Изучение ассоциации VNTR полиморфизма rs58335419 гена MIR137 с риском развития шизофрении
- Авторы: Коровайцева Г.И.1, Олейчик И.В.1, Лежейко Т.В.1, Голимбет В.Е.1
-
Учреждения:
- Научный центр психического здоровья
- Выпуск: Том 60, № 2 (2024)
- Страницы: 63-69
- Раздел: ГЕНЕТИКА ЧЕЛОВЕКА
- URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/259145
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675824020065
- EDN: https://elibrary.ru/DQTXKJ
- ID: 259145
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ген MIR137 кодирует микроРНК-137 (miR-137), которая активно экспрессируется в различных областях головного мозга и была идентифицирована как модулятор процессов, участвующих в патогенезе нервно-психических расстройств. В регуляторной области MIR137 обнаружен функциональный полиморфизм вариабельного числа тандемных повторов (VNTR) rs58335419, связанный с изменением экспрессии miR-137 и, как следствие, с увеличением риска развития психопатологий, в том числе и шизофрении. Нами проведен анализ частоты встречаемости аллелей и генотипов VNTR MIR137 на большой выборке этнических русских российской популяции. Изучена ассоциация VNTR с риском развития шизофрении. Обнаружено, что наличие VNTR-аллелей с числом повторов более трех, а также генотипа, гомозиготного по таким аллелям, связано с увеличением риска развития шизофрении (ОШ = 1.4, 95% ДИ: 1.01–1.95).
Ключевые слова
Полный текст
Шизофрения – тяжелое психическое расстройство с высоким уровнем как клинической, так и генетической гетерогенности. Являясь сложным многофакторным заболеванием, шизофрения имеет очень значительный генетический компонент, наследуемость которого оценивается до 80% [1–3]. Многочисленные исследования выявили более 270 независимых локусов, связанных с риском шизофрении, в различных популяциях [4–6]. Показано, что значительное количество вариантов риска, зарегистрированных в этих локусах, расположено в некодирующих областях генома, обогащенных регуляторными элементами [7, 8]. Одним из таких элементов является вариабельное число тандемных повторов (VNTR). Значительная часть идентифицированных VNTR-локусов человека расположена рядом с генами или внутри них. Вследствие этого их потенциальные эффекты на экспрессию генов или белковых продуктов значительны [9, 10]. VNTR могут находиться в неравновесии по сцеплению с однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) – факторами риска или являться независимым компонентом развития заболевания [11–13].
Из числа таких VNTR-полиморфизмов особый интерес вызывает VNTR rs58335419 гена MIR137 (1p21.3), кодирующего последовательность микроРНК-137 (miR-137). MiR-137 играет критическую роль в функционировании головного мозга. С ее экспрессией связаны развитие нервной системы, неопластическая трансформация и регуляция большого количества генов-мишеней, участвующих в различных путях метаболизма [14]. Полногеномные исследования ассоциаций (GWAS) идентифицировали MIR137 как один из генов риска шизофрении [4, 6, 15]. VNTR, состоящий из повторов длиной 15 пар нуклеотидов (пн), находится в 5ꞌ-области гена в первичном транскрипте на расстоянии 6 пн от начала последовательности предшественника miR-137 [16]. Расположение VNTR в регуляторной области гена предполагает его возможность напрямую участвовать в сложном механизме созревания miR-137 [11].
Особенность функционирования miR связана с подавлением экспрессии генов-мишеней, деградацией транскриптов либо ингибированием трансляции, что делает их роль ключевой в регуляции экспрессии множества генов, в том числе и тех, которые связаны с риском развития шизофрении [17]. Учитывая этот широкий диапазон действия miR, генетические вариации, изменяющие экспрессию генов miR, могут способствовать развитию шизофрении. Поэтому исследования ассоциации таких генетических полиморфизмов с риском развития заболевания являются актуальными.
Цель настоящего исследования – анализ распределения частот аллелей и генотипов VNTR-полиморфизма MIR137 в российской популяции и и зучение ассоциации этого полиморфизма с риском развития шизофрении.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Дизайн исследования – “случай–контроль”. Группу контроля составили 1257 психически здоровых человек без наследственной отягощенности психическими заболеваниями (средний возраст 29.9 + 11.5 лет; 58% женщин и 42% мужчин). Выборка больных включала в себя 1336 человек с шизофренией и расстройствами шизофренического спектра (рубрики F20, F21, F23 и F25 по МКБ-10). В выборку не включали лиц с относительно острой и тяжелой хронической соматической патологией в стадии декомпенсации. По полу и возрасту она была сопоставима с группой контроля (средний возраст 35.9 + 12.3 лет; 56% женщин и 44% мужчин). Более 95% в каждой группе являлись этническими русскими. Протокол исследования был одобрен этическим комитетом ФГБНУ НЦПЗ № 98 от 11.09.2007.
Геномная ДНК была выделена из лейкоцитов периферической крови с помощью стандартной методики фенол/хлороформной экстракции. Генотипирование проводили методом полимеразной цепной реакции (ПЦР), выполненной по стандартной процедуре с небольшими модификациями на амплификаторе C1000 Touch (Bio-Rad). Использовали олигонуклеотидные праймеры: прямой 5ꞌ-GCT CAG CGA GCA GCA AGA GT-3ꞌ и обратный 5ꞌ-GTC ACC GAA GAG AGT CAG AGG ACC-3ꞌ [16]. Учитывая высокое содержание GC в последовательности VNTR, для уменьшения вероятности возникновения неспецифики при ПЦР использовали Hot Start Taq ДНК-полимеразу (Genterra TaqF, Россия) в соответствии с рекомендациями производителя. Амплифицируемый фрагмент для аллеля с тремя повторяющимися единицами составлял 118 пн, и длина ПЦР-фрагмента увеличивалась на 15 пн для каждого дополнительного повтора. Полученные ПЦР-фрагменты разделяли в 8%-ном полиакриламидном геле. После анализа достаточного количества образцов была создана лестница из ранжированных по длине VNTR в диапазоне от 3 до 12 повторов. В дальнейшем эта лестница использовалась в качестве маркера длины для определения генотипов остальных образцов. Аллели обозначали R3, R4 и т.д., в соответствии с количеством содержащихся в них повторов.
При анализе данных соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди–Вайнберга оценивали с помощью критерия χ2. Для оценки значимости различий в распределении аллелей и генотипов полиморфного локуса в изучаемых подгруппах использовали критерий χ2 Пирсона. Риск того или иного аллеля или генотипа в развитии шизофрении или наступлении определенного функционального исхода оценивали с помощью показателя отношение шансов (ОШ) с 95%-ным доверительным интервалом (ДИ). За порог статистической значимости при определении ОШ и χ2 был принят стандартный уровень р < 0.05.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Генотипирование выявило 11 VNTR аллелей в выборке больных (от 3 до 13 повторов). В группе контроля длина VNTR варьировала от 2 до 14 повторов, образуя 13 аллелей.
Результаты исследования распределения генотипов VNTR-полиморфизма гена MIR137 в выборке больных шизофренией и в группе здорового контроля представлены в табл. 1.
