On methodological errors in estimating the initial velocities of enzyme-catalyzed reactions and on approaches to their correction(a case study with lactate dehydrogenase)

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

A universal algorithm is proposed to compute the initial velocities of enzyme-catalyzed reactions at “zero time” from the kinetic curve for substrate consumption or product accumulation determined by direct measurements of changes in enzyme activities. The research is illustrated with a commercial lactate dehydrogenase sample and a standard biochemical test kit. The proposed approach makes it possible to virtually eliminate systematic errors in measurements, determine the initial velocity with the same accuracy regardless of the levels of enzyme activities, reduce time spent on analysis to one minute, and expand the scope of application of standard test kits for studying enzymes isolated from different sources when solving a wide range of problems. The algorithm cannot be applied to analyses of coupled enzyme reactions because there is a long initial lag phase in respective kinetic curves.

作者简介

A. Lianguzov

St. Petersburg State University

Email: andrey.lyanguzov@spbu.ru
St. Petersburg, Russia

N. Malygina

St. Petersburg State University;Kirov Military Medical Academy

St. Petersburg, Russia

T. Petrova

St. Petersburg State University

St. Petersburg, Russia

参考

  1. Spinreact, https://www.spinreact.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  2. M. Meerkin, in Tietz cinical guide to laboratory tests, Ed. by A. H. B. Wu (W.B. Saunders Company, Danvers, 2006), pp. 648-б5о.
  3. A. Chang, L. Jeske, S. Ulbrich, et al., Nucl. Acids Res., 49, D498 (2021).
  4. Enzyme Nomenclature, http://www.enzyme-data-base.org/contents.php. Дата обращения: 10.05.2023.
  5. L. S. Vidal, C. L. Kelly, P. M. Mordaka, and J. T. Heap, Biochim. Biophys. Acta: Proteins Proteomics, 1866, 327 (2018).
  6. UV WinLab Software 6.0.4 (PerkinElmer Lambda 35), http://www.perkinelmer.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  7. R Project, https://www.r-project.org. Дата обращения: 10.05.20223.
  8. N. M. Malygina, T. A. Petrova, A. Yu. Lianguzov, and A. M. Ivanov, Dokl. Biochem. Biophys., 488, 311 (2019).
  9. Products/Clinical Biochemistry/Enzymes, https://www.spinreact.com/en/products-list/clinical-biochemistry/enzymes.html. Дата обращения: 10.05.2023.
  10. W. W. Cleland, Anal. Biochem., 99, 142 (1979).
  11. A. Yu. Lyangusov, T. A. Petrova, and V. E. Stefanov. Dokl. Biochem. Biophys., 424, 49 (2009).

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».