MICROSATELLITE POLYMORPHISM WITHIN TWO LAKE BAIKAL OILFISH SPECIES (COMEPHORUS LACEPEDE, 1801)
- Authors: Teterina V.I1, Sukhanova L.V1, Kirilchik S.V1
-
Affiliations:
- Limnological Institute SB RAS, Irkutsk, Irkutsk Oblast, RF
- Issue: Vol 5, No 2 (2007)
- Pages: 50-57
- Section: Articles
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/article/view/5375
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen5250-57
- ID: 5375
Cite item
Full Text
Abstract
Keywords
About the authors
Veronika I Teterina
Limnological Institute SB RAS, Irkutsk, Irkutsk Oblast, RF
Lubov V Sukhanova
Limnological Institute SB RAS, Irkutsk, Irkutsk Oblast, RF
Sergey V Kirilchik
Limnological Institute SB RAS, Irkutsk, Irkutsk Oblast, RF
References
- Аношко П. Н. Морфологическая изменчивость и дифференциация малой голомянки Comephorus dybowskii Korotneff (Cottoidei, Comephoridae) в озере Байкал/П. Н. Аношко//Сиб. экологич. журн. -1998. -№ 5. -С. 453-458.
- Аношко П. Н. Изменение признаков внешней морфологии и трофического статуса у голомянок Comephorus dybowski Korotneff и C. baicalensis (Pallas) (Cottoidei, Comephoridae) оз. Байкал в процессе роста/П. Н. Аношко, Е. В. Дзюба, Н. Г. Мельник//Мат-лы рабочего совещ. молодых ученых Иркутск. НЦ СО РАН. «Междисциплинарные исследования в Байкальском регионе». -Иркутск: Ин-т географии СО РАН, 2001. -С. 5-10.
- Волерман И. Б. Характер питания и использования кормовой базы голомянками Байкала/И. Б. Волерман//Динамика продуцирования рыб Байкала: коллективн. монография. -Новосибирск: Наука, 1983 -С. 63-66.
- Дзюба Е. В. Исследование пищевых стратегий пелагических рыб Байкала: автореф. дис.... канд. биол. наук/Е. В. Дзюба. -Борок: ИБВВ РАН, 2004. -24 с.
- Коряков Е. А. Биология, ресурсы и хозяйственное значение голомянок/Е. А. Коряков//Исследования по ихтиофауне Байкала: тр. Лимнол. ин-та СО АН СССР. -М.-Л., 1964. -Т. 2. -С. 3-75.
- Коряков Е. А. Пелагические бычковые Байкала/Е. А. Коряков. -М.: Наука. -1972. -155 с.
- Мамонтов А. М. Динамика пространственного распределения и размерная структура голомянок (Comephoridae) в прибрежной пелагиали южного Байкала в зимний период/А. М. Мамонтов, П. Н. Аношко, А. В. Сороковиков [и др.]//Тр. каф. зоол. позвочн. Иркутск. гос. ун-та. -Иркутск: Иркутский ун-т, 2004. -Т. 2. -С. 52-64.
- Нагорный В. К. Особенности распределения и продукционная структура голомянок/В. К. Нагорный//Динамика продуцирования рыб Байкала: коллективн. монография. -Новосибирск: Наука, 1983. -С. 6-14.
- Стариков Г. В. Голомянки Байкала/Г. В. Стариков. -Новосибирск: Наука, 1977. -96 с.
- Талиев Д. Н. Бычки-подкаменщики Байкала (Cottoidei)/Д. Н. Талиев. -М.-Л.: АН СССР, 1955. -603 с.
- Тетерина В. И. Анализ генетического полиморфизма малой голомянки Comephorus dybowski Korotneff, 1905 (Scorpaeniformes: Cottoidei) по микросателлитным локусам/В. И. Тетерина, Л. В. Суханова, Б. Э. Богданов [и др.]//Генетика. -2005. -№ 7. -С. 919-924.
- Guillemette J. G. Detection of subnanogram quantities of DNA and RNA on native and denaturing polyacrylamide and agarose gels by silver staining/J. G. Guillemette, P N. Lewis//Electrophoresis. -1983. -Vol. 4. -P 92-94.
- Guo S. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles/S. Guo, E. Thomson//Biometrics. -1992. -Vol. 48. -P. 361-372.
