Геоданные гербария МГУ: структура данных и методика геопривязки

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Оцифровка Гербария Московского университета (MW) была начата весной 2015 г., с октября 2016 г. мы стали размещать изображения образцов в открытый доступ на портале Цифрового гербария МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Постепенно на нашем портале стали появляться и расширенные метаданные: полные расшифровки текста этикеток и геопривязки, т.е. значения координат места сбора каждого образца. На 14.01.2023 две трети образцов Гербария МГУ (693168 штук, или 66%) имеют электронные метки на карте, в то время как 359593 образца их пока не имеют. В статье дана характеристика массива геоданных Гербария Московского университета как в географическом аспекте (покрытие геоданных для разных регионов), так и в аспекте точности геопривязок. Приведены общие методические указания по геопривязке гербарных коллекций.

Об авторах

А. П. Серёгин

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119991, Москва, Ленинские горы, 1

В. Н. Пашкина

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119991, Москва, Ленинские горы, 1

И. Н. Поспелов

Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН

Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119071, Москва, Ленинский пр.,

Список литературы

  1. [Belov] Белов М.И. 1959а. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 3. Советское арктическое мореплавание 1917–1932 гг. Л. 511 с.
  2. [Belov] Белов. М.И. 1959b. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 4. Научное и хозяйственное освоение Советского Севера. 1933–1945 гг. Л. 616 с.
  3. Bijmoer R., Scherrenberg M., Creuwels J. 2023. Naturalis Biodiversity Center (NL) – Botany. Naturalis Biodiversity Center. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ib5ypt accessed via GBIF.org on 2023-01-31.
  4. Catalogue of Life. 2023. https://www.catalogueoflife.org/
  5. Chapman A.D., Wieczorek J.R. 2020. Georeferencing best practices. Version 1.0. Copenhagen, Denmark, GBIF Secretariat. 112 p. https://doi.org/10.15468/doc-gg7h-s853
  6. Drinkwater R.E., Cubey R.W., Haston E.M. 2014. The use of Optical Character Recognition (OCR) in the digitisation of herbarium specimen labels. – PhytoKeys. 19(38): 15–30.
  7. EtoMesto.ru. 2023. http://www.etomesto.ru/
  8. [Glinka et al.] Глинка Г.В., Тхоржевский И.И., Цветков М.А. 1914. Атлас Азиатской России. Издание переселенческого управления главного управления землеустройства и земледелия. СПб. 71 с. http://kartolog.ru/2009/09/atlas-aziatskoj-rossii-1914-g/?ysclid=ld1jlbtnsj906089553
  9. Global Biodiversity Information Facility. 2023. https://www.gbif.org/
  10. Güntsch A., Groom Q., Ernst M., Holetschek J., Plank A., Röpert D., Fichtmüller D., Shorthouse D.P., Hyam R., Dillen M., Trekels M., Haston E., Rainer H. 2021. A botanical demonstration of the potential of linking data using unique identifiers for people. – PLoS ONE. 16(12): e0261130. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0261130
  11. Le Bras G., Pignal M., Jeanson M.L., Muller S., Aupic C., Carré B., Flament G., Gaudeul M., Gonçalves C., Invernón V.R., Jabbour F., Lerat E., Lowry P.P., Offroy B., Pimparé E.P., Poncy O., Rouhan G., Haevermans T. 2017. The French Muséum national d’histoire naturelle vascular plant herbarium collection dataset. – Scientific Data. 4(1): 1–16.
  12. Marcer A., Groom Q., Haston E., Uribe F. 2021. Natural History collections: georeferencing survey report: current georeferencing practices across institutions worldwide. – Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.4644529
  13. Marshruty.ru 2023. https://maps.marshruty.ru/
  14. Nelson G., Paul D., Riccardi G., Mast A.R. 2012. Five task clusters that enable efficient and effective digitization of biological collections. – ZooKeys. 209: 19–45. https://doi.org/10.3897/zookeys.209.3135
  15. [OOPT] ООПТ России. 2023. http://www.oopt.aari.ru/
  16. [Pomogator…] Помогатор Цифрового гербария МГУ. 2023.
  17. https://plant.depo.msu.ru/pomogator
  18. Pospelov I.N. 2018. The experience of geographical fixing Central Siberia herbarium collections from the Moscow State University (MW) collection. – In: Abstracts of the conference “Information Technologies in the Research of Biodiversity” (BIT–2018). Irkutsk. P. 105–106.
  19. [Pospelov] Поспелов И.Н. 2020. Уровни географической локализации пространственных данных в информационных ресурсах о биологическом разнообразии. – В кн.: Информационные технологии в исследовании биоразнообразия: материалы III Национальной науч. конф. с междунар. участием, посвященной 100-летию со дня рождения академика РАН П.Л. Горчаковского. – Екатеринбург. С. 448–451.
  20. [Pospelov, Pospelova] Поспелов И.Н., Поспелова Е.Б. 2019. О возможностях исследования флористического разнообразия на основании анализа гербарных сборов (Цифровой гербарий MW). – В кн.: Ботанико-географические исследования. Камелинские чтения: сб. науч. тр. Пермь. С. 134–138.
  21. Ramirez J., Watson K., McMillin L., Gjieli E., Sessa E. 2022. The New York Botanical Garden Herbarium (NY). Version 1.56. The New York Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/6e8nje
  22. Ranwashe F. et al. 2022. Botanical Database of Southern Africa (BODATSA): Botanical Collections. Version 1.16. South African National Biodiversity Institute. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/2aki0q
  23. RetroMap. 2023. RetroMap: Старые карты России и зарубежья. http://retromap.ru/
  24. [Rodnaya…] Родная Вятка. 2023. http://rodnaya-vyatka.ru/
  25. [Seregin] Серегин А.П. 2017. Гербарий Московского университета (MW) сегодня: фонды, онлайн доступ и научная работа. – Бот. журн. 102 (3): 281–308.
  26. Seregin A.P. 2018. The largest digital herbarium in Russia is now available online! – Taxon. 67 (2): 463–467. https://doi.org/10.12705/672.34
  27. Seregin A.P. 2020. Moscow Digital Herbarium: a consortium since 2019 – Taxon. 67 (2): 417–419. https://doi.org/10.1002/TAX.12228
  28. [Seregin] Серегин А.П. 2022. Инструкция по геопривязке образцов Гербария Московского университета (MW). Вариант “Монголия”. Версия 1.0. М. https://doi.org/10.13140/RG.2.2.14879.84645
  29. Seregin A. 2023a. Moscow University Herbarium (MW). Version 1.265. Lomonosov Moscow State University. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/cpnhcc
  30. Seregin A.P. (Ed.). 2023b. Moscow Digital Herbarium: Electronic resource. Moscow State University, Moscow. https://plant.depo.msu.ru/
  31. Thiers B.M. 2023. Index Herbariorum. https://sweetgum.nybg.org/science/ih/
  32. [Tupitsyna et al.] Тупицына Н.Н., Шауло Д.Н., Гуреева И.И. 2016. Обзор флористических исследований Средней Сибири. Красноярск. 253 с. https://doi.org/10.17223/9785946216371/33 (https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/services/Download/vtls:000617746/SOURCE1)
  33. Teisher J., Stimmel H. 2022. Tropicos Specimen Data. Missouri Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/hja69f
  34. Wittzell H., Shah M. 2022. Lund Botanical Museum (LD). Lund Botanical Museum (LD). Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/c4w4co
  35. [Yandex] Яндекс.Карты. 2023. https://yandex.ru/maps/

© А.П. Серёгин, В.Н. Пашкина, И.Н. Поспелов, 2023

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах