Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
ISSN (print): 0372-9311, ISSN (online): 2686-7613 Учредители: Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора, Всероссийское научно-практическое общество эпидемиологов, микробиологов и паразитологов Главный редактор: Зверев Виталий Васильевич, академик РАН, д-р биол. наук, профессор Периодичность / доступ: 6 выпусков в год / открытый Входит в: Белый список (2 уровень), перечень ВАК, РИНЦ
Central Research Institute for Epidemiology
Фактом подачи статьи и сопровождающих файлов (далее – «Произведение») к публикации в журнале автор (а также все авторы данного произведения, если оно создано в соавторстве) согласен с тем, что предоставляет Издательству «ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора» исключительное и бессрочное право использования произведения на безвозмездной основе (исключительную, бессрочную и безвозмездную лицензию) на территории России и зарубежных стран в следующих пределах и объёме: на публикацию произведения в бумажном и/или электронном формате, производство репринтов произведения, размещение его в сети Интернет, как в открытом, так и платном доступе, отправку метаданных произведения или полных текстов в различные индексирующие базы данных и депозитарии; воспроизведение произведения, то есть изготовление одного и более экземпляра произведения или его части в любой материальной форме, в том числе в форме звуко- или видеозаписи. При этом запись произведения на электронном носителе, в том числе запись в память ЭВМ, также считается воспроизведением; распространение произведения путем продажи или иного отчуждения его оригинала или экземпляров; импорт-экспорт произведения или его частей в любых законных целях как на платной так и на безвозмездной основе оригинала или экземпляров произведения в целях распространения; перевод или другая переработка произведения; размещение произведения, либо его частей в различных сборниках аналогичных произведений; предоставление прав, предусмотренных настоящей статьёй, в полном объёме или в части третьим (физическим и юридическим) лицам как на платной, так и на безвозмездной основе. Авторские экземпляры не предусмотрены. Авторы, подающие статью для публикации в данном журнале, соглашаются со следующим: Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале. Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале. Авторы имеют право размещать свою работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (см. The Effect of Open Access). Выполнение требований Политики размещения препринтов и постпринтов – обязательно.
ПОЭМА: ПОпуляционная Эпидемиологическая Модель Агентная для прогноза эффективности противоэпидемических мероприятий в Российской Федерации
Введение. Пандемия COVID-19 выявила целый комплекс проблем, связанных с математическим моделированием эпидемического процесса и оценкой эффекта от проводимых профилактических и противоэпидемических мероприятий в современном сложноорганизованном обществе. Вместе с этим накопление значительных массивов фактических данных дало импульс активному развитию агентных моделей, в которых каждый агент (условный человек) имеет уникальный набор характеристик и способов взаимодействия, определяемых на основе реальных социологических и демографических данных. Цели и задачи. Разработка и демонстрация возможностей эпидемиологической агентной модели ПОЭМА (ПОпуляционная Эпидемиологическая Модель Агентная). Материалы и методы. Платформа ПОЭМА разработана на исходном коде одной из наиболее широко используемых во всем мире агентной модели Covasim с учетом демографических и организационно-административных условий, характерных для Российской Федерации. Результаты. Вычислительные эксперименты показали, что из-за индивидуальной вариабельности в динамике развития инфекции и особенностей регистрации заболеваемости даже массовые мероприятия хотя и приводят к фактическому увеличению числа инфицированных, но не оказывают существенного влияния на форму кривой регистрируемой заболеваемости. Показано, что транспортные потоки между городами на уровне 0,1% населения в день оказывают минимальный эффект на динамику развития эпидемии, в то время как эффект от перетока 1% населения в день резко снижает эффект от введения строгих противоэпидемических мероприятий, проводимых только в одном отдельно взятом городе. На примере Воронежской области проведено моделирование смены циркулирующего варианта SARS-CoV-2 с Дельта на Omicron в начале 2022 г. и показана высокая степень корреляции между модельной динамикой и наблюдаемым в реальности соотношением вариантов вируса. Заключение. Модель реализована полностью в Российском контуре на сервере НИИ системной биологии и медицины Роспотребнадзора и может быть использована для проведения цифровых эпидемиологических экспериментов с целью прогноза эффективности предполагаемых к проведению противоэпидемических мероприятий.