- Шимараев М. Н. О межкотловинном водообмене в Байкале/М. Н. Шимараев, Н. Г. Гранин, В. М. Домышева [и др.]//Вод. ресурсы. -2003. -№ 6. -С. 678-681.
- Amos W. Microsatellites show mutational bias and heterozygote instability/W. Amos, S. J. Sawcer, R. W. Feakes, D. C. Rubinstein//Nat. Genet. -1996. -Vol. 13. -P 390-391.
- Brookfield J. F. Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency/J. F. Y. Brookfield//Molecular Ecology. -1996. -Vol. 5. -P. 453-455.
- Cornuet J. M. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data/J. M. Cornuet, G. Luikart//Genetics. -1996. -Vol. 144. -P. 2001-2014.
- Englbrecht C. C. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in the European bullhead Cottus gobio L. (Osteichthyes) and their applicability to related taxa/C. C. Englbrecht, C. R. Largiader, B. Hanfling, D. Tautz//Mol. Ecol. -1999. -Vol. 8. -N 11. -P. 1966-1999.
- Estoup A. Microsatellites and minisatellites for molecular ecology: theoretical and empirical considerations/A. Estoup, B. Angers//Advances in molecular ecology. -Amsterdam: IOS Press, 1998. -P. 55-86.
- Luikart G. Distortion of allele frequency distributions provides a test for recent population bottlenecks/G. Luikart, F. W. Allendorf, J.-M. Cornuet, W. B. Sherwin//The Journal of Heredity. -1998. -Vol. 89. -N 3. -P. 238-247.
- McConnel S. K. Polymorphic microsatellite loci from Atlantic salmon (Salmon salar): Genetic differentiation of North American and European populations/S. K. McConnel, P. Oreilly, L. Hamilton [et al]//Canad. J. Fish. Aquat. Sci. -1995. -Vol. 52. -N 9. -P. 1863-1872.
- Olsen J. B. Moderately and highly polymorphic microsatellites provide discordant estimates of population divergence in sockeye salmon, Oncorhynchus nerka //J. B. Olsen, C. Habicht, J. Reynolds, J. E. Seeb // Environmantal Biology of Fishes. - 2004. - Vol. 69. - P. 261-273.
- Pereyra R. Variation in habitat preference and population structure among three species of the Lake Malavi cichlid genus Protomelas/R. Pereyra, M. I. Taylor, G. F. Turner, C. Rico//Molecular Ecology. -2004. -Vol. 13. -P. 2691-2697.
- Rico C. No evidence for parallel sympatric speciation in cichlid species of the genus Pseudotropheus from northwestern Lake Malawi/C. Rico, P. Bouteillon, M. J. H. Van open [et al.]//J. Evol. Biol. -2003. -Vol. 16. -P. 37-46.
- Schneider S. Arlequin: A software for population genetics data analysis. Ver 2.000/S. Schneider, D. Roessli, L. Excoffier//Genetics and Biometry Lab. Dept. of Anthropology, Univ. Geneva. -2000.
- Shaw P. W. Genetic population structure indicates sympatric speciation of Lake Malawi pelagic cichlids/P. W. Shaw, G. F. Turner, M. R. Idid [et al.]//Proc. R. Soc. Lond. -2000. -Vol. 267 -P. 2273-2280.
- Tautz D. Notes on definition and nomenclature of tandemly repetitive DNA sequences/D. Tautz//DNA Fingerprenting: State of the Science. -Basel: Birkhauser Verlag, 1993. -P. 21-28.
- Van Oosterhout C. Micro-checker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data/C. Van Oosterhout, W F. Hutchinson, D. P. M. Wills, P Shipley//Mol. Ecol. Notes. -2004. -Vol. 4. -P. 535-538.
- Van Oppen M. J. H. Unusually fine-scale genetic structuring found in rapidly speciating Malavi cichlid fishes/G. F. Turner, C. Rico [et al]//Proc. R. Soc. Lond. B. -1997. -Vol. 264. -P. 1803-1812.
- Wright S. Evolution and the genetics of populations. Vol. 4. Variability within and among natural populations/S. Wright. -Chicago, London: Univ. Chicago Press, 1978. -580 p.
- Yeh F. C. Population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits/F. C. Yeh, T. J. B. Boyle//Belgian Journal of Botany. -1997. -Vol. 129. -P. 157.
Supplementary files
