О новой классификации дерматофитов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

По результатам последних изменений в классификации, семейство Arthrodermataceae может включать уже 9 родов и 79 видов. Дерматофиты, ассоциированные с поверхностными инфекциями человека и животных, относятся к родам Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton, в то время как рода Arthroderma, Ctenomyces, Guarromyces, Lophophyton, Nannizzia и Paraphyton представлены преимущественно геофильными видами. Поскольку признаки морфологии и физиологии грибов не являются надёжным критерием классификации, современная система дерматофитов была выстроена на основе филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей. В новой классификации дерматофитов закреплён принцип «один гриб ― одно название», согласно которому генетически сходные совершенные и несовершенные формы относятся к одним и тем же видам.

На современном этапе развития геносистематики достоверное определение таксономической принадлежности дерматофитов в большинстве случаев требует применения молекулярных методов идентификации, в частности секвенирования ДНК по региону ITS.

В настоящем обзоре мы кратко рассматриваем историю классификации, приводим сводку родового и видового состава дерматофитов с данными по экологии возбудителей, номерами доступа референтных последовательностей региона ITS и ссылками на основные таксономические публикации.

Об авторах

Иван Михайлович Пчелин

Институт экспериментальной медицины

Автор, ответственный за переписку.
Email: arcella.oraia@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-3062-3316
SPIN-код: 9594-5250

MD

Россия, Санкт-Петербург

Алексей Юрьевич Сергеев

Новосибирский государственный университет; Национальная академия микологии

Email: myco@iaci.ru
ORCID iD: 0000-0001-9061-1347
SPIN-код: 9518-8447

д.м.н., профессор

Россия, Новосибирск; Москва

Список литературы

  1. Сергеев В.Ю., Сергеев А.Ю. Дерматофитии: новое в диагностике, терапии и профилактике наиболее распространенных микозов человека // Дерматология. Приложение к журналу Consilium Medicum. 2008. № 1. С. 30–35.
  2. Ameen M. Epidemiology of superficial fungal infections // Clin Dermatol. 2010. Vol. 28, N 2. Р. 197–201. doi: 10.1016/j.clindermatol.2009.12.005
  3. Martinez-Rossi N.M., Peres N.T., Bitencourt T.A., et al. State-of-the-art dermatophyte infections: epidemiology aspects, pathophysiology, and resistance mechanisms // J Fungi. 2021. Vol. 7, N 8. Р. 629. doi: 10.3390/jof7080629
  4. Taghipour S., Pchelin I.M., Zarei Mahmoudabadi A., et al. Trichophyton mentagrophytes and T interdigitale genotypes are associated with particular geographic areas and clinical manifestations // Mycoses. 2019. Vol. 62, N 11. Р. 1084–1091. doi: 10.1111/myc.12993
  5. Čmoková A., Kolařík M., Dobiáš R., et al. Resolving the taxonomy of emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex // Fungal Diversity. 2020. Vol. 104, N 1. Р. 333–387. doi: 10.1007/s13225-020-00465-3
  6. Сергеев А.Ю., Бурова С.А., Касихина Е.И. Дерматомикозы в эпоху пандемии // Иммунопатология, аллергол, инфектол. 2021. № 1. С. 79–96. doi: 10.14427/jipai.2021.1.79
  7. Gruby D. Recherches sur la nature, le siège et le développement du Porrigo decalvans ou Phytoalopécie, pochette deséance du 14 août 1843, consultable aux AAS et CRAS, vol. XVII. 1842. Р. 301−303.
  8. Ainsworth G.C. Introduction to the history of medical and veterinary mycology. Cambridge University Press, 1986. 228 р.
  9. De Hoog G.S., Dukik K., Monod M., et al. Toward a novel multilocus phylogenetic taxonomy for the dermatophytes // Mycopathologia. 2017. Vol. 182, N 1-2. Р. 5–31. doi: 10.1007/s11046-016-0073-9
  10. Елинов Н.П. Николай Васильевич Сорокин ― основоположник медицинской микологии в России // Проблемы медицинской микологии. 1999. Т. 1, № 1. С. 2–8.
  11. Гусаков Н.И. История отечественной дерматовенерологии. Москва: Авваллон, 2007. 153−169 с.
  12. 12. Castellani A. Observation on a new species of Epidermophyton found in tinea cruris // Br J Dermatol. 1910. Vol. 5. Р. 148–150.
  13. Sabouraud R. Les Teignes. Paris: Masson, 1910.
  14. Chabasse D., Bouchara J.P. Taxonomie des dermatophytes: de Raymond Sabouraud à nos jours // Revue Francophone des Laboratoires. 2022. Vol. 2022, N 539. Р. 22–30.
  15. Emmons C.W. Dermatophytes: natural grouping based on the form of the spores and accessory organs // Archives Dermatol Syphilol. 1934. Vol. 30, N 3. Р. 337–362.
  16. Langeron M., Milochevitch S. Morphologie des dermatophytes // Ann Parasitol Hum Comp. 1930. Vol. 8, N 3-4. Р. 465−508.
  17. Josserand M., Langeron M., Vanbreuseghem R. Précis de Mycologie, 1952 // Publications de la Société Linnéenne de Lyon. 1952. Vol. 21, N 9. Р. 231–232.
  18. Гитман С.М. Библиографический указатель русской дерматологии и венерологии за 1900–1931 гг. Москва: Биомедгиз, 1935.
  19. Подвысоцкая О.Н., Кашкин П.Н. Руководство по исследованию дерматомицетов. Ленинград-Москва: Медгиз, 1931. 112 с.
  20. Кашкин П.Н. Изменчивость дерматофитов и перспектива ее дальнейшего изучения // Вестник дерматологии и венерологии. 1949. № 3. C. 8–13.
  21. Кашкин П.Н. Об одном интересном феномене в культурах дерматофитов // Экспериментальные и клинические исследования. 1954. № 10. C. 177–178.
  22. Аравийский А.Н. Исследования советскими микологами патогенных грибков в свете принципов материалистической биологии. Экспериментальные и клинические исследования // Вопросы дерматомикологии. 1956. Т. 11. C. 44–47.
  23. Ариевич А.М., Степанищева З.Г. Атлас грибковых заболеваний кожи. Москва: Медгиз, 1951. 255 с.
  24. Кашкин П.Н., Шеклаков Н.Д. Руководство по медицинской микологии. Москва: Медицина, 1978. 328 с.
  25. Stockdale P.M. Nannizzia incurvata gen. nov., sp. nov., a perfect state of Microsporum gypseum (Bodin) Guiart et Grigorakis // Sabouraudia. 1961. Vol. 1. Р. 41–48. doi: 10.1080/00362176285190101
  26. Weitzman I., Summerbell R.C. The dermatophytes // Clin Microbiol Rev. 1995. Vol. 8, N 2. Р. 240–259. doi: 10.1128/CMR.8.2.240
  27. Harmsen D., Schwinn A., Weig M., et al. Phylogeny and dating of some pathogenic keratinophilic fungi using small subunit ribosomal RNA // J Med Vet Mycol. 1995. Vol. 33, N 5. Р. 299–303. doi: 10.1080/02681219580000611
