Отправить статью по E-mail Видовой спектр микроорганизмов, выделенных у пациентов госпиталя COVID-19 многопрофильного федерального медицинского учреждения
- Авторы: Петрова Л.В.1,2, Миронов А.Ю.2,3, Гусаров В.Г.1, Камышова Д.А.1, Хакулова А.Э.1, Замятин М.Н.1, Суранова Т.Г.3
-
Учреждения:
- Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова
- Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского
- Академия постдипломного образования Федерального научно-клинического центра специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий
- Выпуск: Том 26, № 6 (2021)
- Страницы: 270-282
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- URL: https://journals.rcsi.science/1560-9529/article/view/109205
- DOI: https://doi.org/10.17816/EID109205
- ID: 109205
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Только для подписчиков
Аннотация
Обоснование. Несмотря на доказанную важность вторичных бактериальных инфекций, влияющих на тяжесть вирусных респираторных заболеваний, их этиология всё ещё недостаточно изучена. Существует пробел в знаниях о природе, частоте и профилях антимикробной устойчивости бактериальных патогенов в нынешней пандемии COVID-19.
Цель исследования — описать видовой спектр микроорганизмов у пациентов госпиталя COVID-19 на базе многопрофильного федерального медицинского учреждения.
Материалы и методы. Получены и обработаны клинические образцы (кровь, отделяемое нижних дыхательных путей, моча, прочие биологические материалы) пациентов с COVID-19, находившихся на лечении в условиях госпиталя COVID-19 на базе многопрофильного федерального медицинского учреждения.
Результаты. В бактериологическую лабораторию поступила 1821 проба биоматериалов от 452 пациентов, микроорганизмы выделены из 620 (38,0%) проб. БÓльшая часть биоматериала была представлена кровью — 35,9% и отделяемым нижних дыхательных путей — 31,7%. В структуре микроорганизмов доминировали Candida albicans — 19,7%, Staphylococcus aureus — 10,2%, Klebsiella pneumoniae — 10,1%, Enterococcus faecalis — 7,9%. В начале периода работы госпиталя наиболее часто идентифицируемыми микроорганизмами были S. aureus и Haemophilus influenzae — 19,7 и 7,9% соответственно, в то время как в заключительном периоде произошла смена спектра микроорганизмов на нозокомиальные ESKAPE-патогены с множественной лекарственной устойчивостью: в структуре доминировал Acinetobacter baumannii — 24,3%. Потребление антибиотиков в стационаре выросло с 18,3 DDD/100 пациенто-дней в 2019 г. до 28,8 DDD/100 пациенто-дней в 2020 г.
Заключение. Выявлена значимая колонизация различных локусов пациентов с COVID-19 грибами рода Candida. Произошла смена микробного спектра возбудителей инфекций от внебольничных (H. influenzae и S. pneumoniae) до нозокомиальных ESKAPE-патогенов с множественной лекарственной устойчивостью. Значимо возросло потребление антибиотиков.
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Людмила Викторовна Петрова
Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова; Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского
Email: PetrovaLV@pirogov-center.ru
ORCID iD: 0000-0001-6221-9743
SPIN-код: 7042-9620
Россия, Москва; Москва
Андрей Юрьевич Миронов
Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского; Академия постдипломного образования Федерального научно-клинического центра специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий
Email: andy.60@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8544-5230
SPIN-код: 9225-1560
д.м.н., профессор
Россия, Москва; МоскваВиталий Геннадьевич Гусаров
Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова
Email: gusarovvg@pirogov-center.ru
ORCID iD: 0000-0002-2900-1459
SPIN-код: 9668-5339
д.м.н., доцент
Россия, МоскваДарья Андреевна Камышова
Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова
Email: d.a.kamyshova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3084-9294
SPIN-код: 1066-2506
Россия, Москва
Алина Эдуардовна Хакулова
Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова
Email: alina.khakulova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1257-8937
SPIN-код: 3961-2856
Россия, Москва
Михаил Николаевич Замятин
Национальный медико-хирургический центр имени Н.И. Пирогова
Автор, ответственный за переписку.