© Попова А.Ю., Аюпова А.Ф., Говорун В.М., Горбачёва А.А., Ильина Е.Н., Качалов В.Н., Козлов И.Е., Клочков К.А., Кутырев В.В., Лукашев А.Н., Манолов А.И., Маслова И.И., Самойлов А.Е., Сафронов В.А., Цуркис В.И., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Ассоциация полиморфных вариантов гена TRIM22 (N155D и T242R) с ВИЧ-инфекцией в Северо-Западном федеральном округе России
Введение. Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) остается глобальной проблемой здравоохранения. Ген TRIM22, кодирующий белок с противовирусной активностью, является перспективным кандидатом для исследований, однако его роль в патогенезе ВИЧ-инфекции в популяциях Российской Федерации ранее не изучалась. Целью работы был анализ полиморфных вариантов rs7935564 (N155D) и rs1063303 (T242R) гена TRIM22 у ВИЧ-инфицированных лиц в Северо-Западном федеральном округе. Материалы и методы. Проведён анализ полиморфных вариантов rs7935564 (N155D) и rs1063303 (T242R) гена TRIM22 в группах ВИЧ-инфицированных лиц с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии (n = 378) и практически здоровых лиц (n = 319). Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием. Статистический анализ включал проверку соответствия распределения генотипов равновесию Харди–Вайнберга, оценку ассоциаций по 3 моделям наследования (доминантной, рецессивной, аддитивной) с расчётом отношения шансов (OШ) и 95% доверительного интервала (ДИ), анализ неравновесия сцепления и частот гаплотипов. Результаты. Распределение генотипов для анализируемых полиморфных вариантов соответствовало равновесию Харди–Вайнберга (p > 0,05). Выявлена достоверная ассоциация аллеля G полиморфизма rs7935564 с наличием ВИЧ-инфекции в рецессивной (OШ = 1,76) и аддитивной (OШ = 1,37) моделях наследования. Для полиморфизма rs1063303 значимая ассоциация наблюдалась только в доминантной модели (OШ = 1,40). Обнаружено умеренное неравновесие сцепления между локусами (D’ = 0,4478; r² = 0,1572; p < 0,001). Гаплотип G-G (rs7935564_G — rs1063303_G) был ассоциирован с наличием инфекции (OШ = 1,57). Заключение. В российской популяции полиморфный вариант rs7935564 (N155D) гена TRIM22 является значимым генетическим фактором ассоциации с ВИЧ-инфекцией, в то время как для rs1063303 (T242R) получены статистически неоднозначные результаты. Ассоциация гаплотипа G-G с наличием инфекции свидетельствует о потенциальном синергетическом эффекте данных аллелей. Полученные данные подчёркивают важность учёта популяционной специфики при оценке генетических детерминант взаимодействия ВИЧ и организма-хозяина.
© Останкова Ю.В., Давыденко В.С., Щемелев А.Н., Тотолян А.А., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Генетическое типирование ДНК-изолятов Coxiella burnetii, выделенных от больных лихорадкой Ку в Ставропольском крае
Цель работы — генетическое типирование ДНК-изолятов Coxiella burnetii, выделенных на территории Ставропольского края (СК) в 2009–2023 гг., анализ генетической структуры популяции возбудителя лихорадки Ку в регионе. Материалы и методы. В работе использовали сыворотки крови от лихорадящих больных, полученные из Центра гигиены и эпидемиологии в Ставропольском крае в 2009–2023 гг. Проводили мультиспейсерное типирование (МST) C. burnetii, определяли принадлежность к MST-типу с помощью интернет-ресурса (http://ifr48.timone.univ-mrs.fr). Филогенетическое дерево строили в программе «MEGA». Плазмидное типирование осуществляли с использованием типоспецифичных праймеров к локусам плазмид QpH1, QpRS, QpDV, визуализацию полученных продуктов амплификации — путём проведения электрофореза в 2% агарозном геле. Территориальное распространение генетических вариантов анализировали с использованием программного обеспечения ArcGiS 10.1. Результаты. В ходе молекулярно-генетического типирования C. burnetii установлено, что на территории СК циркулируют штаммы возбудителя коксиеллёза, относящиеся к двум генотипам: MST7 и MST28 монофилетической группы I. Доминирующим генотипом на территории восточных районов СК является MST7, северных районов — MST28. На территории СК циркулирует возбудитель лихорадки Ку с единственным плазмидным типом — QpH1. Заключение. Определение плазмидного и MST-типа позволяет генотипировать ДНК изоляты C. burnetii без выделения чистой культуры, что может помочь при расследовании вспышек и формировании базы данных региональных ДНК изолятов.
