Genetic Differentiation and Relationships Cottus kolymensis Sideleva et Goto, 2012 (Cottidae)

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

For the first time, a karyological and molecular genetic (COI, cytochrome b, 16S rRNA genes) study of the freshwater fish species Cottus kolymensis, recently described from the Dukcha and Kolyma rivers in northeast Asia, was carried out. A complex of karyological and molecular-genetic marker traits has been determined to identify the species. Genetic differences between the populations of C. kolymensis inhabiting the water bodies of the river basins of Kolyma and the northern part of the Sea of Okhotsk were found. On their basis the species is divided into groups in accordance with the habitat. The existence of a separate group “Cottus poecilopus” within the genus Cottus, which includes taxa of the species rank, including C. kolymensis, has been confirmed.

作者简介

O. Radchenko

Institute of Biological Problems of the North, Far East Branch, Russian Academy of Sciences

编辑信件的主要联系方式.
Email: mradchenko@mail.ru
Russia, 685000, Magadan

I. Moreva

Institute of Biological Problems of the North, Far East Branch, Russian Academy of Sciences; Zhirmunsky National Scientific Center of Marine Biology, Far East Branch,
Russian Academy of Sciences

Email: mradchenko@mail.ru
Russia, 685000, Magadan; Russia, 690041, Vladivostok

A. Petrovskaya

Institute of Biological Problems of the North, Far East Branch, Russian Academy of Sciences

