Distinct mechanisms of phenotypic effects of inactivation and prionization of Swi1 protein in Saccharomyces cerevisiae


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Prions are proteins that under the same conditions can exist in two or more conformations, and at least one of the conformations has infectious properties. The prionization of a protein is typically accompanied by its functional inactivation due to sequestration of monomers by the prion aggregates. The most of prions has been identified in the yeast Saccharomyces cerevisiae. One of them is [SWI+], a prion isoform of the Swi1 protein, which is a component of the evolutionarily conserved chromatin remodeling complex SWI/SNF. Earlier, it was shown that the prionization of [SWI+] induces a nonsense suppression, which leads to weak growth of the [SWI+] strains containing mutant variants of the SUP35 gene and the nonsense allele ade1-14UGA on selective medium without adenine. This effect occurs because of [SWI+] induction that causes a decrease in the amount of the SUP45 mRNA. Strains carrying the SWI1 deletion exhibit significantly higher suppression of the ade1-14UGA nonsense mutation than the [SWI+] strains. In the present study, we identified genes whose expression is altered in the background of the SWI1 deletion using RNA sequencing. We found that the ade1-14UGA suppression in the swi1Δ strains is caused by an increase in the expression of this mutant allele of the ADE1 gene. At the same time, the SUP45 expression level in the swi1Δ strains does not significantly differ from the expression level of this gene in the [swi] strains. Thus, we have shown that the phenotypic effects of Swi1 prionization and deletion are mediated by different molecular mechanisms. Based on these data, we have concluded that the prionization of proteins is not only unequal to their inactivation, but also can lead to the acquisition of novel phenotypic effects and functions.

Ключевые слова

Об авторах

K. Antonets

St. Petersburg State University; St. Petersburg Branch of Vavilov Institute of General Genetics; All-Russian Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034; St. Petersburg, 199034; Pushkin, St. Petersburg, 196608

S. Kliver

St. Petersburg State University; All-Russian Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034; Pushkin, St. Petersburg, 196608

D. Polev

St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Shuvalova

St. Petersburg State University

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034

E. Andreeva

St. Petersburg State University; St. Petersburg Branch of Vavilov Institute of General Genetics

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034; St. Petersburg, 199034

S. Inge-Vechtomov

St. Petersburg State University; St. Petersburg Branch of Vavilov Institute of General Genetics

Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034; St. Petersburg, 199034

A. Nizhnikov

St. Petersburg State University; St. Petersburg Branch of Vavilov Institute of General Genetics; All-Russian Research Institute for Agricultural Microbiology

Автор, ответственный за переписку.
Email: ant.nizhnikov@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 199034; St. Petersburg, 199034; Pushkin, St. Petersburg, 196608

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2017

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».