© Сирица Ю.В., Ульшина Д.В., Волынкина А.С., Васильева О.В., Гнусарева О.А., Михайлова М.Е., Куличенко А.Н., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Подавление образования биоплёнок и выживания в эпителиальных клетках клинических изолятов уропатогенов при действии препарата Fluorothiazinone in vitro
Целью данного исследования было изучение влияния инновационного отечественного антибактериального препарата Fluorothiazinone, ингибитора системы секреции III типа и функционирования жгутика, на вирулентные свойства возбудителей инфекций мочевыводящих путей (ИМП). Материалы и методы. Клинические изоляты видов Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa были получены от 4 пациентов с рецидивирующими инфекциями ИМП. Анализ цитотоксичности проводили на клетках HeLa с помощью набора «CytoTox 96». Жгутиковую подвижность бактерий оценивали в 0,25% агаре с измерением зоны подвижности. Биоплёнки культивировали в 96-луночных планшетах и окрашивали кристаллическим фиолетовым и Конго красным, оценивали структуру биоплёнок при микроскопировании и проводили количественную оценку бактериальной биоплёнки и экзополисахаридного матрикса при измерении оптической плотности связавшегося с биоплёнкой красителя. Внутриклеточное развитие изучали на клетках PC-3 при определении количества внутриклеточных бактерий методом высева лизатов клеток и иммунохимическим методом при окраске бактерий специфическими антителами. Результаты. Препарат Fluorothiazinone специфически подавлял цитотоксичность и подвижность E. coli и P. aeruginosa. Для K. pneumoniae наблюдали чувствительность к препарату Fluorothiazinone, связанную с подавлением цитотоксичности. Для всех изученных изолятов было показано ингибирование образования биоплёнок на абиотической поверхности. Для E. coli и K. pneumoniae выявили достоверное снижение внутриклеточного размножения в клетках аденокарциномы простаты человека и подавление формирования внутриклеточных бактериальных сообществ. Заключение. Препарат Fluorothiazinone нарушает механизмы, способствующие установлению персистенции патогенов при формировании хронических ИМП, среди которых образование биоплёнок на абиотических поверхностях, таких как катетеры, стенты, дренажи, и формирование внутриклеточных бактериальных сообществ и покоящихся внутриклеточных резервуаров.
© Капотина Л.Н., Моргунова Е.Ю., Нелюбина С.А., Федина Е.Д., Королёва Е.А., Бондарева Н.Е., Перепанова Т.С., Зигангирова Н.А., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Характеристика молекулярно-генетических свойств эпидемических штаммов Klebsiella pneumoniae и Staphylococcus aureus — возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, циркулирующих на территории Нижегородской области
Введение. Молекулярно-эпидемиологический мониторинг направлен на получение актуальной информации о генетических вариантах возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), циркулирующих в регионе. В настоящее время особое внимание уделяется слежению за представителями группы ESKAPE, т. к. они являются частой причиной ИСМП, осложняют течение основного заболевания и становятся всё более серьёзной угрозой здоровью и жизни пациентов, поскольку обладают комплексом генов патогенности и разнообразными механизмами антибиотикорезистентности. Цель работы — анализ результатов полногеномного секвенирования эпидемических штаммов возбудителей ИСМП — Klebsiella pneumoniae ssp. pneumoniae и Staphylococcus aureus, циркулирующих на территории Нижегородской области. Материалы и методы. Использованы классические бактериологические методы, MALDI TOF масс-спектрометрия, полногеномное секвенирование, биоинформатические методы. Результаты. Углублённый анализ показал циркуляцию в отделении новорождённых популяции классических штаммов K. pneumoniae сиквенс-типа (ST) 3-К-типа (К) 3, содержащих ряд генов патогенности и бета-лактамазу blaSHV-1. В многопрофильном стационаре обнаружена циркуляция популяции штаммов конвергентного патотипа K. pneumoniae ST395-К39, а также выявлены штаммы конвергентного патотипа K. pneumoniae ST395-К2, К47 и штаммы классического патотипа K. pneumoniae ST5209-К35, ST441-К62, ST147-К64, содержащие в геноме спектр генов патогенности и бета-лактамаз, в том числе Нью-Дели металло-бета-лактамазу blaNDM-1. Штаммы S. aureus, связанные с катетер-ассоциированными инфекциями кровотока, обладают выраженным патогенным потенциалом, относятся к 13 различным ST и 19 spa-типам (t). В гемодиализных центрах и отделениях гемодиализа выявлена циркуляция штаммов метициллин-резистентных (SCCmec IV, ST8, t008) и метициллин-чувствительных (ST1, t127) стафилококков. Заключение. Полученные данные свидетельствуют о циркуляции в лечебно-профилактических медицинских организациях конвергентных и классических штаммов K. pneumoniae и вирулентных штаммов S. aureus, что обосновывает необходимость молекулярно-эпидемиологического мониторинга.
© Соловьева И.В., Точилина А.Г., Белова И.В., Зайцева Н.Н., Кучеренко Н.С., Садыкова Н.А., Молодцова С.Б., Кропотов В.С., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Комбинированная ДНК-белковая вакцина, содержащая полиэпитопный Т-клеточный иммуноген и рецептор-связывающий домен белка S вируса SARS-CoV-2
Введение. В период пандемии COVID-19 стала чрезвычайно актуальной разработка профилактических вакцин, в том числе основанных на новых платформах. Одной из таких платформ являются комбинированные вакцины, сочетающие в одном препарате, например, ДНК и белковые компоненты. Целью данной работы являлось исследование иммуногенности ДНК-вакцины, кодирующей полиэпитопный Т-клеточный иммуноген вируса SARS-CoV-2, в сочетании с рекомбинантным белком RBD (рецепторсвязывающий домен белка S вируса SARS-CoV-2, штамм Wuhan-Hu-1), конъюгированным с поликатионным носителем — полиглюкин-спермидином (PGS), а также оценка вклада отдельных компонентов в развитие иммунного ответа у мышей линии BALB/c. Материалы и методы. Для создания ДНК-вакцины (pBSI-COV-Ub) мы воспользовались стратегией дизайна искусственного полиэпитопного иммуногена, состоящего из консервативных иммунодоминантных фрагментов различных структурных белков вируса SARS-CoV-2, содержащих большое количество эпитопов Т-лимфоцитов: хелперных и цитотоксических. Рекомбинантный белок RBD был конъюгирован с поликатионом PGS, в результате смешивания его с ДНК образовывал вакцинный комплекс CCV–BSI, иммуногенные свойства которого были исследованы в данной работе. Результаты. Иммунизация мышей линии BALB/c комбинированной конструкцией CCV–BSI привела к индукции высоких титров антител, обладающих нейтрализующей активностью в отношении живого вируса SARS-CoV-2, а также к формированию вирус-специфического Т-клеточного ответа, что было показано с помощью иммуноферментного анализа, реакции нейтрализации и ELISpot. Показано, что вклад в гуморальный иммунный ответ вносит именно белковый компонент, а в клеточный — ДНК. Введение рекомбинантного белка RBD привело к индукции только антител, введение ДНК-вакцины — к индукции только Т-клеточного ответа, введение комбинированного препарата — к индукции и гуморального иммунного ответа, и специфических Т-клеток. Выводы. Уникальная комбинация ДНК и белка в составе одной вакцинной конструкции позволяет преодолеть ограничения каждого из данных типов вакцин и приводит к индукции обоих звеньев иммунитета. Белковый компонент может быть заменён в соответствии с актуальным вирусным штаммом, а универсальный Т-клеточный иммуноген может обеспечить ответ на широкий спектр циркулирующих вариантов. Данная платформа в дальнейшем может быть использована для разработки вакцин против различных вирусов с высокой изменчивостью.
