Notes on the chromosomes of two species of fresh-water cottid fishes // Chromosome Inform. Service. 1972. V. 13. P. 25–27.
Abe S. A cytotaxonomical study in some freshwater cottid fishes (Cottidae, Pisces) // Cytologia. 1976. V. 41. P. 323–329.
Berberović L.J., Sofradžija A., Vagner L.J. The chromosomes of the species Cottus gobio L. (Cottidae, Pisces) // Got. Biol. Inst. Univ. Sarajevu. 1978. V. 27. P. 5–15.
Gold J.R., Karel W.J., Strand M.R. Chromosome Formulae of North American Fishes. Texas A & M Univ. System, 1979. 24 p.
Ida H., Terashima H., Fujimi T. Karyotypes in four species of the family Cottidae // Japan J. Ichthyol. 1989. V. 36. P. 135–140. https://doi.org/10.1007/BF02905683
Vitturi R., Rasotto M.B. Karyotype analysis of Cottus gobio L. (Pisces, Cottidae) // Cytobios. 1990. V. 62. P. 81–86.
Park G.M., Song H.B. Karyotypes of five species in Odontobutidae and Cottidae of Korea // Kor. J. Ichthyol. 2006. V. 18. P. 155–162.
Thompson K., Whitcomb S., Choudhry E. et al. Karyotypes of Cottus cognatus, C. bairdi, and their hybrids in central Pennsylvania // J. Pennsylvania Acad. Sci. 2020. V. 93. № 1. P. 37–46. https://doi.org/10.5325/jpennacadscie.93.1.0037
Yamazaki A., Markevich A., Munehara H. Molecular phylogeny and zoogeography of marine sculpins in the genus Gymnocanthus (Teleostei; Cottidae) based on mitochondrial DNA sequences // Mar. Biol. 2013. V. 160. P. 2581–2589. https://doi.org/10.1007/s00227-013-2250-4
Kontula T., Kirilchik S.V., Väinölä R. Endemic diversification of the monophyletic cottoid fish species flock in Lake Baikal explored with mtDNA sequencing // Mol. Phylogen. Evol. 2003. V. 27. P. 143–155. https://doi.org/10.1016/s1055-7903(02)00376-7
Ao M., Xie P., Zhao G. et al. The complete mitochondrial genome of Cottus sibiricus altaicus (Scorpaeniformes: Cottidae) // Mitochondrial DNA. 2016. V. 27. № 2. P. 1315–1316. https://doi.org/10.3109/19401736.2014.945573
Fricke R., Eschmeyer W.N., van der Laan R. (eds) Eschmeyer’s catalog of fishes: Genera, species, references. 2022. (http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/ fishcatmain.asp). Electronic version accessed April 01, 2022.
Савельев П.А., Колпаков Е.В. Морфологическое описание, внутривидовая изменчивость и родственные связи подкаменщика Черского Cottus czerskii (Cottidae) // Вопр. ихтиологии. 2018. Т. 58. № 2. С. 144–153. https://doi.org/10.7868/S0042875218020030
Arai R. Fish Karyotypes. A Check List. Tokyo; Berlin; Heindelberg; New York: Springer, 2011. 347 p. https://doi.org/10.1007/978-4-431-53877-6
Yang T., Meng W., Xuhui W. et al. The complete mitochondrial genome of endemic freshwater sculpin Cottus dzungaricus (Scorpaeniformes: Cottidae) revealed by high-throughput NGS: Genome structure and its phylogenetic relationships // Turkish J. Fish. Aquat. Sci. 2020. V. 20. № 1. P. 29–37. https://doi.org/10.4194/1303-2712-v20_1_03