Геоданные гербария МГУ: структура данных и методика геопривязки
- Авторы: Серёгин А.П.1, Пашкина В.Н.1, Поспелов И.Н.2
-
Учреждения:
- Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
- Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН
- Выпуск: Том 108, № 5 (2023)
- Страницы: 491-505
- Раздел: МЕТОДИКА БОТАНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ
- URL: https://journals.rcsi.science/0006-8136/article/view/134526
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0006813623050083
- EDN: https://elibrary.ru/YZKILC
- ID: 134526
Цитировать
Аннотация
Оцифровка Гербария Московского университета (MW) была начата весной 2015 г., с октября 2016 г. мы стали размещать изображения образцов в открытый доступ на портале Цифрового гербария МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Постепенно на нашем портале стали появляться и расширенные метаданные: полные расшифровки текста этикеток и геопривязки, т.е. значения координат места сбора каждого образца. На 14.01.2023 две трети образцов Гербария МГУ (693168 штук, или 66%) имеют электронные метки на карте, в то время как 359593 образца их пока не имеют. В статье дана характеристика массива геоданных Гербария Московского университета как в географическом аспекте (покрытие геоданных для разных регионов), так и в аспекте точности геопривязок. Приведены общие методические указания по геопривязке гербарных коллекций.
Ключевые слова
Об авторах
А. П. Серёгин
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Автор, ответственный за переписку.
Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119991, Москва,
Ленинские горы, 1
В. Н. Пашкина
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119991, Москва,
Ленинские горы, 1
И. Н. Поспелов
Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН
Email: botanik.seregin@gmail.com
Россия, 119071, Москва, Ленинский пр.,
Список литературы
- [Belov] Белов М.И. 1959а. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 3. Советское арктическое мореплавание 1917–1932 гг. Л. 511 с.
- [Belov] Белов. М.И. 1959b. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 4. Научное и хозяйственное освоение Советского Севера. 1933–1945 гг. Л. 616 с.
- Bijmoer R., Scherrenberg M., Creuwels J. 2023. Naturalis Biodiversity Center (NL) – Botany. Naturalis Biodiversity Center. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ib5ypt accessed via GBIF.org on 2023-01-31.
- Catalogue of Life. 2023. https://www.catalogueoflife.org/
- Chapman A.D., Wieczorek J.R. 2020. Georeferencing best practices. Version 1.0. Copenhagen, Denmark, GBIF Secretariat. 112 p. https://doi.org/10.15468/doc-gg7h-s853
- Drinkwater R.E., Cubey R.W., Haston E.M. 2014. The use of Optical Character Recognition (OCR) in the digitisation of herbarium specimen labels. – PhytoKeys. 19(38): 15–30.
- EtoMesto.ru. 2023. http://www.etomesto.ru/
- [Glinka et al.] Глинка Г.В., Тхоржевский И.И., Цветков М.А. 1914. Атлас Азиатской России. Издание переселенческого управления главного управления землеустройства и земледелия. СПб. 71 с. http://kartolog.ru/2009/09/atlas-aziatskoj-rossii-1914-g/?ysclid=ld1jlbtnsj906089553
- Global Biodiversity Information Facility. 2023. https://www.gbif.org/
- Güntsch A., Groom Q., Ernst M., Holetschek J., Plank A., Röpert D., Fichtmüller D., Shorthouse D.P., Hyam R., Dillen M., Trekels M., Haston E., Rainer H. 2021. A botanical demonstration of the potential of linking data using unique identifiers for people. – PLoS ONE. 16(12): e0261130. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0261130
- Le Bras G., Pignal M., Jeanson M.L., Muller S., Aupic C., Carré B., Flament G., Gaudeul M., Gonçalves C., Invernón V.R., Jabbour F., Lerat E., Lowry P.P., Offroy B., Pimparé E.P., Poncy O., Rouhan G., Haevermans T. 2017. The French Muséum national d’histoire naturelle vascular plant herbarium collection dataset. – Scientific Data. 4(1): 1–16.