  28. Gräser Y., Scott J., Summerbell R. The new species concept in dermatophytes-a polyphasic approach // Mycopathologia. 2008. Vol. 166, N 5-6. Р. 239–256. doi: 10.1007/s11046-008-9099-y
  29. Schoch C.L., Seifert K.A., Huhndorf S., et al. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi // Proc Natl Acad Sci USA. 2012. Vol. 109, N 16. Р. 6241–6246. doi: 10.1073/pnas.1117018109
  30. Diongue K., Bréchard L., Diallo M.A., et al. A comparative study on phenotypic versus ITS-based molecular identification of dermatophytes isolated in Dakar, Senegal // Int J Microbiol. 2019. Vol. 2019. Р. 6754058. doi: 10.1155/2019/6754058
  31. Дьяков Ю.Т., Шнырева А.В., Сергеев А.Ю. Введение в генетику грибов. Москва: Академия, 2005. 304 с.
  32. Kandemir H., Dukik K., de Melo Teixeria M., et al. Phylogenetic and ecological reevaluation of the order Onygenales // Fungal Diversity. 2022. N 5. Р. 23. doi: 10.1007/s13225-022-00506-z
  33. Shamsizadeh F., Pchelin I.M., Makimura K., et al. DNA topoisomerase 2 gene polymorphism in dermatophytes // Mycoses. 2020. Vol. 63, N 7. Р. 694–703. doi: 10.1111/myc.13086
  34. Пиневич, А.В. Микробиология. Биология прокариотов. Т. 1. Санкт-Петербург: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2007.
  35. Turner D., Kropinski A.M., Adriaenssens E.M. A roadmap for genome-based phage taxonomy // Viruses. 2021. Vol. 13, N 3. Р. 506. doi: 10.3390/v13030506
  36. Su H., Packeu A., Ahmed S.A., et al. Species distinction in the Trichophyton rubrum complex // J Clin Microbiol. 2019. Vol. 57, N 9. Р. e00352-19. doi: 10.1128/JCM.00352-19
  37. Kandemir H., Dukik K., Hagen F., et al. Polyphasic discrimination of Trichophyton tonsurans and T. equinum from humans and horses // Mycopathologia. 2020. Vol. 185, N 1. Р. 113–122. doi: 10.1007/s11046-019-00344-9
  38. Tang C., Kong X., Ahmed S.A., et al. Taxonomy of the Trichophyton mentagrophytes / T. interdigitale species complex harboring the highly virulent, multiresistant genotype T. indotineae // Mycopathologia. 2021. Vol. 186, N 3. Р. 315–326. doi: 10.1007/s11046-021-00544-2
  39. De Hoog G.S., Ahmed A., Danesi P., et al. Distribution of pathogens and outbreak fungi in the fungal kingdom. In: Seyedmousavi S., de Hoog G., Guillot J., Verweij P., eds. Emerging and epizootic fungal infections in animals. Springer, Cham, 2018. doi: 10.1007/978-3-319-72093-7
  40. Белов А.Б. Вероятные перспективы развития экологической классификации инфекционных болезней человека по резервуарам возбудителей (взгляд эпидемиолога) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2013. № 1. C. 6–14.
  41. Hubka V., Peano A., Cmokova A., Guillot J. Common and emerging dermatophytoses in animals: well-known and new threats. In: S. Seyedmousavi, et al. Emerging and epizootic fungal infections in animals. Springer International Publishing AG, 2018. Р. 31–79. doi: 10.1007/978-3-319-72093-7_3
  42. Пчелин И.М., Сергеев А.Ю. О таксономическом положении видов комплекса Trichophyton mentagrophytes // Иммунопатология, аллергол, инфектол. 2022. № 1. С. 46–52. doi: 10.14427/jipai.2022.1.46
  43. Hubka V., Dobiašova S., Dobiaš R., Kolařik M. Microsporum aenigmaticum sp. nov. from M. gypseum complex, isolated as a cause of tinea corporis // Med Mycol. 2014. Vol. 52, N 4. Р. 387–396. doi: 10.1093/mmy/myt033
  44. Lorch J.M., Minnis A.M., Meteyer C.U., et al. The fungus Trichophyton redellii sp. nov. causes skin infections that resemble white-nose syndrome of hibernating bats // J Wildl Dis. 2015. Vol. 51, N 1. Р. 36–47. doi: 10.7589/2014-05-134
  45. Sharma R., Shouche Y. Nannizzia graeserae sp. nov., a new dermatophyte of geophilic clade isolated from vicinity of a barbershop in India // Kavaka. 2018. Vol. 50. Р. 14–20.
  46. Čmoková A., Rezaei-Matehkolaei A., Kuklová I., et al. Discovery of new Trichophyton members, T. persicum and T. spiraliforme spp. nov., as a cause of highly inflammatory tinea cases in Iran and Czechia // Microbiol Spectr. 2021. Vol. 9, N 2. Р. e0028421. doi: 10.1128/Spectrum.00284-21
  47. De Hoog G.S., Guarro J., Gené J., et al. Atlas of clinical fungi, 4th edition. Hilversum, 2020.
  48. Chen M., Zeng J., de Hoog G.S., et al. The ‘species complex’ issue in clinically relevant fungi: a case study in Scedosporium apiospermum // Fungal Biol. 2016. Vol. 120, N 2. Р. 137–146. doi: 10.1016/j.funbio.2015.09.003
  49. Pchelin I.M., Mochalov Y.V., Azarov D.V., et al. Genotyping of Russian isolates of fungal pathogen Trichophyton rubrum, based on simple sequence repeat and single nucleotide polymorphism // Mycoses. 2020. Vol. 63, N 11. Р. 1244–1254. doi: 10.1111/myc.13162
