Genetic Structure of Russian Riding Horse Breed

E. A. Nikolaeva; Николаева Э. А.; V. N. Voronkova; Воронкова В. Н.; M. A. Politova; Политова М. А.; E. V. Ryabova; Рябова Е. В.; V. A. Demin; Демин В. А.; Yu. A. Stolpovsky; Столповский Ю. А.

doi:10.31857/S0016675823090096

Генетическая структура русской верховой породы лошадей

Авторы: Николаева Э.А.¹, Воронкова В.Н.¹, Политова М.А.², Рябова Е.В.³, Демин В.А.³, Столповский Ю.А.¹
Учреждения:
1. Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
2. Всесоюзный научно-исследовательский институт племенного дела
3. Российский аграрный университет им. К.А. Тимирязева (МСХА)
Выпуск: Том 59, № 9 (2023)
Страницы: 1048-1058
Раздел: ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ
URL: https://journals.rcsi.science/0016-6758/article/view/134647
DOI: https://doi.org/10.31857/S0016675823090096
EDN: https://elibrary.ru/WUWYIE
ID: 134647

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

С помощью 17 микросателлитных локусов, рекомендованных ISAG, исследовано 166 лошадей русской верховой породы. Для сравнительного анализа генетического разнообразия и современной кластеризации были использованы данные микросателлитного полиморфизма 34 европейских пород – 7874 особи (Mendeley database). По уровню аллельного богатства русская верховая имеет высокие значения – 5.4 аллеля на микросателлитный локус. Всего в породе обнаружено 122 аллеля, в том числе приват-аллель 14 в локусе HTG7. Выявлена популяционно-генетическая структура для русской верховой, арабской, ахалтекинской, немецкой верховой и чистокровной верховой. Кластеризация пород лошадей на круговой дендрограмме, полученной методом UPGMA, выявила шесть основных кластеров. При анализе методом PCA русская верховая образует единую группу с немецкими верховыми и чистокровными английскими лошадьми. При использовании программы STRUCTURE (K = 3) породы разделились на три популяционные структуры: 1) арабская; 2) русская верховая, ахалтекинская, чистокровная верховая; 3) немецкая полукровная. Анализ дифференциации между породами (F_st) показал наибольшие различия между всеми породами и ахалтекинской породой лошадей, наименьшее отличие (F_st = 0.22) – между русской верховой и немецкой верховой. Различия по каждой паре пород были достоверны (p-value < 0.001).

Ключевые слова

лошадь, Equus caballus, микросателлитный анализ, генетическое разнообразие, русская верховая порода.

Список литературы

Парфенов В.А., Спицина Н., Тхинвалели Г.Г. Особенности селекционных процессов в работе с русской верховой породой лошадей // Коневодство и конный спорт. 2011. № 3. С. 5–8.
Храброва Л.А., Блохина Н.В. Генетический мониторинг чистокровной верховой породы лошадей по локусам микросателлитов ДНК // Генетика и разведение животных. 2018. № 3. С. 11–16.
Политова М.А. Работоспособность лошадей русской верховой породы в выездке в 2017–2020 гг. и факторы, ее определяющие // Коневодство и конный спорт. 2021. № 5. С. 31–33. https://doi.org/10.25727/HS.2021.5.60372
Политова М.А., Дорофеева А.В. Сравнительная характеристика методик оценки спортивной работоспособности лошадей по результатам выступлений в выездке // Изв. С.-Петербургского гос. аграр. ун-та. 2021. № 1 (62). С. 146–154.
Никитина Д.А. Анализ распределения по типам высшей нервной деятельности лошадей русской верховой породы Старожиловского конного завода, с учетом их происхождения // Аграрная наука. 2011. № 7. С. 26–27.
Райсманн М., Политова М., Вагнер Х.Й. Молекулярно-генетический анализ мастей в популяциях русской верховой и немецкой верховой пород // Abstracts 3 Intern. Iran and Russia Conf. “Agriculture and Natural Resources”. Сб. докл. М., 2002. С. 41.
Политова М.А, Райсманн М., Вагнер Х.Й. Влияние генотипа в локусах MC1R (Extension) и ASIP (Agouti) на работоспособность и плодовитость лошадей русской верховой породы // Докл. ТСХА. 2003. Вып. 275. С. 476–479.
Калинкова Л.В. Изучение полиморфизма генов ASIP и MC1R у лошадей арабской породы // Генетика и разведение животных. 2020. № 2. С. 50–53.
Rieder S., Taourit S., Mariat D. et al. Mutations in the agouti (ASIP), the extension (MC1R), and the brown (TYRP1) loci and their association to coat color phenotypes in horses (Equus caballus) // Mamm. Genome. 2001. V. 12. № 6. P. 450–455. https://doi.org/10.1007/s003350020017
Воронкова В.Н. Оценка генетического разнообразия лошадей Саяно-Алтайского региона с использованием ядерных и митохондриальных ДНК маркеров: Автореф. дис. … канд. биол. наук. М: ИОГен РАН, 2012. 152 с.
Чебуранова Е.С., Епишко О.А., Горчаков Н.А. и др. Разработка мультилокусной системы по STR-локусам для молекулярно-генетической паспортизации лошадей // Сельское хоз-во – проблемы и перспективы. 2016.
Калашников В.В., Дергунова М.М., Зайцев М.А. и др. Дополнительные возможности метода ДНК-анализа в коневодстве // Farm. Animals. 2013. № 3–4. P. 72–74.
van de Goor L.H.P., van Haeringen W.A., Lenstra J.A. Population studies of 17 equine STR for forensic and phylogenetic analysis // Animal Genet. 2011. V. 42. № 6. P. 627–633. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02194.x
Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: Simplifying basic population genetic analyses in R // Meth. in Ecol. and Evolution. 2014. V. 5. № 4. P. 384–387. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12158
El Mousadik A., Petit R.J. High level of genetic differentiation for allelic richness among populations of the argan tree (Argania spinosa (L.) Skeels) endemic to Morocco // Theor. Applied Genet. 1996. V. 92. № 7. P. 832–839.
Foulley J.L., Ollivier L. Estimating allelic richness and its diversity // Livestock Sci. 2006. V. 101. № 1–3. P. 150–158. https://doi.org/10.1016/j.livprodsci.2005.10.021
Животовский Л.А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 270 с.
Sievert C. Interactive web-based data visualization with R, plotly, and shiny. N.Y.: CRC Press, 2020. 470 p. https://doi.org/10.1201/9780429447273