Создание коллекции бактерий, моделирующих поведение возбудителей инфекционных болезней при разработке экспресс-методов определения устойчивости к антибиотикам
- Авторы: Эпова Е.Ю.1,2, Алиев Р.О.1,3, Щербакова Е.С.3, Нгуен Х.Т.3, Трубникова Е.В.1,2, Шевелев А.Б.1,3
-
Учреждения:
- Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН
- Курский государственный университет
- Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
- Выпуск: Том 145, № 4 (2025)
- Страницы: 297-309
- Раздел: Статьи
- Статья получена: 21.11.2025
- Статья опубликована: 15.12.2025
- URL: https://journals.rcsi.science/0042-1324/article/view/352933
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0042132425040017
- ID: 352933
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Сформирована коллекция из 25 изолятов бактерий, выделенных из листьев люцерны Medicago sativa, мискантуса Miscanthus giganteus сортов Камис и Багряный, озимого рапса Brassica napus, тюльпана Tulipa sp., зеленых частей яснотки Lamium album, чистотела большого Chelidonium majus и горчицы сарептской Brassica juncea, а также красного куриного клеща Dermanyssus gallinae и почвенной нематоды Steinernema carpocapsae. Среди изолятов присутствуют 7 представителей рода Bacillus, Exiguobacterium и Priestia; 5 изолятов рода Pseudomonas; 2 изолята рода Pantoea; 8 изолятов рода Staphylococcus; представители типа Actinomycetota: Pseudoclavibacter и Micrococcus. Идентификация таксономической принадлежности изолятов выполнена на основе секвенирования полных генов 16S рибосомной ДНК, которые депонированы в базе данных GenBank. Исследована степень устойчивости выделенных изолятов к пяти распространенным антибиотикам: канамицину (Km), ампициллину (Ap), спектиномицину (Sp), эритромицину (Em) и хлорамфениколу (Cm). Внутри каждой таксономической группы выявлены штаммы, проявляющие устойчивость к нескольким антибиотикам одновременно, устойчивость к отдельным антибиотикам и не проявляющие устойчивости ни к одному из тестируемых антибиотиков, что позволяет сопоставлять в одно и то же время эффективность экспресс-методов определения антибиотикорезистентности на нескольких группах бактерий.
Ключевые слова
Об авторах
Е. Ю. Эпова
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН; Курский государственный университет
Автор, ответственный за переписку.
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия; Курск, Россия
Р. О. Алиев
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН; Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия; Москва, Россия
Е. С. Щербакова
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия
Х. Т. Нгуен
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия
Е. В. Трубникова
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН; Курский государственный университет
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия; Курск, Россия
А. Б. Шевелев
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН; Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Email: tr_e@list.ru
Москва, Россия; Москва, Россия
Список литературы
- Пушкарева В.И., Литвин В.Ю., Ермолаева С.А. Растения как резервуар и источник возбудителей пищевых инфекций // Эпидемиол. вакцинопрофил. 2012. № 2 (63). С. 10–20.
- Adane W.D., Chandravanshi B.S., Tessema M. A novel electrochemical sensor for the detection of metronidazole residues in food samples // Chemosphere. 2024. V. 359. P. 142279.
- Allegranzi B., Bagheri Nejad S., Combescure C. et al. Burden of endemic health-care-associated infection in developing countries: systematic review and meta-analysis // Lancet. 2011. V. 377 (9761). P. 228–241.
- Dong Y., Iniguez A.L., Ahmer B.M. Kinetics and strain specificity of rhizosphere and endophytic colonization by enteric bacteria on seedlings of Medicago sativa and Medicago truncatula // Appl. Environ. Microbiol. 2003. V. 69 (3). P. 1783–1790.
- Hassanain W.A., Johnson C.L., Faulds K. et al. Ultrasensitive dual ELONA/SERS-RPA multiplex diagnosis of antimicrobial resistance // Anal. Chem. 2024. V. 96 (29). P. 12093–12101.
- Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Eds E. Stackebrandt, M. Goodfellow. N.Y.: John Wiley and Sons, 1991. P. 115–175.
- Lane D.J., Pace B., Olsen G.J. et al. Rapid determination of 16S ribosomal RNA sequences for phylogenetic ana- lyses // PNAS USA. 1985. V. 82 (20). P. 6955–6959.
- Mulani M.S., Kamble E.E., Kumkar S.N. et al. Emerging strategies to combat ESKAPE pathogens in the era of antimicrobial resistance: a review // Front. Microbiol. 2019. V. 10. P. 539.
- Nakano M., Kalsi S., Morgan H. Fast and sensitive isothermal DNA assay using microbead dielectrophoresis for detection of anti-microbial resistance genes // Bio- sens. Bioelectron. 2018. V. 117. P. 583–589.
- Oeschger T.M., Erickson D.C. Visible colorimetric growth indicators of Neisseria gonorrhoeae for low-cost diagnostic applications // PLoS One. 2021 V. 16 (6). P. 0252961.
- Pasquier E., Owolabi O.O., Powell B. et al. Assessing post-abortion care using the WHO quality of care framework for maternal and newborn health: a cross-sectio- nal study in two African hospitals in humanitarian settings // Reprod. Health. 2024. V. 21 (1). P. 114.
- Rana S., Kaur K.N., Narad P. et al. Knowledge, attitudes and practices of antimicrobial resistance awareness among healthcare workers in India: a systematic review // Front Public Health. 2024. V. 12. P. 1433430.
- Saha M., Sarkar A. Review on multiple facets of drug resistance: a rising challenge in the 21st century // J. Xenobiot. 2021. V. 11 (4). P. 197–214.
- Salehi B., Quispe C., Butnariu M. et al. Phytotherapy and food applications from Brassica genus // Phytother. Res. 2021. V. 35 (7). P. 3590–3609.
- Swami P., Sharma A., Anand S., Gupta S. DEPIS: a combined dielectrophoresis and impedance spectroscopy platform for rapid cell viability and antimicrobial susceptibility analysis // Biosens. Bioelectron. 2021. V. 182. P. 113190.
- Treichel S., Hartmann M., Rump A. et al. Evaluation of a didanosin-containing regimen including genotypic resistance testing: an open-label, multicenter study // Eur. J. Med. Res. 2003. V. 8 (9). P. 405–413.
- Wesseling C.M.J., Martin N.I. Synergy by perturbing the gram-negative outer membrane: opening the door for gram-positive specific antibiotics // ACS Infect. Dis. 2022. V. 8 (9). P. 1731–1757.
- Zhang Y., Fan W., Shao C. et al. Rapid determination of antibiotic resistance in Klebsiella pneumoniae by a novel antibiotic susceptibility testing method using SYBR green I and propidium iodide double staining // Front. Microbiol. 2021. V. 12. P. 650458.
Дополнительные файлы

