Ассоциация полиморфизмов генов TCF7L2, FABP2, KCNQ1, ADIPOQ с прогнозом развития сахарного диабета 2-го типа

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Изучить возможность использования в популяции г. Новосибирска в качестве маркеров прогноза развития сахарного диабета 2-го типа (СД 2) полиморфизмов генов TCF7L2, FABP2, KCNQ1, ADIPOQ.

Материалы и методы. На основе проспективного наблюдения репрезентативной популяционной выборки жителей Новосибирска (HAPIEE) сформированы 2 группы по принципу «случай–контроль» (случай – лица, у которых за 10 лет наблюдения выявлен СД 2, и контроль – лица, у которых за 10-летний период не развились нарушения углеводного обмена). Группа СД 2 (n=443, средний возраст 56,2±6,7 года, мужчины – 29,6%, женщины – 70,4%), группа контроля (n=532, средний возраст 56,1±7,1 года, мужчины – 32,7%, женщины – 67,3%). ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией. Статистическая обработка проведена с использованием программного пакета SPSS 16.0.

Результаты и обсуждение. Не обнаружено значимого влияния rs1799883 гена FABP2, rs2237892 гена KCNQ1 и rs6773957 гена ADIPOQ на риск развития СД 2. Генотипы ТТ и TC rs7903146 гена TCF7L2 являются генотипами риска развития СД 2 (относительный риск – ОР 3,90, 95% доверительный интервал – ДИ 2,31–6,61, р<0,001; ОР 1,86, 95% ДИ 1,42–2,43, р<0,001 соответственно). Генотип СС rs7903146 гена TCF7L2 ассоциирован с протективным эффектом в отношении СД 2 (ОР 0,37, 95% ДИ 0,29–0,49, р<0,001). При включении в модель оценки риска развития СД 2 rs7903146 гена TCF7L2 он сохраняет свою значимость и у мужчин, и у женщин.

Заключение. Полиморфизм rs7903146 гена TCF7L2 подтвердил свою ассоциацию с прогнозом развития СД 2, что указывает на возможность его рассмотрения в качестве кандидата на внесение в рискометр СД 2. Разработаны варианты рискометров для оценки прогноза развития СД 2 у мужчин и женщин в возрасте 45–69 лет в течение 10 лет наблюдения. Ассоциация с прогнозом развития СД 2 полиморфизмов rs1799883 гена FABP2, rs2237892 гена KCNQ1 и rs6773957 гена ADIPOQ – не обнаружена.

Об авторах

Елизавета Сергеевна Мельникова

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Автор, ответственный за переписку.
Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-9033-1588

ординатор НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Оксана Дмитриевна Рымар

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0003-4095-0169

д.м.н., зав. лаб. клинико-популяционных и профилактических исследований терапевтических и эндокринных заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Анастасия Андреевна Иванова

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-9460-6294

к.м.н., мл. науч. сотр. лаб. молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Светлана Владимировна Мустафина

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0003-4716-876X

д.м.н., ст. науч. сотр. лаб. клинико-популяционных и профилактических исследований терапевтических и эндокринных заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Марина Юрьевна Шапкина

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-8577-8801

мл. науч. сотр. лаб. этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Мартин Бобак

Отдел эпидемиологии и общественного здоровья Университетского колледжа Лондона

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0003-2357-5918

проф. эпидемиологии, зам. рук. отд. эпидемиологии и общественного здоровья Университетского колледжа

Ангилья, Лондон

Софья Константиновна Малютина

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0001-6539-0466

д.м.н., проф., зав. лаб. этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Михаил Иванович Воевода

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0001-9425-413X

акад. РАН, д.м.н., проф., НИИТПМ – филиал ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Владимир Николаевич Максимов

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины

Email: jarinaleksi@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-7165-4496

д.м.н., проф., зав. лаб. молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний НИИТПМ – филиала ФГБНУ ИЦиГ

Россия, Новосибирск

Список литературы

  1. Cho NH, Shaw JE, Karuranga S, et al. IDF Diabetes Atlas: Global estimates of diabetes prevalence for 2017 and projections for 2045. Diabet Res Clin Pract. 2018;138:271-81. doi: 10.1016/j.diabres.2018.02.023
  2. Воевода М.И., Иванова А.А., Шахтшнейдер Е.В. и др. Молекулярная генетика MODY. Терапевтический архив. 2016;88(4):117-24 [Voevoda MI, Ivanova AA, Shahtshnejder EV, et al. Molekular genetics of maturity-onset diabetes of the young. Therapeutic Arhive. 2016;88(4):117-24 (In Russ.)]. doi: 10.17116/terarkh2016884117-124
  3. OMIM. Accessed May 14, 2019. http://omim.org/
  4. HuGE Navigator. Accessed May 14, 2019. http://www.cdc.gov/genomics/hugenet/hugenavigator.htm
  5. Sikhayeva N, Iskakova A, Saigi-Morgui N, et al. Association between 28 single nucleotide polymorphisms and type 2 diabetes mellitus in the Kazakh population: a case-control study. BMC medical genetics. 2017;18(1):76. doi: 10.1186/s12881-017-0443-2
  6. Мустафина С.В., Симонова Г.И., Рымар О.Д. Сравнительная характеристика шкал риска сахарного диабета 2 типа. Сахарный диабет. 2014;3:17-22. [Mustafina SV, Simonova GI, Rymar OD. Comparative characteristics of diabetes risk scores. Diabetes Mellitus. 2014;3:17-22 (In Russ.)]. doi: 10.14341/DM2014317-22
  7. Wang J, Stancáková A, Kuusisto J, Laakso M. Identification of undiagnosed type 2 diabetic individuals by the finnish diabetes risk score and biochemical and genetic markers: a population-based study of 7232 Finnish men. J Clin Endocrin Metab. 2010;95(8):3858-62. doi: 10.1210/ jc.2010-0012
  8. Мустафина С.В., Рымар О.Д., Сазонова О.В. и др. Валидизация финской шкалы риска «FINDRISC» на европеоидной популяции Сибири. Сахарный диабет. 2016;19(2):113-8 [Mustafina SV, Rymar OD, Sazonova OV, et al. Validation of the Finnish diabetes risk score (FINDRISC) for the Caucasian population of Siberia. Diabetes Mellitus. 2016;19(2):113-8 (In Russ.)]. doi: 10.14341/DM200418-10
  9. Mühlenbruch K, Jeppesen C, Joost HG, et al. The value of genetic information for diabetes risk prediction – differences according to sex, age, family history and obesity. PLoS One. 2013;8(5):e64307. doi: 10.1371/journal.pone.0064307
  10. Goto A, Noda M, Goto M, et al.; JPHC Study Group. Predictive performance of a genetic risk score using 11 susceptibility alleles for the incidence of Type 2 diabetes in a general Japanese population: a nested case-control study. Diabetic Med: J British Diabetic Assotiation. 2018;35(5):602-11. doi: 10.1111/dme.13602
  11. Lin X, Song K, Lim N, et al. Risk prediction of prevalent diabetes in a Swiss population using a weighted genetic score – the CoLaus Study. Diabetologia. 2009;52(4):600-8. doi: 10.1007/s00125-008-1254-y
  12. Meigs JB, Shrader P, Sullivan LM, et al. Genotype score in addition to common risk factors for prediction of type 2 diabetes. N Engl J Med. 2008;359(21):2208-19. doi: 10.1056/NEJMoa0804742
  13. Lyssenko V, Jonsson A, Almgren P, et al. Clinical risk factors, DNA variants, and the development of type 2 diabetes. N Engl J Med. 2008;359(21):2220-32. doi: 10.1056/NEJMoa0801869
  14. Abbas S, Raza ST, Chandra A, et al. Association of ACE, FABP2 and GST genes polymorphism with essential hypertension risk among a North Indian population. Ann Hum Biol. 2015;42(5):461-9. doi: 10.3109/03014460.2014.968206
  15. Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова С.В. и др. Исследование ассоциаций новых генетических маркеров сахарного диабета второго типа на Западно-Сибирской популяции европеоидов. Сибирский научный мед. журн. 2015;35(2):74-9 [Orlov PS, Ivanoshchuk DI, Mikhaylova SV, et al. Association study of new genetic markers of type 2 diabets mellitus in West Siberian Caucasian population. Sibirskii nauchnyi med. zhurn. 2015;35(2):74-9 (In Russ.)].
  16. Ding W, Xu L, Zhang L, et al. Meta-analysis of association between TCF7L2 polymorphism rs7903146 and type 2 diabetes mellitus. BMC Med Genetics. 2018;19(1):38. doi: 10.1186/s12881-018-0553-5
  17. Grant SF, Thorleifsson G, Reynisdottir I, et al. Variant of transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) gene confers risk of type 2 diabetes. Nat Genetics 2006;38(3):320-3. doi: 10.1038/ng1732
  18. Cauchi S, Meyre D, Choquet H, et al.; DESIR Study Group. Transcription factor TCF7L2 genetic study in the french population. Diabetes. 2006;55(10):2903-8. doi: 10.2337/db06-0474
  19. Yan Y, North KE, Ballantyne CM, et al. Transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) polymorphism and context-specific risk of type 2 diabetes in african american and caucasian adults the atherosclerosis risk in communities study. Diabetes. 2009;58(1):285-9. doi: 10.2337/db08-0569
  20. Horikoshi M, Hara K, Ito C, et al. A genetic variation of the transcription factor 7-like 2 gene is associated with risk of type 2 diabetes in the Japanese population. Diabetologia. 2007;50(4):747-51. doi: 10.1007/s00125-006-0588-6
  21. Barra GB, Dutra LAS, Watanabe S, et al. Association of the rs7903146 single nucleotide polymorphism at the transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) locus with type 2 diabetes in brazilian subjects. Arq Bras Endocrinol Metabol. 2012;56(8):479-84. doi: 10.1590/S0004-27302012000800003
  22. Meng Q, Ge S, Yan W, et al. Screening for potential serum-based proteomic biomarkers for human type 2 diabetes mellitus using maldi-tof ms. Proteomics. Clin Applicat. 2017;11(3-4). doi: 10.1002/prca.201600079
  23. Бондарь И.А., Филипенко М.Л., Шабельникова О.Ю., Соколова Е.А. Ассоциация полиморфных маркеров rs7903146 гена TCF7L2 и rs1801282 гена PPARG (PRO12ALA) с сахарным диабетом 2 типа в Новосибирской области. Сахарный диабет. 2013;4:17-22 [Bondar’ IA, Filipenko ML, Shabel’nikova OJu, Sokolova EA. Rs7903146 variant of TCF7L2 gene and rs18012824 variant of PPARG2 gene (Pro12Ala) are associated with type 2 diabetes mellitus in Novosibirsk population. Diabetes Mellitus. 2013;4:17-22 (In Russ.)]. doi: 10.14341/dm2013417-22
  24. World Health Organization. Fact files: ten facts on obesity. 2016. Accessed May 14, 2019. https://www.who.int/features/factfiles/obesity/en/
  25. Qiu CJ, Ye XZ, Yu XJ, et al. Association between FABP2 Ala54Thr polymorphisms and type 2 diabetes mellitus risk: a HuGE Review and Meta-Analysis. J Cell Molecul Med. 2014;18(12):2530-5. doi: 10.1111/jcmm.12385
  26. Liu Y, Wu G, Han L, et al. Association of the FABP2 Ala54Thr polymorphism with type 2 diabetes, obesity, and metabolic syndrome: a population-based case-control study and a systematic meta-analysis. Genetics and molecular research: GMR. 2015;14(1):1155-68. doi: 10.4238/2015
  27. Zhao T, Zhao J, Yang W. Association of the fatty acid-binding protein 2 gene Ala54Thr polymorphism with insulin resistance and blood glucose: a meta-analysis in 13451 subjects. Diabetes/metabolism Res Rev. 2010;26(5):357-64. doi: 10.1002/dmrr.1085
  28. Li YY, Wang XM, Lu XZ. KCNQ1 rs2237892 C→T gene polymorphism and type 2 diabetes mellitus in the Asian population: a meta-analysis of 15,736 patients. J Cell Molecul Med. 2014;18(2):274-82. doi: 10.1111/jcmm.12185.
  29. Liu Y, Zhou DZ, Zhang D, et al. Variants in KCNQ1 are associated with susceptibility to type 2 diabetes in the population of mainland China. Diabetologia. 2009;52(7):1315-21. doi: 10.1007 / s00125-009-1375-y
  30. Han X, Luo Y, Ren Q, et al. Implication of genetic variants near SLC30A8, HHEX, CDKAL1, CDKN2A/B, IGF2BP2, FTO, TCF2, ¬KCNQ1, and WFS1 in type 2 diabetes in a Chinese population. BMC Med Genetics. 2010;11:81. doi: 10.1186/1471-2350-11-81
  31. Unoki H, Takahashi A, Kawaguchi T, et al. SNPs in KCNQ1 are associated with susceptibility to type 2 diabetes in East Asian and European populations. Nat Genetics. 2008;40(9):1098-102. doi: 10.1038/ng.208
