Роль экологических факторов в формировании генетической структуры популяций P. abies (L.) Karst
- Авторы: Захарова К.В.1, Сейц К.С.1
-
Учреждения:
- ФГБУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный университет»
- Выпуск: Том 15, № 2 (2017)
- Страницы: 11-20
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/article/view/6763
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen15211-20
- ID: 6763
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Для выявления степени влияния экологических факторов на дифференциацию популяций Picea abies было исследовано 20 ценопопуляций из четырех географических точек. В работе показано, что экологические условия влияют на генотипический состав популяций сильнее, чем географическое расстояние. Структура внутрипопуляционной генетической изменчивости Picea abies определяется в большей степени эффектом «экологической изоляции», чем эффектом «изоляции расстоянием».
Ключевые слова
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Ксения Вениаминовна Захарова
ФГБУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный университет»
Автор, ответственный за переписку.
Email: ksenven@mail.ru
кафедра геоботаники и экологии растений
Россия, Санкт-ПетербургКирилл Сергеевич Сейц
ФГБУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный университет»
Email: seits@rambler.ru
кафедра геоботаники и экологии растений
Россия, Санкт-ПетербургСписок литературы
- Попов П.П. Ель на востоке Европы и Западной Сибири. – Новосибирск: Наука, 1999. [Popov PP. Norway spruce in Eastern Europe and Western Siberia. Novosibirsk: Nauka; 1999. (In Russ.)]
- Hamrick JL, Godt MJ, Sherman-Broyles SL. Factors influencing levels of genetic diversity in woody plant species. New Forests. 1992;6:95-124. doi: 10.1007/BF00120641.
- Bouillé M, Bousquet J. Trans-species shared polymorphisms at orthologous nuclear gene loci among distant species in the conifer Picea (Pinacea): implications for the longterm maintainance of genetic diversity in trees. Am J Bot. 2005;92(1):63-73. doi: 10.3732/ajb.92.1.63.
- Ratnam W, Rajora OP, Finkeldey R, et al. Genetic effects of forest management practices: global synthesis and perspectives. For Ecol Manage. 2014;333:52-65. doi: 10.1016/j.foreco.2014.06.008.
- Meirmans PG. The trouble with isolation by distance. Mol Ecol. 2012;21:2839-2846. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05578.x.
- Wang IJ, Bradburd GS. Isolation by Environment. Mol Ecol. 2014;23:5649-5662. doi: 10.1111/mec.12938.
- Kremer A, Ronce O, Robledo-Arnuncio JJ, et al. Long-distance gene flow and adaptation of forest trees to rapid climate change. Ecology letters. 2012;15:378-392. doi: 10.1111/j.1461-0248.2012.01746.x.
- Andrew RL, Ostevik KL, Ebert DP, Rieseberg LH. Adaptation with gene flow across the landscape in a dune sunflower. Molecular Ecology. 2012;21:2078-2091. doi: 10.1111/j.1365-294X.2012.05454.x.
- Василевич В.И., Бибикова Т.В. Сфагновые ельники европейской России // Бот. журн. – 2004. – Т. 89. – № 5. – С. 734–748. [Vasilevich VI, Bibikova TV. Sphagnumspruce forests in European Russia. Botanicheskyi Journal. 2004;89(5):734-748. (In Russ.)]
- Рысин Л.П., Савельева Л.И. Еловые леса России. — М.: Наука, 2002. [Risin LP, Savelieva LI. Spruce forests of Russia. Moscow: Nauka; 2002. (In Russ.)]
- Василевич В.И., Бибикова Т.В. Ельники кисличные европейской России // Бот. журн. – 2004. – Т. 89. – № 10. – С. 1573–1587. [Vasilevich VI, Bibikova TV. Woodsorrel spruce forests in European Russia. Botanicheskyi Journal. 2004;89(10):1573-1587. (In Russ.)]
- Pfeiffer A, Olivieri AM, Morgante M. Identification and characterization of microsatellites in Norway spruce (Picea abies K). Genome. 1997;40:411-419. doi: 10.1139/g97-055.
- Fluch S, Burg А, Kopecky D, et al. Characterization of variable EST SSR markers for Norway spruce (Picea abies L.). BMC Research notes. 2011;4:401. doi: 10.1186/1756-0500-4-401.
- Rungis D, Bérubé Y, Zhang J, et al. Robust simple sequence repeat markers for spruce (Picea spp.) from expressed sequence tags. Theor Appl Genet. 2004;109:1283-1294. doi: 10.1007/s00122-004-1742-5.
- Scotti I, Paglia GP, Magni F, Morgante M. Efficient development of dinucleotide microsatellite markers in Norway spruce (Picea abies Karst.) through dot-blot selection. Theor Appl Genet. 2002;104:1035-1041. doi: 10.1007/s00122-001-0843-7.
- Scotti I, Magni F, Paglia GP, Morgante M. Trinucleotide microsatellites in Norway spruce (Picea abies): their features and the development of molecular markers. Theor Appl Genet. 2002;106:40-50. doi: 10.1007/s00122-002-0986-1.
- Peakall R, Smouse PE. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012;28:2537-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts460.
- Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000;155:945-959.
- Jakobsson M, Rosenberg NA. CLUMPP: a cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure. Bioinformatics. 2007;23:1801-1806. doi: 10.1093/bioinformatics/btm233.
- Rosenberg NA. Distruct: a program for the graphical display of population structure. Mol Ecol. 2004;4:137-8. doi: 10.1046/j.1471-8286.2003.00566.x.
- Tollefsrud MM, Sonstebo JH, Brochmann C, et al. Combined analysis of nuclear and mitochondrial markers provide new insight into the genetic structure of North European Picea abies. Heredity. 2009;102:549-62. doi: 10.1038/hdy.2009.16.
- Потокина Е.К., Орлова Л.В., Вишневская М.С., и др. Генетическая дифференциация популяций ели на Северо-Западе России по результатам маркирования микросателлитных локусов // Экол. генет. – 2012. – Т. 10. – № 2. – С. 4049. [Potokina EK, Orlova LV, Vishnevskaya MS, et al. Genetic differentiation of spruce populations in Northwest Russia revealed with microsatellite markers. Ecological Gene tics. 2012;10(2):40-49. (In Russ.)]
- Попова Т.А., Березкина Л.И., Бычкова И.А., и др. Природный парк «Вепсский лес». – СПб.: Вести, 2005. [Popova TA, Berezkina LI, Bichkova IA, et al. Natural park “Vepssky forest”. Saint Petersburg: Vesti; 2005. (In Russ.)]
- Nei M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics. 1978;89(3):583-90.
- Mantel N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach. Cancer Research. 1967;27(2):209-220.
- Evanno G, Regnaut S, Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol. 2005;14:2611-2620. doi: 10.1111/j.1365-294X.2005. 02553.x.
- Lagercrantz U, Ryman N. Genetic structure of Norway spruce (Picea abies): concordance of morphological and allozyme variation. Evolution. 1990;44:38-53. doi: 10.2307/2409523.
- Androsiuk P, Shimono A, Westin J, et al. Genetic status of Norway spruce (Picea abies) breeding populations for northern Sweden. Silvae Genet. 2013;62(3):127-136.
- Попов П.П. Популяционно-расовая дифференциация Picea abies и Picea obovata (Pinaceae) // Бот. журн. – 2009. – Т. 94. – № 9. – С. 1317–1334. [Popov PP. Population and race differentiation of Picea abies and Picea obovata (Pinaceae). Botanicheskyi Journal. 2009;94(9):1317-1334. (In Russ.)]
- Savolainen O, Pyhajarvi T, Knurr T. Gene flow and local adaptation in trees. Annu Rev Ecol Evol Syst. 2007;38:595-619. doi: 10.1146/annurev.ecolsys.38.091206.095646.