GENOME POLYMORPHISM STREPTOCOCCUS DYSGALACTIAE SUBSPECIES EQUISIMILIS


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis is the most wide-spread representative of group G streptococci and an essential aetiologic agent of most human deseases. Despite of the published genome-wide sequence of S. dysgalactiae subsp. equisimilis, there are almost no data on the genetic heterogeneity of this subspecies provided in the present-day literature. This document provides for the comparative analysis of a vast collection of S. dysgalactiae subsp. equisimilis strains isolated in various geographic regions. Virulence genes scpG, lmb, nga, speG and ska have been analyzed for presence. High-grade heterogeneity of scpG gene has been detected. Some strains have been subjected to emm-genotyping. Strains have been analyzed through the pulsed-field electrophoresis. As a result, the significant genome polymorphism of S. dysgalactiae subsp. equisimilis was found out.

About the authors

Yu Yu Uliasov

Institute of Experimental Medicine NWB RAMS

Email: kolpino@hotmail.com
St.-Petersburg, Russia

A V Dmitriev

Institute of Experimental Medicine NWB RAMS

St.-Petersburg, Russia

References

  1. Broyles L. N., Van Beneden C., Beall B. et al. Populaion-based study of invasive disease due to P-hemolytic streptococci of groups other than A and B // Clin. Infect. Dis.- 2009.- Vol. 48.- P. 706-712.
  2. Facklam R. What happened to streptococci: overview of taxonomic and nomenclature changes // Clin. Microbiol. Rev.- 2002.- Vol. 15.-P. 613-630.
  3. Ruoff K. L., Whiley R. A., Beighton D. Streptococcus // Manual of clinical microbiology.- 2003.- P. 405-421.
  4. Lancefield R. C., Hare R. The serological differentiation of pathogenic and non-pathogenic streptococci from parturient woman // J. Exp. Med.- 1935.- Vol. 61.- P. 335 -349.
  5. Nohlgard C., Bjorklind A., Hammar H. Group G streptococcal infections on a dermatological ward // Acta Derm. Venereol.- 1992.- Vol. 72.- P. 128-130.
  6. Alberti 5., Garcia-Rey C., Garcia-Laorden M. I. et al. The Spanish surveillance group for respiratory pathogens: survey of emm-like gene sequences from pharyngeal isolates of group C and group G streptococci collected in Spain // J. Clin. Microbiol.- 2005.- Vol. 43.-P. 1433-1436.
  7. Reissmann S., Friedrichs C., Rajkumari R. et al. Contribution of Streptococcus anginosus to infections caused by groups C and G streptococci in Southern India // Emerg. Infect. Dis.- 2010.- Vol. 16.- P. 656-663.
  8. Barnham M. R. D., Weightman N. C., Anderson A. W., Tanna A. Streptococcal toxic shock syndrome: a description of 14 cases from North Yorkshire, UK // Clin. Microbiol. Infect.- 2002.- Vol. 8.- P. 174-181.
  9. Hashikawa S., Iinuma Y., Furushita M. et al. Characterization of group C and G streptococcal strains that cause streptococcal toxic shock syndrome // J. Clin. Microbiol.- 2004.- Vol. 42.- P. 186-192.
  10. Natoli S., Fimiani C., Faglieri N. et al. Toxic shock syndrome due to group C streptococci. A case report // Intensive Care Med.- 1996.-Vol. 22.- P. 985-989.
  11. Wagner J. G., Schlievert P. M., Assimacopoulos A. Р. et al. Acute group G streptococcal myositis associated with streptococcal toxic shock syndrome: case report and review // Clin. Infect. Dis.- 1996.- Vol. 23.- P. 1159-1161.
  12. Collins C. M., Kimura A, Bisno A. L. Group G streptococcal M protein exhibits structural features analogous to those of class I M protein of group A streptococci // Infect. Immun.- 1992.- Vol. 60.- P. 3689-3696.
  13. McDonald M., Towers R. J., Andrews R. M. et al. Epidemiology of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis in tropical communities, Northern Australia // Emerg. Infect. Dis.- 2007.- Vol. 13.- P. 1694-1700.
  14. Rato M. G., Nerlich A., Bergmann R. et al. Virulence gene pool detected in bovine group C Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae isolates by use of a group A S. pyogenes virulence microarray // J. Clin. Microbiol.- 2011.- Vol. 49.- P. 2470-2479.
  15. Timmer A. M., Kristian S. A., Datta V. et al. Serum opacity factor promotes group A streptococcal epithelial cell invasion and virulence // Mol. Microbiol.- 2006.- Vol. 62.- P. 15-25.
  16. Ильясов Ю. Ю., Biswas I., Тотолян A. A., Дмитриев А. В. Метод дифференциальной диагностики стрептококков групп С и G // Клиническая лабораторная диагностика.- 2011.- № 2.- С. 40-43.
  17. Jensen A., Kilian M. Delineation of Streptococcus dysgalactiae, its subspecies, and its clinical and phylogenetic relationship to Streptococcus pyogenes // J. Clin. Microbiol.- 2012.- Vol. 50.- P. 113-126.
  18. Lefebure T., Richards V. P., Lang P. et al. Gene repertoire evolution of Streptococcus pyogenes inferred from phylogenomic analysis with Streptococcus canis and Streptococcus dysgalactiae // PLoS One.- 2012.- Vol. 7.- e37607.
  19. Дмитриев А. В., Hu Y. Y., Shen A. D. и др. Анализ клинических штаммов стрептококков группы В методами молекулярной генетики // Медицинский академический журнал.- 2002.- Т. 2, № 2.- С. 18-27.
  20. Dmitriev A. V., Shakleina E., Tkacikova L. et al. Genetic heterogeneity of the pathogenic potentials of human and bovine group B streptococci // Folia Microbiol.- 2002.- Vol. 47.- P. 291-295.
  21. Dmitriev A.V., Suvorov A. N., Shen A.D., Yang Y. H. Clinical diagnosis of group B streptococci by scpB gene based PCR // Indian. J. Med. Res.- 2004.- Vol. 119 (suppl.).- P. 233-236.
  22. Koroleva I. V., Efstratiou A., Suvorov A. N. Structural heterogeneity of the streptococcal C5a peptidase gene in Streptococcus pyogenes // J. Bacteriol.- 2002.- Vol. 184.- P. 6384-6386.
  23. Beall B., Facklam R., Thompson T. Sequencing emm-specific PCR products for routine and accurate typing of group A streptococci // J. Clin. Microbiol.- 1996.- Vol. 34.- P. 953-958.
  24. Sunaoshi K., Murayama S. Y., Adachi K. et al. Molecular emm genotyping and antibiotic susceptibility of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis isolated from invasive and non-invasive infections // J. Med. Microbiol.- 2010.- Vol. 59.- P. 82-88.
  25. Davies M. R., McMillan D. J., Van Domselaar G. H. et al. Phage 3396 from a Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis pathovar may have its origins in Streptococcus pyogenes // J. Bacteriol- 2007.- Vol. 189.- P. 2646-2652.
  26. Beres S. B., Sylva G. L., Barbian K. D. et al. Genome sequence of a serotype M3 strain of group A Streptococcus: phage-encoded toxins, the high-virulence phenotype, and clone emergence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2002.- Vol. 99.- P. 10078-10083.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Uliasov Y.Y., Dmitriev A.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».