Таблица 1. Распределение частот аллелей и генотипов VNTR-полиморфизма гена MIR137 у больных шизофренией и здоровых индивидов
Аллель, генотип | Больные шизофренией (N = 1336) | Контрольная группа (N = 1257) | ||
n | частота (%) | n | частота (%) | |
R2 | – | – | 1 | 0.0398 |
R3 | 1996 | 74.70 | 1964 | 78.12 |
R4 | 250 | 9.36 | 207 | 8.47 |
R5 | 78 | 2.92 | 73 | 2.90 |
R6 | 65 | 2.43 | 51 | 2.03 |
R7 | 77 | 2.88 | 44 | 1.75 |
R8 | 52 | 1.95 | 38 | 1.51 |
R9 | 52 | 1.95 | 41 | 1.63 |
R10 | 58 | 2.17 | 46 | 1.83 |
R11 | 28 | 1.05 | 34 | 1.35 |
R12 | 14 | 0.52 | 13 | 0.52 |
R13 | 2 | 0.075 | 1 | 0.0398 |
R14 | – | – | 1 | 0.0398 |
R2/R3 | – | – | 1 | 0.08 |
R3/R3 | 752 | 56.29 | 770 | 61.26 |
R3/R4 | 176 | 13.17 | 163 | 12.97 |
R3/R5 | 58 | 4.34 | 54 | 4.30 |
R3/R6 | 52 | 3.89 | 36 | 2.86 |
R3/R7 | 53 | 3.97 | 38 | 3.02 |
R3/R8 | 39 | 2.92 | 27 | 2.15 |
R3/R9 | 41 | 3.07 | 31 | 2.47 |
R3/R10 | 39 | 2.92 | 36 | 2.86 |
R3/R11 | 22 | 1.65 | 28 | 2.23 |
R3/R12 | 11 | 0.82 | 9 | 0.72 |
R3/R13 | 1 | 0.07 | 1 | 0.08 |
R4/R4 | 15 | 1.27 | 10 | 0.80 |
R4/R5 | 5 | 0.37 | 1 | 0.08 |
R4/R6 | 5 | 0.37 | 5 | 0.40 |
R4/R7 | 4 | 0.30 | 2 | 0.16 |
R4/R8 | 5 | 0.37 | 6 | 0.48 |
R4/R9 | 6 | 0.45 | 2 | 0.16 |
R4/R10 | 9 | 0.67 | 4 | 0.32 |
Аллель, генотип | Больные шизофренией (N = 1336) | Контрольная группа (N = 1257) | ||
n | частота (%) | n | частота (%) | |
R4/R11 | 3 | 0.22 | 1 | 0.08 |
R4/R12 | 2 | 0.15 | 2 | 0.16 |
R4/R13 | 1 | 0.07 | – | – |
R4/R14 | – | – | 1 | 0.08 |
R5/R5 | 2 | 0.15 | 4 | 0.32 |
R5/R6 | 2 | 0.15 | 1 | 0.08 |
R5/R7 | 6 | 0.45 | – | – |
R5/R8 | 2 | 0.15 | 1 | 0.08 |
R5/R9 | – | – | 2 | 0.16 |
R5/R10 | 1 | 0.07 | 2 | 0.16 |
R5/R11 | – | – | 3 | 0.24 |
R5/R12 | – | – | 1 | 0.08 |
R6/R6 | 1 | 0.07 | – | – |
R6/R7 | 2 | 0.15 | 2 | 0.16 |
R6/R8 | – | – | 1 | 0.08 |
R6/R9 | – | – | 2 | 0.16 |
R6/R10 | 2 | 0.15 | 1 | 0.08 |
R6/R11 | – | – | 2 | 0.16 |
R6/R12 | – | – | 1 | 0.08 |
R7/R7 | 4 | 0.30 | – | – |
R7/R8 | 1 | 0.07 | – | – |
R7/R9 | 1 | 0.07 | 2 | 0.16 |
R7/R11 | 1 | 0.07 | – | – |
R7/R12 | 1 | 0.07 | – | – |
R8/R9 | – | – | 1 | 0.08 |
R8/R10 | 4 | 0.30 | 2 | 0.16 |
R8/R11 | 1 | 0.07 | – | – |
R9/R9 | 1 | 0.07 | – | – |
R9/R10 | 2 | 0.15 | 1 | 0.08 |
R10/R11 | 1 | 0.07 | – | – |
Примечание. “–” – генотипы отсутствуют в анализируемой выборке.
Аллель дикого типа R3 являлся мажорным. Частота R3 составила 78% в контрольной группе и 74.7% в группе больных. Для последующего анализа все аллели с количеством повторов больше трех (минорные аллели) мы объединили в одну группу и обозначили ее как R>3. Один образец в контрольной группе с генотипом R2/R3 был исключен из анализа. Выборка в результате составила 1256 человек. После группировки минорных аллелей генотипы VNTR MIR137 распределялись следующим образом: в выборке больных R3/R3 – 752 (56.3%), R3/R>3 – 492 (36.8%), R>3/R>3 – 92 (6.9%); в группе здорового контроля R3/R3 – 770 (61.3%), R3/R>3 – 423 (33.7%), R>3/R>3 – 63 (5%). Распределение частот генотипов в обеих выборках соответствовало равновесию Харди–Вайнберга (χ² = 0.88, р = 0.35 – в группе больных; χ² = 0.25, р = 0.88 – в контрольной группе). Частоты аллелей и генотипов у мужчин и женщин значимо не отличалась между собой как в группе больных шизофренией, так и в группе контроля.
Анализ распределения частот аллелей и генотипов выявил достоверное увеличение как частоты генотипа R>3/R>3, (χ² = 4.03, р = 0.044; ОШ = 1.4, 95%ДИ (1.01–1.95)), так и аллеля R>3 (χ² = 8.51, р = 0.0035; ОШ = 1.21, 95%ДИ (1.06–1.38)) у больных шизофренией по сравнению с контрольной группой (табл. 2).
В качестве количественной меры эффекта при сравнении данных, нами использовался показатель отношения шансов (ОШ). Полученные значения ОШ указывают на то, что наличие VNTR-аллелей с числом повторов более трех повышает риск развития шизофрении. Аллель дикого типа, наиболее распространенный в популяции (R3), напротив, обладает защитным эффектом (табл. 2). Для того чтобы выяснить, связан ли риск шизофрении с полом, мы проанализировали распределение частот генотипов в группах мужчин и женщин. Достоверных отличий распределения генотипов между этими группами в выборках больных и контроля не обнаружено.
Самую высокую частоту среди аллелей, более чем с тремя VNTR-повторами, имел аллель R4. Поэтому мы проверили, связан ли данный аллель с риском развития шизофрении. Анализ не выявил достоверных отличий распределения R4 в выборках больных и контроля.
ОБСУЖДЕНИЕ
MIR137 кодирует miR-137, которая активно экспрессируется во всех областях головного мозга, за исключением мозжечка [18, 19], и была идентифицирована как модулятор процессов, участвующих в патогенезе нервно-психических расстройств, включая развитие нервной системы, нейрогенез у взрослых, синаптогенез и нервную передачу [14, 20–24]. Ряд генов-кандидатов шизофрении, выявленных в исследованиях GWAS, являлись мишенями miR-137 [6, 25–27]. А количество генов-мишеней для miR-137, прогнозируемое в результате биоинформационных исследований, превышает 1300 [28]. Кроме того, показано, что SNP гена MIR137 увеличивают риск развития заболевания [4, 6, 15], влияют на уровень экспрессии miR-137 в мозге [20, 23, 29, 30], а также на структурные характеристики головного мозга и концентрацию серого вещества при шизофрении [29, 31]. Несмотря на все эти многочисленные данные, подтверждающие роль miR в этиологии шизофрении, молекулярные механизмы, лежащие в основе ассоциации miR-137 с шизофренией, до сих пор не ясны.
Наряду с SNP в гене MIR137 обнаружен новый функциональный вариант – вариабельное число тандемных повторов (VNTR) rs58335419. Показано, что он вовлечен в регуляцию альтернативного сплайсинга первичного транскрипта miR-137, который приводит к образованию изоформ, подавляющих экспрессию зрелой miR-137 [16]. Обнаружена роль аллелей VNTR в модулировании уровня экспрессии miR-137 [12, 21]. Кроме того, последовательность VNTR имеет высокое содержание GC и находится в области CpG-островков (CGI), так же, как и последовательность зрелой miR-137. Таким образом, увеличение числа копий повторов увеличивает протяженность CGI и может способствовать различным эпигенетическим модификациям этого участка, влияя на регуляцию экспрессии miR-137 [16].
