Noninvasive Prenatal Testing Using Next Generation Sequencing: Pilot Experience of the D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

In recent years, noninvasive prenatal testing (NIPT) for fetal chromosomal abnormalities has come into wide use. NIPT allows detection of fetal chromosomal abnormalities without invasive sampling of fetal material: by analyzing cell-free fetal DNA in maternal blood. Here, we report on the pilot results of using NIPT at the D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology (St. Petersburg, Russia). The results obtained in 149 blood samples from pregnant women proved the clinical value of NIPT for detection of fetal trisomies 21, 18, and 13. Aneuploidy was detected in 20 out of 149 samples. Among these 20 aneuploid cases, trisomy 21 amounted to 60%, trisomy 18 – to 25%, and trisomy 13 to 5% of cases. In one sample, double aneuploidy involving chromosomes 13 and 21 was detected, and in one case, trisomy X was identified. In 100% of cases, aneuploidies were confirmed by prenatal karyotyping advocating for the absence of false positive NIPT results. The observed high specificity was consistent with the declared test specificity level of >99.9%. The sensitivity of the method was 100%. To summarize, NIPT is a new reliable technique that will probably soon replace the conventional first trimester combined screening. The only disadvantages of implementing NIPT in Russia are its relatively high cost and the lack of coverage by insurance companies. NGS-based NIPT is suitable for clinical practice and will be widely deployed due to a further cost decrease.

Ключевые слова

Об авторах

T. Ivashchenko

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Автор, ответственный за переписку.
Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

E. Vashukova

ООО NIPT

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199106

P. Kozyulina

ООО NIPT

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199106

N. Dvoynova

ООО NIPT

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199106

O. Talantova

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Koroteev

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Pendina

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Tikhonov

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

O. Chiryaeva

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

L. Petrova

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

V. Dudkina

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

O. Efimova

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

V. Baranov

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

A. Glotov

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology

Email: tivashchenko2011@mail.ru
Россия, St. Petersburg, 199034

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2019

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».