© Боргоякова М.Б., Рудомётов А.П., Старостина Е.В., Яковлев В.А., Тигеева Е.В., Зайковская А.В., Волосникова Е.А., Меркульева Ю.А., Исаева А.А., Несмеянова В.С., Шаньшин Д.В., Зайцев Б.Н., Кисаков Д.Н., Кисакова Л.А., Щербаков Д.Н., Карпенко Л.И., Ильичёв А.А., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Критерии оценки качества геномов Pseudomonas aeruginosa
Введение. С развитием технологий секвенирования растёт объём геномных данных, что требует разработки показателей для оценки качества сборок геномов. Современные инструменты (Plantagora, SQUAT, QUAST, BUSCO, CheckM2 и др.) являются унифицированными, но при этом не учитывают особенностей организации генома конкретных видов. Особенно остро стоит вопрос импортозамещения биоинформационных инструментов в условиях ограниченного доступа к зарубежным технологиям. Кроме того, отсутствуют специализированные методы оценки качества сборок генома Pseudomonas aeruginosa, что ограничивается общими метриками (N50, количество контигов). Цель работы — разработка алгоритма и критериев на основе комплексного подхода для специфической оценки качества полногеномного секвенирования представителей вида P. aeruginosa. Материалы и методы. Исследование проводили на 108 штаммах P. aeruginosa. Авторское программное обеспечение разработано на языках Java и Python. Результаты. Разработан алгоритм оценки качества полногеномных данных P. aeruginosa на основе анализа ключевых генов жизнеобеспечения (fur, algU, dinB и др.), размера генома, GC-состава и показателя N50. Геномы с отсутствием ключевых генов или структурными ошибками классифицируются как плохие или средние, последние не рекомендуются для филогенетического анализа. Алгоритм предлагает простые и понятные параметры оценки качества полногеномных данных. Заключение. На основе анализа генов жизнеобеспечения, размера генома, GC-состава и показателя N50 нами разработана классификация качества сборок геномов P. aeruginosa (хорошее, среднее, низкое). Созданы алгоритм и программа «Genomes Validator» для оперативной оценки.
© Ковалевич А.А., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Генетическое разнообразие мутаций, влияющих на гемолитическую активность бактерий Bordetella pertussis при культивировании in vitro
Введение. Ключевую роль в патогенезе коклюша, антропонозного инфекционного заболевания, играет двухкомпонентная система BvgAS, регулирующая транскрипцию генов вирулентности возбудителя. Факторы, оказывающие воздействие на работу системы BvgAS бактерий Bordetella pertussis в организме человека, практически не изучены. Известно, что нарушение структуры оперона bvgAS приводит к фазовым переходам и изменению вирулентности. Перемещение IS-элементов в оперон bvgAS и другие гены вирулентности возбудителя коклюша является важным механизмом в регуляции их экспрессии, потенциально приводящим к длительной персистенции бактерий в организме человека. Цель работы — поиск и характеристика спонтанных инсерционных мутантов бактерий B. pertussis по генам вирулентности bvgAS, cya и fhaB, ответственным за гемолитическую активность при культивировании бактерий in vitro. Материалы и методы. Использованы штаммы B. pertussis из коллекции НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи: вирулентный штамм B. pertussis 475 и изогенный ему аттенуированный штамм B. pertussis 4МKS, вирулентный штамм B. pertussis Tohama I и его авирулентный мутант B. pertussis 347. Бактерии культивировали на казеиново-угольном агаре с добавлением крови. Формирование зон гемолиза оценивали визуально. Для молекулярно-генетической характеристики полученных инсерционных мутантов использовали методы ПЦР, ПЦР-РВ, секвенирования. Результаты. In vitro выделены мутанты B. pertussis с нарушенной гемолитической активностью (фенотип Hly–) c инсерциями IS-элементов в генах fhaB и bvgAS, а также мутанты, сохранившие гемолитическую активность (фенотип Hly+), содержащие IS-элементы в ранее не описанной ориентации в гене bvgAS. Частота образования инсерционных мутантов зависела от условий культивирования и генотипа бактерий. Заключение. Приведены аргументы, свидетельствующие о возможной роли IS-элементов в переходе бактерий B. pertussis в состояние пониженной вирулентности, что обеспечивает длительную персистенцию возбудителя коклюша в организме человека.