Email: zamyatinmn@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2072-7798
SPIN-код: 5228-8664
д.м.н., профессор
Россия, МоскваТатьяна Григорьевна Суранова
Академия постдипломного образования Федерального научно-клинического центра специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий
Email: suranovatatiana@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3411-1027
SPIN-код: 7326-5273
к.м.н., доцент
Россия, Москва
Список литературы
- Kannan S., Shaik Syed Ali P., Sheeza A., Hemalatha K. COVID-19 (Novel Coronavirus 2019) — recent trends // Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2020. Vol. 24, N 4. P. 2006–2011. doi: 10.26355/eurrev_202002_20378
- Sifuentes-Rodríguez E., Palacios-Reyes D. COVID-19: The outbreak caused by a new coronavirus // Bol Med Hosp Infant Mex. 2020. Vol. 77, N 2. P. 47–53. doi: 10.24875/BMHIM.20000039
- Sharma B., Sreenivasan P., Biswal M., et al. Bacterial coinfections and secondary infections in COVID-19 patients from a tertiary care hospital of northern India: Time to adhere to culture-based practices // Qatar Med J. 2021. N 3. P. 62. doi: 10.5339/qmj.2021.62
- Кузьменков А.Ю., Виноградова А.Г., Трушин И.В., и др. AMRcloud: новая парадигма мониторинга антибиотикорезистентности // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019. Т. 21, № 2. С. 119–124. doi: 10.36488/cmac.2019.2.119-124
- Archive of EUCAST tables and documents [интернет]. [дата обращения: 02.09.2022]. Доступ по ссылке: https://www.eucast.org/ast_of_bacteria/previous_versions_of_documents/.
- Wang Y., Wang Y., Chen Y., Qin Q. Unique epidemiological and clinical features of the emerging 2019 novel coronavirus pneumonia (COVID-19) implicate special control measures // J Med Virol. 2020. Vol. 92, N 6. P. 568–576. doi: 10.1002/jmv.25748
- Garcia-Vidal C., Sanjuan G., Moreno-García E., et al.; COVID-19 Researchers Group. Incidence of co-infections and superinfections in hospitalized patients with COVID-19: a retrospective cohort study // Clin Microbiol Infect. 2021. Vol. 27, N 1. P. 83–88. doi: 10.1016/j.cmi.2020.07.041
- Boucher H.W., Talbot G.H., Bradley J.S., et al. Bad bugs, no drugs: no ESKAPE! An update from the Infectious Diseases Society of America // Clin Infect Dis. 2009. Vol. 48, N 1. P. 1–12. doi: 10.1086/595011
- Yu D., Ininbergs K., Hedman K., et al. Low prevalence of bloodstream infection and high blood culture contamination rates in patients with COVID-19 // PLoS One. 2020. Vol. 15, N 11. P. e0242533. doi: 10.1371/journal.pone.0242533
- Карпов О.Э., Гусаров В.Г., Замятин М.Н., и др. Управление антибиотикорезистентностью в стационаре: современные реалии и перспективы // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2020. Т. 22, № 4. С. 277–286. doi: 10.36488/cmac.2020.4.277-286
- Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В., и др.; Исследовательская группа «ДАРМИС-2018». Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС-2018» // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019. Т. 21, № 2. С. 134–146. doi: 10.36488/cmac.2019.2.134-146
- Martinez-Guerra B.A., Gonzalez-Lara M.F., de-Leon-Cividanes N.A., et al. Antimicrobial Resistance Patterns and Antibiotic Use during Hospital Conversion in the COVID-19 Pandemic // Antibiotics (Basel). 2021. Vol. 10, N 2. P. 182. doi: 10.3390/antibiotics10020182
- Langford B.J., So M., Raybardhan S., et al. Antibiotic prescribing in patients with COVID-19: rapid review and meta-analysis // Clin Microbiol Infect. 2021. Vol. 27, N 4. P. 520–531. doi: 10.1016/j.cmi.2020.12.018
- Mirzaei R., Goodarzi P., Asadi M., et al. Bacterial co-infections with SARS-CoV-2 // IUBMB Life. 2020. Vol. 72, N 10. P. 2097–2111. doi: 10.1002/iub.2356
Дополнительные файлы