Анализ частоты встречаемости аллелей и генотипов VNTR MIR137 в разных популяциях демонстрирует различные результаты. Во всех исследованиях аллель дикого типа с тремя повторами R3 является самым распространенным, однако его частота заметно различается и варьирует от 56 до 91% [11, 16, 32, 33]. В нашей работе это значение составляет 78% и превышает частоту R3 (68%) в европейской популяции, полученную ранее другими авторами [16], причем оба эти значения отличаются от данных для европейских популяций, представленных в проекте “1000 геномов”, – 92% [34]. Следует отметить, что ранее некоторые исследователи уже отмечали сложности в определении длины VNTR при числе повторов более девяти и предполагали, что несопоставимость частот аллелей в разных исследованиях связана с различиями в протоколах амплификации [16].
Проведенный нами анализ ассоциаций вариантов VNTR гена MIR137 в исследованиях “случай–контроль” в российской популяции выявил ассоциацию как генотипа R>3/R>3, так и аллеля R>3 с увеличением риска развития шизофрении. Значение показателя ОШ свидетельствует о том, что изучаемый полиморфизм вносит определенный вклад в риск развития заболевания, хотя и не обладает большим самостоятельным эффектом. Это вполне естественно, так как возможно существование ряда других генетических и средовых факторов, которые при взаимодействии с VNTR MIR137 могут определять особенности развития и протекания шизофрении.
Подобные исследования, выполненные ранее, показали различные результаты. При анализе японской популяции изучали ассоциацию отдельных вариантов VNTR и шизофрении [33]. Ни для одного варианта ассоциация не была обнаружена, однако частота аллеля R>3 в группе больных шизофренией была выше, чем в группе контроля, что согласуется с результатами, полученными нами. В другом исследовании, напротив, было обнаружено, что у больных повышена частота аллеля дикого типа R3 и генотипа R3/R3 [16]. Это различие не достигало статистической значимости, но авторы прогнозировали значительный эффект при увеличении объема выборки. При изучении роли VNTR MIR-137 в механизме альтернативного сплайсинга первичного транскрипта miR-137 была обнаружена ассоциация между VNTR, содержащими более трех повторов, и изоформами транскриптов, снижающих уровень экспрессии зрелой miR-137 [16]. Поэтому авторы предположили, что именно короткая длина VNTR связана с риском, а большая длина (R>3) обеспечивает защитный эффект. Существует ряд других подтверждений того, что наличие некоторых “длинных” аллелей VNTR может приводить к снижению экспрессии miR-137 [11, 21, 35, 36]. Между тем, при изучении гаплотипов SNP гена MIR137, ассоциированных с шизофренией, были получены данные, позволяющие предположить наличие гаплотипа, обусловливающего риск развития заболевания, который может включать редкие варианты VNTR с большим числом копий [15]. Это согласуется с нашими результатами. Данные, полученные нами на больших выборках, свидетельствуют о том, что аллель дикого типа R3 обладает защитным эффектом, а R>3 является фактором риска.
Кроме того, следует отметить, что связь между уровнем экспрессии miR-137 и патофизиологическими механизмами развития шизофрении до сих пор остается неясной. Одни авторы предполагают, что риск развития шизофрении связан со сверхэкспрессией miR-137, приводящей к подавлению функционирования генов-мишеней [16, 18, 20, 24]. В то же время M. Strazisar с соавт. в результате проведения транскриптомного анализа показал, что именно снижение экспрессии miR-137 приводит к нарушению функционирования ряда генов, участвующих в синаптогенезе и нейрональной передаче, которые, как известно, связаны с психическими расстройствами [21]. Помимо этого исследования показали, что SNP в области гена MIR137, увеличивающие риск шизофрении, могут обусловливать как снижение экспрессии miR-137 [15, 30], так и ее увеличение [23].