© Куликов С.В., Медкова А.Ю., Локтев М.А., Синяшина Л.Н., Каратаев Г.И., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Мониторинг Clostridioides difficile-ассоциированной инфекции в условиях стационара
Введение. Clostridioides difficile — вид анаэробных спорообразующих грамположительных бактерий — является составной частью нормальной микрофлоры кишечника. C. difficile-ассоциированная инфекция развивается при избыточной колонизации C. difficile, вегетативные формы которой способны продуцировать экзотоксины, вызывающие воспаление в стенке толстой кишки. Токсигенные штаммы C. difficile являются основным возбудителем инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи в стационаре. Целью исследования является изучение частоты выявления C. difficile (как токсигенных, так и нетоксигенных штаммов) у пациентов гастроэнтерологического отделения ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России, госпитализированных в 2021–2023 гг. с синдромом диареи и другими установленными диагнозами. Материалы и методы. В исследование были включены 547 пациентов в возрасте 19–88 лет (46,6% мужчин, 53,4% женщин). Для выявления ДНК C. difficile и генов её токсинов А и В применяли метод полимеразной цепной реакции в реальном времени, дополнительно проводили бактериологическое исследование кала. При обнаружении клинических признаков бактериальной инфекции проводили анализ на С-реактивный белок (СРБ). Результаты. ДНК C. difficile выявлена у 65 (11,9%) пациентов, гены токсинов А и В обнаружены у 32 (5,9%) пациентов. Нетоксигенные штаммы C. difficile чаще детектировались у мужчин (55%) в возрасте до 40 лет. Токсигенные штаммы C. difficile с одинаковой частотой встречались у мужчин и женщин в возрасте до 40 лет. Анализ на СРБ показал, что воспалительные процессы чаще развиваются у пациентов старше 40 лет. Преобладающее заболевание с высоким показателем СРБ у пациентов с токсигенным штаммом — энтероколит, вызванный C. difficile (кодирование по МКБ-10: А04.7), в группе с нетоксигенным штаммом — у пациентов с диагнозом: язвенный колит (кодирование по МКБ-10: К51). У всех пациентов наблюдались выраженные нарушения баланса кишечной микрофлоры согласно развёрнутому бактериологическому анализу кала. Заключение. В результате трёхлетнего мониторинга установлено увеличение доли пациентов с C. difficile с 6,6 до 7,9%. Доля образцов, положительных на гены токсинов A/B C. difficile, также увеличилась с 5,2 до 7,9%. Таким образом, необходимо проводить профилактические мероприятия для уменьшения влияния факторов риска развития C. difficile-ассоциированной инфекции в стационаре.
© Господарик А.В., Прохорова Н.Д., Куликова В.К., Калачнюк Т.Н., Хромых Н.И., Кудрявцева Ю.В., Беспятых Ю.А., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Совершенствование схемы MLVA-типирования штаммов Burkholderia mallei
Введение. Регистрация на территории России отдельных случаев сапа у лошадей, возбудителем которого является Burkholderia mallei, определяет важность разработки алгоритмов генотипирования этого патогена. Перспективным остается метод MLVA (multilocus-variable tandem repeat analysis), основанный на сравнительном анализе количества вариабельных тандемных повторов (VNTR — variable number tandem repeats). По мере увеличения числа полногеномных последовательностей в международных базах данных изменяется информативная ценность VNTR-локусов, что требует пересмотра существующих схем типирования. Цель работы — оценить перспективность включения VNTR-локуса BPSS1974#I в схему MLVA-6 для внутривидовой дифференциации B. mallei. Материалы и методы. Исследование 64 штаммов B. mallei проводили in silico и in vitro с помощью методов MLVA, амплификации дифференцирующих регионов, полногеномного секвенирования и биоинформатического анализа. Результаты. Генотипирование B. mallei при использовании схемы MLVA-6 не позволило определить in silico VNTR-профили 13 штаммов из базы данных GenBank NCBI по одному или нескольким локусам ввиду низкого покрытия ридами соответствующих областей генома или их полного отсутствия (нуль-аллели). Эффективное число аллелей (ne) и индекс полиморфного информационного содержания (PIC) для локусов схемы MLVA-6 варьировали в диапазонах 3,842–8,103 и 0,740–0,877 соответственно. Перспективность включения в эту схему VNTR-локуса BPSS1974#I определена на основе молекулярной стабильности мотива в его составе и высоких показателей ne и PIC, составивших 4,299 и 0,767 соответственно. VNTR-профили коллекционных штаммов по локусу BPSS1974#I были идентичны соответствующим штаммам из базы данных GenBank. Результаты кластерного анализа при сочетанном использовании схемы MLVA-6 и локуса BPSS1974#I соответствовали филогенетическим реконструкциям, полученным с использованием других молекулярно-генетических методов. Заключение. VNTR-локус BPSS1974#I можно расценивать как маркер, включение которого в схему MLVA-6 позволит повысить точность генотипирования и установления регионов происхождения вновь выделенных штаммов B. mallei.
