New Gene of Aminoglycoside Phosphotransferase aph(3'')-Id from Streptomyces rimosus ATCC10970, Encoding Streptomycin Resistance


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Previously, in the strain Streptomyces rimosus ATCC10970 (producer of oxytetracycline), the aminoglycoside phosphotransferase AphVIII, determining kanamycin, neomycin, and paromomycin resistance, was identified and characterized. Recently, the authors obtained the 3D structure of AphVIII. The 14 aph genes, including gene aphVIII, were annotated when the genome of S. rimosus ATCC10970 was sequenced. In the present study, a new aph(3'')-Id (aphSR3) gene encoding streptomycin phosphotansferase was first identified in the strain of S. rimosus ATCC10970 using bioinformatic and comparative phylogenetic analysis of the aphSR1-aphSR14 genes with the previously known aph genes from clinical isolates and producer strains of aminoglycoside antibiotics belonging to seven subfamilies. When cloning, it was found that the gene aphSR3 (aph(3'')-Id) in Escherichia coli causes resistance to streptomycin at a concentration of 150 μg/mL. The obtained data can be used in practical terms to study the distribution and features of the functions of genes that determine the natural resistance to aminoglycoside antibiotics in actinobacteria of the genus Streptomyces.

Об авторах

M. Alekseeva

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119991

N. Rudakova

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119991

N. Zakharevich

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119991

D. Mavletova

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119991

K. Boyko

Bach Institute of Biochemistry, Federal Research Centre of Biotechnology,
Russian Academy of Sciences; National Research Center Kurchatov Institute

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119071; Moscow, 123182

A. Nikolaeva

National Research Center Kurchatov Institute

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 123182

D. Korzhenevskiy

National Research Center Kurchatov Institute

Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 123182

V. Danilenko

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Автор, ответственный за переписку.
Email: valerid@vigg.ru
Россия, Moscow, 119991

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».