  50. Медведева Т.В., Чилина Г.А., Пчелин И.М., Рублева И.А. Отечественный опыт определения «нового» патогена Trichophyton benhamiae // Успехи медицинской микологии. 2019. № 20. С. 101–103.
  51. Pchelin I.M., Azarov D.V., Churina M.A., et al. Species boundaries in the Trichophyton mentagrophytes / T. interdigitale species complex // Med Mycol. 2019. Vol. 57, N 6. Р. 781–789. doi: 10.1093/mmy/myy115
  52. Савинов В.А., Овчинников Р.С., Южаков А.Г., и др. Новые виды возбудителей в этиологии дерматофитозов животных-компаньонов в Московском регионе // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. 2021. № 9. С. 15–25. doi: 10.36871/vet.zoo.bio.202109002
  53. Серебрякова И.С., Корнишева В.Г., Раводин Р.А., и др. Микоз кожи, вызванный Nannizzia incurvata (ранее Microsporum incurvatum): описание редкого клинического случая // Проблемы медицинской микологии. 2019. Т. 21, № 1. С. 16–20.
  54. Gräser Y., Kuijpers A.F., el Fari M., et al. Molecular and conventional taxonomy of the Microsporum canis complex // Med Mycol. 2000. Vol. 38, N 2. Р. 143–153. doi: 10.1080/mmy.38.2.143.153
  55. Kaszubiak A., Klein S., de Hoog G.S., Gräser Y. Population structure and evolutionary origins of Microsporum canis, M. ferrugineum and M. audouinii // Infect Genet Evol. 2004. Vol. 4, N 3. Р. 179–186. doi: 10.1016/j.meegid.2003.12.004
  56. Uhrlaß S., Sitaru C., Scholz C., et al. Microsporum ferrugineum: the renaissance of a forgotten dermatophyte. In: Bouchara J.P., Nenoff P., Gupta A.K., et al. Dermatophytes and Dermatophytoses. Springer, Cham., 2021. doi: 10.1007/978-3-030-67421-2_11
  57. Медведева Т.В., Леина Л.М., Чилина Г.А., и др. Микроспория: современное представление о проблеме (описание клинических случаев и обзор литературы) // Проблемы медицинской микологии. 2020. Т. 22, № 2. C. 12–21.
  58. Brito-Santos F., Figueiredo-Carvalho M.H., Coelho R.A., et al. Tinea capitis by Microsporum audouinii: case reports and review of published global literature 2000−2016 // Mycopathologia. 2017. Vol. 182, N 1-2. Р. 1053−1060. doi: 10.1007/s11046-017-0181-1
  59. Сергеев А.Ю., Сергеев Ю.В. Порядок Onygenales и медицинская микология. В кн.: Новое в систематике и номенклатуре грибов / под. ред. Ю.Т. Дьякова и Ю.В. Сергеева. Москва: Медицина для всех, 2003. 496 с.
  60. Sharma R., Shouche Y.S. Diversity of onygenalean fungi in keratin-rich habitats of Maharashtra (India) and description of three novel taxa // Mycopathologia. 2020. Vol. 185, N 1. Р. 67–85. doi: 10.1007/s11046-019-00346-7
  61. Сергеев Ю.В., Бунин В.М., Сергеев А.Ю., и др. Поликлинические микозы // Кремлевская медицина. 2010. № 5. С. 24–29.
  62. Pchelin I.M., Zlatogursky V.V., Rudneva M.V., et al. Reconstruction of phylogenetic relationships in dermatomycete genus Trichophyton Malmsten 1848 based on ribosomal internal transcribed spacer region, partial 28S rRNA and beta-tubulin genes sequences // Mycoses. 2016. Vol. 59, N 9. Р. 566–575. doi: 10.1111/myc.12505
  63. Ларионов М.Д., Чилина Г.А., Богданова Т.В., Пчелин И.М. Редкий клинический случай дерматомикоза гладкой кожи и крупных складок, вызванного грибом Trichophyton mentagrophytes экзотического генотипа // Проблемы медицинской микологии. 2017. Т. 19, № 2. С. 95.
  64. Cornet L., D’hooge E., Magain N., et al. The taxonomy of the Trichophyton rubrum complex: a phylogenomic approach // Microb Genom. 2021. Vol. 7, N 11. Р. 000707. doi: 10.1099/mgen.0.000707
  65. Beguin H., Pyck N., Hendrickx M., et al. The taxonomic status of Trichophyton quinckeanum and T. interdigitale revisited: a multigene phylogenetic approach // Med Mycol. 2012. Vol. 50, N 8. Р. 871–882. doi: 10.3109/13693786.2012.684153
  66. Rezaei-Matehkolaei A., Makimura K., de Hoog G.S., et al. Multilocus differentiation of the related dermatophytes Microsporum canis, Microsporum ferrugineum and Microsporum audouinii // J Med Microbiol. 2012. Vol. 61, Pt 1. Р. 57–63. doi: 10.1099/jmm.0.036541-0
  67. Hainsworth S., Kučerová I., Sharma R., et al. Three-gene phylogeny of the genus Arthroderma: basis for future taxonomic studies // Med Mycol. 2021. Vol. 59, N 4. Р. 355–365. doi: 10.1093/mmy/myaa057
  68. Zhang Z.Y., Han Y.F., Chen W.H., Liang Z.Q. Phylogeny and taxonomy of three new Ctenomyces (Arthrodermataceae, Onygenales) species from China // MycoKeys. 2019. N 47. Р. 1–16. doi: 10.3897/mycokeys.47.30740
  69. Dukik K., de Hoog G.S., Stielow J.B., et al. Molecular and phenotypic characterization of Nannizzia (Arthrodermataceae) // Mycopathologia. 2020. Vol. 185, N 1. Р. 9–35. doi: 10.1007/s11046-019-00336-9

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Пчелин И.М., Сергеев А.Ю., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах