Влияние гамма-лактонов на рост и химическую коммуникацию у Chromobacterium subtsugae


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Актуальность. Поиск природных соединений, ингибирующих химическую плотностно-зависимую коммуникацию у патогенных бактерий, в настоящее время рассматривается как одно из наиболее перспективных направлений разработки альтернативных средств для антимикробной химиотерапии. Цель работы - скрининг биологической активности химически синтезированных аналогов гамма-лактонов растительного происхождения на модели Chromobacterium subtsugae с системой химической коммуникации, опосредуемой N-гексаноил-L-гомосерин лактоном (С6-АГЛ). Материал и методы. В исследование включены пять гамма-лактонов, содержащих общее пятичленное оксолановое кольцо и отличающихся размером присоединенного к нему линейного алкильного радикала, состоящего из 2, 3, 4, 5 или 8 атомов углерода. Объектом для их воздействия являлась генетически связанная пара штаммов C. subtsugae ATCC 31532 и C. subtsugae NCTC 13274 с полноценным или дефектным образованием С6-АГЛ. Критерием ингибирования химической коммуникации у названных бактерий служило 50%-ное подавление биосинтеза пигмента виолацеина, интенсивность которого прямо пропорциональна активности С6-АГЛ. Результаты. Впервые документировано ингибирующее воздействие гамма-лактонов на химическую коммуникацию у бактерий, развивающееся в диапазонах от 1,04 мг/мл до 0,02 мг/мл на модели C. subtsugae ATCC 31532 и от 0,35 мг/мл до 0,02 мг/мл на модели C. subtsugae NCTC 13274. Выраженность и специфичность подобного эффекта оказались прямо пропорциональными длине линейного алкильного радикала в структуре воздействующих молекул, возрастая в ряду от короткоцепочечного гамма-капролактона к длинноцепочечному гамма-додеканолактону. Выводы. Полученный результат расширяет представления о природе биоактивности лекарственных растений, используемых для терапии инфекционных состояний и имеющих в своём составе соединения из группы гамма-лактонов. Одновременно полученные данные формируют основу для дальнейшего углубленного изучения механизмов биоактивности гамма-лактонов, в том числе - с учетом их структурной близости с Сб-АГЛ, что позволяет предполагать интерференцию между ними в системах химической плотностно-зависимой коммуникации у бактерий.

Об авторах

К. С. Инчагова

ФГБНУ «Федеральный научный центр биологических систем и агротехнологий» Российской академии наук

Email: dgderyabin@yandex.ru

к.б.н

Россия

Г. К. Дускаев

ФГБНУ «Федеральный научный центр биологических систем и агротехнологий» Российской академии наук

Email: dgderyabin@yandex.ru

д.б.н

Россия

Д. Г. Дерябин

ФГБНУ «Федеральный научный центр биологических систем и агротехнологий» Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: dgderyabin@yandex.ru

д.м.н., профессор

Россия, г. Оренбург, Россия

Список литературы

  1. Carey F.A., Giuliano R.M. Organic Chemistry (8th ed.). New-York: McGraw-Hill. 2011; pp. 798-99.
  2. Du Y.L., Shen X.L., Yu P. et al. Gamma-butyrolactone regulatory system of Streptomyces chattanoogensis links nutrient utilization, metabolism, and development. Appl. Environ. Microbiol. 2011; 77(23): 8415-8426.
  3. Gottelt M., Hesketh A., Bunet R. et al. Characterisation of a natural variant of the y-butyrolactone signalling receptor. BMC Res. Notes. 2012; 5: 379.
  4. Lechner D., Stavri M., Oluwatuyi M. et al. The anti-staphylococcal activity of Angelica dahurica (Bai Zhi). Phytochemistry. 2004; 65(3): 331-335.
  5. Whiteley M., Diggle S.P., Greenberg E.P. Progress in and promise of bacterial quorum sensing research. Nature. 2017; 551: 313-320.
  6. Mukherjee S., Bassler B.L. Bacterial quorum sensing in complex and dynamically changing environments. Nat. Rev. Microbiol. 2019; 17: 371-382.
  7. Biarnes-Carrera M., Lee C.K., Nihira T. et al. Orthogonal regulatory circuits for Escherichia coli based on the y-butyrolactone system of Streptomyces coelicolor. ACS Synth. Biol. 2018; 7(4): 1043-1055.
  8. Liu X., Wang W., Li J. et al. A widespread response of Gram-negative bacterial acyl-homoserine lactone receptors to Gram-positive Streptomyces y-butyrolactone signaling molecules. Sci. China. Life. Sci. 2021; 64(10): 1575-1589.
  9. Harrison A.M., Soby S.D. Reclassification of Chromobacterium violaceum ATCC 31532 and its quorum biosensor mutant CV026 to Chromobacterium subtsugae. AMB Express. 2020; 10(1): 202.
  10. Stauff D.L., Bassler B.L. Quorum sensing in Chromobacterium violaceum: DNA recognition and gene regulation by the CviR receptor. J. Bacteriol. 2011; 193(15): 3871-3878.
  11. McClean K.H., Winson M.K., Fish L. et al. Quorum sensing and Chromobacterium violaceum: exploitation of violacein production and inhibition for the detection of N-acylho-moserine lactones. Microbiology (Reading). 1997; 143(12): 3703-3711.
  12. Дерябин Д.Г., Галаджиева А.А., Дускаев Г.К. Скрининг производных N-гексанамида и 2Н-1,3-бензодиаксола как модуляторов «кворум сенсинга» у Chromobacterium violaceum. Микробиология. 2020; 89(6): 728-736

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Механизм образования гамма-лактонов (на примере гамма-бутиролактона)

Скачать (11KB)
3. Рис. 2. Принцип организации плотностно-зависимой химической коммуникации у Chromobacterium subtsugae: а – молекула автоиндуктора С6-АГЛ; б – схема двухкомпонентной автоиндукции с участием синтазы CviI и АГЛ-рецептора CviR

Скачать (29KB)
4. Рис. 3. Зависимости относительных (а) и абсолютных (б) различий между концентрациями МИК50 и EC50 у гамма-лактонов с различным числом атомов углерода в алкильном радикале. Обозначения: по осям абсцисс – число атомов углерода (n); по осям ординат – в части (а) значения МИК50/EC50, в части (б) МИК50 – EC50; черные ромбы – данные, полученные на модели C. subtsugae ATCC 31532, белые ромбы – на модели C. subtsugae NCTC 13274

Скачать (29KB)
5. Таблица 1. Рис. 1

6. Таблица 1. Рис. 2

7. Таблица 1. Рис. 3

8. Таблица 1. Рис. 4

9. Таблица 1. Рис. 5

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».