PMTOOLS: New Application for Paleomagnetic Data Analysis

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Abstract

—This paper introduces PMTools (https://pmtools.ru), a novel cross-platform open-source web application designed for the analysis of paleomagnetic data. Our software offers a user-friendly interface and supports the most commonly used data formats in paleomagnetism, including .pmd, .dir, .pmm, .rs3, .squid, .vgp, and .gpml. It encompasses all the necessary functionalities for conducting principal component analysis of natural remanent magnetization and computing mean paleomagnetic directions along with corresponding virtual geomagnetic (paleomagnetic) poles. PMTools facilitates the application of various paleomagnetic tests to user data, such as the fold test, conglomerate test, and reversals test. Notably, the application allows for seamless import and export of paleomagnetic data (tables) in formats compatible with .csv and MS Excel. Additionally, all generated figures can be exported as high-quality vector graphics in .svg format, specifically designed for direct integration into publications and presentations. Furthermore, PMTools enables the export of sets of paleomagnetic poles in GMap and GPlates software formats, enabling researchers to promptly use their paleomagnetic data for paleotectonic reconstructions. PMTools has an intuitive interface, customizable hotkeys, and an extensive array of graph elements, all of which contribute to making PMTools an appealing, cutting-edge tool for processing and analyzing the results of paleomagnetic studies.

About the authors

I. V. Efremov

Lomonosov Moscow State University, Faculty of Geology; Schmidt Institute of Physics of the Earth, Russian Academy of Sciences

Email: roman.veselovskiy@ya.ru
Russia, Moscow; Russia, Moscow

R. V. Veselovskiy

Lomonosov Moscow State University, Faculty of Geology; Schmidt Institute of Physics of the Earth, Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: roman.veselovskiy@ya.ru
Russia, Moscow; Russia, Moscow

References

  1. Храмов А.Н., Гончаров Г.И., Комиссарова Р.А. и др. Палеомагнитология. Л.: Недра. 1982. 312 с.
  2. Chadima M., Hrouda F. Remasoft 3.0 a user-friendly paleomagnetic data browser and analyzer // Travaux G’eophysiques. 2006. V. 27. P. 20–21.
  3. Cogne J.P. PaleoMac: a Macintosh™ application for treating paleomagnetic data and making plate reconstructions // Geochemistry, Geophysics, Geosystems. 2003. V. 4. № 1. https://doi.org/10.1029/2001GC000227
  4. Collinson D. (ed.). Methods in rock magnetism and palaeomagnetism: techniques and instrumentation. Springer Science & Business Media. 2013. 503 p.
  5. Kirschvink J. L. The least-square line and plane and the analysis of paleomagnetic data // Geophysical Journal International. 1980. V. 62(3). P. 699–718. https://doi.org/10.1111/j.1365-246X.1980.tb02601.x
  6. Kirschvink J.L., Kopp R.E., Raub T.D., Baumgartner C.T., Holt J.W. Rapid, precise, and high-sensitivity acquisition of paleomagnetic and rock-magnetic data: Development of a low-noise automatic sample changing system for superconducting rock magnetometers // Geochemistry, Geophysics, Geosystems. 2008. V. 9. P. Q05Y01. https://doi.org/10.1029/2007GC001856
  7. Enkin R.J. A computer program package for analysis and presentation of paleomagnetic data. Geological Survey of Canada. 1994. 16 p.
  8. Enkin R.J. Paleomagnetism data analysis: Version 4.2. Geological Survey of Canada. 2004.
  9. McFadden P.L., McElhinny M.W. Classification of the reversal test in palaeomagnetism // Geophys. J. Int. 1990. V. 103. № 3. P. 725–729. https://doi.org/10.1111/j.1365-246X.1990.tb05683.x
  10. Koymans M.R., Langereis C.G., Pastor-Galán D., van Hinsbergen D.J.J. Paleomagnetism.org: An online multi-platform open source environment for paleomagnetic data analysis // Computers & Geosciences. 2016. V. 93. P. 127–137. https://doi.org/10.1016/j.cageo.2016.05.007
  11. McFadden P.L., McElhinny M.W. Classification of the reversal test in palaeomagnetism // Geophysical J. International. 1990. V. 103. № 3. P. 725–729.
  12. Muller R.D., Cannon J., Qin X., Watson R.J., Gurnis M., Williams S. et al. GPlates: building a virtual Earth through deep time // Geochemistry, Geophysics, Geosystems. 2018. V. 19. № 7. P. 2243–2261. https://doi.org/10.1029/2018GC007584
  13. Tauxe L. Essentials of paleomagnetism. University of California Press. 2010.
  14. Tauxe L., Shaar R., Jonestrask L., Swanson-Hysell N.L., Minnett R., Koppers A.A.P., Constable C.G., Jarboe N., Gaastra K., Fairchild L. PmagPy: Software package for paleomagnetic data analysis and a bridge to the Magnetics Information Consortium (MagIC) Database // Geochemistry, Geophysics, Geosystems. 2016. V. 17. № 6. P. 2450–2463. https://doi.org/10.1002/2016GC006307
  15. Torsvik T., Smethurst M. GMAP v.32: Geographic mapping and palaeoreconstruction package. Norges geologiske underskelse. 1998. 65 p.
  16. Veselovskiy R.V., Dubinya N.V., Ponomarev A.V., Fokin I.V., Patonin A.V., Pasenko A.M., Fetisova A.M., Matveev M.A., Afinogenova N.A., Rud’ko D.V., Chistyakova A.V. Shared Research Facilities “Petrophysics, Geomechanics and Paleomagnetism” of the Schmidt Institute of Physics of the Earth RAS // Geodynamics & Tectonophysics. 2022. V. 13(2). P. 0579. https://doi.org/10.5800/GT-2022-13-2-0579
  17. Watson G. S. A test for randomness of directions // Geophysical Supplements to the Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. 1956. V. 7. № 4. P. 160–161.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2.

Download (158KB)
Indexing metadata
3.

Download (931KB)
Indexing metadata
4.

Download (1MB)
Indexing metadata
5.

Download (716KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2023 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».