Диагностические характеристики тест-системы для определения вирусного гепатита B методом ПЦР в реальном времени по результатам анализа клинических образцов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Введение. Метод ПЦР важен в клинической диагностике вируса гепатита B (ВГВ) из-за высокой чувствительности, особенно при низкой вирусной нагрузке, при мониторинге динамики лечения и при выявлении скрытой формы инфекции. Существуют строгие требования к диагностической чувствительности и специфичности ПЦР-тест-систем, применяемым в клинической практике.

Цель исследования определение диагностических параметров разработанной тест-системы для ПЦР-диагностики ВГВ на 837 образцах плазмы крови человека.

Материал и методы. Исследованы 465 клинических образцов плазмы крови человека, полученных от людей с подтверждённым диагнозом заражения ВГВ, а также 372 образца плазмы крови, полученных от людей с подтверждённым отсутствием ВГВ в плазме крови. Образцы с подтверждённым клиническим статусом предоставлены аккредитованной лабораторией станции переливания крови. Набором сравнения служил коммерческий набор «РеалБест ВГВ ПЦР» (форма 2) (АО «Вектор-Бест», Россия). Для выделения нуклеиновых кислот использовали набор «РеалБест ДельтаМаг ВГВ/ВГС/ВИЧ» (АО «Вектор-Бест», Россия). Процесс автоматического выделения ДНК проводили на станции Auto-Pure96 (Allsheng, Китай). Для оценки эффективности выделения нуклеиновых кислот в исследуемые образцы плазмы крови человека вносили внутренний контрольный образец.

Результаты. Проведено сравнение разработанной тест-системы с набором «РеалБест ВГВ ПЦР». В результате анализа клинических образцов плазмы крови человека с использованием обеих тест-систем были получены диагностические характеристики разработанной тест-системы. Определена диагностическая чувствительность разработанной тест-системы (96,39%), а также диагностическая специфичность (98,33%).

Выводы. Статистический анализ Бланда–Альтмана показал высокую степень соответствия чувствительности обеих использованных тест-систем. Разработанная тест-система может быть рекомендована для использования в клинической диагностике ВГВ.

Об авторах

А. С. Мороз

ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»; ГК «Алкор Био»

Автор, ответственный за переписку.
Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4693-623X
SPIN-код: 4721-1020

аспирант, Высшая школа биотехнологий и пищевых производств, инженер-исследователь

Россия, 194021, Санкт-Петербург, ул. Новороссийская, 48; 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

В. А. Торопов

ГК «Алкор Био»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0009-0005-1993-5572

ведущий инженер-исследователь

Россия, 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

А. С. Романов

ГК «Алкор Био»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0009-0009-3726-8346

инженер-лаборант

Россия, 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

М. К. Идутова

ГК «Алкор Био»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0009-0002-9104-4457

вед. инженер-исследователь

Россия, 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

А. В. Лисок

ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»; ГК «Алкор Био»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3134-1970

аспирант, Высшая школа биотехнологий и пищевых производств, руководитель лаборатории ПЦР

Россия, 194021, Санкт-Петербург, ул. Новороссийская, 48; 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

В. Н. Большаков

ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»; ГК «Алкор Био»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0009-0007-5126-6035

кандидат биологических наук, доцент, доцент Высшей школы биотехнологий и пищевых производств, руководитель лаборатории молекулярной диагностики

Россия, 194021, Санкт-Петербург, ул. Новороссийская, 48; 192148, Санкт-Петербург, Железнодорожный пр., 40а

Е. Б. Аронова

ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»

Email: anny-nice@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4376-2972
SPIN-код: 7288-6820

кандидат технических наук, доцент, доцент Высшей школы биотехнологий и пищевых производств

Россия, 194021, Санкт-Петербург, ул. Новороссийская, 48

Список литературы

  1. Лялина Л.В., Эсауленко Е.В., Хорькова Е.В. и др. Результаты реализации программы элиминации вирусного гепатита В на Северо-Западе России. Инфекция и иммунитет. 2021; 11(5): 875–886. doi: 10.15789/2220-7619-ROT-1785.
  2. Какорина Е.П., Залевская О.В., Голубев Н.А., Огрызко Е.В. Диамика инфекционной заболеваемости в Российской Федерации за 2000-2020гг. Инфекция и иммунитет. 2022; 5: 875–886. doi: 10.24412/2312-2935-2022-5-65-93.
  3. Серикова Е.Н., Семенов А. В., Останкова Ю. В., Тотолян Арег А. Метод выявления вируса гепатита B в плазме крови при низкой вирусной нагрузке с использованием ПЦР в режиме реального времени. Клиническая лабораторная диагностика. 2021; 66(1): 59–64. doi: 10.18821/0869-2084-2021-66-l-59-64.
  4. Волков А.Н., Начева Л.В. Молекулярно-генетические методы в практике современных медико-биологических исследований. Часть III: генодиагностика человека при решении медицинских задач. Фундаментальная и клиническая медицина. 2021; 6(3): 100–109. doi: 10.23946/2500-0764-2021-6-3-100-109.
  5. Фазылов В.Х., Еремеева Ж.Г., Тураев Р.Г. Пути оптимизации диагностики латентной формы гепатита В у доноров крови. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2023; 12(1): 54–61. doi: 10.33029/2305-3496-2023-12-1-54-61.
  6. Song J.E., Kim D.Y. Diagnosis of hepatitis B. Ann Transl Med 2016; 4(18): 338. doi: 10.21037/atm.2016.09.11.
  7. Zanella I., Rossini A., Domenighini D., Albertini A., Cariani E. Quantitative analysis of hepatitis B virus DNA by real-lime amplification. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2002 Jan; 21(1): 22–26. doi: 10.1007/s10096-001-0648-2.
  8. Ивашкин В.Т., Маевская М.В., Жаркова М.С. и др. Клинические рекомендации Российского общества по изучению печени и Российской гастроэнтерологической ассоциации по диагностике и лечению фиброза и цирроза печени и их осложнений. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2021; 31(6): 56–102. doi: 10.22416/1382-4376-2021-31-6-56-102.
  9. Tan B., Qin L., Chen C. et al. Multiplex fluorescence quantitative polymerase chain reaction for simultaneous detection of hepatitis B virus, hepatitis C virus and human immunodeficiency virus. Clin Lab. 2015; 61(1-2): 53–9. doi: 10.7754/clin.lab.2014.131102.
  10. Безуглова Л.В., Мануйлов В.А., Осипова Л.П. и др. Результаты испытаний реагентов для иммуноферментного определения субтипа HBsAg и генотипа вируса гепатита B в образцах плазмы крови человека. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2020; 38(4): 188–195. doi: 10.17116/molgen202038041188.
  11. Bland J.M., Altman D.G. Statistical methods for assessing agreement between two methods of clinical measurement. Lancet. 1986 Feb 8; 1(8476): 307–310.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».