  32. Jonsson AA, Isomaa B, Tuomi T, et al. Variant in the KCNQ1 gene predicts future type 2 diabetes and mediates impaired insulin secretion. Diabetes. 2009;58(10):2409-13. doi: 10.2337/db09-0246
  33. Hu C, Wang C, Zhang R, et al. Variations in KCNQ1 are associated with type 2 diabetes and beta cell function in a Chinese population. Diabetologia. 2009;52(7):1322-5. doi: 10.1007/s00125-009-1335-6
  34. Zhou Q, Chen B, Ji T, et al. Association of genetic variants in RETN, NAMPT and ADIPOQ gene with glycemic, metabolic traits and diabetes risk in a Chinese population. Gene. 2018;642:439-46. doi: 10.1016/j.gene.2017.10.084
  35. Qian Y, Dong M, Lu F, et al. Joint effect of CENTD2 and KCNQ1 polymorphisms on the risk of type 2 diabetes mellitus among Chinese Han population. Mol Cell Endocrinol. 2015;407:46-51. doi: 10.1016/j.mce.2015.02.026
  36. Lee YH, Kang ES, Kim SH, et al. Association between polymorphisms in SLC30A8, HHEX, CDKN2A/B, IGF2BP2, FTO, WFS1, CDKAL1, KCNQ1 and type 2 diabetes in the Korean population. J Hum Genetics. 2008;53(11-12):991-8. doi: 10.1007/s10038-008-0341-8
  37. Yasuda K, Miyake K, Horikawa Y, et al. Variants in KCNQ1 are associated with susceptibility to type 2 diabetes mellitus. Nat Genetics. 2008;40(9):1092-7. doi: 10.1038/ng.207
  38. Mussig K, Staiger H, Machicao F, et al. Association of type 2 diabetes candidate polymorphisms in KCNQ1 with incretin and insulin secretion. Diabetes. 2009;58(7):1715-20. doi: 10.2337/db08-1589
  39. Been LF, Ralhan S, Wander GS, et al. Variants in KCNQ1 increase type II diabetes susceptibility in South Asians: a study of 3,310 subjects from India and the US. BMC Med Genetics. 2011;12:18. doi: 10.1186/1471-2350-12-18
  40. Chu H, Wang M, Zhong D, et al. ADIPOQ polymorphisms are associated with type 2 diabetes mellitus: a meta-analysis study. Diabetes Metab Res Rev. 2013;29(7):532-45. doi: 10.1002/dmrr.2424
  41. Goto A, Noda M, Goto M, et al.; JPHC Study Group. Plasma adiponectin levels, ADIPOQ variants, and incidence of type 2 diabetes: A nested case-control study. Diabetes Res Clin Pract. 2017;127:256-64. doi: 10.1016/j.diabres.2017.03.020
  42. Ramya K, Ayyappa KA, Ghosh S, et al. Genetic association of ADIPOQ gene variants with type 2 diabetes, obesity and serum adiponectin levels in south Indian population. Gene. 2013;532(2):253-62. doi: 10.1016/j.gene.2013.09.012
  43. Малютина С.К., Максимов В.Н., Орлов П.С. и др. Ассоциации артериального давления и артериальной гипертензии с генетическими маркерами, отобранными по данным полногеномных исследований. Рус. журн. кардиологии. 2018;23(10):8–13 [Malyutina SK, Maksimov VN, Orlov PS, et al. The association of blood pressure and hypertension with genetic markers identified in genome-wide association studies. Russian Journal of Cardiology. 2018;23(10):8–13 (In Russ.)]. doi: 10.15829/1560-4071-2018-10-8-13
  44. Menzaghi C, Salvemini L, Paroni G, et al. Circulating high molecular weight adiponectin isoform is heritable and shares a common genetic background with insulin resistance in nondiabetic White Caucasians from Italy: evidence from a family-based study. J Int Med. 2010;267(3):287-94. doi: 10.1111/j.1365-2796.2009.02141
  45. Siitonen N, Pulkkinen L, Lindström J, et al. Association of ADIPOQ gene variants with body weight, type 2 diabetes and serum adiponectin concentrations: the Finnish Diabetes Prevention Study. BMC Med Genetics. 2011;12:5. doi: 10.1186/1471-2350-12-5

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Регрессионная модель прогноза развития СД 2 в течение 10 лет с включением в шкалу риска С.В. Мустафиной генотипов полиморфизма rs7903146 гена TCF7L2.

Скачать (26KB)
Метаданные

© ООО "Консилиум Медикум", 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
 
 


Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).