Учитывая полученные ранее данные о связи аллеля VNTR c четырьмя повторами (R4) с изменениями морфологии головного мозга [11] и тяжестью когнитивных нарушений [11, 37], мы изучали ассоциацию R4 с риском развития шизофрении. Наши результаты согласуются с предыдущими исследованиями, в которых также не сообщалось об ассоциации между R4 и шизофренией [11, 33]. Соответственно мы подтвердили предположение о том, что R4 имеют более сильную связь с когнитивными и нейроанатомическими эндофенотипами шизофрении, чем с заболеванием, как диагностической категорией.
Таким образом, в настоящей работе мы впервые провели анализ VNTR rs58335419 гена MIR137 на большой выборке этнических русских из российской популяции. В наших исследованиях мы показали, что и аллель R>3, и генотип R>3/R>3 влияют на риск развития шизофрении, повышая его.
Работа выполнена в рамках Государственного задания.
Все процедуры, выполненные в исследовании с участием людей, соответствуют этическим стандартам институционального и/или национального комитета по исследовательской этике и Хельсинкской декларации 1964 г. и ее последующим изменениям или сопоставимым нормам этики.
От каждого из включенных в исследование участников было получено информированное добровольное согласие.
Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.
Об авторах
Г. И. Коровайцева
Научный центр психического здоровья
Автор, ответственный за переписку.
Email: korovaitseva@mail.ru
Россия, Москва, 115522
И. В. Олейчик
Научный центр психического здоровья
Email: korovaitseva@mail.ru
Россия, Москва, 115522
Т. В. Лежейко
Научный центр психического здоровья
Email: korovaitseva@mail.ru
Россия, Москва, 115522
В. Е. Голимбет
Научный центр психического здоровья
Email: golimbet@mail.ru
Россия, Москва, 115522
Список литературы
- Stefansson H., Ophof R.A., Steinberg S. et al. Common variants conferring risk of schizophrenia // Nature. 2009. V. 460. № 7256. P. 744–747. https://doi.org/10.1038/nature08186
- Gejman P.V., Sanders A.R., Duan J. The role of genetics in the etiology of schizophrenia // Psychiatr. Clin. North Am. 2010. V. 33. № 1. P. 35–66. https://doi.org/10.1016/j.psc.2009.12.003
- Polderman T.J., Benyamin B., de Leeuw C.A. et al. Meta-analysis of the heritability of human traits based on fifty years of twin studies // Nat. Genet. 2015. V. 47. № 7. P. 702–709. https://doi.org/10.1038/ng.3285
- Trubetskoy V., Pardiña, A.F., Qi T. et al. Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia // Nature. 2022. V.604. P. 502–508. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04434-5
- Lam M., Chen C.Y., Li Z. et al. Comparative genetic architectures of schizophrenia in East Asian and European populations // Nat. Genet. 2019. V. 51. № 12. Р. 1670–1678. https://doi.org/10.1038/s41588-019-0512-x
- Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium, Ripke S., Walters J.T., O’Donovan M.C. Mapping genomic loci prioritises genes and implicates synaptic biology in schizophrenia // MedRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.09.12.20192922
- Jaffe A.E., Straub R.E., Shin J.H. et al. Developmental and genetic regulation of the human cortex transcriptome illuminate schizophrenia pathogenesis // Nat. Neurosci. 2018. V. 21. № 8. Р. 1117–1125. https://doi.org/10.1038/s41593-018-0197-y
- Takata A., Matsumoto N., Kato T. Genome-wide identification of splicing QTLs in the human brain and their enrichment among schizophrenia-associated loci // Nat. Commun. 2017. V. 8. P. 14519–14529. https://doi.org/10.1038/ncomms14519