Email: mradchenko@mail.ru
Russia, 685000, Magadan

参考

  1. Сиделева В.Г., Гото А. Новый вид подкаменщика Cottus kolymensis sp. nova (Scorpaeniformes: Cottidae) из рек Колымского края // Вопр. ихтиологии. 2012. Т. 52. № 3. С. 288–294. https://doi.org/10.1134/S0032945212020130
  2. Черешнев И.А. Подкаменщик рода Cottus (Cottidae) из бассейна реки Чаун (арктическая Чукотка) // Вопр. ихтиологии. 1982. Т. 22. № 1. С. 15–26.
  3. Сиделева В.Г., Гото А. Видовой статус и переописание трех видов группы Cottus poecilopus (Cottidae) Евразии // Вопр. ихтиологии. 2009. Т. 49. № 5. С. 617–631.
  4. Парин Н.В., Евсеенко С.А., Васильева Е.Д. Рыбы морей России: аннотированный каталог. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2014. 733 с.
  5. Токранов А.М., Липнягов С.В., Ким О.О. Подкаменщик рода Cottus Linnaeus (Cottidae) из бассейна р. Ука (Северо-Восток Камчатки) // Чтения памяти Владимира Яковлевича Леванидова. Вып. 8. Владивосток: Дальнаука, 2019. С. 166–174. https://doi.org/10.25221/levanidov.08.17
  6. Богданов Б.Э., Свердлова Т.В., Книжин И.Б. Изменчивость и таксономический статус сибирских популяций пестроногого подкаменщика Cottus poecilopus complex (Scorpaeniformes: Cottidae) // Журн. Сиб. федерального ун-та. Биология. 2013. Т. 6. № 1. С. 18–31.
  7. Кириллов А.Ф., Апсолихова О.Д., Жирков Ф.Н. и др. Аннотированный список рыбообразных и рыб бассейна Восточно-Сибирского моря // Исследования водных биологических ресурсов Камчатки и Северо-Западной части Тихого океана. 2016. Вып. 42. С. 78–87. https://doi.org/10.15853/2072-8212.2016.42.78-87
  8. Yokoyama R., Sideleva V.G., Shedko S.V., Goto A. Broad-scale phylogeography of the Palearctic freshwater fish Cottus poecilopus complex (Pisces: Cottidae) // J. Mol. Phylogen. Evol. 2008. V. 48. P. 1244–1251. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2008.02.002
  9. Radchenko O.A., Moreva I.N., Petrovskaya A.V. The subfamily Myoxocephalinae of cottid fishes (Cottidae): Genetic divergence and phylogenetic relationships // J. Fish Biol. 2021. V. 99. P. 1857–1868. https://doi.org/10.1111/jfb.14886
  10. Черешнев И.А., Шестаков А.В., Скопец М.Б. Определитель пресноводных рыб Северо-Востока России. В.: Дальнаука, 2001. 129 с.
  11. Maniatis T., Fritsch E.F., Sambrook J. Molecular Cloning, A Laboratory Manual. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab., 1982. 480 p.
  12. Moreva I.N., Radchenko O.A., Petrovskaya A.V. Differentiation of the frog sculpin Myoxocephalus stelleri Tilesius, 1811 (Actinopterygii, Cottidae) based on mtDNA and karyotype analyses // Comp. Cytogenet. 2021. V. 15. № 2. P. 179–197. https://doi.org/10.3897/CompCytogen.v15.i2.63207
  13. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. P. 1547–1549.
  14. Ronquist F., Teslenko M., Van Der Mark P. et al. MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space // Syst. Biol. 2012. V. 61. P. 539–542.
  15. Rambaut A., Drummond A.J., Xie D. et al. Posterior summarisation in Bayesian phylogenetics using tracer 1.7 // Syst. Biol. 2018. V. 67. P. 901–904.
  16. Leache A.D., Reeder T.W. Molecular systematics of the eastern fence lizard (Sceloporus undulatus): A comparison of parsimony, likelihood, and Bayesian approaches // Syst. Biol. 2002. V. 51. P. 44–68.
  17. Kligerman A.D., Bloom S.E. Rapid chromosome preparations from solid tissues of fishes // J. Fish. Res. Board Can. 1977. V. 34. P. 266–269.
  18. Levan A., Fredga K., Sandberg A.A. Nomenclature for centromeric position on chromosomes // Hereditas. 1964. V. 52. P. 201–220.
  19. Starmach J. Die Cromosomen von Cottus poecilopus Heckel und Cottus gobio L. // Acta Hydrobiol. 1967. V. 9. P. 301–307.
  20. Abe S. Notes on the chromosomes of two species of fresh-water cottid fishes // Chromosome Inform. Service. 1972. V. 13. P. 25–27.
  21. Abe S. A cytotaxonomical study in some freshwater cottid fishes (Cottidae, Pisces) // Cytologia. 1976. V. 41. P. 323–329.
  22. Berberović L.J., Sofradžija A., Vagner L.J. The chromosomes of the species Cottus gobio L. (Cottidae, Pisces) // Got. Biol. Inst. Univ. Sarajevu. 1978. V. 27. P. 5–15.
  23. Gold J.R., Karel W.J., Strand M.R. Chromosome Formulae of North American Fishes. Texas A & M Univ. System, 1979. 24 p.
  24. Ida H., Terashima H., Fujimi T. Karyotypes in four species of the family Cottidae // Japan J. Ichthyol. 1989. V. 36. P. 135–140. https://doi.org/10.1007/BF02905683
  25. Vitturi R., Rasotto M.B. Karyotype analysis of Cottus gobio L. (Pisces, Cottidae) // Cytobios. 1990. V. 62. P. 81–86.
  26. Park G.M., Song H.B. Karyotypes of five species in Odontobutidae and Cottidae of Korea // Kor. J. Ichthyol. 2006. V. 18. P. 155–162.
  27. Thompson K., Whitcomb S., Choudhry E. et al. Karyotypes of Cottus cognatus, C. bairdi, and their hybrids in central Pennsylvania // J. Pennsylvania Acad. Sci. 2020. V. 93. № 1. P. 37–46. https://doi.org/10.5325/jpennacadscie.93.1.0037
  28. Yamazaki A., Markevich A., Munehara H. Molecular phylogeny and zoogeography of marine sculpins in the genus Gymnocanthus (Teleostei; Cottidae) based on mitochondrial DNA sequences // Mar. Biol. 2013. V. 160. P. 2581–2589. https://doi.org/10.1007/s00227-013-2250-4
  29. Kontula T., Kirilchik S.V., Väinölä R. Endemic diversification of the monophyletic cottoid fish species flock in Lake Baikal explored with mtDNA sequencing // Mol. Phylogen. Evol. 2003. V. 27. P. 143–155. https://doi.org/10.1016/s1055-7903(02)00376-7
  30. Ao M., Xie P., Zhao G. et al. The complete mitochondrial genome of Cottus sibiricus altaicus (Scorpaeniformes: Cottidae) // Mitochondrial DNA. 2016. V. 27. № 2. P. 1315–1316. https://doi.org/10.3109/19401736.2014.945573
  31. Fricke R., Eschmeyer W.N., van der Laan R. (eds) Eschmeyer’s catalog of fishes: Genera, species, references. 2022. (http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/ fishcatmain.asp). Electronic version accessed April 01, 2022.
  32. Савельев П.А., Колпаков Е.В. Морфологическое описание, внутривидовая изменчивость и родственные связи подкаменщика Черского Cottus czerskii (Cottidae) // Вопр. ихтиологии. 2018. Т. 58. № 2. С. 144–153. https://doi.org/10.7868/S0042875218020030
  33. Arai R. Fish Karyotypes. A Check List. Tokyo; Berlin; Heindelberg; New York: Springer, 2011. 347 p. https://doi.org/10.1007/978-4-431-53877-6
  34. Yang T., Meng W., Xuhui W. et al. The complete mitochondrial genome of endemic freshwater sculpin Cottus dzungaricus (Scorpaeniformes: Cottidae) revealed by high-throughput NGS: Genome structure and its phylogenetic relationships // Turkish J. Fish. Aquat. Sci. 2020. V. 20. № 1. P. 29–37. https://doi.org/10.4194/1303-2712-v20_1_03

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2.

下载 (286KB)
索引源数据
3.

下载 (162KB)
索引源数据
4.

下载 (486KB)
索引源数据

版权所有 © О.А. Радченко, И.Н. Морева, А.В. Петровская, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».