Характеристика митогенома подверженной угрозе исчезновения рыбы Beaufortia pingi (Gastromyzontidae): описание генома и филогенетические соображения
- Авторы: Шен З.1, Шенг Ц.2, Джин З.3, Жанг Й.2, Льв Х.2
-
Учреждения:
- Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук
- Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
- Колледж туризма провинции Чжэцзян
- Выпуск: Том 63, № 4 (2023)
- Страницы: 426
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/0042-8752/article/view/135209
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0042875223040252
- EDN: https://elibrary.ru/ROMMDX
- ID: 135209
Цитировать
Аннотация
Горные вьюны (щиповки) − богатая видами группа, которая хорошо приспособлена к быстротекущим пресноводным местообитаниям. Потеря среды обитания из-за строительства плотин гидроэлектростанций подвергает этих рыб угрозе исчезновения. Согласно предыдущим исследованиям, филогения рода Beaufortia остается спорной. Чтобы помочь прояснить филогенетические взаимоотношения Beaufortia и близкородственных видов, был секвенирован и проанализирован полный митогеном B. pingi. Кольцевой митогеном имеет длину 16 565 п.н. и содержит 13 генов, кодирующих белок PCGs, 22 гена транспортной РНК, два гена рибосомальной РНК и один контрольный регион. Наиболее распространенным кодоном в PCGs был лейцин (16.66%), за которым следовали аланин (9.32%) и треонин (7.71%). Филогенетический анализ, включающий 17 других видов горных вьюнов, был выполнен с использованием метода максимального правдоподобия, основанного на последовательностях 13 митохондриальных PCGs. Эти виды разделились на две клады: Gastromyzontidae и Balitoridae, а некоторые роды, включая Beaufortia, оказались парафилетическими. В частности, B. pingi попал в одну кладу с Erromyzon kalotaenia, Yaoshania pachychilus и Pseudogastromyzon fangi, которые в последующем образовали кластер с двумя другими видами Beaufortia.
Ключевые слова
Об авторах
З. Шен
Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Ухань
Ц. Шенг
Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу
З. Джин
Колледж туризма провинции Чжэцзян
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Ханчжоу
Й. Жанг
Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу
Х. Льв
Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
Автор, ответственный за переписку.
Email: qsheng@zjhu.edu.cn
Китай, Хучжоу