- Marcer A., Groom Q., Haston E., Uribe F. 2021. Natural History collections: georeferencing survey report: current georeferencing practices across institutions worldwide. – Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.4644529
- Marshruty.ru 2023. https://maps.marshruty.ru/
- Nelson G., Paul D., Riccardi G., Mast A.R. 2012. Five task clusters that enable efficient and effective digitization of biological collections. – ZooKeys. 209: 19–45. https://doi.org/10.3897/zookeys.209.3135
- [OOPT] ООПТ России. 2023. http://www.oopt.aari.ru/
- [Pomogator…] Помогатор Цифрового гербария МГУ. 2023.
- https://plant.depo.msu.ru/pomogator
- Pospelov I.N. 2018. The experience of geographical fixing Central Siberia herbarium collections from the Moscow State University (MW) collection. – In: Abstracts of the conference “Information Technologies in the Research of Biodiversity” (BIT–2018). Irkutsk. P. 105–106.
- [Pospelov] Поспелов И.Н. 2020. Уровни географической локализации пространственных данных в информационных ресурсах о биологическом разнообразии. – В кн.: Информационные технологии в исследовании биоразнообразия: материалы III Национальной науч. конф. с междунар. участием, посвященной 100-летию со дня рождения академика РАН П.Л. Горчаковского. – Екатеринбург. С. 448–451.
- [Pospelov, Pospelova] Поспелов И.Н., Поспелова Е.Б. 2019. О возможностях исследования флористического разнообразия на основании анализа гербарных сборов (Цифровой гербарий MW). – В кн.: Ботанико-географические исследования. Камелинские чтения: сб. науч. тр. Пермь. С. 134–138.
- Ramirez J., Watson K., McMillin L., Gjieli E., Sessa E. 2022. The New York Botanical Garden Herbarium (NY). Version 1.56. The New York Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/6e8nje
- Ranwashe F. et al. 2022. Botanical Database of Southern Africa (BODATSA): Botanical Collections. Version 1.16. South African National Biodiversity Institute. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/2aki0q
- RetroMap. 2023. RetroMap: Старые карты России и зарубежья. http://retromap.ru/
- [Rodnaya…] Родная Вятка. 2023. http://rodnaya-vyatka.ru/
- [Seregin] Серегин А.П. 2017. Гербарий Московского университета (MW) сегодня: фонды, онлайн доступ и научная работа. – Бот. журн. 102 (3): 281–308.
- Seregin A.P. 2018. The largest digital herbarium in Russia is now available online! – Taxon. 67 (2): 463–467. https://doi.org/10.12705/672.34
- Seregin A.P. 2020. Moscow Digital Herbarium: a consortium since 2019 – Taxon. 67 (2): 417–419. https://doi.org/10.1002/TAX.12228
- [Seregin] Серегин А.П. 2022. Инструкция по геопривязке образцов Гербария Московского университета (MW). Вариант “Монголия”. Версия 1.0. М. https://doi.org/10.13140/RG.2.2.14879.84645
- Seregin A. 2023a. Moscow University Herbarium (MW). Version 1.265. Lomonosov Moscow State University. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/cpnhcc
- Seregin A.P. (Ed.). 2023b. Moscow Digital Herbarium: Electronic resource. Moscow State University, Moscow. https://plant.depo.msu.ru/
- Thiers B.M. 2023. Index Herbariorum. https://sweetgum.nybg.org/science/ih/
- [Tupitsyna et al.] Тупицына Н.Н., Шауло Д.Н., Гуреева И.И. 2016. Обзор флористических исследований Средней Сибири. Красноярск. 253 с. https://doi.org/10.17223/9785946216371/33 (https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/services/Download/vtls:000617746/SOURCE1)
- Teisher J., Stimmel H. 2022. Tropicos Specimen Data. Missouri Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/hja69f
- Wittzell H., Shah M. 2022. Lund Botanical Museum (LD). Lund Botanical Museum (LD). Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/c4w4co
- [Yandex] Яндекс.Карты. 2023. https://yandex.ru/maps/