Характеристика митогенома подверженной угрозе исчезновения рыбы Beaufortia pingi (Gastromyzontidae): описание генома и филогенетические соображения

Обложка
  • Авторы: Шен З.1, Шенг Ц.2, Джин З.3, Жанг Й.2, Льв Х.2
  • Учреждения:
    1. Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук
    2. Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
    3. Колледж туризма провинции Чжэцзян
  • Выпуск: Том 63, № 4 (2023)
  • Страницы: 426
  • Раздел: Статьи
  • URL: https://journals.rcsi.science/0042-8752/article/view/135209
  • DOI: https://doi.org/10.31857/S0042875223040252
  • EDN: https://elibrary.ru/ROMMDX
  • ID: 135209

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Горные вьюны (щиповки) − богатая видами группа, которая хорошо приспособлена к быстротекущим пресноводным местообитаниям. Потеря среды обитания из-за строительства плотин гидроэлектростанций подвергает этих рыб угрозе исчезновения. Согласно предыдущим исследованиям, филогения рода Beaufortia остается спорной. Чтобы помочь прояснить филогенетические взаимоотношения Beaufortia и близкородственных видов, был секвенирован и проанализирован полный митогеном B. pingi. Кольцевой митогеном имеет длину 16 565 п.н. и содержит 13 генов, кодирующих белок PCGs, 22 гена транспортной РНК, два гена рибосомальной РНК и один контрольный регион. Наиболее распространенным кодоном в PCGs был лейцин (16.66%), за которым следовали аланин (9.32%) и треонин (7.71%). Филогенетический анализ, включающий 17 других видов горных вьюнов, был выполнен с использованием метода максимального правдоподобия, основанного на последовательностях 13 митохондриальных PCGs. Эти виды разделились на две клады: Gastromyzontidae и Balitoridae, а некоторые роды, включая Beaufortia, оказались парафилетическими. В частности, B. pingi попал в одну кладу с Erromyzon kalotaenia, Yaoshania pachychilus и Pseudogastromyzon fangi, которые в последующем образовали кластер с двумя другими видами Beaufortia.

Об авторах

З. Шен

Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук

Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Ухань

Ц. Шенг

Колледж естественных наук, Университет Хучжоу

Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу

З. Джин

Колледж туризма провинции Чжэцзян

Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Ханчжоу

Й. Жанг

Колледж естественных наук, Университет Хучжоу

Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу

Х. Льв

Колледж естественных наук, Университет Хучжоу

Автор, ответственный за переписку.
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу

Список литературы


© З. Шен, Ц. Шенг, З. Джин, Й. Жанг, Х. Льв, 2023

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах