Несоответствие границ речных бассейнов, в пределах которых происходит перенос загрязняющих веществ водными потоками, и административных (муниципальных) округов, где размещены источники их поступления в реки, является сложной научно-методической проблемой управления водными ресурсами. В статье приводится интегральная оценка антропогенного воздействия, рассчитанного по материалам государственной статистики в разрезе муниципалитетов Байкальской природной территории, и на примере речных бассейнов – притоков Байкала, расположенных в ее пределах, обсуждается предложенная авторами методика оценки вклада муниципалитетов в поступление тяжелых металлов и металлоидов (V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, As, Cd, Pb, Mo, P, Sb, Sn, U) в растворенной и взвешенной форме с речным стоком в оз. Байкал. Методами регрессионного анализа определена ведущая роль 5 факторов воздействия, статистически оказывающих влияние на формирование концентраций и потоков приоритетных загрязнителей в замыкающих створах 13 крупнейших притоков Байкала (рр. Селенга, Баргузин, Турка, Тыя, Верхняя Ангара, Снежная, Кичера, Голоустная, Бугульдейка, Утулик, Кика, Фролиха, Большая Черемшана). К ним относятся: объем сброса сточных вод; объем сброса неочищенных сточных вод; площади, нарушенные горнодобывающей деятельностью; геоморфологическая опасность территории; темпы потенциальной эрозии почв. Учет вклада отдельных муниципалитетов, расположенных в пределах речных бассейнов, в формирование суммарного воздействия по каждому из пяти факторов позволил обосновать метод определения количественной роли муниципалитетов в формировании потока загрязняющих веществ в Байкал. В границах Байкальской природной территории уровень антропогенного воздействия по большинству показателей имеет слабую тенденцию к снижению при увеличении локализации загрязнения в трех городских агломерациях (от 10 до 30% по каждому из веществ в городском округе Улан-Удэ, Северобайкальском и Селенгинском районах). Для этой зоны характерна наибольшая нагрузка сточных вод относительно объема поверхностных вод.