- Bakhtiari M., Park J., Ding Y.C. et al. Variable number tandem repeats mediate the expression of proximal genes // Nat. Commun. 2021. V. 12. № 1. P. 2075–2099. https://doi.org/10.1038/s41467-021-22206-z
- Eslami R.M., Hernández Y., Drinan S.D. et al. Genome-wide characterization of human minisatellite VNTRs: Population-specific alleles and gene expression differences // Nucleic Acids Res. 2021. V. 49. № 8. P. 4308–4324. https://doi.org/10.1093/nar/gkab224
- Mahmoudi E., Atkins J.R., Quidé Y. et al. The MIR137 VNTR rs58335419 is associated with cognitive impairment in schizophrenia and altered cortical morphology // Schizophr. Bull. 2021. V. 47. № 2. P. 495–504. https://doi.org/10.1093/schbul/sbaa123
- Warburton A., Breen G., Rujescu D. et al. Characterization of a REST-regulated internal promoter in the schizophrenia genome-wide associated gene MIR137 // Schizophr. Bull. 2015. V. 41. № 3. P. 698–707. ttps://doi.org/10.1093/schbul/sbu117
- Li M., Jaffe A.E., Straub R.E. et al. A human-specific AS3MT isoform and BORCS7 are molecular risk factors in the 10q24.32 schizophrenia-associated locus // Nature Med. 2016. V. 22. P. 649–656.https://doi.org/10.1038/nm.4096
- Mahmoudi E., Cairns M.J. MiR-137: An important player in neural development and neoplastic transformation // Mol. Psychiatry. 2017. V. 22. № 1. P. 44–55. https://doi.org/10.1038/mp.2016.150
- Warburton A., Breen G., Bubb V.J. et al. A GWAS SNP for schizophrenia is linked to the internal MIR137 promoter and supports differential allele-specific expression // Schizophr. Bull. 2016. V. 42. № 4. P. 1003–1008. https://doi.org/10.1093/schbul/sbv144
- Pacheco A., Berger R., Freedman R., Law A.J. A VNTR regulates miR-137 expression through novel alternative splicing and contributes to risk for schizophrenia // Sci. Rep. 2019. V. 9. № 1. P. 11793–11804. https://doi.org/10.1038/s41598-019-48141-0
- O’Connor R.M., Gururajan A., DinanT.G. et al. All Roads Lead to the miRNome: miRNAs have a central role in the molecular pathophysiology of psychiatric disorders // Trends in pharmacological sciences. 2016. V. 37. № 12. P. 1029–1044. https://doi.org/10.1016/j.tips.2016.10.004
- Arakawa Y., Yokoyama K., Tasaki S. et al. Transgenic mice overexpressing miR-137 in the brain show schizophrenia-associated behavioral deficits and transcriptome profiles // PLoS One. 2019. V. 14. № 7. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0220389
- Forero D.A., van der Ven K., Callaerts P., Del-Favero J. miRNA genes and the brain: Implications for psychiatric disorders // Hum. Mutat. 2010. V. 31. № 11. P. 1195–1204. https://doi.org/10.1002/humu.21344
- He E., Lozano M.A.G., Stringer S. et al. MIR137 schizophrenia-associated locus controls synaptic function by regulating synaptogenesis, synapse maturation and synaptic transmission // Hum. Mol. Genet. 2018. V. 27. № 11. P. 1879–1891. https://doi.org/10.1093/hmg/ddy089
- Strazisar M., Cammaerts S., van der Ven K. et al. MIR137 variants identified in psychiatric patients affect synaptogenesis and neuronal transmission gene sets // Mol. Psychiatry. 2015. V. 20. № 4. P. 472–481. https://doi.org/10.1038/mp.2014.53
- Hill M.J., Donocik J.G., Nuamah R.A. et al. Transcriptional consequences of schizophrenia candidate miR-137 manipulation in human neural progenitor cells // Schizophr. Res. 2014. V. 153. № 1-3. P. 225–230. https://doi.org/10.1016/j.schres.2014.01.034
- Siegert S., Seo J., Kwon E.J. et al. The schizophrenia risk gene product miR-137 alters presynaptic plasticity // Nat. Neurosci. 2015. V. 18. № 7. P. 1008–1016.https://doi.org/10.1038/nn.4023
- He E., Lozano M.A.G., Stringer S. et al. MIR137 schizophrenia-associated locus controls synaptic function by regulating synaptogenesis, synapse maturation and synaptic transmission // Hum. Mol. Genet. 2018. V. 27. № 11. P. 1879–1891. https://doi.org/10.1093/hmg/ddy089
- Collins A.L., Kim Y., Bloom R.J. et al. Transcriptional targets of the schizophrenia risk gene MIR137 // Transl. Psychiatry. 2014. V. 4. № 7. e404. https://doi.org/10.1038/tp.2014.42
- Kwon E., Wang W., Tsai L.H. Validation of schizophrenia-associated genes CSMD1, C10orf26, CACNA1C and TCF4 as miR-137 targets // Mol. Psychiatry. 2013. V. 18. P. 11–12. https://doi.org/10.1038/mp.2011.170
- Kim A.H., Parker E.K., Williamson V. et al. Experimental validation of candidate schizophrenia gene ZNF804A as target for hsa-miR-137 // Schizophr. Res. 2012. V. 141. № 1. P. 60–64. https://doi.org/10.1016/j.schres.2012.06.038
- Agarwal V., Bell G.W., Nam J.-W., Bartel, D.P. Predicting effective microRNA target sites in mammalian mRNAs. // eLife. 2015. V. 4. e05005. https://doi.org/10.7554/eLife.05005
- Wright C., Gupta C.N., Chen J. et al. Polymorphisms in MIR137HG and microRNA-137-regulated genes influence gray matter structure in schizophrenia // Transl. Psychiatry. 2016. V. 6. № 2. e724. https://doi.org/10.1038/tp.2015.211
- Guella I., Sequeira A., Rollins B. et al. Analysis of miR-137 expression and rs1625579 in dorsolateral prefrontal cortex // J. Psychiatr. Res. 2013. V. 47. № 9. P. 1215–1221. https://doi.org/10.1016/j.jpsychires.2013.05.021
- Zhang Z., Yan T., Wang Y. et al. Polymorphism in schizophrenia risk gene MIR137 is associated with the posterior cingulate Cortex’s activation and functional and structural connectivity in healthy controls // Neuroimage Clin. 2018. V. 19. P. 160–166. https://doi.org/10.1016/j.nicl.2018.03.039
- Jafari P., Baghernia S., Moghanibashi M., Mohamadynejad P. Significant association of variable number tandem repeat polymorphism rs58335419 in the MIR137 gene with the risk of gastric and colon cancers // Br. J. Biomed. Sci. 2022. V. 79. P. 10095–10099. https://doi.org/10.3389/bjbs.2021.10095
- Egawa J., Nunokawa A., Shibuya M. et al. Resequencing and association analysis of MIR137 with schizophrenia in a Japanese population // Psychiatry Clin. Neurosci. 2013. V. 67. № 4. P. 277–279. https://doi.org/10.1111/pcn.12047
- Проект “1000 геномов”. http://www.internationalgenome.org
- Mamdani M., McMichael G.O., Gadepalli V. et al. Differential regulation of schizophrenia-associated microRNA gene function by variable number tandem repeats (VNTR) polymorphism // Schizophr. Res. 2013. V. 151. № 1–3. P. 284–286. https://doi.org/10.1016/j.schres.2013.10.024
- Bemis L.T., Chen R., Amato C.M, et al. MicroRNA-137 targets microphthalmia-associated transcription factor in melanoma cell lines // Cancer Res. 2008. V. 68. P. 1362–1368. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-2912
- González-Giraldo Y., González-Reyes R.E., Forero D.A. A functional variant in MIR137, a candidate gene for schizophrenia, affects Stroop test performance in young adults // Psychiatry. Res. 2016. V. 236. P. 202–205. https://doi.org/10.1016/j.psychres.2016.01.006
Дополнительные файлы