© Леденева М.Л., Бондарева О.С., Ткаченко Г.А., Устинов Д.В., Захарова И.Б., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Иммунологическая и эпидемиологическая эффективность вакцинации детей против гепатита А с применением одной дозы инактивированной вакцины
Гепатит А — это острое заболевание печени, вызываемое вирусом гепатита А, которое можно предотвратить с помощью вакцинации. Стандартная схема вакцинации против гепатита А предполагает введение двух доз инактивированной вакцины, однако по экономическим соображениям и для повышения уровня охвата вакцинацией в некоторых регионах мира внедрены программы массовой вакцинации детей с применением одной дозы вакцины. Целью обзора является обобщение и анализ опубликованных данных о длительности сохранения протективных уровней антител после однократной иммунизации детей, а также о заболеваемости в странах, в которых проводится вакцинопрофилактика гепатита А с использованием одной дозы инактивированной вакцины. Данные последних лет, полученные в разных регионах мира, в том числе в России, подтверждают эффективность стратегии вакцинации против гепатита А с применением одной дозы вакцины как с точки зрения длительности сохранения иммунологического ответа, так и с точки зрения влияния на уровни регистрируемой заболеваемости. Однако для оценки продолжительности защиты и необходимости ревакцинации на более позднем этапе жизни необходимы дальнейшие исследования по долгосрочной эффективности стратегий вакцинации с применением одной дозы инактивированной вакцины, а также непрерывный надзор за гепатитом А.
© Лопатухина М.А., Кюрегян К.К., Михайлов М.И., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Защитные перчатки нового поколения: актуальные тенденции технологических решений и перспективы применения (научный обзор)
Введение. Защитные перчатки широко используют в медицине, они обеспечивают уровень биологической защиты пациентов и медицинского персонала. Вместе с тем существует риск развития инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, у сотрудников и пациентов при их ненадлежащем применении. Значимой проблемой является рост медицинских отходов и их утилизация. В этой связи разработка новых подходов к обеспечению максимальной защиты персонала и пациентов, минимизации риска инфицирования, благодаря созданию защитных перчаток на основе биоразлагаемых полимерных материалов с антимикробным покрытием, является актуальной эпидемиологической и экологической задачей. В статье обсуждаются современные технологии и возникающие проблемы при получении новых материалов для создания защитных перчаток с антимикробными свойствами при использовании производных гуанидина, четвертичных аммониевых соединений, хлорированных фенолов, эфирных масел, соединений йода, солей серебра, частиц и наночастиц металлов и их оксидов, экстрактов растительных масел, анилиновых красителей. Введение таких бионаполнителей, как крахмал и наноцеллюлоза, будет способствовать улучшению биоразлагаемых свойств при сохранении необходимых физико-химических характеристик. Разработка новых композитных материалов с улучшенными характеристиками биодеградации в форме термопластичных эластомеров, полилактида и поликапролактона позволит решить проблему утилизации отходов из синтетического каучука. Заключение. Анализ современной научной литературы определил высокий интерес в мире к созданию защитных перчаток с антимикробными свойствами на основе биоразлагаемых материалов. Однако их применение, кроме непосредственного подавления роста патогенной микрофлоры, может дополнительно нести ряд проблем, связанных с влиянием на здоровье человека и экосистему. Для успешной реализации данного направления важно продолжать научные исследования по приданию перчаткам заявленных свойств с использованием эффективных, надёжных и безопасных технологий с разработкой унифицированных методик и протоколов оценки антимикробной активности для последующего широкого внедрения в практику. Создание биоразлагаемых защитных перчаток имеет большие перспективы, поскольку будет способствовать снижению риска распространения инфекций в медицинских организациях и внесёт существенный вклад в охрану окружающей среды.
© Захарова Ю.А., Новиков В.А., Андреев С.В., Макарова М.А., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
К 70-летию академика РАН Александра Николаевича Куличенко
© Редакция ж., 2025 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0
Резолюция Конгресса с международным участием «Эпидемиология — 2025» (Москва, 15–16 октября 2025 г.)