The Development of Segmentation Algorithms in Holographic Microscopy and Tomography for Determination of Morphological Parameters of Cells


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Algorithms of cell segmentation on two-dimensional phase images and three-dimensional distributions of a refractive index obtained by means of digital holographic microscopy and tomography are developed. The proposed algorithms are optimized for determining cell morphology characteristics including the cell volume, projection area, and surface area. A comparative analysis of the error of cell volume determination by holographic methods using the proposed cell segmentation algorithms and the standard method of confocal fluorescence microscopy has been performed.

Об авторах

A. Belashov

Ioffe Institute, Russian Academy of Sciences

Автор, ответственный за переписку.
Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194021

D. Gorbenko

Ioffe Institute, Russian Academy of Sciences; ITMO University

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194021; St. Petersburg, 197101

A. Zhikhoreva

Ioffe Institute, Russian Academy of Sciences

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194021

T. Belyaeva

Institute of Cytology, Russian Academy of Sciences

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194064

E. Kornilova

Institute of Cytology, Russian Academy of Sciences

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194064

I. Semenova

Ioffe Institute, Russian Academy of Sciences

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194021

O. Vasyutinskii

Ioffe Institute, Russian Academy of Sciences

Email: belashov.andrey.93@gmail.com
Россия, St. Petersburg, 194021

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2019

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).